binaries/src/fasta34/rna.mat

   1 #  Sample rna matrix with +2 for G:A, TU:C
   2    A  C  G  T  U  R  Y  M  W  S  K  D  H  V  B  N  X
   3 A  5 -4  2 -4 -4  2 -1  2  2 -1 -1  1  1  1 -2 -1 -1
   4 C -4  5 -4  2  2 -1  2  2 -1  2 -1 -2  1  1  1 -1 -1
   5 G  2 -4  5 -4 -4  2 -1 -1 -1  2  2  1 -2  1  1 -1 -1
   6 T -4  2 -4  5  5 -1  2 -1  2 -1  2  1  1 -2  1 -1 -1
   7 U -4  2 -4  5  5 -1  2 -1  2 -1  2  1  1 -2  1 -1 -1
   8 R  2 -1  2 -1 -1  2 -2 -1  1  1  1  1 -1  1 -1 -1 -1
   9 Y -1  2 -1  2  2 -2  2 -1  1  1  1 -1  1 -1  1 -1 -1
  10 M  2  2 -1 -1 -1 -1 -1  2  1  1 -1 -1  1  1 -1 -1 -1
  11 W  2 -1 -1  2  2  1  1  1  2 -1  1  1  1 -1 -1 -1 -1
  12 S -1  2  2 -1 -1  1  1  1 -1  2  1 -1 -1  1  1 -1 -1
  13 K -1 -1  2  2  2  1  1 -1  1  1  2  1 -1 -1  1 -1 -1
  14 D  1 -2  1  1  1  1 -1 -1  1 -1  1  1 -1 -1 -1 -1 -1
  15 H  1  1 -2  1  1 -1  1  1  1 -1 -1 -1  1 -1 -1 -1 -1
  16 V  1  1  1 -2 -2  1 -1  1 -1  1 -1 -1 -1  1 -1 -1 -1
  17 B -2  1  1  1  1 -1  1 -1 -1  1  1 -1 -1 -1  1 -1 -1
  18 N -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1
  19 X -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1