website/man_awscloud.html

   1 <?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>\r
   2 <!DOCTYPE html PUBLIC "XHTML 1.0 Strict"\r
   3 "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-strict.dtd">\r
   4 <html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">\r
   5 <head>\r
   6 <meta name="Last-modified" content="Mon, 4 Apr 2011 12:00:00 GMT"/>\r
   7 <title>Java Bioinformatics Analyses Web Services (JABAWS) Server Virtual Appliance Manual</title>\r
   8 <link href="ws.css" rel="stylesheet" type="text/css" media=\r
   9 "screen, projection, handheld, tv" />\r
  10 <link rel="stylesheet" type="text/css" media="print" href=\r
  11 "print.css" />\r
  12 <script type="text/javascript" src="prototype-1.6.0.3.js"></script>\r
  13 </head>\r
  14 <body>\r
  15 <div id="page">\r
  16 <div id="banner">\r
  17 <table> \r
  18 <tr><td style="width:158px;"><a href="http://www.dundee.ac.uk"><img src="images/uod_lt_long.gif"  alt="University of Dundee" width="158" height="90" class="logo"  title="University of Dundee" longdesc="http://www.dundee.ac.uk"/></a></td>\r
  19 <td class="bg"><img src="images/jabaws2.png" alt="JABAWS-2.0" title="Java Bioinformatics Analysis Web Services version 2.0"/></td>\r
  20 <td class="bg"><img src="images/banner_right.png" alt="Disorder" width="200" height="80"/></td>\r
  21 </tr>\r
  22 </table>\r
  23 </div><!-- banner end-->\r
  24 \r
  25 <div id="wrapper">\r
  26 <div id="panel"><a href="index.html">Home</a> \r
  27  <a href="quick_start.html">Getting Started</a> \r
  28  <a class="selected" href="man_about.html">Manual</a> \r
  29         <div id="submenu">\r
  30                 <a href="man_about.html">About</a>\r
  31                 <a href="man_servervm.html" title="JABAWS Server as Virtual Appliance">Server VA</a>\r
  32                 <a class="selected" href="man_awscloud.html" title="JABAWS Server in the Amazon EC2 Cloud">Server in the Cloud</a>\r
  33                 <a href="man_serverwar.html" title="JABAWS Server as Web Application aRchive">Server WAR</a>\r
  34                 <a href="man_configuration.html" >Server<br/>\r
  35                 Configuration</a>\r
  36                 <a href="man_client.html" title="JABAWS Command Line Client">CMD Client</a>\r
  37                 <a href="man_stats.html" title="JABAWS Usage Statistics">Usage Statistics</a>\r
  38                 <a href="man_dev.html" title="Accessing JABAWS from your program">Accessing<br/>\r
  39                 JABAWS</a>      \r
  40                 <a href="man_server_dev.html" >JABAWS Development</a>\r
  41         </div>\r
  42 <a href="http://www.compbio.dundee.ac.uk/download">Download</a> \r
  43 <a href="PublicAnnualStat" title="JABAWS usage statistics">Usage Statistics</a>\r
  44  <a href="ServiceStatus" title="JABAWS webservices status. Click to test all web services. Please be patient while the services are being checked">Services Status</a>\r
  45 <a href="contacts.html">Contact Us</a>\r
  46 <a href="http://www.compbio.dundee.ac.uk" title="University of Dundee, The Barton Group" >Barton Group</a>\r
  47 </div>\r
  48 \r
  49 <!-- panel end-->\r
  50 <div id="content">\r
  51 <h2 id="headtitle">JABAWS MANUAL</h2>\r
  52 \r
  53 <h2>JABAWS Server in the Amazon Cloud</h2>\r
  54 <ul>\r
  55   <li><a href="#jabawsOnCloud">JABAWS on the Cloud</a></li>\r
  56     <li><a href="man_awscloud_ec2.html">How to use JABAWS on the Amazon EC2 cloud</a></li>\r
  57     <li><a href="man_awscloud_bs.html">How to use JABAWS WAR on Amazon Elastic Beanstalk</a> </li>\r
  58 </ul>\r
  59 <div id="jabaws_on_cloud">\r
  60   <h3><a name="jabawsOnCloud" id="jabawsOnCloud"></a>JABAWS on the Cloud</h3>\r
  61   <p>We provide pre-configured JABAWS Amazon Machine Image (AMI) which you can use on the <a href="http://aws.amazon.com/what-is-aws">Amazon EC2 cloud</a>. Typical use cases are </p>\r
  62   <ul>\r
  63   <li>you need to perform large scale calculations but do not have the resources available locally </li>\r
  64   <li>your organization already uses the Amazon cloud and you do not want to do any special arrangements for the JABAWS  </li>\r
  65   <li>you want to benefit from the Amazon automatic scaling and monitoring to make sure JABAWS is always ready </li>\r
  66 </ul>\r
  67 <p>If you know what to do than JABAWS AMI ID is  <strong>ami-d1d5e9a5</strong>, manifest  <strong>846107356395/JABAWS 2</strong>   to get you started, if not please refer to <a href="man_awscloud_ec2.html">How to use JABAWS on the Amazon EC2 cloud</a> pages. </p>\r
  68 <p>Alternatively you can use JABAWS on the <a href="http://docs.amazonwebservices.com/elasticbeanstalk/latest/dg/index.html?GettingStarted.html">Amazon Elastic BeanStalk</a>. You may want to use this option to deploy JABAWS in the cluster configuration.</p>\r
  69 </div>   \r
  70 <!-- end of jabaws_on_cloud div -->\r
  71 </div>\r
  72 <!-- content end-->\r
  73 <div id="copyright">Last update: 16 September 2011<br />\r
  74  Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of\r
  75 Dundee, UK</div>\r
  76 </div>\r
  77 \r
  78 <!-- wrapper end-->\r
  79 </div>\r
  80 <!-- page end-->\r
  81 \r
  82 <!-- Google analitics -->\r
  83 <script type="text/javascript">\r
  84 var gaJsHost = (("https:" == document.location.protocol) ? "https://ssl." : "http://www.");\r
  85 document.write(unescape("%3Cscript src='" + gaJsHost + "google-analytics.com/ga.js' type='text/javascript'%3E%3C/script%3E"));\r
  86 </script>\r
  87 <script type="text/javascript">\r
  88 try{\r
  89 var pageTracker = _gat._getTracker("UA-5356328-1");\r
  90 pageTracker._trackPageview();\r
  91 } catch(err) {}\r
  92 </script>\r
  93 </body>\r
  94 </html>\r
  95 \r