help/html/io/export.html

   1 <html>
   2 <!--
   3  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.2b1)
   4  * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
   5  *
   6  * This file is part of Jalview.
   7  *
   8  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   9  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  10  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  11  * of the License, or (at your option) any later version.
  12  *
  13  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  14  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  15  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  16  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  17  *
  18  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  19  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  20  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  21  -->
  22 <head>
  23 <title>Exporting alignments as artwork</title>
  24 </head>
  25 <body>
  26 <p><strong>Exporting alignments as graphics and lineart<a name="export"></a></strong></p>
  27 <p>The alignment view can be printed using
  28 <strong>File&#8594;Print</strong>, or exported in a number of ways via the
  29 <strong>File&#8594;Export</strong> menu:
  30 <ul>
  31 <li>HTML<br><em>for viewing in a web browser</em>
  32 </li>
  33 <li>PNG - a Portable Networks Graphics image<br><em>For low quality
  34 diagrams and powerpoint presentations</em>
  35 </li>
  36 <li>EPS - an Encapsulated Postscript Document<br><em>For high quality
  37 diagrams and publications.</em>
  38 <li>SVG - a Scalable Vector Graphics document<br><em>For high quality
  39 diagrams in publications and on the web.</em>
  40 </li></ul>
  41
  42 <p><em>Tips for working with EPS Files</em></p>
  43 <li>The EPS file generated by jalview contains vector graphics which are directly
  44   editable in graphics applications such as Adobe Illustrator.</li>
  45 <li>EPS files can be produced as &quot;Text&quot; or &quot;Lineart&quot;. Use
  46   &quot;Text&quot; if you want the final document to be MUCH smaller in diskspace
  47   and be able to search, edit and select text. Use &quot;Lineart&quot; if you
  48   want an exact image of the alignment as displayed in Jalview. This is useful
  49   if a 3rd Party EPS viewer does not have the same Font which the EPS file was
  50   created with.</li>
  51 <li>When importing an EPS file into a Microsoft office document, a snapshot image of the
  52   file will be displayed which often looks blurred. Right-click the
  53   image and choose &quot;Edit image.&quot; to convert it to word
  54   drawing objects which give a truer WYSIWIG representation.
  55   </li>
  56   <li>
  57   Mac OSX users will find that eps files are automatically converted into
  58   PDF files.
  59   </li>
  60 </p>
  61 </body>
  62 </html>