binaries/src/MSAProbs-0.9.7/MSAProbs/Makefile

   1
   2 CXXOBJS = MSA.o MSAGuideTree.o MSAClusterTree.o MSAPartProbs.o MSAReadMatrix.o main.o
   3
   4 OPENMP = -fopenmp
   5 CXX = g++
   6 COMMON_FLAGS = -O3 $(OPENMP) -Wall -funroll-loops -I . -I /usr/include
   7 CXXFLAGS = $(COMMON_FLAGS)
   8
   9 EXEC = msaprobs
  10
  11 all: $(CXXOBJS)
  12         $(CXX) $(CXXFLAGS) -o $(EXEC) $(CXXOBJS) $(NVCCOBJS) $(NVCCLIBS)
  13         strip $(EXEC)
  14 clean:
  15         rm -rf *.o $(EXEC)
  16