website/full_javadoc/compbio/data/_structure/JpredAnnotation.html

   1 <!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/html4/loose.dtd">\r
   2 <!--NewPage-->\r
   3 <HTML>\r
   4 <HEAD>\r
   5 <!-- Generated by javadoc (build 1.6.0_24) on Fri Aug 12 14:32:35 BST 2011 -->\r
   6 <TITLE>\r
   7 JpredAnnotation\r
   8 </TITLE>\r
   9 \r
  10 <META NAME="date" CONTENT="2011-08-12">\r
  11 \r
  12 <LINK REL ="stylesheet" TYPE="text/css" HREF="../../../stylesheet.css" TITLE="Style">\r
  13 \r
  14 <SCRIPT type="text/javascript">\r
  15 function windowTitle()\r
  16 {\r
  17     if (location.href.indexOf('is-external=true') == -1) {\r
  18         parent.document.title="JpredAnnotation";\r
  19     }\r
  20 }\r
  21 </SCRIPT>\r
  22 <NOSCRIPT>\r
  23 </NOSCRIPT>\r
  24 \r
  25 </HEAD>\r
  26 \r
  27 <BODY BGCOLOR="white" onload="windowTitle();">\r
  28 <HR>\r
  29 \r
  30 \r
  31 <!-- ========= START OF TOP NAVBAR ======= -->\r
  32 <A NAME="navbar_top"><!-- --></A>\r
  33 <A HREF="#skip-navbar_top" title="Skip navigation links"></A>\r
  34 <TABLE BORDER="0" WIDTH="100%" CELLPADDING="1" CELLSPACING="0" SUMMARY="">\r
  35 <TR>\r
  36 <TD COLSPAN=2 BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">\r
  37 <A NAME="navbar_top_firstrow"><!-- --></A>\r
  38 <TABLE BORDER="0" CELLPADDING="0" CELLSPACING="3" SUMMARY="">\r
  39   <TR ALIGN="center" VALIGN="top">\r
  40   <TD BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">    <A HREF="../../../overview-summary.html"><FONT CLASS="NavBarFont1"><B>Overview</B></FONT></A>&nbsp;</TD>\r
  41   <TD BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">    <A HREF="package-summary.html"><FONT CLASS="NavBarFont1"><B>Package</B></FONT></A>&nbsp;</TD>\r
  42   <TD BGCOLOR="#FFFFFF" CLASS="NavBarCell1Rev"> &nbsp;<FONT CLASS="NavBarFont1Rev"><B>Class</B></FONT>&nbsp;</TD>\r
  43   <TD BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">    <A HREF="class-use/JpredAnnotation.html"><FONT CLASS="NavBarFont1"><B>Use</B></FONT></A>&nbsp;</TD>\r
  44   <TD BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">    <A HREF="package-tree.html"><FONT CLASS="NavBarFont1"><B>Tree</B></FONT></A>&nbsp;</TD>\r
  45   <TD BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">    <A HREF="../../../deprecated-list.html"><FONT CLASS="NavBarFont1"><B>Deprecated</B></FONT></A>&nbsp;</TD>\r
  46   <TD BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">    <A HREF="../../../index-files/index-1.html"><FONT CLASS="NavBarFont1"><B>Index</B></FONT></A>&nbsp;</TD>\r
  47   <TD BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">    <A HREF="../../../help-doc.html"><FONT CLASS="NavBarFont1"><B>Help</B></FONT></A>&nbsp;</TD>\r
  48   </TR>\r
  49 </TABLE>\r
  50 </TD>\r
  51 <TD ALIGN="right" VALIGN="top" ROWSPAN=3><EM>\r
  52 </EM>\r
  53 </TD>\r
  54 </TR>\r
  55 \r
  56 <TR>\r
