Merge branch 'patch/Release_2_11_1_Branch_patch_JAL-3490' into releases/Release_2_11_...
[jalview.git] / resources / lang / Messages.properties
1 action.refresh_services = Refresh Services
2 action.reset_services = Reset Services
3 action.merge_results = Merge Results
4 action.load_scheme = Load scheme
5 action.save_scheme = Save scheme
6 label.scheme_changed = Changes to scheme ''{0}'' have not been saved.<br><br>Save changes, or continue without saving to make a new colour scheme.
7 label.save_changes = Save Changes
8 label.dont_save_changes = Don't Save
9 action.save_image = Save Image
10 action.paste = Paste
11 action.show_html_source = Show HTML Source
12 action.print = Print...
13 action.web_service = Web Service
14 action.cancel_job = Cancel Job
15 action.start_job = Start Job
16 action.revert = Revert
17 action.move_down = Move Down
18 action.move_up = Move Up
19 action.remove_return_datatype = Remove return datatype
20 action.add_return_datatype = Add return datatype
21 action.remove_input_parameter = Remove selected input parameter
22 action.add_input_parameter = Add input parameter
23 action.edit = Edit
24 action.new = New
25 action.open_file = Open file
26 action.show_unconserved = Show Unconserved
27 action.open_new_alignment = Open new alignment
28 action.raise_associated_windows = Raise Associated Windows
29 action.minimize_associated_windows = Minimize Associated Windows
30 action.close_all = Close all
31 action.load_project = Load Project
32 action.save_project = Save Project
33 action.save_project_as = Save Project as...
34 action.quit = Quit
35 label.quit_jalview = Quit Jalview?
36 action.expand_views = Expand Views
37 action.gather_views = Gather Views
38 action.page_setup = Page Setup...
39 action.reload = Reload
40 action.load = Load
41 action.open = Open
42 action.cancel = Cancel
43 action.create = Create
44 action.update = Update
45 action.delete = Delete
46 action.clear = Clear
47 action.accept = Accept
48 action.select_ddbb = --- Select Database ---
49 action.undo = Undo
50 action.redo = Redo
51 action.reset = Reset
52 action.remove_left = Remove left
53 action.remove_right = Remove right
54 action.remove_empty_columns = Remove Empty Columns
55 action.remove_all_gaps = Remove All Gaps
56 action.left_justify_alignment = Left Justify Alignment
57 action.right_justify_alignment = Right Justify Alignment
58 action.boxes = Boxes
59 action.text = Text
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61 action.by_id = By Id
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64 action.unmark_as_reference = Unmark as Reference 
65 action.set_as_reference = Set as Reference 
66 action.remove = Remove
67 action.remove_redundancy = Remove Redundancy...
68 action.pairwise_alignment = Pairwise Alignment
69 action.user_defined = User Defined...
70 action.by_conservation = By Conservation
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72 action.show_gaps = Show Gaps
73 action.show_hidden_markers = Show Hidden Markers
74 action.find = Find
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76 action.make_groups_selection = Make Groups For Selection
77 action.copy = Copy
78 action.cut = Cut
79 action.font = Font...
80 action.scale_above = Scale Above
81 action.scale_left = Scale Left
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83 action.by_tree_order = By Tree Order
84 action.sort = Sort
85 action.calculate_tree = Calculate Tree...
86 action.calculate_tree_pca = Calculate Tree or PCA...
87 action.help = Help
88 action.by_annotation = By Annotation...
89 action.invert_sequence_selection = Invert Sequence Selection
90 action.invert_column_selection = Invert Column Selection
91 action.show = Show
92 action.hide = Hide
93 action.ok = OK
94 action.set_defaults = Defaults
95 action.create_group = Create Group
96 action.remove_group = Remove Group
97 action.edit_group = Edit Group
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104 action.reveal_all = Reveal All
105 action.reveal_sequences = Reveal Sequences
106 action.find_all = Find all
107 action.find_next = Find next
108 action.file = File
109 action.view = View
110 action.annotations = Annotations
111 action.change_params = Change Parameters
112 action.apply = Apply
113 action.apply_threshold_all_groups = Apply threshold to all groups
114 action.apply_all_groups = Apply to all Groups
115 action.by_chain = By Chain
116 action.by_sequence = By Sequence
117 action.paste_annotations = Paste Annotations
118 action.format = Format
119 action.select = Select
120 action.new_view = New View
121 action.close = Close
122 action.add = Add
123 action.save_as = Save as...
124 action.save = Save
125 action.change_font = Change Font
126 action.change_font_tree_panel = Change Font (Tree Panel)
127 action.colour = Colour
128 action.calculate = Calculate
129 action.select_all = Select all
130 action.select_highlighted_columns = Select Highlighted Columns
131 tooltip.select_highlighted_columns = Press B to mark highlighted columns, Ctrl-(or Cmd)-B to toggle, and Alt-B to mark all but highlighted columns 
132 action.deselect_all = Deselect all
133 action.invert_selection = Invert selection
134 action.using_jmol = Using Jmol
135 action.undo_changes_to_feature_settings = Undo all unapplied changes to feature settings
136 action.undo_changes_to_feature_settings_and_close_the_dialog = Undo all pending changes and close the feature settings dialog
137 action.link = Link
138 action.group_link = Group Link
139 action.show_chain = Show Chain
140 action.show_group = Show Group
141 action.fetch_db_references = Fetch DB References
142 action.view_flanking_regions = Show flanking regions
143 label.view_flanking_regions = Show sequence data either side of the subsequences involved in this alignment
144 label.structures_manager = Structures Manager
145 label.url = URL
146 label.url\: = URL:
147 label.input_file_url = Enter URL or Input File
148 label.select_feature = Select feature
149 label.name = Name
150 label.name\: = Name:
151 label.name_param = Name: {0}
152 label.group = Group
153 label.group\: = Group:
154 label.group_name = Group Name
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156 label.edit_group_name_description = Edit Group Name/Description
157 label.colour = Colour:
158 label.description = Description
159 label.description\: = Description:
160 label.start = Start:
161 label.end = End:
162 label.current_parameter_set_name = Current parameter set name:
163 label.service_action = Service Action:
164 label.post_url = POST URL:
165 label.url_suffix = URL Suffix
166 label.per_seq = per Sequence
