binaries/src/fasta34/create_seq_demo.sql

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   2 DROP DATABASE seq_demo;
   3 CREATE DATABASE seq_demo;
   4
   5 USE seq_demo;
   6
   7 CREATE TABLE prot (
   8 id INT UNSIGNED NOT NULL AUTO_INCREMENT PRIMARY KEY,
   9 seq TEXT NOT NULL,
  10 bin BLOB NOT NULL,
  11 len INT UNSIGNED NOT NULL
  12 );
  13
  14 CREATE TABLE annot (
  15 prot_id INT UNSIGNED NOT NULL,
  16 gi INT UNSIGNED NOT NULL PRIMARY KEY,
  17 db ENUM("gb","emb","dbj","prf","ref","pdb","pir","sp") NOT NULL,
  18 descr TEXT NOT NULL,
  19
  20 INDEX (prot_id),
  21 INDEX (db)
  22 );
  23
  24 CREATE TABLE sp (
  25     gi INT UNSIGNED NOT NULL,
  26     acc   VARCHAR(10),
  27     name  VARCHAR(10),
  28
  29     PRIMARY KEY (gi)
  30 );