website/dm_javadoc/overview-summary.html

   1 <!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/html4/loose.dtd">\r
   2 <!--NewPage-->\r
   3 <HTML>\r
   4 <HEAD>\r
   5 <!-- Generated by javadoc (build 1.6.0_24) on Fri Aug 12 14:32:04 BST 2011 -->\r
   6 <TITLE>\r
   7 Overview\r
   8 </TITLE>\r
   9 \r
  10 <META NAME="date" CONTENT="2011-08-12">\r
  11 \r
  12 <LINK REL ="stylesheet" TYPE="text/css" HREF="stylesheet.css" TITLE="Style">\r
  13 \r
  14 <SCRIPT type="text/javascript">\r
  15 function windowTitle()\r
  16 {\r
  17     if (location.href.indexOf('is-external=true') == -1) {\r
  18         parent.document.title="Overview";\r
  19     }\r
  20 }\r
  21 </SCRIPT>\r
  22 <NOSCRIPT>\r
  23 </NOSCRIPT>\r
  24 \r
  25 </HEAD>\r
  26 \r
  27 <BODY BGCOLOR="white" onload="windowTitle();">\r
  28 <HR>\r
  29 \r
  30 \r
  31 <!-- ========= START OF TOP NAVBAR ======= -->\r
  32 <A NAME="navbar_top"><!-- --></A>\r
  33 <A HREF="#skip-navbar_top" title="Skip navigation links"></A>\r
  34 <TABLE BORDER="0" WIDTH="100%" CELLPADDING="1" CELLSPACING="0" SUMMARY="">\r
  35 <TR>\r
  36 <TD COLSPAN=2 BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">\r
  37 <A NAME="navbar_top_firstrow"><!-- --></A>\r
  38 <TABLE BORDER="0" CELLPADDING="0" CELLSPACING="3" SUMMARY="">\r
  39   <TR ALIGN="center" VALIGN="top">\r
  40   <TD BGCOLOR="#FFFFFF" CLASS="NavBarCell1Rev"> &nbsp;<FONT CLASS="NavBarFont1Rev"><B>Overview</B></FONT>&nbsp;</TD>\r
  41   <TD BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">    <FONT CLASS="NavBarFont1">Package</FONT>&nbsp;</TD>\r
  42   <TD BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">    <FONT CLASS="NavBarFont1">Class</FONT>&nbsp;</TD>\r
  43   <TD BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">    <FONT CLASS="NavBarFont1">Use</FONT>&nbsp;</TD>\r
  44   <TD BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">    <A HREF="overview-tree.html"><FONT CLASS="NavBarFont1"><B>Tree</B></FONT></A>&nbsp;</TD>\r
  45   <TD BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">    <A HREF="deprecated-list.html"><FONT CLASS="NavBarFont1"><B>Deprecated</B></FONT></A>&nbsp;</TD>\r
  46   <TD BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">    <A HREF="index-files/index-1.html"><FONT CLASS="NavBarFont1"><B>Index</B></FONT></A>&nbsp;</TD>\r
  47   <TD BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">    <A HREF="help-doc.html"><FONT CLASS="NavBarFont1"><B>Help</B></FONT></A>&nbsp;</TD>\r
  48   </TR>\r
  49 </TABLE>\r
  50 </TD>\r
  51 <TD ALIGN="right" VALIGN="top" ROWSPAN=3><EM>\r
  52 </EM>\r
  53 </TD>\r
  54 </TR>\r
  55 \r
  56 <TR>\r
  57 <TD BGCOLOR="white" CLASS="NavBarCell2"><FONT SIZE="-2">\r
  58 &nbsp;PREV&nbsp;\r
  59 &nbsp;NEXT</FONT></TD>\r
  60 <TD BGCOLOR="white" CLASS="NavBarCell2"><FONT SIZE="-2">\r
  61   <A HREF="index.html?overview-summary.html" target="_top"><B>FRAMES</B></A>  &nbsp;\r
  62 &nbsp;<A HREF="overview-summary.html" target="_top"><B>NO FRAMES</B></A>  &nbsp;\r
  63 &nbsp;<SCRIPT type="text/javascript">\r
  64   <!--\r
  65   if(window==top) {\r
  66     document.writeln('<A HREF="allclasses-noframe.html"><B>All Classes</B></A>');\r
  67   }\r
  68   //-->\r
  69 </SCRIPT>\r
  70 <NOSCRIPT>\r
  71   <A HREF="allclasses-noframe.html"><B>All Classes</B></A>\r
  72 </NOSCRIPT>\r
  73 \r
  74 \r
  75 </FONT></TD>\r
  76 </TR>\r
  77 </TABLE>\r
  78 <A NAME="skip-navbar_top"></A>\r
  79 <!-- ========= END OF TOP NAVBAR ========= -->\r
  80 \r
  81 <HR>\r
  82 <CENTER>\r
  83 <H1>\r
  84 JABAWS 2 data model and a CMD client javadoc\r
  85 </H1>\r
  86 </CENTER>\r
  87 \r
  88 <TABLE BORDER="1" WIDTH="100%" CELLPADDING="3" CELLSPACING="0" SUMMARY="">\r
  89 <TR BGCOLOR="#CCCCFF" CLASS="TableHeadingColor">\r
  90 <TH ALIGN="left" COLSPAN="2"><FONT SIZE="+2">\r
  91 <B>Packages</B></FONT></TH>\r
  92 </TR>\r
  93 <TR BGCOLOR="white" CLASS="TableRowColor">\r
  94 <TD WIDTH="20%"><B><A HREF="compbio/data/msa/package-summary.html">compbio.data.msa</A></B></TD>\r
