help/html/colourSchemes/pid.html

   1 <html>
   2 <!--
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  21  -->
  22 <head><title>Percentage Identity Colour Scheme</title>
  23 <style type="text/css">
  24 <!--
  25 td {
  26         text-align: center;
  27 }
  28 -->
  29 </style>
  30 </head>
  31
  32 <body>
  33 <p><strong>PID Colours</strong><br>
  34   <br>
  35   The PID option colours the residues (boxes and/or text) according to the percentage
  36   of the residues in each column that agree with the consensus sequence. Only
  37   the residues that agree with the consensus residue for each column are coloured.</p>
  38 <div align="center">
  39 <table width="200" border="1">
  40   <tr>
  41     <td bgcolor="#6464FF">&gt; 80 %</td>
  42   </tr>
  43   <tr>
  44     <td bgcolor="#9999FF">&gt; 60 %</td>
  45   </tr>
  46   <tr>
  47     <td bgcolor="#CCCCFF">&gt; 40%</td>
  48   </tr>
  49   <tr>
  50     <td>&lt; 40%</td>
  51   </tr>
  52 </table>
  53 </div>
  54 </body>
  55 </html>