167 label.result_vertically_separable = Results are vertically separable
168 label.amend = Amend
169 label.undo_command = Undo {0}
170 label.redo_command = Redo {0}
171 label.principal_component_analysis = Principal Component Analysis
172 label.average_distance_identity = Average Distance Using % Identity
173 label.neighbour_joining_identity = Neighbour Joining Using % Identity
174 label.choose_calculation = Choose Calculation
175 label.calc_title = {0} Using {1}
176 label.tree_calc_av = Average Distance
177 label.tree_calc_nj = Neighbour Joining
178 label.score_model_pid = % Identity
179 label.score_model_blosum62 = BLOSUM62
180 label.score_model_pam250 = PAM 250
181 label.score_model_smithwatermanscore = Score between two sequences aligned with Smith-Waterman with default Peptide/Nucleotide matrix
182 label.score_model_sequencefeaturesimilarity = Distance measure of average number of features not shared at sequence positions 
183 label.score_model_conservation = Physicochemical property conservation
184 label.score_model_enhconservation = Physicochemical property conservation
185 label.status_bar = Status bar
186 label.out_to_textbox = Output to Textbox
187 label.occupancy = Occupancy
188 # delete Clustal - use FileFormat name instead
189 label.clustal = Clustal
190 # label.colourScheme_<schemeName> as in JalviewColourScheme, spaces removed
191 label.colourScheme_clustal = Clustalx
192 label.colourScheme_blosum62 = BLOSUM62 Score
193 label.colourScheme_%identity = Percentage Identity
194 label.colourScheme_zappo = Zappo
195 label.colourScheme_taylor = Taylor
196 label.colourScheme_hydrophobic = Hydrophobicity
197 label.colourScheme_helixpropensity = Helix Propensity
198 label.colourScheme_strandpropensity = Strand Propensity
199 label.colourScheme_turnpropensity = Turn Propensity
200 label.colourScheme_buriedindex = Buried Index
201 label.colourScheme_purine/pyrimidine = Purine/Pyrimidine
202 label.colourScheme_nucleotide = Nucleotide
203 label.colourScheme_t-coffeescores = T-Coffee Scores
204 label.colourScheme_rnahelices = By RNA Helices
205 label.colourScheme_sequenceid = Sequence ID Colour
206 label.blc = BLC
207 label.fasta = Fasta
208 label.msf = MSF
209 label.pfam = PFAM
210 label.pileup = Pileup
211 label.pir = PIR
212 label.average_distance_blosum62 = Average Distance Using BLOSUM62
213 label.neighbour_blosum62 = Neighbour Joining Using BLOSUM62
214 label.show_annotations = Show annotations
215 label.hide_annotations = Hide annotations
216 label.show_all_seq_annotations = Show sequence related
217 label.hide_all_seq_annotations = Hide sequence related
218 label.show_all_al_annotations = Show alignment related
219 label.hide_all_al_annotations = Hide alignment related
220 label.hide_all = Hide all
221 label.add_reference_annotations = Add reference annotations
222 label.find_tip = Search alignment, selection or sequence ids for a subsequence (ignoring gaps).<br>Accepts regular expressions - search Help for 'regex' for details.
223 label.colour_text = Colour Text
224 label.show_non_conserved = Show nonconserved
225 label.overview_window = Overview Window
226 label.none = None
227 label.above_identity_threshold = Above Identity Threshold
228 label.show_sequence_features = Show Sequence Features
229 label.nucleotide = Nucleotide
230 label.protein = Protein
231 label.nucleotides = Nucleotides
232 label.proteins = Proteins
233 label.CDS = CDS
234 label.to_new_alignment = To New Alignment
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237 label.modify_identity_threshold = Modify Identity Threshold...
238 label.modify_conservation_threshold = Modify Conservation Threshold...
239 label.input_from_textbox = Input from textbox
240 label.centre_column_labels = Centre column labels
241 label.automatic_scrolling = Automatic Scrolling
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243 label.about = About...
244 label.show_sequence_limits = Show Sequence Limits
245 action.feature_settings = Feature Settings...
246 label.all_columns = All Columns
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251 label.all_but_selected_region = All but Selected Region (Shift+Ctrl+H)
252 label.selected_region = Selected Region
253 label.all_sequences_columns = All Sequences and Columns
254 label.hide_selected_annotations = Hide selected annotations
255 label.show_selected_annotations = Show selected annotations
256 label.group_consensus = Group Consensus
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258 label.show_consensus_histogram = Show Consensus Histogram
259 label.show_consensus_logo = Show Consensus Logo
260 label.norm_consensus_logo = Normalise Consensus Logo
261 label.apply_all_groups = Apply to all groups
262 label.autocalculated_annotation = Autocalculated Annotation
263 label.show_first = Show first
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265 label.struct_from_pdb = Process secondary structure from PDB
266 label.use_rnaview = Use RNAView for secondary structure
267 label.autoadd_secstr = Add secondary structure annotation to alignment
268 label.autoadd_temp = Add Temperature Factor annotation to alignment
269 label.structure_viewer = Default structure viewer
270 label.double_click_to_browse = Double-click to browse for file
271 label.chimera_path = Path to Chimera program
272 label.chimera_path_tip = Jalview will first try any path entered here, else standard installation locations.<br>Double-click to browse for file.
273 label.invalid_chimera_path = Chimera path not found or not executable
274 label.chimera_missing = Chimera structure viewer not found.<br/>Please enter the path to Chimera (if installed),<br/>or download and install UCSF Chimera.
275 label.chimera_failed = Error opening Chimera - is it installed?\nCheck path in Preferences, Structure
276 label.min_colour = Minimum Colour
277 label.max_colour = Maximum Colour
278 label.no_colour = No Colour
279 label.use_original_colours = Use Original Colours
280 label.threshold_minmax = Threshold is min/max
281 label.represent_group_with = Represent Group with {0}
282 label.selection = Selection
283 label.group_colour = Group Colour
284 label.sequence = Sequence
285 label.view_pdb_structure = View PDB Structure
286 label.min_value = Min value
287 label.max_value = Max value
288 label.no_value = No value
289 label.new_feature = New Feature
290 label.match_case = Match Case
291 label.view_alignment_editor = View in alignment editor
292 label.labels = Labels
293 label.output_values = Output Values...
294 label.output_points = Output points...
295 label.output_transformed_points = Output transformed points
296 label.input_data = Input Data...
