binaries/linux_x86/fasta34/Makefile.nmk_icl

   1 #
   2 # makefile for fasta3, fasta3_t.  Use makefile.pvm for pvcompxx.
   3 #
   4 # options for Intel C compiler (v9.1)
   5 #
   6 # must be compiled/linked with /MT (or /MTd for debugging) to ensure
   7 # multi-threaded staticly linked executables.  /MD uses dynamic
   8 # linking to DLL's, which may not be available on the users machine
   9
  10 CC= icl /O2 /MT /W1
  11 #CC= icl /Zi /MTd /W1
  12 CL= icl /O2 /MT
  13 #CL= icl /Zi /MTd
  14
  15 # standard options
  16 CFLAGS= -DSHOWSIM -DWIN32 -DHZ=100 -DPROGRESS -DSAMP_STATS -DPGM_DOC -DTHR_EXIT=pthread_exit -D_CRT_SECURE_NO_WARNINGS=1
  17
  18 XDIR = /seqprg/bin
  19
  20 THR_SUBS = pthr_subs2
  21 THR_LIBS= pthreadVC2.lib
  22
  23 DROPNFA_O = drop_nfa.obj
  24 DROPGSW_O = dropgsw.obj
  25 DROPGSW_SSE2_O = dropgsw_sse2.obj smith_waterman_sse2.obj
  26 DROPRSS_O = dropnsw.obj
  27 DROPRSS_SSE2_O = dropgsw_sse2.obj smith_waterman_sse2.obj
  28 #
  29
  30 # renamed (fasta33)  programs
  31 include Makefile34.nmk_com
  32 # conventional (fasta3) names
  33 # include Makefile.common
  34