binaries/src/ViennaRNA/doc/latex/group__local__consensus__fold.eps

   1 %!PS-Adobe-3.0
   2 %%Creator: graphviz version 2.26.0 (20091210.2329)
   3 %%Title: structs
   4 %%Pages: (atend)
   5 %%BoundingBox: (atend)
   6 %%EndComments
   7 save
   8 %%BeginProlog
   9 /DotDict 200 dict def
  10 DotDict begin
  11
  12 /setupLatin1 {
  13 mark
  14 /EncodingVector 256 array def
  15  EncodingVector 0
  16
  17 ISOLatin1Encoding 0 255 getinterval putinterval
  18 EncodingVector 45 /hyphen put
  19
  20 % Set up ISO Latin 1 character encoding
  21 /starnetISO {
  22         dup dup findfont dup length dict begin
  23         { 1 index /FID ne { def }{ pop pop } ifelse
  24         } forall
  25         /Encoding EncodingVector def
  26         currentdict end definefont
  27 } def
  28 /Times-Roman starnetISO def
  29 /Times-Italic starnetISO def
  30 /Times-Bold starnetISO def
  31 /Times-BoldItalic starnetISO def
  32 /Helvetica starnetISO def
  33 /Helvetica-Oblique starnetISO def
  34 /Helvetica-Bold starnetISO def
  35 /Helvetica-BoldOblique starnetISO def
  36 /Courier starnetISO def
  37 /Courier-Oblique starnetISO def
  38 /Courier-Bold starnetISO def
  39 /Courier-BoldOblique starnetISO def
  40 cleartomark
  41 } bind def
  42
  43 %%BeginResource: procset graphviz 0 0
  44 /coord-font-family /Times-Roman def
  45 /default-font-family /Times-Roman def
  46 /coordfont coord-font-family findfont 8 scalefont def
  47
  48 /InvScaleFactor 1.0 def
  49 /set_scale {
  50        dup 1 exch div /InvScaleFactor exch def
  51        scale
  52 } bind def
  53
  54 % styles
  55 /solid { [] 0 setdash } bind def
  56 /dashed { [9 InvScaleFactor mul dup ] 0 setdash } bind def
  57 /dotted { [1 InvScaleFactor mul 6 InvScaleFactor mul] 0 setdash } bind def
  58 /invis {/fill {newpath} def /stroke {newpath} def /show {pop newpath} def} bind def
  59 /bold { 2 setlinewidth } bind def
  60 /filled { } bind def
  61 /unfilled { } bind def
  62 /rounded { } bind def
  63 /diagonals { } bind def
  64
  65 % hooks for setting color
  66 /nodecolor { sethsbcolor } bind def
  67 /edgecolor { sethsbcolor } bind def
  68 /graphcolor { sethsbcolor } bind def
  69 /nopcolor {pop pop pop} bind def
  70
  71 /beginpage {    % i j npages
  72         /npages exch def
  73         /j exch def
  74         /i exch def
  75         /str 10 string def
  76         npages 1 gt {
  77                 gsave
  78                         coordfont setfont
  79                         0 0 moveto
  80                         (\() show i str cvs show (,) show j str cvs show (\)) show
  81                 grestore
  82         } if
  83 } bind def
  84
  85 /set_font {
  86         findfont exch
  87         scalefont setfont
  88 } def
  89
  90 % draw text fitted to its expected width
  91 /alignedtext {                  % width text
  92         /text exch def
  93         /width exch def
  94         gsave
  95                 width 0 gt {
  96                         [] 0 setdash
  97                         text stringwidth pop width exch sub text length div 0 text ashow
  98                 } if
  99         grestore
 100 } def
 101
 102 /boxprim {                              % xcorner ycorner xsize ysize
 103                 4 2 roll
 104                 moveto
 105                 2 copy
 106                 exch 0 rlineto
 107                 0 exch rlineto
 108                 pop neg 0 rlineto
 109                 closepath
 110 } bind def
 111
 112 /ellipse_path {
 113         /ry exch def
 114         /rx exch def
 115         /y exch def
 116         /x exch def
 117         matrix currentmatrix
 118         newpath
 119         x y translate
 120         rx ry scale
 121         0 0 1 0 360 arc
 122         setmatrix
 123 } bind def
 124
 125 /endpage { showpage } bind def
 126 /showpage { } def
 127
 128 /layercolorseq
 129         [       % layer color sequence - darkest to lightest
 130                 [0 0 0]
 131                 [.2 .8 .8]
 132                 [.4 .8 .8]
 133                 [.6 .8 .8]
 134                 [.8 .8 .8]
