git://source.jalview.org / jabaws.git / blobdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | inline | side by side
WSTester updated to work plus hopefully all the other changes that need to go into...
[jabaws.git] / binaries / src / ViennaRNA / Kinfold / Example / traj.e
diff --git a/binaries/src/ViennaRNA/Kinfold/Example/traj.e b/binaries/src/ViennaRNA/Kinfold/Example/traj.e
new file mode 100644 (file)
index 0000000..2c7c6fa
--- /dev/null
+++ b/binaries/src/ViennaRNA/Kinfold/Example/traj.e
@@ -0,0 +1,219 @@
+...............   0.00      0.596  24 i 1
+.......(....)..   2.10      0.746  10 d 0
+...............   0.00      0.864  24 i 1
+(.......)......   4.20      0.912   9 d 0
+...............   0.00      1.171  24 i 1
+.......(......)   3.20      1.380   9 d 0
+...............   0.00      4.876  24 i 1
+...(........)..   1.80      4.950  12 S 0
+.......(....)..   2.10      5.137  10 d 0
+...............   0.00      5.559  24 i 1
+..(......).....   4.80      5.577  10 d 0
+...............   0.00      6.931  24 i 1
+.......(....)..   2.10      6.970  10 d 0
+...............   0.00      7.341  24 i 1
+...(........)..   1.80      7.626  12 d 0
+...............   0.00      8.780  24 i 1
+...(........)..   1.80      8.972  12 i 0
+...((......))..   0.70      9.298   9 i 0
+..(((......))).   0.20      9.438   8 i 0
+..((((....)))).  -0.60      9.495   6 _ 1 X1
+...............   0.00      2.988  24 i 1
+.(........)....   2.80      3.023  12 d 0
+...............   0.00      4.665  24 i 1
+...(.......)...   5.80      4.672  12 s 0
+...(........)..   1.80      4.693  12 i 0
+..((........)).   1.30      5.012  11 i 0
+..(((......))).   0.20      5.167   8 i 0
+..((((....)))).  -0.60      5.325   6 _ 1 X1
+...............   0.00      1.603  24 i 1
+..(....).......   4.20      1.619  13 d 0
+...............   0.00      1.951  24 i 1
+....(......)...   4.80      1.958  11 d 0
+...............   0.00      3.732  24 i 1
+.......(....)..   2.10      3.832  10 d 0
+...............   0.00      3.895  24 i 1
+...(........)..   1.80      3.918  12 d 0
+...............   0.00      4.104  24 i 1
+.......(....)..   2.10      4.131  10 S 0
+...(........)..   1.80      4.345  12 d 0
+...............   0.00      4.448  24 i 1
+...(........)..   1.80      4.513  12 i 0
+..((........)).   1.30      4.796  11 i 0
+..(((......))).   0.20      5.229   8 i 0
+..((((....)))).  -0.60      6.008   6 _ 1 X1
+...............   0.00      0.993  24 i 1
+.......(....)..   2.10      1.190  10 d 0
+...............   0.00      1.262  24 i 1
+...(.......)...   5.80      1.269  12 d 0
+...............   0.00      1.981  24 i 1
+.......(....)..   2.10      2.028  10 d 0
+...............   0.00      2.529  24 i 1
+.......(....)..   2.10      2.546  10 d 0
+...............   0.00      2.639  24 i 1
+(..........)...   5.40      2.643  16 i 0
+((........))...   2.10      2.980  11 i 0
+(((......)))...   1.30      3.028   7 i 0
+((((....))))...   0.40      4.194   5 _ 1 X2
+...............   0.00      0.054  24 i 1
+(..........)...   5.40      0.057  16 d 0
+...............   0.00      0.110  24 i 1
+.(.....).......   3.10      0.445  10 i 0
+((.....))......   1.80      3.483   6 d 1
+.(.....).......   3.10      3.574  10 s 0
+.(........)....   2.80      3.627  12 i 0
+((........))...   2.10      4.287  11 i 0
