src/jalview/xml/binding/jalview/ObjectFactory.java

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   2 // This file was generated by the JavaTM Architecture for XML Binding(JAXB) Reference Implementation, v2.2.8-b130911.1802
   3 // See <a href="http://java.sun.com/xml/jaxb">http://java.sun.com/xml/jaxb</a>
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   7
   8
   9 package jalview.xml.binding.jalview;
  10
  11 import javax.xml.bind.JAXBElement;
  12 import javax.xml.bind.annotation.XmlElementDecl;
  13 import javax.xml.bind.annotation.XmlRegistry;
  14 import javax.xml.namespace.QName;
  15
  16
  17 /**
  18  * This object contains factory methods for each
  19  * Java content interface and Java element interface
  20  * generated in the jalview.xml.binding.jalview package.
  21  * <p>An ObjectFactory allows you to programatically
  22  * construct new instances of the Java representation
  23  * for XML content. The Java representation of XML
  24  * content can consist of schema derived interfaces
  25  * and classes representing the binding of schema
  26  * type definitions, element declarations and model
  27  * groups.  Factory methods for each of these are
  28  * provided in this class.
  29  *
  30  */
  31 @XmlRegistry
  32 public class ObjectFactory {
  33
  34     private final static QName _WebServiceParameterSet_QNAME = new QName("www.jalview.org/xml/wsparamset", "WebServiceParameterSet");
  35     private final static QName _JalviewModel_QNAME = new QName("www.jalview.org", "JalviewModel");
  36     private final static QName _JalviewUserColours_QNAME = new QName("www.jalview.org/colours", "JalviewUserColours");
  37
  38     /**
  39      * Create a new ObjectFactory that can be used to create new instances of schema derived classes for package: jalview.xml.binding.jalview
  40      *
  41      */
  42     public ObjectFactory() {
  43     }
  44
  45     /**
  46      * Create an instance of {@link AlcodonFrame }
  47      *
  48      */
  49     public AlcodonFrame createAlcodonFrame() {
  50         return new AlcodonFrame();
  51     }
  52
  53     /**
  54      * Create an instance of {@link MapListType }
  55      *
  56      */
  57     public MapListType createMapListType() {
  58         return new MapListType();
  59     }
  60
  61     /**
  62      * Create an instance of {@link Sequence }
  63      *
  64      */
  65     public Sequence createSequence() {
  66         return new Sequence();
  67     }
  68
  69     /**
  70      * Create an instance of {@link Annotation }
  71      *
  72      */
  73     public Annotation createAnnotation() {
  74         return new Annotation();
  75     }
  76
  77     /**
  78      * Create an instance of {@link SequenceSet }
  79      *
  80      */
  81     public SequenceSet createSequenceSet() {
  82         return new SequenceSet();
  83     }
  84
  85     /**
  86      * Create an instance of {@link FeatureMatcherSet }
  87      *
  88      */
  89     public FeatureMatcherSet createFeatureMatcherSet() {
  90         return new FeatureMatcherSet();
  91     }
  92
  93     /**
  94      * Create an instance of {@link JalviewUserColours }
  95      *
  96      */
  97     public JalviewUserColours createJalviewUserColours() {
  98         return new JalviewUserColours();
  99     }
 100
 101     /**
 102      * Create an instance of {@link Pdbentry }
 103      *
 104      */
 105     public Pdbentry createPdbentry() {
 106         return new Pdbentry();
 107     }
 108
 109     /**
 110      * Create an instance of {@link Feature }
 111      *
 112      */
 113     public Feature createFeature() {
 114         return new Feature();
 115     }
 116
 117     /**
 118      * Create an instance of {@link JalviewModel }
 119      *
 120      */
 121     public JalviewModel createJalviewModel() {
 122         return new JalviewModel();
 123     }
 124