 135         ]
 136 def
 137
 138 /layerlen layercolorseq length def
 139
 140 /setlayer {/maxlayer exch def /curlayer exch def
 141         layercolorseq curlayer 1 sub layerlen mod get
 142         aload pop sethsbcolor
 143         /nodecolor {nopcolor} def
 144         /edgecolor {nopcolor} def
 145         /graphcolor {nopcolor} def
 146 } bind def
 147
 148 /onlayer { curlayer ne {invis} if } def
 149
 150 /onlayers {
 151         /myupper exch def
 152         /mylower exch def
 153         curlayer mylower lt
 154         curlayer myupper gt
 155         or
 156         {invis} if
 157 } def
 158
 159 /curlayer 0 def
 160
 161 %%EndResource
 162 %%EndProlog
 163 %%BeginSetup
 164 14 default-font-family set_font
 165 1 setmiterlimit
 166 % /arrowlength 10 def
 167 % /arrowwidth 5 def
 168
 169 % make sure pdfmark is harmless for PS-interpreters other than Distiller
 170 /pdfmark where {pop} {userdict /pdfmark /cleartomark load put} ifelse
 171 % make '<<' and '>>' safe on PS Level 1 devices
 172 /languagelevel where {pop languagelevel}{1} ifelse
 173 2 lt {
 174     userdict (<<) cvn ([) cvn load put
 175     userdict (>>) cvn ([) cvn load put
 176 } if
 177
 178 %%EndSetup
 179 setupLatin1
 180 %%Page: 1 1
 181 %%PageBoundingBox: 36 36 622 106
 182 %%PageOrientation: Portrait
 183 0 0 1 beginpage
 184 gsave
 185 36 36 586 70 boxprim clip newpath
 186 1 1 set_scale 0 rotate 40 41 translate
 187 % Node2
 188 gsave
 189 [ /Rect [ 10 39.5 254 62.5 ]
 190   /Border [ 0 0 0 ]
 191   /Action << /Subtype /URI /URI ($group__consensus__fold.html) >>
 192   /Subtype /Link
 193 /ANN pdfmark
 194 1 setlinewidth
 195 0 0 0 nodecolor
 196 newpath 10 40 moveto
 197 10 62 lineto
 198 254 62 lineto
 199 254 40 lineto
 200 closepath stroke
 201 0 0 0 nodecolor
 202 10 /FreeSans set_font
 203 18 49 moveto 228 (Predicting Consensus Structures from Alignment\(s\)) alignedtext
 204 grestore
 205 % Node0
 206 gsave
 207 0 0 0.74902 nodecolor
 208 newpath 300 20 moveto
 209 300 42 lineto
 210 578 42 lineto
 211 578 20 lineto
 212 closepath fill
 213 1 setlinewidth
 214 filled
 215 0 0 0 nodecolor
 216 newpath 300 20 moveto
 217 300 42 lineto
 218 578 42 lineto
 219 578 20 lineto
 220 closepath stroke
 221 0 0 0 nodecolor
 222 10 /FreeSans set_font
 223 308 29 moveto 262 (Local MFE consensus structures for Sequence Alignments) alignedtext
 224 grestore
 225 % Node2->Node0
 226 gsave
 227 1 setlinewidth
 228 solid
 229 0.66667 0.77647 0.43922 edgecolor
 230 newpath 264.45 42.37 moveto
 231 276.14 41.61 288 40.84 299.75 40.07 curveto
 232 stroke
 233 0.66667 0.77647 0.43922 edgecolor
 234 newpath 263.97 38.9 moveto
 235 254.22 43.04 lineto
 236 264.42 45.88 lineto
 237 closepath fill
 238 1 setlinewidth
 239 solid
 240 0.66667 0.77647 0.43922 edgecolor
 241 newpath 263.97 38.9 moveto
 242 254.22 43.04 lineto
 243 264.42 45.88 lineto
 244 closepath stroke
 245 grestore
 246 % Node1
 247 gsave
 248 [ /Rect [ 1 -.5 263 22.5 ]
 249   /Border [ 0 0 0 ]
 250   /Action << /Subtype /URI /URI ($group__local__fold.html) >>
 251   /Subtype /Link
 252 /ANN pdfmark
 253 1 setlinewidth
 254 0 0 0 nodecolor
 255 newpath .5 0 moveto
 256 .5 22 lineto
 257 263.5 22 lineto
 258 263.5 0 lineto
 259 closepath stroke
 260 0 0 0 nodecolor
 261 10 /FreeSans set_font
 262 8.5 9 moveto 247 (Predicting Locally stable structures of large sequences) alignedtext
 263 grestore
 264 % Node1->Node0
 265 gsave
 266 1 setlinewidth
 267 solid
 268 0.66667 0.77647 0.43922 edgecolor
 269 newpath 273.73 20.23 moveto
 270 282.44 20.8 291.21 21.37 299.91 21.94 curveto
 271 stroke
 272 0.66667 0.77647 0.43922 edgecolor
 273 newpath 273.74 16.73 moveto
 274 263.53 19.57 lineto
 275 273.28 23.71 lineto
 276 closepath fill
 277 1 setlinewidth
 278 solid
 279 0.66667 0.77647 0.43922 edgecolor
 280 newpath 273.74 16.73 moveto
 281 263.53 19.57 lineto
 282 273.28 23.71 lineto
 283 closepath stroke
 284 grestore
 285 endpage
 286 showpage
 287 grestore
 288 %%PageTrailer
 289 %%EndPage: 1
 290 %%Trailer
 291 %%Pages: 1
 292 %%BoundingBox: 36 36 622 106
 293 end
 294 restore
 295 %%EOF