binaries/src/fasta34/readme.pvm_3.2

   1 --> August, 1999
   2
   3 Corrected problem with opt_cut initialization that only appeared
   4 with p?compfa programs.
   5
   6 --> v3.26       July, 1999
   7
   8 pvcomp* programs now use the same method for working with forward and
   9 reverse strands as the standard fast*3(_t) programs.  Thus, statistics
  10 for DNA sequences should be very similar for pvcompfa and fasta3 or
  11 fasta3_t.
  12
  13                 February, 1999
  14
  15 With release fasta32t02 of the FASTA package, the alignment
  16 routines for pvcompfa, pvcompsw, etc now work properly
  17 again.
  18
  19 The PVM versions of the FASTA and Smith-Waterman search programs
  20 should now be functionally identical to the multithreaded (fasta3_t,
  21 ssearch3_t) and non-threaded (fasta3, ssearch3) versions.
  22
  23 The programs have also been updated to provide similar -m 10
  24 information to the non-pvm versions.  There are some slight
  25 differences, because the pvcomp* versions are designed to work with
  26 multiple sequences.  But, in general, a script that looks for /^>>>/
  27 to start an alignment set and /^>>><<</ to end the set work work
  28 properly.
  29
  30 --> v3.23       March, 1999
  31
  32 Modified Makefile.pvm, showsum.c so that showsum.c is used by
  33 both the complib/_thr and pvcomplib (pvm parallel) versions.
  34
  35 Corrected bug in reading first query for DNA sequences.
  36
  37 --> v3.25       May, 1999
  38
  39 Fixed pvm_showalign.c so that FIRSTNODE (in msg.h) can be 1, rather
  40 than 0.  #define FIRSTNODE 1 is recommended when the virtual machine
  41 has 8 or more nodes.
  42