JAL-2738 use GeneLocus extends DBRefEntry to hold chromosomal mappings
[jalview.git] / src / jalview / xml / binding / jalview / VAMSAS.java
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3 // See <a href="http://java.sun.com/xml/jaxb">http://java.sun.com/xml/jaxb</a> 
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5 // Generated on: 2018.12.20 at 11:47:26 AM GMT 
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8
9 package jalview.xml.binding.jalview;
10
11 import java.util.ArrayList;
12 import java.util.List;
13 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessType;
14 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessorType;
15 import javax.xml.bind.annotation.XmlElement;
16 import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
17
18
19 /**
20  * <p>Java class for VAMSAS complex type.
21  * 
22  * <p>The following schema fragment specifies the expected content contained within this class.
23  * 
24  * <pre>
25  * &lt;complexType name="VAMSAS">
26  *   &lt;complexContent>
27  *     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
28  *       &lt;sequence>
29  *         &lt;element name="Tree" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" maxOccurs="unbounded" minOccurs="0"/>
30  *         &lt;element ref="{www.vamsas.ac.uk/jalview/version2}SequenceSet" maxOccurs="unbounded" minOccurs="0"/>
31  *       &lt;/sequence>
32  *     &lt;/restriction>
33  *   &lt;/complexContent>
34  * &lt;/complexType>
35  * </pre>
36  * 
37  * 
38  */
39 @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
40 @XmlType(name = "VAMSAS", propOrder = {
41     "tree",
42     "sequenceSet"
43 })
44 public class VAMSAS {
45
46     @XmlElement(name = "Tree")
47     protected List<String> tree;
48     @XmlElement(name = "SequenceSet")
49     protected List<SequenceSet> sequenceSet;
50
51     /**
52      * Gets the value of the tree property.
53      * 
54      * <p>
55      * This accessor method returns a reference to the live list,
56      * not a snapshot. Therefore any modification you make to the
57      * returned list will be present inside the JAXB object.
58      * This is why there is not a <CODE>set</CODE> method for the tree property.
59      * 
60      * <p>
61      * For example, to add a new item, do as follows:
62      * <pre>
63      *    getTree().add(newItem);
64      * </pre>
65      * 
66      * 
67      * <p>
68      * Objects of the following type(s) are allowed in the list
69      * {@link String }
70      * 
71      * 
72      */
73     public List<String> getTree() {
74         if (tree == null) {
75             tree = new ArrayList<String>();
76         }
77         return this.tree;
78     }
79
80     /**
81      * Gets the value of the sequenceSet property.
82      * 
83      * <p>
84      * This accessor method returns a reference to the live list,
85      * not a snapshot. Therefore any modification you make to the
86      * returned list will be present inside the JAXB object.
87      * This is why there is not a <CODE>set</CODE> method for the sequenceSet property.
88      * 
89      * <p>
90      * For example, to add a new item, do as follows:
91      * <pre>
92      *    getSequenceSet().add(newItem);
93      * </pre>
94      * 
95      * 
96      * <p>
97      * Objects of the following type(s) are allowed in the list
98      * {@link SequenceSet }
99      * 
100      * 
101      */
102     public List<SequenceSet> getSequenceSet() {
103         if (sequenceSet == null) {
104             sequenceSet = new ArrayList<SequenceSet>();
105         }
106         return this.sequenceSet;
107     }
108
109 }