297 label.nucleotide_matrix = Nucleotide matrix
298 label.protein_matrix = Protein matrix
299 label.show_bootstrap_values = Show Bootstrap Values
300 label.show_distances = Show distances
301 label.mark_unassociated_leaves = Mark Unassociated Leaves
302 label.fit_to_window = Fit To Window
303 label.newick_format = Newick Format
304 label.select_newick_like_tree_file = Select a newick-like tree file
305 label.colours = Colours
306 label.view_mapping = View Mapping
307 label.wireframe = Wireframe
308 label.depthcue = Depthcue
309 label.z_buffering = Z Buffering
310 label.charge_cysteine = Charge & Cysteine
311 label.all_chains_visible = All Chains Visible
312 label.successfully_added_features_alignment = Successfully added features to alignment
313 label.keyboard_editing_mode = Keyboard editing mode is {0}
314 label.paste_features_annotations_Tcoffee_here = Paste your features / annotations / T-coffee score file here.
315 label.removed_columns = Removed {0} columns.
316 label.removed_empty_columns = Removed {0} empty columns.
317 label.paste_newick_tree_file = Paste your Newick tree file here.
318 label.order_by_params = Order by {0}
319 label.html_content = <html>{0}</html>
320 label.paste_pdb_file= Paste your PDB file here.
321 label.paste_pdb_file_for_sequence = Paste PDB file for sequence {0}
322 label.could_not_parse_newick_file  = Could not parse Newick file\!\n {0}
323 label.successfully_pasted_tcoffee_scores_to_alignment= Successfully pasted T-Coffee scores to alignment.
324 label.failed_add_tcoffee_scores = Failed to add T-Coffee scores: 
325 label.successfully_pasted_annotation_to_alignment= Successfully pasted annotation to alignment.
326 label.couldnt_parse_pasted_text_as_valid_annotation_feature_GFF_tcoffee_file = Couldn't parse pasted text as a valid annotation, feature, GFF, or T-Coffee score file
327 label.successfully_pasted_alignment_file = Successfully pasted alignment file
328 label.paste_your_alignment_file = Paste your alignment file here
329 label.paste_your = Paste your
330 label.finished_searching = Finished searching
331 label.search_results= Search results {0} : {1}
332 label.found_match_for = Found match for {0}
333 label.font = Font:
334 label.size = Size:
335 label.style = Style:
336 label.calculating = Calculating....
337 label.modify_conservation_visibility = Modify conservation visibility
338 label.colour_residues_above_occurrence = Colour residues above % occurrence
339 label.set_this_label_text = set this label text
340 label.sequences_from = Sequences from {0}
341 label.successfully_loaded_file  = Successfully loaded file {0}
342 label.successfully_loaded_matrix  = Successfully loaded score matrix {0}
343 label.successfully_saved_to_file_in_format = Successfully saved to file: {0} in {1} format.
344 label.copied_sequences_to_clipboard = Copied {0} sequences to clipboard.
345 label.check_file_matches_sequence_ids_alignment = Check that the file matches sequence IDs in the alignment.
346 label.problem_reading_tcoffee_score_file = Problem reading T-COFFEE score file
347 label.source_to_target = {0} ... {1}
348 label.per_sequence_only= Per-sequence only
349 label.to_file = to File
350 label.to_textbox = to Textbox
351 label.jalview = Jalview
352 label.csv_spreadsheet = CSV (Spreadsheet)
353 label.status = Status
354 label.channels = Channels
355 label.channel_title_item_count = {0} ({1})
356 label.blog_item_published_on_date = {0} {1} 
357 label.session_update = Session Update
358 label.new_vamsas_session = New Vamsas Session
359 action.load_vamsas_session = Load Vamsas Session...
360 action.save_vamsas_session = Save Vamsas Session
361 label.select_vamsas_session_opened_as_new_vamsas_session= Select a vamsas session to be opened as a new vamsas session.
362 label.open_saved_vamsas_session = Open a saved VAMSAS session
363 label.groovy_console = Groovy Console...
364 label.lineart = Lineart
365 label.dont_ask_me_again = Don't ask me again
366 label.select_eps_character_rendering_style = Select EPS character rendering style
367 label.invert_selection = Invert Selection
368 label.optimise_order = Optimise Order
369 label.seq_sort_by_score = Sequence sort by Score
370 label.load_colours = Load Colours
371 label.save_colours = Save Colours
372 label.load_colours_tooltip = Load feature colours and filters from file
373 label.save_colours_tooltip = Save feature colours and filters to file
374 label.selected_database_to_fetch_from = Selected {0} database {1} to fetch from {2} 
375 label.database_param = Database: {0}
376 label.example = Example
377 label.example_param = Example: {0}
378 label.select_file_format_before_saving = You must select a file format before saving!
379 label.file_format_not_specified = File format not specified
380 label.couldnt_save_file = Couldn''t save file: {0}
381 label.error_saving_file = Error Saving File
382 label.remove_from_default_list = Remove from default list?
383 label.remove_user_defined_colour = Remove user defined colour
384 label.you_must_select_least_two_sequences = You must select at least 2 sequences.
385 label.invalid_selection = Invalid Selection
386 label.sequence_selection_insufficient = Sequence selection insufficient
387 label.you_need_at_least_n_sequences = You need to select at least {0} sequences
388 label.not_enough_sequences = Not enough sequences
389 label.selected_region_to_tree_may_only_contain_residues_or_gaps =  The selected region to create a tree may\nonly contain residues or gaps.\nTry using the Pad function in the edit menu,\nor one of the multiple sequence alignment web services.
390 label.sequences_selection_not_aligned = Sequences in selection are not aligned
391 label.problem_reading_tree_file =  Problem reading tree file
392 label.possible_problem_with_tree_file = Possible problem with tree file
393 label.select_at_least_three_bases_in_at_least_one_sequence_to_cDNA_translation = Please select at least three bases in at least one sequence in order to perform a cDNA translation.
394 label.translation_failed = Translation Failed
395 label.error_when_translating_sequences_submit_bug_report = Unfortunately, something went wrong when translating your sequences.\nPlease take a look in the Jalview java console\nand submit a bug report including the stacktrace.
396 label.implementation_error  = Implementation error:
397 label.automatically_associate_structure_files_with_sequences_same_name = Do you want to automatically associate the {0} structure file(s) with sequences in the alignment that have the same name?
398 label.automatically_associate_structure_files_by_name = Automatically Associate Structure files by name
399 label.ignore_unmatched_dropped_files_info = <html>Do you want to <em>ignore</em> the {0} files whose names did not match any sequence IDs ?</html>
400 label.ignore_unmatched_dropped_files = Ignore unmatched dropped files?
401 label.view_name_original = Original
402 label.enter_view_name = Enter View Name
403 label.enter_label = Enter label
404 label.enter_label_for_the_structure = Enter a label for the structure
405 label.pdb_entries_couldnt_be_retrieved = The following pdb entries could not be retrieved from the PDB\:\n{0}\nPlease retry, or try downloading them manually.
