binaries/src/fasta34/readme.v30

   1
   2 Because of interdependencies in the Makefile, sometimes you must
   3 type "make" a second time to get everything built.
   4
   5 June 12, 1996 - fasta30t1
   6
   7         Fixed bug in reading blast-format DNA sequence files.
   8         Fixed core-dump for some large libraries on some machines.
   9
  10 June 19, 1996 - fasta30t2
  11
  12         Fixed a serious bug in the Smith-Waterman alignment routines used
  13         by both fasta3 (dropnfa.c) and ssearch3 (dropgsw.c) that caused
  14         the amount of memory required to depend on the library sequence
  15         size, rather than the query sequence size.
  16
  17         Fixed some memory-overwrite errors in showalign.c
  18
  19 June 27, 1996 - fasta30t3
  20
  21         Found and fixed bugs in comp_thr.c and nxgetaa.c that caused core
  22         dumps when reading DNA libraries with long sequences in fasta
  23         format.
  24
  25 July 6, 1996  - fasta30t4
  26
  27         ibm_pthread_subs.c available, Makefile.ibm for multiprocessor
  28         IBM RS/6000 AIX systems.
  29
  30         Finally (?) fixed the previous bug that caused core dumps when
  31         reading DNA libraries in fasta format.
  32
  33         Corrections to the fastx algorithm.
  34
  35 July 10, 1996
  36
  37         Fixed reading of compressed GCG DNA format.
  38