  95 <TD>Web Service interfaces for JAva Bioinformatics Analysis Web Services.</TD>\r
  96 </TR>\r
  97 <TR BGCOLOR="white" CLASS="TableRowColor">\r
  98 <TD WIDTH="20%"><B><A HREF="compbio/data/msa/jaxws/package-summary.html">compbio.data.msa.jaxws</A></B></TD>\r
  99 <TD>&nbsp;</TD>\r
 100 </TR>\r
 101 <TR BGCOLOR="white" CLASS="TableRowColor">\r
 102 <TD WIDTH="20%"><B><A HREF="compbio/data/sequence/package-summary.html">compbio.data.sequence</A></B></TD>\r
 103 <TD>A data model for multiple sequence alignment web services and utility methods
 104  that work on the objects of this model.</TD>\r
 105 </TR>\r
 106 <TR BGCOLOR="white" CLASS="TableRowColor">\r
 107 <TD WIDTH="20%"><B><A HREF="compbio/metadata/package-summary.html">compbio.metadata</A></B></TD>\r
 108 <TD>A meta-data model for multiple sequence alignment web services
 109  Classes in this package have no dependencies to other sources in the project.</TD>\r
 110 </TR>\r
 111 <TR BGCOLOR="white" CLASS="TableRowColor">\r
 112 <TD WIDTH="20%"><B><A HREF="compbio/ws/client/package-summary.html">compbio.ws.client</A></B></TD>\r
 113 <TD>A command line client and web services testing client for
 114  JAva Bioinformatics Analysis Web Services.</TD>\r
 115 </TR>\r
 116 </TABLE>\r
 117 \r
 118 <P>\r
 119 &nbsp;<HR>\r
 120 \r
 121 \r
 122 <!-- ======= START OF BOTTOM NAVBAR ====== -->\r
 123 <A NAME="navbar_bottom"><!-- --></A>\r
 124 <A HREF="#skip-navbar_bottom" title="Skip navigation links"></A>\r
 125 <TABLE BORDER="0" WIDTH="100%" CELLPADDING="1" CELLSPACING="0" SUMMARY="">\r
 126 <TR>\r
 127 <TD COLSPAN=2 BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">\r
 128 <A NAME="navbar_bottom_firstrow"><!-- --></A>\r
 129 <TABLE BORDER="0" CELLPADDING="0" CELLSPACING="3" SUMMARY="">\r
 130   <TR ALIGN="center" VALIGN="top">\r
 131   <TD BGCOLOR="#FFFFFF" CLASS="NavBarCell1Rev"> &nbsp;<FONT CLASS="NavBarFont1Rev"><B>Overview</B></FONT>&nbsp;</TD>\r
 132   <TD BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">    <FONT CLASS="NavBarFont1">Package</FONT>&nbsp;</TD>\r
 133   <TD BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">    <FONT CLASS="NavBarFont1">Class</FONT>&nbsp;</TD>\r
 134   <TD BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">    <FONT CLASS="NavBarFont1">Use</FONT>&nbsp;</TD>\r
 135   <TD BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">    <A HREF="overview-tree.html"><FONT CLASS="NavBarFont1"><B>Tree</B></FONT></A>&nbsp;</TD>\r
 136   <TD BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">    <A HREF="deprecated-list.html"><FONT CLASS="NavBarFont1"><B>Deprecated</B></FONT></A>&nbsp;</TD>\r
 137   <TD BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">    <A HREF="index-files/index-1.html"><FONT CLASS="NavBarFont1"><B>Index</B></FONT></A>&nbsp;</TD>\r
 138   <TD BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">    <A HREF="help-doc.html"><FONT CLASS="NavBarFont1"><B>Help</B></FONT></A>&nbsp;</TD>\r
 139   </TR>\r
 140 </TABLE>\r
 141 </TD>\r
 142 <TD ALIGN="right" VALIGN="top" ROWSPAN=3><EM>\r
 143 </EM>\r
 144 </TD>\r
 145 </TR>\r
 146 \r
 147 <TR>\r
 148 <TD BGCOLOR="white" CLASS="NavBarCell2"><FONT SIZE="-2">\r
 149 &nbsp;PREV&nbsp;\r
 150 &nbsp;NEXT</FONT></TD>\r
 151 <TD BGCOLOR="white" CLASS="NavBarCell2"><FONT SIZE="-2">\r
 152   <A HREF="index.html?overview-summary.html" target="_top"><B>FRAMES</B></A>  &nbsp;\r
 153 &nbsp;<A HREF="overview-summary.html" target="_top"><B>NO FRAMES</B></A>  &nbsp;\r
 154 &nbsp;<SCRIPT type="text/javascript">\r
 155   <!--\r
 156   if(window==top) {\r
 157     document.writeln('<A HREF="allclasses-noframe.html"><B>All Classes</B></A>');\r
 158   }\r
 159   //-->\r
 160 </SCRIPT>\r
 161 <NOSCRIPT>\r
 162   <A HREF="allclasses-noframe.html"><B>All Classes</B></A>\r
 163 </NOSCRIPT>\r
 164 \r
 165 \r
 166 </FONT></TD>\r
 167 </TR>\r
 168 </TABLE>\r
 169 <A NAME="skip-navbar_bottom"></A>\r
 170 <!-- ======== END OF BOTTOM NAVBAR ======= -->\r
 171 \r
 172 <HR>\r
 173 \r
 174 </BODY>\r
 175 </HTML>\r