 125     /**
 126      * Create an instance of {@link JalviewModel.FeatureSettings }
 127      *
 128      */
 129     public JalviewModel.FeatureSettings createJalviewModelFeatureSettings() {
 130         return new JalviewModel.FeatureSettings();
 131     }
 132
 133     /**
 134      * Create an instance of {@link JalviewModel.PcaViewer }
 135      *
 136      */
 137     public JalviewModel.PcaViewer createJalviewModelPcaViewer() {
 138         return new JalviewModel.PcaViewer();
 139     }
 140
 141     /**
 142      * Create an instance of {@link JalviewModel.Viewport }
 143      *
 144      */
 145     public JalviewModel.Viewport createJalviewModelViewport() {
 146         return new JalviewModel.Viewport();
 147     }
 148
 149     /**
 150      * Create an instance of {@link JalviewModel.JSeq }
 151      *
 152      */
 153     public JalviewModel.JSeq createJalviewModelJSeq() {
 154         return new JalviewModel.JSeq();
 155     }
 156
 157     /**
 158      * Create an instance of {@link JalviewModel.JSeq.RnaViewer }
 159      *
 160      */
 161     public JalviewModel.JSeq.RnaViewer createJalviewModelJSeqRnaViewer() {
 162         return new JalviewModel.JSeq.RnaViewer();
 163     }
 164
 165     /**
 166      * Create an instance of {@link JalviewModel.JSeq.Pdbids }
 167      *
 168      */
 169     public JalviewModel.JSeq.Pdbids createJalviewModelJSeqPdbids() {
 170         return new JalviewModel.JSeq.Pdbids();
 171     }
 172
 173     /**
 174      * Create an instance of {@link DoubleMatrix }
 175      *
 176      */
 177     public DoubleMatrix createDoubleMatrix() {
 178         return new DoubleMatrix();
 179     }
 180
 181     /**
 182      * Create an instance of {@link AnnotationColourScheme }
 183      *
 184      */
 185     public AnnotationColourScheme createAnnotationColourScheme() {
 186         return new AnnotationColourScheme();
 187     }
 188
 189     /**
 190      * Create an instance of {@link PcaDataType }
 191      *
 192      */
 193     public PcaDataType createPcaDataType() {
 194         return new PcaDataType();
 195     }
 196
 197     /**
 198      * Create an instance of {@link DoubleVector }
 199      *
 200      */
 201     public DoubleVector createDoubleVector() {
 202         return new DoubleVector();
 203     }
 204
 205     /**
 206      * Create an instance of {@link AlcodonFrame.Alcodon }
 207      *
 208      */
 209     public AlcodonFrame.Alcodon createAlcodonFrameAlcodon() {
 210         return new AlcodonFrame.Alcodon();
 211     }
 212
 213     /**
 214      * Create an instance of {@link AlcodonFrame.AlcodMap }
 215      *
 216      */
 217     public AlcodonFrame.AlcodMap createAlcodonFrameAlcodMap() {
 218         return new AlcodonFrame.AlcodMap();
 219     }
 220
 221     /**
 222      * Create an instance of {@link AnnotationElement }
 223      *
 224      */
 225     public AnnotationElement createAnnotationElement() {
 226         return new AnnotationElement();
 227     }
 228
 229     /**
 230      * Create an instance of {@link Mapping }
 231      *
 232      */
 233     public Mapping createMapping() {
 234         return new Mapping();
 235     }
 236
 237     /**
 238      * Create an instance of {@link MapListType.MapListFrom }
 239      *
 240      */
 241     public MapListType.MapListFrom createMapListTypeMapListFrom() {
 242         return new MapListType.MapListFrom();
 243     }
 244
 245     /**
 246      * Create an instance of {@link MapListType.MapListTo }
 247      *
 248      */
 249     public MapListType.MapListTo createMapListTypeMapListTo() {
 250         return new MapListType.MapListTo();
 251     }
 252
 253     /**
 254      * Create an instance of {@link SequenceType }
 255      *
 256      */
 257     public SequenceType createSequenceType() {
 258         return new SequenceType();
 259     }
 260
 261     /**
 262      * Create an instance of {@link Sequence.DBRef }