406 label.couldnt_load_file = Couldn't load file
407 label.couldnt_find_pdb_id_in_file = Couldn't find a PDB id in the file supplied. Please enter an Id to identify this structure.
408 label.no_pdb_id_in_file = No PDB Id in File
409 label.couldnt_read_pasted_text = Couldn''t read the pasted text {0}
410 label.error_parsing_text = Error parsing text
411 label.input_alignment_from_url = Input Alignment From URL
412 label.input_alignment = Input Alignment
413 label.couldnt_import_as_vamsas_session = Couldn''t import {0} as a new vamsas session.
414 label.vamsas_document_import_failed = Vamsas Document Import Failed
415 label.couldnt_locate = Could not locate {0}
416 label.url_not_found = URL not found
417 label.new_sequence_url_link = New sequence URL link
418 label.cannot_edit_annotations_in_wrapped_view = Cannot edit annotations in wrapped view
419 label.wrapped_view_no_edit = Wrapped view - no edit
420 label.error_retrieving_data = Error Retrieving Data
421 label.user_colour_scheme_must_have_name = User colour scheme must have a name
422 label.no_name_colour_scheme = No name for colour scheme
423 label.invalid_url = Invalid URL !
424 label.error_loading_file = Error loading file
425 label.problems_opening_file = Encountered problems opening {0}!!
426 label.file_open_error = File open error
427 label.colour_scheme_exists_overwrite = Colour scheme {0} exists.\nContinue saving colour scheme as {1}?"
428 label.duplicate_scheme_name = Duplicate scheme name
429 label.jalview_new_questionnaire = There is a new Questionnaire available. Would you like to complete it now ?\n
430 label.jalview_user_survey = Jalview User Survey
431 label.alignment_properties = Alignment Properties: {0}
432 label.alignment_props = Alignment Properties
433 label.input_cut_paste = Cut & Paste Input
434 label.input_cut_paste_params = Cut & Paste Input - {0}
435 label.alignment_output_command = Alignment output - {0}
436 label.annotations = Annotations
437 label.structure_options = Structure Options
438 label.features = Features
439 label.overview_params = Overview {0}
440 label.paste_newick_file = Paste Newick file
441 label.load_tree_from_file = From File - 
442 label.colour_by_annotation = Colour by Annotation
443 label.selection_output_command = Selection output - {0}
444 label.annotation_for_displayid = <p><h2>Annotation for {0} </h2></p><p>
445 label.pdb_sequence_mapping = PDB - Sequence Mapping
446 label.pca_details = PCA details
447 label.redundancy_threshold_selection = Redundancy threshold selection
448 label.user_defined_colours = User defined colours
449 label.jalviewLite_release = JalviewLite - Release {0}
450 label.jaview_build_date = Build date: {0}
451 label.jalview_authors_1 = Authors: Jim Procter, Andrew Waterhouse, Mungo Carstairs, Tochukwu Ofoegbu, Lauren Lui, Jan Engelhardt,
452 label.jalview_authors_2 = Natasha Sherstnev, Daniel Barton, Michele Clamp, James Cuff, Steve Searle, David Martin & Geoff Barton.
453 label.jalview_dev_managers = Development managed by The Barton Group, University of Dundee, Scotland, UK.
454 label.jalview_distribution_lists = For help, see the FAQ at www.jalview.org and/or join the jalview-discuss@jalview.org mailing list
455 label.jalview_please_cite = If  you use Jalview, please cite:
456 label.jalview_cite_1_authors = Waterhouse, A.M., Procter, J.B., Martin, D.M.A, Clamp, M. and Barton, G. J. (2009)
457 label.jalview_cite_1_title = Jalview Version 2 - a multiple sequence alignment editor and analysis workbench
458 label.jalview_cite_1_ref = Bioinformatics doi: 10.1093/bioinformatics/btp033
459 label.right_click = Right click
460 label.to_add_annotation = to add annotation
461 label.alignment_has_no_annotations = Alignment has no annotations
462 label.retrieving_pdb_data = Retrieving PDB data...
463 label.label = Label
464 label.no_features_added_to_this_alignment = No Features added to this alignment!!
465 label.features_can_be_added_from_searches_1 = (Features can be added from searches or
466 label.features_can_be_added_from_searches_2 = from Jalview / GFF features files)
467 label.calculating_pca= Calculating PCA
468 label.jalview_cannot_open_file = Jalview can't open file
469 label.jalview_applet = Jalview applet
470 label.loading_data = Loading data
471 label.memory_stats = Total Free Memory: {0} MB; Max Memory: {1} MB; {2} %
472 label.calculating_tree = Calculating tree
473 label.state_queueing = queuing
474 label.state_running = running
475 label.state_completed = finished
476 label.state_job_cancelled = job cancelled!!
477 label.state_job_error = job error!
478 label.server_error_try_later = Server Error! (try later)
479 label.error_loading_pdb_data = Error loading PDB data!!
480 label.fetching_pdb_data = Fetching PDB data...
481 label.structure_type = Structure type
482 label.settings_for_type = Settings for {0}
483 label.view_full_application = View in Full Application
484 label.load_associated_tree = Load Associated Tree...
485 label.load_features_annotations = Load Features/Annotations...
486 label.load_vcf = Load SNP variants from plain text or indexed VCF data
487 label.load_vcf_file = Load VCF File
488 label.searching_vcf = Loading VCF variants...
489 label.added_vcf = Added {0} VCF variants to {1} sequence(s)
490 label.export_features = Export Features...
491 label.export_annotations = Export Annotations...
492 label.to_upper_case = To Upper Case
493 label.to_lower_case = To Lower Case
494 label.toggle_case = Toggle Case
495 label.edit_name_description = Edit Name/Description...
496 label.create_sequence_feature = Create Sequence Feature...
497 label.edit_sequence = Edit Sequence
498 label.edit_sequences = Edit Sequences
499 label.insert_gap = Insert 1 gap
500 label.insert_gaps = Insert {0} gaps
501 label.delete_gap = Delete 1 gap
502 label.delete_gaps = Delete {0} gaps
503 label.sequence_details = Sequence Details
504 label.jmol_help = Jmol Help
505 label.chimera_help = Chimera Help
506 label.close_viewer = Close Viewer
507 label.confirm_close_chimera = This will close Jalview''s connection to {0}.<br>Do you want to close the Chimera window as well?
