binaries/src/tcoffee/example/three_pdb.aln

   1 CLUSTAL FORMAT for T-COFFEE Version_4.32 [http://www.tcoffee.org], CPU=0.97 sec, SCORE=65, Nseq=3, Len=228
   2
   3 1FI8B           IIGGHEAKPHSRPYMAYLQIMYG---SKKCGGFLIREDFVLTAAHCS-GSKIQV-LGAHN
   4 1PPGE           IVGGRRARPHAWPFMVSLQLR-G---GHFCGATLIAPNFVMSAAHCVANVNVRVVLGAHN
   5 1NN6A           --GGTECKPHSRPYMAYLEIVTSNGPSKFCGGFLIRRNFVLTAAHCA-GRSITVTLGAHN
   6                   ** ..:**: *:*. *::  .   .: **. **  :**::****  . .: * *****
   7
   8 1FI8B           IKEQEKMQQIIPVVKIIPHPAYNSKTISNDIMLLKLKSKAKRSSAVKPLNLPRRNVKVKP
   9 1PPGE           LSRREPTRQVFAVQRIFENG-YDPVNLLNDIVILQLNGSATINANVQVAQLPAQGRRLGN
  10 1NN6A           ITEEEDTWQKLEVIKQFRHPKYNTSTLHHDIMLLKLKEKASLTLAVGTLPFPSQFNFVPP
  11                 :...*   * : * : : :  *:. .: :**::*:*: .*. .  *    :* :   :
  12
  13 1FI8B           GDVCYVAGWGKLGPMGKYSDTLQEVELTVQEDQKCESLKNYFDKANEICADPKIRASFRG
  14 1PPGE           GVQCLAMGWGLLGRNRGIASVLQELNVTVVTSL-C--------RRSNVCTLVRQAGVCFG
  15 1NN6A           GRMCRVAGWGRTGVLKPGSDTLQEVKLRLMDPQACSHFRD-FDHNLQLCVGNPRKTAFKG
  16                 *  * . ***  *     :..***::: :     *        :  ::*.         *
  17
  18 1FI8B           DSGGPLVCKKVAAGIVSYGQNDG--STPRAFTKVSTFLSWIKKTMK-K
  19 1PPGE           DSGSPLVCNGLIHGIASFVRGGCSGLYPDAFAPVAQFVNWIDSIIQ--
  20 1NN6A           DSGGPLLCAGVAQGIVSYGRSDA--KPPAVFTRISHYRPWINQILQAN
  21                 ***.**:*  :  **.*: :..     * .*: :: :  **.. ::
  22
  23
  24