+(((......)))...   1.30      4.882   7 i 0
+((((....))))...   0.40      5.419   5 _ 1 X2
+...............   0.00      0.253  24 i 1
+....(......)...   4.80      0.256  11 d 0
+...............   0.00      0.383  24 i 1
+.......(....)..   2.10      0.466  10 d 0
+...............   0.00      1.275  24 i 1
+.(........)....   2.80      1.294  12 d 0
+...............   0.00      1.562  24 i 1
+...(.......)...   5.80      1.563  12 d 0
+...............   0.00      1.671  24 i 1
+...(........)..   1.80      1.957  12 S 0
+.......(....)..   2.10      2.029  10 d 0
+...............   0.00      2.409  24 i 1
+.....(.......).   5.50      2.418  10 d 2
+...............   0.00      2.421  24 i 1
+.......(......)   3.20      2.489   9 d 0
+...............   0.00      3.678  24 i 1
+.......(......)   3.20      3.814   9 s 0
+.......(....)..   2.10      3.820  10 s 0
+.......(......)   3.20      3.887   9 d 0
+...............   0.00      4.415  24 i 1
+..(..........).   5.20      4.438  16 d 0
+...............   0.00      5.269  24 i 1
+...(........)..   1.80      5.396  12 d 0
+...............   0.00      5.825  24 i 1
+.(.....).......   3.10      5.911  10 d 0
+...............   0.00      6.122  24 i 1
+.......(....)..   2.10      6.336  10 s 0
+.(.....).......   3.10      6.346  10 d 0
+...............   0.00      8.023  24 i 1
+.(........)....   2.80      8.126  12 d 0
+...............   0.00      8.552  24 i 1
+...(........)..   1.80      8.553  12 d 0
+...............   0.00     10.330  24 i 1
+.(.....).......   3.10     10.332  10 d 0
+...............   0.00     11.609  24 i 1
+.(.....).......   3.10     11.627  10 S 0
+.......(....)..   2.10     11.725  10 S 0
+...(........)..   1.80     11.810  12 d 0
+...............   0.00     11.872  24 i 1
+........(....).   5.10     11.875  11 d 0
+...............   0.00     12.252  24 i 1
+...(.......)...   5.80     12.258  12 d 0
+...............   0.00     12.686  24 i 1
+.......(......)   3.20     12.865   9 i 0
+.......((....))   2.80     13.815   6 d 1
+.......(......)   3.20     13.866   9 d 0
+...............   0.00     15.046  24 i 1
+.(.....).......   3.10     15.063  10 d 0
+...............   0.00     15.479  24 i 1
+.......(....)..   2.10     15.564  10 s 0
+..(....).......   4.20     15.615  13 d 0
+...............   0.00     16.260  24 i 1
+...(..........)   5.40     16.268  15 d 0
+...............   0.00     18.202  24 i 1
+(.......)......   4.20     18.203   9 d 0
+...............   0.00     19.593  24 i 1
+.(........)....   2.80     19.720  12 d 0
+...............   0.00     21.111  24 i 1
+.......(......)   3.20     21.140   9 d 0
+...............   0.00     21.152  24 i 1
+.....(....)....   5.00     21.161  14 d 2
+...............   0.00     22.588  24 i 1
+.......(....)..   2.10     22.605  10 s 0
+.......(......)   3.20     22.649   9 d 0
+...............   0.00     23.969  24 i 1
+.....(.......).   5.50     23.982  10 d 2
+...............   0.00     24.575  24 i 1
+...(....)......   4.90     24.604  13 d 0
+...............   0.00     25.254  24 i 1
+.......(....)..   2.10     25.263  10 d 0
+...............   0.00     25.868  24 i 1
+........(....).   5.10     25.883  11 i 0
+.......((....))   2.80     26.080   6 d 1
+........(....).   5.10     26.096  11 S 0
+.....(.......).   5.50     26.103  10 d 2