  57 <TD BGCOLOR="white" CLASS="NavBarCell2"><FONT SIZE="-2">\r
  58 &nbsp;<A HREF="../../../compbio/data/_structure/JnetAnnotation.html" title="enum in compbio.data._structure"><B>PREV CLASS</B></A>&nbsp;\r
  59 &nbsp;<A HREF="../../../compbio/data/_structure/JpredResult.html" title="class in compbio.data._structure"><B>NEXT CLASS</B></A></FONT></TD>\r
  60 <TD BGCOLOR="white" CLASS="NavBarCell2"><FONT SIZE="-2">\r
  61   <A HREF="../../../index.html?compbio/data/_structure/JpredAnnotation.html" target="_top"><B>FRAMES</B></A>  &nbsp;\r
  62 &nbsp;<A HREF="JpredAnnotation.html" target="_top"><B>NO FRAMES</B></A>  &nbsp;\r
  63 &nbsp;<SCRIPT type="text/javascript">\r
  64   <!--\r
  65   if(window==top) {\r
  66     document.writeln('<A HREF="../../../allclasses-noframe.html"><B>All Classes</B></A>');\r
  67   }\r
  68   //-->\r
  69 </SCRIPT>\r
  70 <NOSCRIPT>\r
  71   <A HREF="../../../allclasses-noframe.html"><B>All Classes</B></A>\r
  72 </NOSCRIPT>\r
  73 \r
  74 \r
  75 </FONT></TD>\r
  76 </TR>\r
  77 <TR>\r
  78 <TD VALIGN="top" CLASS="NavBarCell3"><FONT SIZE="-2">\r
  79   SUMMARY:&nbsp;NESTED&nbsp;|&nbsp;<A HREF="#enum_constant_summary">ENUM CONSTANTS</A>&nbsp;|&nbsp;FIELD&nbsp;|&nbsp;<A HREF="#method_summary">METHOD</A></FONT></TD>\r
  80 <TD VALIGN="top" CLASS="NavBarCell3"><FONT SIZE="-2">\r
  81 DETAIL:&nbsp;<A HREF="#enum_constant_detail">ENUM CONSTANTS</A>&nbsp;|&nbsp;FIELD&nbsp;|&nbsp;<A HREF="#method_detail">METHOD</A></FONT></TD>\r
  82 </TR>\r
  83 </TABLE>\r
  84 <A NAME="skip-navbar_top"></A>\r
  85 <!-- ========= END OF TOP NAVBAR ========= -->\r
  86 \r
  87 <HR>\r
  88 <!-- ======== START OF CLASS DATA ======== -->\r
  89 <H2>\r
  90 <FONT SIZE="-1">\r
  91 compbio.data._structure</FONT>\r
  92 <BR>\r
  93 Enum JpredAnnotation</H2>\r
  94 <PRE>\r
  95 <A HREF="http://java.sun.com/javase/6/docs/api/java/lang/Object.html?is-external=true" title="class or interface in java.lang">java.lang.Object</A>\r
  96   <IMG SRC="../../../resources/inherit.gif" ALT="extended by "><A HREF="http://java.sun.com/javase/6/docs/api/java/lang/Enum.html?is-external=true" title="class or interface in java.lang">java.lang.Enum</A>&lt;<A HREF="../../../compbio/data/_structure/JpredAnnotation.html" title="enum in compbio.data._structure">JpredAnnotation</A>&gt;\r
  97       <IMG SRC="../../../resources/inherit.gif" ALT="extended by "><B>compbio.data._structure.JpredAnnotation</B>\r
  98 </PRE>\r
  99 <DL>\r
 100 <DT><B>All Implemented Interfaces:</B> <DD><A HREF="http://java.sun.com/javase/6/docs/api/java/io/Serializable.html?is-external=true" title="class or interface in java.io">Serializable</A>, <A HREF="http://java.sun.com/javase/6/docs/api/java/lang/Comparable.html?is-external=true" title="class or interface in java.lang">Comparable</A>&lt;<A HREF="../../../compbio/data/_structure/JpredAnnotation.html" title="enum in compbio.data._structure">JpredAnnotation</A>&gt;</DD>\r
