binaries/src/mafft/core/dummy.c

   1 #include "mltaln.h"
   2
   3 #define ALNLEN 1e5
   4
   5 int main()
   6 {
   7         int res;
   8         static int nlen[M];
   9         static char name[M][B];
  10         static char **seq;
  11
  12         seq = AllocateCharMtx( 2, ALNLEN );
  13
  14         njob = 2;
  15         strcpy( name[0], ">name1" );
  16         strcpy( name[1], ">name2" );
  17         strcpy( seq[0], "atgcctaatgccgta" );
  18         strcpy( seq[1], "atgccgtaatgccgta" );
  19
  20         nlen[0] = strlen( seq[0] );
  21         nlen[1] = strlen( seq[1] );
  22         nlenmax = MAX( nlen[0], nlen[1] );
  23
  24         dorp = 'd';
  25         scoremtx = -1;
  26
  27         res = disttbfast( seq, nlen, name );
  28
  29         fprintf( stdout, "%s\n", name[0] );
  30         fprintf( stdout, "%s\n", seq[0] );
  31         fprintf( stdout, "%s\n", name[1] );
  32         fprintf( stdout, "%s\n", seq[1] );
  33         return( res );
  34 }