 263      *
 264      */
 265     public Sequence.DBRef createSequenceDBRef() {
 266         return new Sequence.DBRef();
 267     }
 268
 269     /**
 270      * Create an instance of {@link Annotation.ThresholdLine }
 271      *
 272      */
 273     public Annotation.ThresholdLine createAnnotationThresholdLine() {
 274         return new Annotation.ThresholdLine();
 275     }
 276
 277     /**
 278      * Create an instance of {@link Annotation.Property }
 279      *
 280      */
 281     public Annotation.Property createAnnotationProperty() {
 282         return new Annotation.Property();
 283     }
 284
 285     /**
 286      * Create an instance of {@link SequenceSet.SequenceSetProperties }
 287      *
 288      */
 289     public SequenceSet.SequenceSetProperties createSequenceSetSequenceSetProperties() {
 290         return new SequenceSet.SequenceSetProperties();
 291     }
 292
 293     /**
 294      * Create an instance of {@link VAMSAS }
 295      *
 296      */
 297     public VAMSAS createVAMSAS() {
 298         return new VAMSAS();
 299     }
 300
 301     /**
 302      * Create an instance of {@link FeatureMatcher }
 303      *
 304      */
 305     public FeatureMatcher createFeatureMatcher() {
 306         return new FeatureMatcher();
 307     }
 308
 309     /**
 310      * Create an instance of {@link WebServiceParameterSet }
 311      *
 312      */
 313     public WebServiceParameterSet createWebServiceParameterSet() {
 314         return new WebServiceParameterSet();
 315     }
 316
 317     /**
 318      * Create an instance of {@link FeatureMatcherSet.CompoundMatcher }
 319      *
 320      */
 321     public FeatureMatcherSet.CompoundMatcher createFeatureMatcherSetCompoundMatcher() {
 322         return new FeatureMatcherSet.CompoundMatcher();
 323     }
 324
 325     /**
 326      * Create an instance of {@link JalviewUserColours.Colour }
 327      *
 328      */
 329     public JalviewUserColours.Colour createJalviewUserColoursColour() {
 330         return new JalviewUserColours.Colour();
 331     }
 332
 333     /**
 334      * Create an instance of {@link JalviewUserColours.Filter }
 335      *
 336      */
 337     public JalviewUserColours.Filter createJalviewUserColoursFilter() {
 338         return new JalviewUserColours.Filter();
 339     }
 340
 341     /**
 342      * Create an instance of {@link Pdbentry.Property }
 343      *
 344      */
 345     public Pdbentry.Property createPdbentryProperty() {
 346         return new Pdbentry.Property();
 347     }
 348
 349     /**
 350      * Create an instance of {@link Feature.OtherData }
 351      *
 352      */
 353     public Feature.OtherData createFeatureOtherData() {
 354         return new Feature.OtherData();
 355     }
 356
 357     /**
 358      * Create an instance of {@link JalviewModel.JGroup }
 359      *
 360      */
 361     public JalviewModel.JGroup createJalviewModelJGroup() {
 362         return new JalviewModel.JGroup();
 363     }
 364
 365     /**
 366      * Create an instance of {@link JalviewModel.UserColours }
 367      *
 368      */
 369     public JalviewModel.UserColours createJalviewModelUserColours() {
 370         return new JalviewModel.UserColours();
 371     }
 372
 373     /**
 374      * Create an instance of {@link JalviewModel.Tree }
 375      *
 376      */
 377     public JalviewModel.Tree createJalviewModelTree() {
 378         return new JalviewModel.Tree();
 379     }
 380
 381     /**
 382      * Create an instance of {@link JalviewModel.FeatureSettings.Setting }
 383      *
 384      */
 385     public JalviewModel.FeatureSettings.Setting createJalviewModelFeatureSettingsSetting() {
 386         return new JalviewModel.FeatureSettings.Setting();
 387     }
 388
 389     /**
 390      * Create an instance of {@link JalviewModel.FeatureSettings.Group }
 391      *
 392      */