 101 </DL>\r
 102 <HR>\r
 103 <DL>\r
 104 <DT><PRE>public enum <B>JpredAnnotation</B><DT>extends <A HREF="http://java.sun.com/javase/6/docs/api/java/lang/Enum.html?is-external=true" title="class or interface in java.lang">Enum</A>&lt;<A HREF="../../../compbio/data/_structure/JpredAnnotation.html" title="enum in compbio.data._structure">JpredAnnotation</A>&gt;</DL>\r
 105 </PRE>\r
 106 \r
 107 <P>\r
 108 <HR>\r
 109 \r
 110 <P>\r
 111 <!-- =========== ENUM CONSTANT SUMMARY =========== -->\r
 112 \r
 113 <A NAME="enum_constant_summary"><!-- --></A>\r
 114 <TABLE BORDER="1" WIDTH="100%" CELLPADDING="3" CELLSPACING="0" SUMMARY="">\r
 115 <TR BGCOLOR="#CCCCFF" CLASS="TableHeadingColor">\r
 116 <TH ALIGN="left" COLSPAN="2"><FONT SIZE="+2">\r
 117 <B>Enum Constant Summary</B></FONT></TH>\r
 118 </TR>\r
 119 <TR BGCOLOR="white" CLASS="TableRowColor">\r
 120 <TD><CODE><B><A HREF="../../../compbio/data/_structure/JpredAnnotation.html#JNETCONF">JNETCONF</A></B></CODE>\r
 121 \r
 122 <BR>\r
 123 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;</TD>\r
 124 </TR>\r
 125 <TR BGCOLOR="white" CLASS="TableRowColor">\r
 126 <TD><CODE><B><A HREF="../../../compbio/data/_structure/JpredAnnotation.html#JNETHMM">JNETHMM</A></B></CODE>\r
 127 \r
 128 <BR>\r
 129 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;</TD>\r
 130 </TR>\r
 131 <TR BGCOLOR="white" CLASS="TableRowColor">\r
 132 <TD><CODE><B><A HREF="../../../compbio/data/_structure/JpredAnnotation.html#jnetpred">jnetpred</A></B></CODE>\r
 133 \r
 134 <BR>\r
 135 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;</TD>\r
 136 </TR>\r
 137 <TR BGCOLOR="white" CLASS="TableRowColor">\r
 138 <TD><CODE><B><A HREF="../../../compbio/data/_structure/JpredAnnotation.html#JNETPROPE">JNETPROPE</A></B></CODE>\r
 139 \r
 140 <BR>\r
 141 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;</TD>\r
 142 </TR>\r
 143 <TR BGCOLOR="white" CLASS="TableRowColor">\r
 144 <TD><CODE><B><A HREF="../../../compbio/data/_structure/JpredAnnotation.html#JNETPROPH">JNETPROPH</A></B></CODE>\r
 145 \r
 146 <BR>\r
 147 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;</TD>\r
 148 </TR>\r
 149 <TR BGCOLOR="white" CLASS="TableRowColor">\r
 150 <TD><CODE><B><A HREF="../../../compbio/data/_structure/JpredAnnotation.html#JNETSOL0">JNETSOL0</A></B></CODE>\r
 151 \r
 152 <BR>\r
 153 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;</TD>\r
 154 </TR>\r
 155 <TR BGCOLOR="white" CLASS="TableRowColor">\r
 156 <TD><CODE><B><A HREF="../../../compbio/data/_structure/JpredAnnotation.html#JNETSOL25">JNETSOL25</A></B></CODE>\r
 157 \r
 158 <BR>\r
 159 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;</TD>\r
 160 </TR>\r
 161 <TR BGCOLOR="white" CLASS="TableRowColor">\r
 162 <TD><CODE><B><A HREF="../../../compbio/data/_structure/JpredAnnotation.html#JNETSOL5">JNETSOL5</A></B></CODE>\r