508 label.all = All
509 label.sort_by = Sort alignment by
510 label.sort_by_score = Sort by Score
511 label.sort_by_density = Sort by Density
512 label.sequence_sort_by_density = Sequence sort by Density
513 label.sort_ann_by = Sort annotations by
514 label.sort_annotations_by_sequence = Sort by sequence
515 label.sort_annotations_by_label = Sort by label
516 label.reveal = Reveal
517 label.hide_columns = Hide Columns
518 label.load_jalview_annotations = Load Jalview Annotations or Features File
519 label.load_tree_file = Load a tree file
520 label.retrieve_parse_sequence_database_records_alignment_or_selected_sequences = Retrieve and parse sequence database records for the alignment or the currently selected sequences
521 label.standard_databases = Standard Databases
522 label.fetch_embl_uniprot = Fetch from EMBL/EMBLCDS or Uniprot/PDB and any selected DAS sources
523 label.reset_min_max_colours_to_defaults = Reset min and max colours to defaults from user preferences.
524 label.align_structures_using_linked_alignment_views = Superpose structures using {0} selected alignment view(s)
525 label.connect_to_session = Connect to session {0}
526 label.threshold_feature_display_by_score = Threshold the feature display by score.
527 label.threshold_feature_no_threshold = No Threshold
528 label.threshold_feature_above_threshold = Above Threshold
529 label.threshold_feature_below_threshold = Below Threshold
530 label.adjust_threshold = Adjust threshold
531 label.toggle_absolute_relative_display_threshold = Toggle between absolute and relative display threshold.
532 label.select_colour_minimum_value = Select Colour for Minimum Value
533 label.select_colour_maximum_value = Select Colour for Maximum Value
534 label.open_url_param = Open URL {0}
535 label.open_url_seqs_param = Open URL ({0}..) ({1} seqs)
536 label.load_pdb_file_associate_with_sequence = Load a PDB file and associate it with sequence {0}
537 label.reveal_hidden_columns = Reveal Hidden Columns with Right Mouse Button
538 label.dark_colour = Dark Colour
539 label.light_colour = Light Colour
540 label.highlightnode = Left click to select leaves.<br>Double-click to invert leaves.<br>Right click to change colour.
541 label.load_colour_scheme = Load colour scheme
542 label.copy_format_from = Copy format from
543 label.toggle_enabled_views = When enabled, allows many views to be selected.
544 label.select_all_views = Select all views
545 label.select_many_views = Select many views
546 label.edit_notes_parameter_set = Click to edit the notes for this parameter set.
547 label.open_local_file = Open local file
548 label.enable_automatically_sort_alignment_when_open_new_tree = Enable this to automatically sort<br>the alignment when you open<br> a new tree.
549 label.listen_for_selections = Listen for selections
550 label.selections_mirror_selections_made_same_sequences_other_views = When selected, selections in this view will mirror<br>selections made on the same sequences in other views.
551 label.toggle_sequence_visibility = Shift+H toggles sequence visiblity
552 label.toggle_columns_visibility = Ctrl+H toggles column visiblity.
553 label.toggles_visibility_hidden_selected_regions = H toggles visibility of hidden or selected regions
554 label.rename_tab_eXpand_reGroup=  Right-click to rename tab <br> Press X to eXpand tabs, G to reGroup.
555 label.right_align_sequence_id = Right Align Sequence Id
556 label.sequence_id_tooltip = Sequence ID Tooltip
557 label.no_services = <No Services>
558 label.select_copy_raw_html = Select this if you want to copy raw html
559 label.share_data_vamsas_applications = Share data with other vamsas applications
560 label.connect_to = Connect to
561 label.join_existing_vamsas_session = Join an existing vamsas session
562 label.from_url = from URL
563 label.any_trees_calculated_or_loaded_alignment_automatically_sort = When selected, any trees calculated or loaded onto the alignment will automatically sort the alignment
564 label.sort_with_new_tree = Sort With New Tree
565 label.from_textbox = from Textbox
566 label.window = Window
567 label.preferences = Preferences
568 label.tools = Tools
569 label.fetch_sequences = Fetch Sequences
570 action.fetch_sequences = Fetch Sequences...
571 label.stop_vamsas_session = Stop Vamsas Session
572 label.collect_garbage = Collect Garbage
573 label.show_memory_usage = Show Memory Usage
574 label.show_java_console = Show Java Console
575 label.show_jalview_news = Show Jalview News
576 label.take_snapshot = Take snapshot
577 label.monospaced_fonts_faster_to_render = Monospaced fonts are faster to render
578 label.anti_alias_fonts = Anti-alias Fonts (Slower to render)
579 label.monospaced_font= Monospaced
580 label.quality = Quality
581 label.maximize_window = Maximize Window
582 label.conservation = Conservation
583 label.consensus = Consensus
584 label.histogram = Histogram
585 label.logo = Logo
586 label.non_positional_features = List Non-positional Features
587 label.database_references = List Database References
588 #label.share_selection_across_views = Share selection across views
589 #label.scroll_highlighted_regions = Scroll to highlighted regions
590 label.gap_symbol = Gap Symbol
591 label.prot_alignment_colour = Protein Alignment Colour
592 label.nuc_alignment_colour = Nucleotide Alignment Colour
593 label.address = Address
594 label.port = Port
595 label.default_browser_unix = Default Browser (Unix)
596 label.send_usage_statistics = Send usage statistics
597 label.check_for_questionnaires = Check for questionnaires
598 label.check_for_latest_version = Check for latest version
599 label.url_linkfrom_sequence_id = URL link from Sequence ID
600 label.use_proxy_server = Use a proxy server
601 label.eps_rendering_style = EPS rendering style
602 label.append_start_end = Append /start-end (/15-380)
603 label.full_sequence_id = Full Sequence Id
604 label.smooth_font = Smooth Font
605 label.autocalculate_consensus = AutoCalculate Consensus
606 label.pad_gaps = Pad Gaps
607 label.pad_gaps_when_editing = Pad Gaps When Editing
608 label.automatically_set_id_width = Automatically set ID width
609 label.figure_id_column_width = Figure ID column width
610 label.use_modeller_output = Use Modeller Output
611 label.wrap_alignment = Wrap Alignment
612 label.right_align_ids = Right Align Ids
613 label.sequence_name_italics = Italic Sequence Ids
614 label.open_overview = Open Overview
615 label.default_colour_scheme_for_alignment = Default Colour Scheme for alignment
616 label.annotation_shading_default = Annotation Shading Default
617 label.default_minimum_colour_annotation_shading = Default Minimum Colour for annotation shading
618 label.default_maximum_colour_annotation_shading = Default Maximum Colour for annotation shading
619 label.visual = Visual
620 label.connections = Connections
621 label.output = Output
622 label.editing = Editing
623 label.web_services = Web Services
624 label.right_click_to_edit_currently_selected_parameter = Right click to edit currently selected parameter.
