website/download.html

   1 <!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Strict//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-strict.dtd">\r
   2 <html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">\r
   3 <head>\r
   4 <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1" />\r
   5 <title>Java Bioinformatics Analysis Web Services (JABAWS) download page</title>\r
   6 <link href="ws.css" rel="stylesheet" type="text/css" />\r
   7 <script type="text/javascript" src="prototype-1.6.0.3.js"></script>\r
   8 \r
   9 </head>\r
  10 <body>\r
  11 <div id="page">\r
  12 <div id="banner">\r
  13 <h2><span class="headeru">JA</span>va <span class="headeru">B</span>ioinformatics <span class="headeru">A</span>nalyses <span class="headeru">W</span>eb <span class="headeru">S</span>ervices<h2>\r
  14 </div><!-- banner end-->\r
  15 <div id="wrapper">\r
  16 <div id="panel">\r
  17         <a href="index.html">Home</a>\r
  18         <a href="manual.html">Manual</a>\r
  19         <a href="howto.html">How To</a>\r
  20         <a class="selected"  href="download.html">Download</a>\r
  21         <a href="http://www.jalview.org">Jalview</a>\r
  22 </div>\r
  23 <!-- panel end-->\r
  24 <div id="content">\r
  25 \r
  26 <h4><a name="minclient" id="minclient"></a>JABAWS Client</h4>\r
  27 <p>\r
  28 For anyone who would like to program against JABA Web Services or use a command line client.\r
  29 <a href="http://www.compbio.dundee.ac.uk/jaba/archive/min-jaba-client.jar">Download</a> (64k)</p>\r
  30 \r
  31 <h4>JABAWS Server</h4>\r
  32 <p>\r
  33 Download this if you intend to run JABAWS for your lab/university locally. \r
  34 <ul>\r
  35 <li>A Complete Server for all platforms: <a href="http://www.compbio.dundee.ac.uk/jaba/archive/jaba.war">download</a> (45M)</li>\r
  36 <li>A Complete Server for windows: <a href="http://www.compbio.dundee.ac.uk/jaba/archive/jaba-windows.war">download</a> (16M)</li>\r
  37 </ul>\r
  38 </p>\r
  39 \r
  40 <div class="source">\r
  41 <div class="header collapsed" onclick="$(this).toggleClassName('collapsed'); $(this).next('.body').toggleClassName('collapsed');" title="Click to open/close">Packages for experts</div> <div class="body collapsed">\r
  42         <h4>JABAWS server without alignment programs</h4>\r
  43         <p>If you have all the programs or wish to download them separately this package is for you</p>\r
  44         <p>Complete Server without native executables: <a href="http://www.compbio.dundee.ac.uk/jaba/archive/jaba-no-binaries.war">download</a> (14M)  </p>\r
  45         <h4>JABAWS server without JAX-WS</h4>\r
  46         <p>\r
  47                 Download this if you intend to run JABAWS for your lab/institute locally. \r
  48                 This package does not contain <a href="https://jax-ws.dev.java.net/">JAX-WS</a> libraries required to run JABAWS. This package is intended for anyone who have JAX-WS libraries already installed on their web application servers. In this case JABAWS will be using the libraries supplied by your web application server. This way you can avoid any version conflicts.      </p>\r
  49                 <ul>\r
  50                 <li>Server for all platforms: <a href="http://www.compbio.dundee.ac.uk/jaba/archive/jaba-no-jaxws.war">download</a> (31M)</li>\r
  51                 <li>Server for windows: <a href="http://www.compbio.dundee.ac.uk/jaba/archive/jaba-no-jaxws-windows.war">download</a> (2M)</li>\r
  52                 <li>Server without binaries: <a href="http://www.compbio.dundee.ac.uk/jaba/archive/jaba-no-jaxws-no-binaries.war">download</a> (&lt;1M) </li>\r
  53                 </ul>\r
  54 \r
  55 \r
  56 <h4>JABAWS framework </h4>\r
  57 <p>\r
  58 This package is for developers who would like to use JABAWS code to control native executables in local or cluster environments. It is a JABA code without web services part. \r
  59 <ul>\r
  60   <li>A framework package: <a href="http://www.compbio.dundee.ac.uk/jaba/archive/full-jaba-client-pack.zip">download</a>(31M)</li>\r
  61 </ul>\r
  62 </p>\r
  63 \r
  64 <h4>A complete source code</h4>\r
  65 <p>We offer the code under <a href="http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0.txt">Apache version 2 licence</a> please feel free to download and use our product as well as the source code.\r
  66 Code comes in the form of an <a href="http://www.eclipse.org">Eclipse</a> project. However, Eclipse is not necessary to run it. Look into build.xml Ant task to find a variety of useful tasks among them are the tasks to run test cases.\r
  67 <ul>\r
  68   <li>\r
  69 A complete eclipse project package: <a href="http://www.compbio.dundee.ac.uk/jaba/archive/jaba-project.zip">download</a> (82M)</li>\r
  70   <li>Source only package: <a href="archive/jaba-source.jar">download</a> (25K) </li>\r
  71 </ul>\r
  72 </p>\r
  73 </div><!--body end -->\r
  74 </div> <!--source end -->\r
  75 </div>\r
  76 <!-- content end--> \r
  77 <div id="copyright">Last update: 7 July 2010<br/>\r
  78 Peter Troshin and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
  79 </div><!-- wrapper end-->\r
  80 </div> <!-- page end-->\r
  81 \r
  82 </body>\r
  83 </html>\r
  84 \r