website/quick_start.html

   1 <?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>\r
   2 <!DOCTYPE html PUBLIC "XHTML 1.0 Strict" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-strict.dtd">\r
   3 <html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">\r
   4 <head>\r
   5 <meta name="Last-modified" content="Fri, 28 Jun 2013 12:00:00 GMT"/>\r
   6 <title>Java Bioinformatics Analyses Web Services (JABAWS) manual - getting started</title>\r
   7 <link href="ws.css" rel="stylesheet" type="text/css" media="screen,  projection, handheld, tv" />\r
   8 <link rel="stylesheet" type="text/css" media="print" href="print.css"/>\r
   9 <script type="text/javascript" src="prototype-1.6.0.3.js"></script>\r
  10 </head>\r
  11 \r
  12 <body>\r
  13 <div id="page">\r
  14 <div id="banner">\r
  15 <table>\r
  16 <tr><td style="width:158px;"><a href="http://www.dundee.ac.uk"><img src="images/uod_lt_long.gif"  alt="University of Dundee" width="158" height="90" class="logo"  title="University of Dundee" longdesc="http://www.dundee.ac.uk"/></a></td>\r
  17 <td class="bg"><img src="images/jabaws25.png" width="263" height="60" alt="JABAWS-2.5" title="Java Bioinformatics Analysis Web Services version 2.5"/></td>\r
  18 <td class="bg"><img src="images/banner_right.png" alt="Disorder" width="200" height="80"/></td>\r
  19 </tr>\r
  20 </table>\r
  21 </div><!-- banner end-->\r
  22 \r
  23 <div id="wrapper">\r
  24 <div id="panel">\r
  25   <a href="index.html">Home</a>\r
  26   <a class="selected" href="quick_start.html">Getting Started</a> \r
  27   <a href="man_about.html">Manual</a> \r
  28   <a href="http://www.compbio.dundee.ac.uk/download">Download</a>\r
  29   <a href="PublicAnnualStat" title="JABAWS server usage statistics">Usage Statistics</a>\r
  30   <a href="ServiceStatus" title="JABAWS webservices status. Click to test all web services. Please be patient while the services are being checked">Services Status</a>\r
  31   <a href="contacts.html">Contact Us</a>\r
  32   <a href="http://www.compbio.dundee.ac.uk" title="University of Dundee, The Barton Group" >Barton Group</a>\r
  33   <a href="jabaws_funding.html">Funding</a>\r
  34 </div>\r
  35 <!-- panel end-->\r
  36 \r
  37 \r
  38 <div id="content">\r
  39 <h2 id="headtitle">Getting Started</h2>\r
  40 <h3><a name="whichjaba" id="whichjaba"></a>Choose a JABAWS distribution</h3>\r
  41 <table id="choicematrix">\r
  42 <tr>\r
  43   <th>I want to use JABAWS for...</th>\r
  44   <th>Quick Guide</th>\r
  45 </tr>\r
  46 <tr>\r
  47   <td>Running Muptiple Sequence Alignments through Jalview on my <strong>own</strong> computer</td>\r
  48   <td><a href="manual_qs_va.html#qsc">JABAWS Virtual Appliance (VA)</a></td>\r
  49 </tr>\r
  50 <tr>\r
  51   <td>Running JABAWS  on the <strong>cloud</strong>, for one or many users</td>\r
  52   <td><a href="manual_qs_amazon.html#qsc">JABAWS on the Amazon cloud</a></td>\r
  53 </tr>\r
  54 <tr>\r
  55   <td>Running JABAWS for my group, lab, or organization on the <strong>local</strong> infrastructure </td>\r
  56   <td><a href="manual_qs_war.html#qsc">JABAWS Web Application aRchive (WAR)</a></td>\r
  57 </tr>\r
  58 <tr>\r
  59   <td>Accessing a JABAWS server from my own code</td>\r
  60   <td><a href="manual_qs_client.html#qsc">JABAWS Java Client</a></td>\r
  61 </tr>\r
  62 </table>\r
  63 </div><!-- content end--> \r
  64 <div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
  65 </div><!-- wrapper end-->\r
  66 </div> <!-- page end-->\r
  67 \r
  68 \r
  69 <!-- Google analitics -->\r
  70 <script type="text/javascript">\r
  71 var gaJsHost = (("https:" == document.location.protocol) ? "https://ssl." : "http://www.");\r
  72 document.write(unescape("%3Cscript src='" + gaJsHost + "google-analytics.com/ga.js' type='text/javascript'%3E%3C/script%3E"));\r
  73 </script>\r
  74 <script type="text/javascript">\r
  75 try{\r
  76 var pageTracker = _gat._getTracker("UA-5356328-1");\r
  77 pageTracker._trackPageview();\r
  78 } catch(err) {}\r
  79 </script>\r
  80 </body>\r
  81 </html>\r