625 label.let_jmol_manage_structure_colours = Let Jmol manage structure colours
626 label.let_chimera_manage_structure_colours = Let Chimera manage structure colours
627 label.fetch_chimera_attributes = Fetch Chimera attributes
628 label.fetch_chimera_attributes_tip = Copy Chimera attribute to Jalview feature
629 label.marks_leaves_tree_not_associated_with_sequence = Marks leaves of tree not associated with a sequence
630 label.index_web_services_menu_by_host_site = Index web services in menu by the host site
631 label.option_want_informed_web_service_URL_cannot_be_accessed_jalview_when_starts_up = Check this option if you want to be informed<br>when a web service URL cannot be accessed by Jalview<br>when it starts up
632 label.new_service_url = New Service URL
633 label.edit_service_url = Edit Service URL
634 label.delete_service_url = Delete Service URL
635 label.details = Details
636 label.options = Options
637 label.parameters = Parameters
638 label.proxy_server = Proxy Server
639 label.file_output = File Output
640 label.select_input_type = Select input type
641 label.set_options_for_type = Set options for type
642 label.data_input_parameters = Data input parameters
643 label.data_returned_by_service = Data returned by service
644 label.rsbs_encoded_service = RSBS Encoded Service
645 label.parsing_errors = Parsing errors
646 label.simple_bioinformatics_rest_services = Simple Bioinformatics Rest Services
647 label.web_service_discovery_urls = Web Service Discovery URLS
648 label.input_parameter_name = Input Parameter name
649 label.short_descriptive_name_for_service = Short descriptive name for service
650 label.function_service_performs = What kind of function the service performs (e.g. alignment, analysis, search, etc).
651 label.brief_description_service = Brief description of service
652 label.url_post_data_service = URL to post data to service. Include any special parameters needed here
653 label.optional_suffix = Optional suffix added to URL when retrieving results from service
654 label.preferred_gap_character = Which gap character does this service prefer?
655 label.gap_character = Gap character
656 label.move_return_type_up_order= Move return type up order
657 label.move_return_type_down_order= Move return type down order
658 label.update_user_parameter_set = Update this existing user parameter set
659 label.delete_user_parameter_set = Delete the currently selected user parameter set
660 label.create_user_parameter_set = Create a new parameter set with the current settings.
661 label.revert_changes_user_parameter_set = Undo all changes to the current parameter set
662 label.start_job_current_settings = Start Job with current settings
663 label.cancel_job_close_dialog = Close this dialog and cancel job
664 label.input_output = Input/Output
665 label.cut_paste = Cut'n'Paste
666 label.adjusting_parameters_for_calculation = Adjusting parameters for existing Calculation
667 label.2d_rna_structure_line = 2D RNA {0} (alignment)
668 label.2d_rna_sequence_name = 2D RNA - {0}
669 label.edit_name_and_description_current_group = Edit name and description of current group
670 label.from_file = From File
671 label.enter_pdb_id = Enter PDB Id
672 label.enter_pdb_id_tip = Enter PDB Id (or pdbid:chaincode)
673 label.text_colour = Text Colour...
674 label.structure = Structure
675 label.show_pdbstruct_dialog = 3D Structure Data...
676 label.view_rna_structure = VARNA 2D Structure
677 label.create_sequence_details_report_annotation_for = Annotation for {0}
678 label.sequence_details_for = Sequence Details for {0}
679 label.sequence_name = Sequence Name
680 label.sequence_description = Sequence Description
681 label.edit_sequence_name_description = Edit Sequence Name/Description
682 label.spaces_converted_to_backslashes = Spaces have been converted to _
683 label.no_spaces_allowed_sequence_name = No spaces allowed in Sequence Name
684 label.select_outline_colour = Select Outline Colour
685 label.web_browser_not_found_unix = Unixers\: Couldn't find default web browser.\nAdd the full path to your browser in Preferences."
686 label.web_browser_not_found = Web browser not found
687 label.select_pdb_file_for = Select a PDB file for {0}
688 label.html = HTML
689 label.wrap = Wrap
690 label.show_database_refs = Show Database Refs
691 label.show_non_positional_features = Show Non-Positional Features
692 label.save_png_image = Save As PNG Image
693 label.load_tree_for_sequence_set = Load a tree for this sequence set
694 label.export_image = Export Image
695 label.vamsas_store = VAMSAS store
696 label.translate_cDNA = Translate as cDNA
697 label.reverse = Reverse
698 label.reverse_complement = Reverse Complement
699 label.linked_view_title = Linked CDS and protein view
700 label.extract_scores = Extract Scores
701 label.get_cross_refs = Get Cross-References
702 label.sort_alignment_new_tree = Sort Alignment With New Tree
703 label.add_sequences = Add Sequences
704 label.new_window = New Window
705 label.split_window = Split Window
706 label.set_as_default = Set as Default
707 label.show_labels = Show labels
708 action.background_colour = Background Colour...
709 label.associate_nodes_with = Associate Nodes With
710 label.link_name = Link Name
711 label.pdb_file = PDB file
712 label.colour_with_jmol = Colour with Jmol
713 label.colour_with_chimera = Colour with Chimera
714 label.superpose_structures = Superpose Structures
715 error.superposition_failed = Superposition failed: {0}
716 label.insufficient_residues = Not enough aligned residues ({0}) to perform superposition
717 label.jmol = Jmol
718 label.chimera = Chimera
719 label.create_chimera_attributes = Write Jalview features
720 label.create_chimera_attributes_tip = Set Chimera residue attributes for visible features
721 label.attributes_set = {0} attribute values set on Chimera
722 label.sort_alignment_by_tree = Sort Alignment By Tree
723 label.mark_unlinked_leaves = Mark Unlinked Leaves
724 label.associate_leaves_with = Associate Leaves With
725 label.save_colour_scheme_with_unique_name_added_to_colour_menu = Save your colour scheme with a unique name and it will be added to the Colour menu
726 label.case_sensitive = Case Sensitive
727 label.lower_case_colour = Colour All Lower Case
728 label.lower_case_tip = Chosen colour applies to all lower case symbols
729 label.index_by_host = Index by Host
730 label.index_by_type = Index by Type
731 label.enable_jabaws_services = Enable JABAWS Services
732 label.display_warnings = Display Warnings
733 label.move_url_up = Move URL Up
734 label.move_url_down = Move URL Down
735 label.add_sbrs_definition = Add a SBRS Definition
736 label.edit_sbrs_definition = Edit SBRS Definition
737 label.delete_sbrs_definition = Delete SBRS Definition
738 label.your_sequences_have_been_verified = Your sequences have been verified against known sequence databases.\n(Use Calculate | Show flanking regions to show enclosing sequence.)\nTo preserve data changes, save your alignment.\n\n
739 label.sequences_updated = Sequences updated
740 label.dbref_search_completed = DBRef search completed
741 label.fetch_all_param = Fetch all {0}
742 label.paste_new_window = Paste To New Window
743 label.settings_for_param = Settings for {0}
744 label.view_params = View {0}
745 label.aacon_calculations = AACon Calculations
746 label.aacon_settings = Change AACon Settings...