 163 \r
 164 <BR>\r
 165 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;</TD>\r
 166 </TR>\r
 167 </TABLE>\r
 168 &nbsp;\r
 169 <!-- ========== METHOD SUMMARY =========== -->\r
 170 \r
 171 <A NAME="method_summary"><!-- --></A>\r
 172 <TABLE BORDER="1" WIDTH="100%" CELLPADDING="3" CELLSPACING="0" SUMMARY="">\r
 173 <TR BGCOLOR="#CCCCFF" CLASS="TableHeadingColor">\r
 174 <TH ALIGN="left" COLSPAN="2"><FONT SIZE="+2">\r
 175 <B>Method Summary</B></FONT></TH>\r
 176 </TR>\r
 177 <TR BGCOLOR="white" CLASS="TableRowColor">\r
 178 <TD ALIGN="right" VALIGN="top" WIDTH="1%"><FONT SIZE="-1">\r
 179 <CODE>static&nbsp;<A HREF="../../../compbio/data/_structure/JpredAnnotation.html" title="enum in compbio.data._structure">JpredAnnotation</A></CODE></FONT></TD>\r
 180 <TD><CODE><B><A HREF="../../../compbio/data/_structure/JpredAnnotation.html#valueOf(java.lang.String)">valueOf</A></B>(<A HREF="http://java.sun.com/javase/6/docs/api/java/lang/String.html?is-external=true" title="class or interface in java.lang">String</A>&nbsp;name)</CODE>\r
 181 \r
 182 <BR>\r
 183 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;Returns the enum constant of this type with the specified name.</TD>\r
 184 </TR>\r
 185 <TR BGCOLOR="white" CLASS="TableRowColor">\r
 186 <TD ALIGN="right" VALIGN="top" WIDTH="1%"><FONT SIZE="-1">\r
 187 <CODE>static&nbsp;<A HREF="../../../compbio/data/_structure/JpredAnnotation.html" title="enum in compbio.data._structure">JpredAnnotation</A>[]</CODE></FONT></TD>\r
 188 <TD><CODE><B><A HREF="../../../compbio/data/_structure/JpredAnnotation.html#values()">values</A></B>()</CODE>\r
 189 \r
 190 <BR>\r
 191 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;Returns an array containing the constants of this enum type, in
 192 the order they are declared.</TD>\r
 193 </TR>\r
 194 </TABLE>\r
 195 &nbsp;<A NAME="methods_inherited_from_class_java.lang.Enum"><!-- --></A>\r
 196 <TABLE BORDER="1" WIDTH="100%" CELLPADDING="3" CELLSPACING="0" SUMMARY="">\r
 197 <TR BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="TableSubHeadingColor">\r
 198 <TH ALIGN="left"><B>Methods inherited from class java.lang.<A HREF="http://java.sun.com/javase/6/docs/api/java/lang/Enum.html?is-external=true" title="class or interface in java.lang">Enum</A></B></TH>\r
 199 </TR>\r
 200 <TR BGCOLOR="white" CLASS="TableRowColor">\r
 201 <TD><CODE><A HREF="http://java.sun.com/javase/6/docs/api/java/lang/Enum.html?is-external=true#compareTo(E)" title="class or interface in java.lang">compareTo</A>, <A HREF="http://java.sun.com/javase/6/docs/api/java/lang/Enum.html?is-external=true#equals(java.lang.Object)" title="class or interface in java.lang">equals</A>, <A HREF="http://java.sun.com/javase/6/docs/api/java/lang/Enum.html?is-external=true#getDeclaringClass()" title="class or interface in java.lang">getDeclaringClass</A>, <A