website/archive/binaries/mac/src/fasta34/Makefile.sun_x86

   1 #
   2 # makefile for fasta3, fasta3_t.  Use makefile.pvm for pvcompxx.
   3
   4 # switches for 64-bit addressing - AMD64
   5 CC= cc -g -fast -xarch=amd64 -DSW_SSE2
   6
   7 # debugging options
   8 #CC= cc -g -DDEBUG -xarch=amd64 -DSW_SSE2
   9
  10 # for SUNMP, use -DTHR_EXIT=thr_exit
  11 # HZ=100 for Solaris x86
  12 # Solaris X86 is little endian - be certain IS_BIG_ENDIAN is not defined
  13
  14 CFLAGS= -DSHOWSIM -DUNIX -DTIMES -DHZ=100 -DBIGMEM -DSFCHAR="':'" -DMAX_WORKERS=2 -DTHR_EXIT=thr_exit -DPROGRESS -DFASTA_setscope -DUSE_MMAP -DBIG_LIB64 -DHAS_INTTYPES -D_LARGEFILE_SOURCE -D_LARGEFILE64_SOURCE -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -DUSE_FSEEKO -DM10_CONS -DSAMP_STATS -DPGM_DOC
  15 HFLAGS= -o
  16 NFLAGS= -o
  17
  18 # use -D_LARGEFILE_SOURCE -D_LARGEFILE64_SOURCE -D_FILE_OFFSET_BITS=64
  19 # for files > 2 GB
  20
  21 #for Sun pthreads (preferred, pthreads used on all other platforms)
  22 THR_SUBS = pthr_subs2
  23 THR_LIBS = -lpthread
  24 THR_CC =
  25
  26 #for Sun threads (no longer necessary as Sun supports pthreads)
  27 #THR_SUBS = uthr_subs2
  28 #THR_LIBS = -lthread
  29 #THR_CC =
  30
  31 LIB_M= -lmopt
  32 XDIR = /seqprg/bin
  33
  34 DROPNFA_O = drop_nfa.o
  35 DROPTFA_O = drop_tfa.o
  36 DROPGSW_O = dropgsw.o smith_waterman_sse2.o
  37 DROPRSS_O = dropnsw.o smith_waterman_sse2.o
  38
  39 # renamed (fasta34)  programs
  40 include Makefile34m.common
  41 # conventional (fasta3) names
  42 # include Makefile.common