747 tooltip.aacon_calculations = When checked, AACon calculations are updated automatically.
748 tooltip.aacon_settings = Modify settings for AACon calculations.
749 label.rnalifold_calculations = RNAAliFold Prediction
750 label.rnalifold_settings = Change RNAAliFold settings...
751 tooltip.rnalifold_calculations = When checked, RNA secondary structure predictions will be calculated for the alignment, and updated when edits are made.
752 tooltip.rnalifold_settings = Modify settings for the RNAAliFold prediction. Use this to hide or show different results of the RNA calculation, and change RNA folding parameters.
753 label.all_views = All Views
754 label.align_sequences_to_existing_alignment = Align sequences to an existing alignment
755 label.realign_with_params = Realign with {0}
756 label.calcname_with_default_settings = {0} with Defaults
757 label.action_with_default_settings = {0} with default settings
758 label.edit_settings_and_run = Edit settings and run...
759 label.view_and_change_parameters_before_alignment = View and change the parameters before alignment
760 label.run_with_preset_params = Run {0} with preset
761 label.view_and_change_parameters_before_running_calculation = View and change parameters before running calculation
762 label.view_documentation = View documentation
763 label.select_return_type = Select return type
764 label.translation_of_params = Translation of {0} (Table {1})
765 label.features_for_params = Features for - {0}
766 label.annotations_for_params = Annotations for - {0}
767 label.generating_features_for_params = Generating features for - {0}
768 label.generating_annotations_for_params = Generating annotations for - {0}
769 label.varna_params = VARNA - {0}
770 label.sequence_feature_settings = Sequence Feature Settings
771 label.sequence_feature_settings_for = Sequence Feature Settings for {0}
772 label.sequence_feature_settings_for_view = Sequence Feature Settings for view "{0}"
773 label.sequence_feature_settings_for_CDS_and_Protein = Sequence Feature Settings for CDS and Protein
774 label.pairwise_aligned_sequences = Pairwise Aligned Sequences
775 label.original_data_for_params = Original Data for {0}
776 label.points_for_params = Points for {0}
777 label.transformed_points_for_params = Transformed points for {0}
778 label.variable_color_for = Variable Feature Colour for {0}
779 label.select_background_colour = Select Background Colour
780 label.invalid_font = Invalid Font
781 label.separate_multiple_accession_ids = Enter one or more accession IDs separated by a semi-colon ";"
782 label.separate_multiple_query_values = Enter one or more {0}s separated by a semi-colon ";"
783 label.search_all = Enter one or more search values separated by a semi-colon ";" (Note: This searches the entire database)
784 label.replace_commas_semicolons = Replace commas with semi-colons
785 label.parsing_failed_syntax_errors_shown_below_param = Parsing failed. Syntax errors shown below {0}
786 label.parsing_failed_unrecoverable_exception_thrown_param = \nParsing failed. An unrecoverable exception was thrown\:\n {0}
787 label.example_query_param = Example query: {0}
788 label.enter_value_increase_conservation_visibility = Enter value to increase conservation visibility
789 label.enter_percentage_identity_above_which_colour_residues = Enter % identity above which to colour residues
790 label.wswublast_client_credits = To display sequence features an exact Uniprot id with 100% sequence identity match must be entered.\nIn order to display these features, try changing the names of your sequences to the ids suggested below.\n\nRunning WSWUBlast at EBI.\nPlease quote Pillai S., Silventoinen V., Kallio K., Senger M., Sobhany S., Tate J., Velankar S., Golovin A., Henrick K., Rice P., Stoehr P., Lopez R.\nSOAP-based services provided by the European Bioinformatics Institute.\nNucleic Acids Res. 33(1)\:W25-W28 (2005));
791 label.blasting_for_unidentified_sequence = BLASTing for unidentified sequences
792 label.select_columns_containing = Select columns containing
793 label.select_columns_not_containing = Select columns that do not contain
794 label.hide_columns_containing = Hide columns containing
795 label.hide_columns_not_containing = Hide columns that do not contain
796 option.trim_retrieved_seqs = Trim retrieved sequences
797 label.trim_retrieved_sequences = When the reference sequence is longer than the sequence that you are working with, only keep the relevant subsequences.
798 label.use_sequence_id_1 = Use $DB_ACCESSION$ or $DB_ACCESSION=/<regex>/=$
799 label.use_sequence_id_2 = to embed accession id in URL
800 label.use_sequence_id_3 = Use $SEQUENCE_ID$ similarly to embed sequence id
801 label.use_sequence_id_4 = 
802 label.ws_parameters_for = Parameters for {0}
803 label.switch_server = Switch server
804 label.choose_jabaws_server = Choose a server for running this service
805 label.services_at = Services at {0}
806 label.rest_client_submit = {0} using {1}
807 label.fetch_retrieve_from =Retrieve from {0}</html>
808 label.fetch_retrieve_from_all_sources = Retrieve from all {0} sources in {1}<br>First is :{2}<html> 
809 label.feature_settings_click_drag = Drag up or down to change render order.<br/>Double click to select columns containing feature.
810 label.transparency_tip = Adjust transparency to 'see through' feature colours.