HREF="http://java.sun.com/javase/6/docs/api/java/lang/Enum.html?is-external=true#hashCode()" title="class or interface in java.lang">hashCode</A>, <A HREF="http://java.sun.com/javase/6/docs/api/java/lang/Enum.html?is-external=true#name()" title="class or interface in java.lang">name</A>, <A HREF="http://java.sun.com/javase/6/docs/api/java/lang/Enum.html?is-external=true#ordinal()" title="class or interface in java.lang">ordinal</A>, <A HREF="http://java.sun.com/javase/6/docs/api/java/lang/Enum.html?is-external=true#toString()" title="class or interface in java.lang">toString</A>, <A HREF="http://java.sun.com/javase/6/docs/api/java/lang/Enum.html?is-external=true#valueOf(java.lang.Class, java.lang.String)" title="class or interface in java.lang">valueOf</A></CODE></TD>\r
 202 </TR>\r
 203 </TABLE>\r
 204 &nbsp;<A NAME="methods_inherited_from_class_java.lang.Object"><!-- --></A>\r
 205 <TABLE BORDER="1" WIDTH="100%" CELLPADDING="3" CELLSPACING="0" SUMMARY="">\r
 206 <TR BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="TableSubHeadingColor">\r
 207 <TH ALIGN="left"><B>Methods inherited from class java.lang.<A HREF="http://java.sun.com/javase/6/docs/api/java/lang/Object.html?is-external=true" title="class or interface in java.lang">Object</A></B></TH>\r
 208 </TR>\r
 209 <TR BGCOLOR="white" CLASS="TableRowColor">\r
 210 <TD><CODE><A HREF="http://java.sun.com/javase/6/docs/api/java/lang/Object.html?is-external=true#getClass()" title="class or interface in java.lang">getClass</A>, <A HREF="http://java.sun.com/javase/6/docs/api/java/lang/Object.html?is-external=true#notify()" title="class or interface in java.lang">notify</A>, <A HREF="http://java.sun.com/javase/6/docs/api/java/lang/Object.html?is-external=true#notifyAll()" title="class or interface in java.lang">notifyAll</A>, <A HREF="http://java.sun.com/javase/6/docs/api/java/lang/Object.html?is-external=true#wait()" title="class or interface in java.lang">wait</A>, <A HREF="http://java.sun.com/javase/6/docs/api/java/lang/Object.html?is-external=true#wait(long)" title="class or interface in java.lang">wait</A>, <A HREF="http://java.sun.com/javase/6/docs/api/java/lang/Object.html?is-external=true#wait(long, int)" title="class or interface in java.lang">wait</A></CODE></TD>\r
 211 </TR>\r
 212 </TABLE>\r
 213 &nbsp;\r
 214 <P>\r
 215 \r
 216 <!-- ============ ENUM CONSTANT DETAIL =========== -->\r
 217 \r
 218 <A NAME="enum_constant_detail"><!-- --></A>\r
 219 <TABLE BORDER="1" WIDTH="100%" CELLPADDING="3" CELLSPACING="0" SUMMARY="">\r
 220 <TR BGCOLOR="#CCCCFF" CLASS="TableHeadingColor">\r
 221 <TH ALIGN="left" COLSPAN="1"><FONT SIZE="+2">\r
 222 <B>Enum Constant Detail</B></FONT></TH>\r
 223 </TR>\r
 224 </TABLE>\r
 225 \r
 226 <A NAME="jnetpred"><!-- --></A><H3>\r
 227 jnetpred</H3>\r
 228 <PRE>\r
