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   1 <html>
   2 <!--
   3  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.2b1)
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  17  *
  18  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  19  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  20  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  21  -->
  22 <head>
  23 <title>Creating Sequence Features</title>
  24 </head>
  25 <body>
  26 <strong>Creating Sequence Features</strong>
  27 <p>Jalview can create sequence features from the matches of a <a
  28         href="search.html">regular expression search</a>, or from the currently
  29 selected area via the <strong>&quot;selection&#8594;Create
  30 sequence feature&quot;</strong> entry in the <a href="../menus/popupMenu.html">selection area popup menu</a>. In both
  31 cases, the <strong>Create Features</strong> dialog box will then be
  32 opened:</p>
  33 <p><img src="crnewfeature.gif"></p>
  34 <p>Select or enter the attributes for the features being created,
  35 and then press OK to create the new features.</p>
  36 <p>Each attribute is described below:
  37 <ul>
  38         <li><strong>Sequence Feature Name</strong>
  39         <p>Either give the new features a new name or use the menu to
  40         re-use an existing feature name.</p>
  41         </li>
  42         <li><strong>Feature group</strong>
  43         <p>Enter a new group name, or re-use an existing group from the
  44         pull-down menu.</p>
  45         </li>
  46         <li><strong>Feature Colour</strong>
  47         <p>Keep the existing colour for this feature's name and group, or
  48         select the colour box to open a colour chooser to pick a different one.</p>
  49         </li>
  50         <li><strong>Description</strong>
  51         <p>Enter a description for all the features being created. Each
  52         feature defined on a sequence may have its own description that will be
  53         displayed in the tooltip for the feature in that region.</p>
  54         </li>
  55 </ul>
  56 </p><p><em>Sequence Feature Creation was introduced in Jalview Version 2.2</em></p>
  57 </body>
  58 </html>