 393     public JalviewModel.FeatureSettings.Group createJalviewModelFeatureSettingsGroup() {
 394         return new JalviewModel.FeatureSettings.Group();
 395     }
 396
 397     /**
 398      * Create an instance of {@link JalviewModel.PcaViewer.SequencePoint }
 399      *
 400      */
 401     public JalviewModel.PcaViewer.SequencePoint createJalviewModelPcaViewerSequencePoint() {
 402         return new JalviewModel.PcaViewer.SequencePoint();
 403     }
 404
 405     /**
 406      * Create an instance of {@link JalviewModel.PcaViewer.Axis }
 407      *
 408      */
 409     public JalviewModel.PcaViewer.Axis createJalviewModelPcaViewerAxis() {
 410         return new JalviewModel.PcaViewer.Axis();
 411     }
 412
 413     /**
 414      * Create an instance of {@link JalviewModel.PcaViewer.SeqPointMin }
 415      *
 416      */
 417     public JalviewModel.PcaViewer.SeqPointMin createJalviewModelPcaViewerSeqPointMin() {
 418         return new JalviewModel.PcaViewer.SeqPointMin();
 419     }
 420
 421     /**
 422      * Create an instance of {@link JalviewModel.PcaViewer.SeqPointMax }
 423      *
 424      */
 425     public JalviewModel.PcaViewer.SeqPointMax createJalviewModelPcaViewerSeqPointMax() {
 426         return new JalviewModel.PcaViewer.SeqPointMax();
 427     }
 428
 429     /**
 430      * Create an instance of {@link JalviewModel.Viewport.HiddenColumns }
 431      *
 432      */
 433     public JalviewModel.Viewport.HiddenColumns createJalviewModelViewportHiddenColumns() {
 434         return new JalviewModel.Viewport.HiddenColumns();
 435     }
 436
 437     /**
 438      * Create an instance of {@link JalviewModel.Viewport.CalcIdParam }
 439      *
 440      */
 441     public JalviewModel.Viewport.CalcIdParam createJalviewModelViewportCalcIdParam() {
 442         return new JalviewModel.Viewport.CalcIdParam();
 443     }
 444
 445     /**
 446      * Create an instance of {@link JalviewModel.JSeq.RnaViewer.SecondaryStructure }
 447      *
 448      */
 449     public JalviewModel.JSeq.RnaViewer.SecondaryStructure createJalviewModelJSeqRnaViewerSecondaryStructure() {
 450         return new JalviewModel.JSeq.RnaViewer.SecondaryStructure();
 451     }
 452
 453     /**
 454      * Create an instance of {@link JalviewModel.JSeq.Pdbids.StructureState }
 455      *
 456      */
 457     public JalviewModel.JSeq.Pdbids.StructureState createJalviewModelJSeqPdbidsStructureState() {
 458         return new JalviewModel.JSeq.Pdbids.StructureState();
 459     }
 460
 461     /**
 462      * Create an instance of {@link JAXBElement }{@code <}{@link WebServiceParameterSet }{@code >}}
 463      *
 464      */
 465     @XmlElementDecl(namespace = "www.jalview.org/xml/wsparamset", name = "WebServiceParameterSet")
 466     public JAXBElement<WebServiceParameterSet> createWebServiceParameterSet(WebServiceParameterSet value) {
 467         return new JAXBElement<WebServiceParameterSet>(_WebServiceParameterSet_QNAME, WebServiceParameterSet.class, null, value);
 468     }
 469
 470     /**
 471      * Create an instance of {@link JAXBElement }{@code <}{@link JalviewModel }{@code >}}
 472      *
 473      */
 474     @XmlElementDecl(namespace = "www.jalview.org", name = "JalviewModel")
 475     public JAXBElement<JalviewModel> createJalviewModel(JalviewModel value) {
 476         return new JAXBElement<JalviewModel>(_JalviewModel_QNAME, JalviewModel.class, null, value);
 477     }
 478
 479     /**
 480      * Create an instance of {@link JAXBElement }{@code <}{@link JalviewUserColours }{@code >}}
 481      *
 482      */
 483     @XmlElementDecl(namespace = "www.jalview.org/colours", name = "JalviewUserColours")
 484     public JAXBElement<JalviewUserColours> createJalviewUserColours(JalviewUserColours value) {
 485         return new JAXBElement<JalviewUserColours>(_JalviewUserColours_QNAME, JalviewUserColours.class, null, value);
 486     }
 487
 488 }