 229 public static final <A HREF="../../../compbio/data/_structure/JpredAnnotation.html" title="enum in compbio.data._structure">JpredAnnotation</A> <B>jnetpred</B></PRE>\r
 230 <DL>\r
 231 <DL>\r
 232 </DL>\r
 233 </DL>\r
 234 <HR>\r
 235 \r
 236 <A NAME="JNETCONF"><!-- --></A><H3>\r
 237 JNETCONF</H3>\r
 238 <PRE>\r
 239 public static final <A HREF="../../../compbio/data/_structure/JpredAnnotation.html" title="enum in compbio.data._structure">JpredAnnotation</A> <B>JNETCONF</B></PRE>\r
 240 <DL>\r
 241 <DL>\r
 242 </DL>\r
 243 </DL>\r
 244 <HR>\r
 245 \r
 246 <A NAME="JNETSOL25"><!-- --></A><H3>\r
 247 JNETSOL25</H3>\r
 248 <PRE>\r
 249 public static final <A HREF="../../../compbio/data/_structure/JpredAnnotation.html" title="enum in compbio.data._structure">JpredAnnotation</A> <B>JNETSOL25</B></PRE>\r
 250 <DL>\r
 251 <DL>\r
 252 </DL>\r
 253 </DL>\r
 254 <HR>\r
 255 \r
 256 <A NAME="JNETSOL5"><!-- --></A><H3>\r
 257 JNETSOL5</H3>\r
 258 <PRE>\r
 259 public static final <A HREF="../../../compbio/data/_structure/JpredAnnotation.html" title="enum in compbio.data._structure">JpredAnnotation</A> <B>JNETSOL5</B></PRE>\r
 260 <DL>\r
 261 <DL>\r
 262 </DL>\r
 263 </DL>\r
 264 <HR>\r
 265 \r
 266 <A NAME="JNETSOL0"><!-- --></A><H3>\r
 267 JNETSOL0</H3>\r
 268 <PRE>\r
 269 public static final <A HREF="../../../compbio/data/_structure/JpredAnnotation.html" title="enum in compbio.data._structure">JpredAnnotation</A> <B>JNETSOL0</B></PRE>\r
 270 <DL>\r
 271 <DL>\r
 272 </DL>\r
 273 </DL>\r
 274 <HR>\r
 275 \r
 276 <A NAME="JNETHMM"><!-- --></A><H3>\r
 277 JNETHMM</H3>\r
 278 <PRE>\r
 279 public static final <A HREF="../../../compbio/data/_structure/JpredAnnotation.html" title="enum in compbio.data._structure">JpredAnnotation</A> <B>JNETHMM</B></PRE>\r
 280 <DL>\r
 281 <DL>\r
 282 </DL>\r
 283 </DL>\r
 284 <HR>\r
 285 \r
 286 <A NAME="JNETPROPH"><!-- --></A><H3>\r
 287 JNETPROPH</H3>\r
 288 <PRE>\r
 289 public static final <A HREF="../../../compbio/data/_structure/JpredAnnotation.html" title="enum in compbio.data._structure">JpredAnnotation</A> <B>JNETPROPH</B></PRE>\r
 290 <DL>\r
 291 <DL>\r
 292 </DL>\r
 293 </DL>\r
 294 <HR>\r
 295 \r
 296 <A NAME="JNETPROPE"><!-- --></A><H3>\r
 297 JNETPROPE</H3>\r
 298 <PRE>\r
 299 public static final <A HREF="../../../compbio/data/_structure/JpredAnnotation.html" title="enum in compbio.data._structure">JpredAnnotation</A> <B>JNETPROPE</B></PRE>\r
 300 <DL>\r
 301 <DL>\r
 302 </DL>\r
 303 </DL>\r
 304 \r
 305 <!-- ============ METHOD DETAIL ========== -->\r
 306 \r
 307 <A NAME="method_detail"><!-- --></A>\r
 308 <TABLE BORDER="1" WIDTH="100%" CELLPADDING="3" CELLSPACING="0" SUMMARY="">\r
 309 <TR BGCOLOR="#CCCCFF" CLASS="TableHeadingColor">\r
 310 <TH ALIGN="left" COLSPAN="1"><FONT SIZE="+2">\r
 311 <B>Method Detail</B></FONT></TH>\r
 312 </TR>\r
 313 </TABLE>\r
 314 \r
 315 <A NAME="values()"><!-- --></A><H3>\r
 316 values</H3>\r
 317 <PRE>\r