+...............   0.00     27.378  24 i 1
+.......(....)..   2.10     27.771  10 d 0
+...............   0.00     30.157  24 i 1
+...(........)..   1.80     30.318  12 i 0
+...(.(....).)..   4.80     30.334   8 i 0
+...(((....)))..  -0.10     31.290   7 i 0
+..((((....)))).  -0.60     32.380   6 _ 1 X1
+...............   0.00      0.057  24 i 1
+..(....).......   4.20      0.070  13 d 0
+...............   0.00      0.149  24 i 1
+..(..........).   5.20      0.154  16 d 0
+...............   0.00      0.391  24 i 1
+(.......)......   4.20      0.434   9 d 0
+...............   0.00      0.528  24 i 1
+.(........)....   2.80      0.565  12 d 0
+...............   0.00      1.325  24 i 1
+...(........)..   1.80      1.635  12 i 0
+...((......))..   0.70      2.006   9 i 0
+...(((....)))..  -0.10      2.106   7 i 0
+..((((....)))).  -0.60      4.066   6 _ 1 X1
+...............   0.00      0.595  24 i 1
+...(..........)   5.40      0.598  15 d 0
+...............   0.00      4.842  24 i 1
+.......(....)..   2.10      4.928  10 d 0
+...............   0.00      4.963  24 i 1
+.......(....)..   2.10      5.200  10 d 0
+...............   0.00      5.285  24 i 1
+(.......)......   4.20      5.309   9 d 0
+...............   0.00      5.908  24 i 1
+...(........)..   1.80      5.945  12 d 0
+...............   0.00      6.161  24 i 1
+.......(....)..   2.10      6.174  10 s 0
+.(.....).......   3.10      6.209  10 d 0
+...............   0.00      8.002  24 i 1
+(.......)......   4.20      8.023   9 d 0
+...............   0.00      8.066  24 i 1
+.(........)....   2.80      8.113  12 i 0
+.((......))....   2.00      8.654   8 d 0
+.(........)....   2.80      8.667  12 i 0
+((........))...   2.10      8.710  11 i 0
+(((......)))...   1.30      9.191   7 i 0
+((((....))))...   0.40      9.916   5 _ 1 X2
+...............   0.00      0.272  24 i 1
+(..........)...   5.40      0.279  16 d 0
+...............   0.00      1.794  24 i 1
+.......(....)..   2.10      1.886  10 d 0
+...............   0.00      2.390  24 i 1
+..(......).....   4.80      2.413  10 d 0
+...............   0.00      5.053  24 i 1
+...(........)..   1.80      5.253  12 i 0
+..((........)).   1.30      5.364  11 i 0
+..(((......))).   0.20      6.090   8 i 0
+..((((....)))).  -0.60      6.766   6 _ 1 X1
+...............   0.00      0.146  24 i 1
+.......(....)..   2.10      0.227  10 s 0
+.......(......)   3.20      0.312   9 d 0
+...............   0.00      2.574  24 i 1
+.......(....)..   2.10      2.654  10 d 0
+...............   0.00      3.356  24 i 1
+.......(......)   3.20      3.413   9 d 0
+...............   0.00      4.742  24 i 1
+...(........)..   1.80      4.921  12 d 0
+...............   0.00      6.128  24 i 1
+.......(....)..   2.10      6.463  10 s 0
+.......(......)   3.20      6.478   9 d 0
+...............   0.00      7.229  24 i 1
+...(........)..   1.80      7.262  12 S 0
+.......(....)..   2.10      7.291  10 d 0
+...............   0.00      7.603  24 i 1
+...(........)..   1.80      7.707  12 i 0
+..((........)).   1.30      7.752  11 i 0
+..(((......))).   0.20      8.740   8 d 0
+..((........)).   1.30      8.940  11 i 0
+..(((......))).   0.20      9.363   8 d 0
+...((......))..   0.70      9.382   9 i 0
+...(((....)))..  -0.10      9.435   7 i 0
+..((((....)))).  -0.60     11.207   6 _ 1 X1