binaries/src/muscle/clustset.h

   1 #ifndef ClustSet_h\r
   2 #define ClustSet_h\r
   3 \r
   4 enum JOIN;\r
   5 enum LINKAGE;\r
   6 class Clust;\r
   7 \r
   8 class ClustSet\r
   9         {\r
  10 public:\r
  11         virtual unsigned GetLeafCount() = 0;\r
  12         virtual double ComputeDist(const Clust &C, unsigned uNodeIndex1,\r
  13           unsigned uNodeIndex2) = 0;\r
  14         virtual void JoinNodes(const Clust &C, unsigned uLeftNodeIndex,\r
  15           unsigned uRightNodeIndex, unsigned uJoinedNodeIndex,\r
  16           double *ptrdLeftLength, double *ptrdRightLength) = 0;\r
  17         virtual const char *GetLeafName(unsigned uNodeIndex) = 0;\r
  18         virtual unsigned GetLeafId(unsigned uNodeIndex) = 0;\r
  19         };\r
  20 \r
  21 #endif  // ClustSet_h\r