 318 public static <A HREF="../../../compbio/data/_structure/JpredAnnotation.html" title="enum in compbio.data._structure">JpredAnnotation</A>[] <B>values</B>()</PRE>\r
 319 <DL>\r
 320 <DD>Returns an array containing the constants of this enum type, in
 321 the order they are declared.  This method may be used to iterate
 322 over the constants as follows:
 323 <pre>
 324 for (JpredAnnotation c : JpredAnnotation.values())
 325 &nbsp;   System.out.println(c);
 326 </pre>\r
 327 <P>\r
 328 <DD><DL>\r
 329 \r
 330 <DT><B>Returns:</B><DD>an array containing the constants of this enum type, in
 331 the order they are declared</DL>\r
 332 </DD>\r
 333 </DL>\r
 334 <HR>\r
 335 \r
 336 <A NAME="valueOf(java.lang.String)"><!-- --></A><H3>\r
 337 valueOf</H3>\r
 338 <PRE>\r
 339 public static <A HREF="../../../compbio/data/_structure/JpredAnnotation.html" title="enum in compbio.data._structure">JpredAnnotation</A> <B>valueOf</B>(<A HREF="http://java.sun.com/javase/6/docs/api/java/lang/String.html?is-external=true" title="class or interface in java.lang">String</A>&nbsp;name)</PRE>\r
 340 <DL>\r
 341 <DD>Returns the enum constant of this type with the specified name.
 342 The string must match <I>exactly</I> an identifier used to declare an
 343 enum constant in this type.  (Extraneous whitespace characters are
 344 not permitted.)\r
 345 <P>\r
 346 <DD><DL>\r
 347 <DT><B>Parameters:</B><DD><CODE>name</CODE> - the name of the enum constant to be returned.\r
 348 <DT><B>Returns:</B><DD>the enum constant with the specified name\r
 349 <DT><B>Throws:</B>\r
 350 <DD><CODE><A HREF="http://java.sun.com/javase/6/docs/api/java/lang/IllegalArgumentException.html?is-external=true" title="class or interface in java.lang">IllegalArgumentException</A></CODE> - if this enum type has no constant
 351 with the specified name\r
 352 <DD><CODE><A HREF="http://java.sun.com/javase/6/docs/api/java/lang/NullPointerException.html?is-external=true" title="class or interface in java.lang">NullPointerException</A></CODE> - if the argument is null</DL>\r
 353 </DD>\r
 354 </DL>\r
 355 <!-- ========= END OF CLASS DATA ========= -->\r
 356 <HR>\r
 357 \r
 358 \r
 359 <!-- ======= START OF BOTTOM NAVBAR ====== -->\r
 360 <A NAME="navbar_bottom"><!-- --></A>\r
 361 <A HREF="#skip-navbar_bottom" title="Skip navigation links"></A>\r
 362 <TABLE BORDER="0" WIDTH="100%" CELLPADDING="1" CELLSPACING="0" SUMMARY="">\r
 363 <TR>\r
 364 <TD COLSPAN=2 BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">\r
 365 <A NAME="navbar_bottom_firstrow"><!-- --></A>\r
 366 <TABLE BORDER="0" CELLPADDING="0" CELLSPACING="3" SUMMARY="">\r
 367   <TR ALIGN="center" VALIGN="top">\r
 368   <TD BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">    <A HREF="../../../overview-summary.html"><FONT CLASS="NavBarFont1"><B>Overview</B></FONT></A>&nbsp;</TD>\r
