src/jalview/ws/jws2/JabaPreset.java

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  20  */
  21 package jalview.ws.jws2;
  22
  23 import jalview.ws.jws2.jabaws2.Jws2Instance;
  24 import jalview.ws.params.ArgumentI;
  25 import jalview.ws.params.WsParamSetI;
  26
  27 import java.util.List;
  28
  29 import compbio.metadata.Preset;
  30
  31 public class JabaPreset implements WsParamSetI
  32 {
  33   Preset p = null;
  34
  35   Jws2Instance service;
  36
  37   public JabaPreset(Jws2Instance svc, Preset preset)
  38   {
  39     service = svc;
  40     p = preset;
  41   }
  42
  43   @Override
  44   public String getName()
  45   {
  46     return p.getName();
  47   }
  48
  49   @Override
  50   public String getDescription()
  51   {
  52     return p.getDescription();
  53   }
  54
  55   @Override
  56   public String[] getApplicableUrls()
  57   {
  58     return new String[]
  59     { service.getUri() };
  60   }
  61
  62   @Override
  63   public String getSourceFile()
  64   {
  65     return null;
  66   }
  67
  68   @Override
  69   public boolean isModifiable()
  70   {
  71     return false;
  72   }
  73
  74   @Override
  75   public void setSourceFile(String newfile)
  76   {
  77     throw new Error("Cannot set source file for " + getClass());
  78   }
  79
  80   @Override
  81   public List<ArgumentI> getArguments()
  82   {
  83     try
  84     {
  85       return JabaParamStore.getJwsArgsfromJaba(p.getArguments(service
  86               .getRunnerConfig()));
  87     } catch (Exception e)
  88     {
  89       e.printStackTrace();
  90       throw new Error(
  91               "Probable mismatch between service instance and preset!");
  92     }
  93   }
  94
  95   @Override
  96   public void setArguments(List<ArgumentI> args)
  97   {
  98     throw new Error("Cannot set Parameters for a Jaba Web service's preset");
  99   }
 100 }