 369   <TD BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">    <A HREF="package-summary.html"><FONT CLASS="NavBarFont1"><B>Package</B></FONT></A>&nbsp;</TD>\r
 370   <TD BGCOLOR="#FFFFFF" CLASS="NavBarCell1Rev"> &nbsp;<FONT CLASS="NavBarFont1Rev"><B>Class</B></FONT>&nbsp;</TD>\r
 371   <TD BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">    <A HREF="class-use/JpredAnnotation.html"><FONT CLASS="NavBarFont1"><B>Use</B></FONT></A>&nbsp;</TD>\r
 372   <TD BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">    <A HREF="package-tree.html"><FONT CLASS="NavBarFont1"><B>Tree</B></FONT></A>&nbsp;</TD>\r
 373   <TD BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">    <A HREF="../../../deprecated-list.html"><FONT CLASS="NavBarFont1"><B>Deprecated</B></FONT></A>&nbsp;</TD>\r
 374   <TD BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">    <A HREF="../../../index-files/index-1.html"><FONT CLASS="NavBarFont1"><B>Index</B></FONT></A>&nbsp;</TD>\r
 375   <TD BGCOLOR="#EEEEFF" CLASS="NavBarCell1">    <A HREF="../../../help-doc.html"><FONT CLASS="NavBarFont1"><B>Help</B></FONT></A>&nbsp;</TD>\r
 376   </TR>\r
 377 </TABLE>\r
 378 </TD>\r
 379 <TD ALIGN="right" VALIGN="top" ROWSPAN=3><EM>\r
 380 </EM>\r
 381 </TD>\r
 382 </TR>\r
 383 \r
 384 <TR>\r
 385 <TD BGCOLOR="white" CLASS="NavBarCell2"><FONT SIZE="-2">\r
 386 &nbsp;<A HREF="../../../compbio/data/_structure/JnetAnnotation.html" title="enum in compbio.data._structure"><B>PREV CLASS</B></A>&nbsp;\r
 387 &nbsp;<A HREF="../../../compbio/data/_structure/JpredResult.html" title="class in compbio.data._structure"><B>NEXT CLASS</B></A></FONT></TD>\r
 388 <TD BGCOLOR="white" CLASS="NavBarCell2"><FONT SIZE="-2">\r
 389   <A HREF="../../../index.html?compbio/data/_structure/JpredAnnotation.html" target="_top"><B>FRAMES</B></A>  &nbsp;\r
 390 &nbsp;<A HREF="JpredAnnotation.html" target="_top"><B>NO FRAMES</B></A>  &nbsp;\r
 391 &nbsp;<SCRIPT type="text/javascript">\r
 392   <!--\r
 393   if(window==top) {\r
 394     document.writeln('<A HREF="../../../allclasses-noframe.html"><B>All Classes</B></A>');\r
 395   }\r
 396   //-->\r
 397 </SCRIPT>\r
 398 <NOSCRIPT>\r
 399   <A HREF="../../../allclasses-noframe.html"><B>All Classes</B></A>\r
 400 </NOSCRIPT>\r
 401 \r
 402 \r
 403 </FONT></TD>\r
 404 </TR>\r
 405 <TR>\r
 406 <TD VALIGN="top" CLASS="NavBarCell3"><FONT SIZE="-2">\r
 407   SUMMARY:&nbsp;NESTED&nbsp;|&nbsp;<A HREF="#enum_constant_summary">ENUM CONSTANTS</A>&nbsp;|&nbsp;FIELD&nbsp;|&nbsp;<A HREF="#method_summary">METHOD</A></FONT></TD>\r
 408 <TD VALIGN="top" CLASS="NavBarCell3"><FONT SIZE="-2">\r
 409 DETAIL:&nbsp;<A HREF="#enum_constant_detail">ENUM CONSTANTS</A>&nbsp;|&nbsp;FIELD&nbsp;|&nbsp;<A HREF="#method_detail">METHOD</A></FONT></TD>\r
 410 </TR>\r
 411 </TABLE>\r
 412 <A NAME="skip-navbar_bottom"></A>\r
 413 <!-- ======== END OF BOTTOM NAVBAR ======= -->\r
 414 \r
 415 <HR>\r
 416 \r
 417 </BODY>\r
 418 </HTML>\r