811 label.opt_and_params_further_details = see further details by right-clicking
812 label.opt_and_params_show_brief_desc_image_link = <html>Click to show brief description<br><img src="{0}"/> Right click for further information.</html> 
813 label.opt_and_params_show_brief_desc = <html>Click to show brief description<br></html>
814 label.adjusts_width_generated_eps_png = <html>Adjusts the width of the generated EPS or PNG file to ensure even the longest sequence ID or annotation label is displayed</html>
815 label.manually_specify_width_left_column = <html>Manually specify the width of the left hand column where sequence IDs and annotation labels will be rendered in exported alignment figures. This setting will be ignored if 'Automatically set ID width' is set</html>
816 label.job_created_when_checked = <html>When checked, a job is created for every sequence in the current selection.</html>
817 label.when_checked_job_visible_region_and_results = <html>When checked, a single job is created for the visible region and results mapped back onto their location in the alignment. Otherwise, a job would be created for every contiguous region visible in the alignment or current selection (e.g. a multiple alignment).</html>
818 label.flat_file_representation = <html>Flat file representation of this rest service using the Really Simple Bioinformatics Service formalism</html>
819 label.result_of_parsing_rsbs = <html>Results of parsing the RSBS representation</html>
820 label.user_preset = User Preset
821 label.service_preset = Service Preset
822 label.run_with_preset = Run {0} with preset
823 label.view_service_doc_url = <html>View <a href="{0}">{1}</a></html>
824 action.by_title_param = By {0}
825 label.source_from_db_source = Sources from {0}
826 label.from_msname = from {0}
827 label.superpose_with = Superpose with
828 label.scale_label_to_column = Scale Label to Column
829 label.add_new_row = Add New Row
830 label.edit_label_description = Edit Label/Description
831 label.hide_row = Hide This Row
832 label.delete_row = Delete This Row
833 label.show_all_hidden_rows = Show All Hidden Rows
834 label.export_annotation = Export Annotation
835 label.copy_consensus_sequence = Copy Consensus Sequence
836 label.helix = Helix
837 label.sheet = Sheet
838 label.rna_helix = RNA Helix
839 label.remove_annotation = Remove Annotation
840 label.colour_by = Colour by...
841 label.muscle_multiple_protein_sequence_alignment = Muscle Multiple Protein Sequence Alignment
842 label.mafft_multiple_sequence_alignment = MAFFT Multiple Sequence Alignment
843 label.clustalw_multiple_sequence_alignment = ClustalW Multiple Sequence Alignment
844 label.jnet_secondary_structure_prediction = JPred Secondary Structure Prediction
845 label.multiharmony = Multi-Harmony
846 label.unable_start_web_service_analysis = Unable to start web service analysis
847 label.job_couldnt_be_started_check_input = The Job couldn't be started. Please check your input, and the Jalview console for any warning messages.
848 label.prompt_each_time = Prompt each time
849 label.couldnt_save_project = Couldn't save project
850 label.error_whilst_saving_current_state_to = Error whilst saving current state to {0}
851 label.error_whilst_loading_project_from = Error whilst loading project from {0}
852 label.couldnt_load_project = Couldn't load project
853 label.invalid_name_preset_exists = Invalid name - preset already exists.
854 label.invalid_name = Invalid name
855 label.set_proxy_settings = Please set up your proxy settings in the 'Connections' tab of the Preferences window
856 label.proxy_authorization_failed = Proxy Authorization Failed
857 label.internal_jalview_error = Internal Jalview Error
858 label.secondary_structure_prediction_service_couldnt_be_located = The Secondary Structure Prediction Service named {0} at {1} couldn''t be located.
859 label.service_called_is_not_msa_service = The Service called \n{0}\nis not a \nMultiple Sequence Alignment Service\!
860 label.msa_service_is_unknown = The Multiple Sequence Alignment Service named {0} is unknown
861 label.service_called_is_not_seq_search_service = The Service called \n{0}\nis not a \nSequence Search Service\!
862 label.seq_search_service_is_unknown = The Sequence Search Service named {0} is unknown
863 label.feature_type = Feature Type
864 label.show = Show
865 label.service_url = Service URL
866 label.copied_sequences = Copied sequences
867 label.cut_sequences = Cut Sequences
868 label.conservation_colour_increment = Conservation Colour Increment ({0})
869 label.percentage_identity_threshold = Percentage Identity Threshold ({0})
870 label.error_unsupported_owwner_user_colour_scheme = Unsupported owner for User Colour scheme dialog
871 label.save_alignment_to_file = Save Alignment to file
872 label.save_features_to_file = Save Features to File
873 label.save_annotation_to_file = Save Annotation to File
874 label.save_pdb_file = Save PDB File
875 label.save_text_to_file = Save Text to File
876 label.save_state = Save State
877 label.restore_state = Restore State
878 label.saving_jalview_project = Saving jalview project {0}
879 label.loading_jalview_project = Loading jalview project {0}
880 label.save_vamsas_document_archive = Save Vamsas Document Archive
881 label.saving_vamsas_doc = Saving VAMSAS Document to {0}
882 label.load_feature_colours = Load Feature Colours
883 label.save_feature_colours = Save Feature Colour Scheme
884 label.select_startup_file = Select startup file
885 label.select_default_browser = Select default web browser
886 label.save_tree_as_newick = Save tree as newick file
887 label.create_eps_from_tree = Create EPS file from tree
888 label.create_png_from_tree = Create PNG image from tree
889 label.save_colour_scheme = Save colour scheme
890 label.edit_params_for = Edit parameters for {0}
891 label.choose_filename_for_param_file = Choose a filename for this parameter file
892 label.save_as_html = Save as HTML
893 label.recently_opened = Recently Opened
894 label.blasting_for_unidentified_sequence_jobs_running = BLASTing for unidentified sequences - {0}  jobs running.
895 label.tree = Tree
896 label.tree_from = Tree from {0}
897 label.webservice_job_title = {0} using {1}
898 label.select_visible_region_of = selected {0} region of {1}
899 label.visible = Visible
900 label.select_unselect_visible_regions_from = select and unselected {0} regions from {1}
901 label.visible_region_of = visible region of
902 label.webservice_job_title_on = {0} using {1} on {2}
903 label.updating_vamsas_session = Updating vamsas session
904 label.loading_file = Loading File: {0}
905 label.edit_params = Edit {0}
906 label.as_percentage = As Percentage
907 error.not_implemented = Not implemented
908 error.no_such_method_as_clone1_for = No such method as clone1 for {0}
909 error.null_from_clone1 = Null from clone1!
910 error.not_yet_implemented = Not yet implemented
911 error.unknown_type_dna_or_pep = Unknown Type {0} - dna or pep are the only allowed values.
912 error.implementation_error_dont_know_threshold_annotationcolourgradient = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
913 error.invalid_separator_parameter = Invalid separator parameter - must be non-zero length
914 error.alignment_cigararray_not_implemented = Alignment(CigarArray) not yet implemented
915 error.empty_view_cannot_be_updated = empty view cannot be updated.
916 error.mismatch_between_number_of_sequences_in_block = Mismatch between number of sequences in block {0} ({1}) and the original view ({2})
917 error.padding_not_yet_implemented = Padding not yet implemented
918 error.mismatch_between_visible_blocks_to_update_and_number_of_contigs_in_view = Mismatch between visible blocks to update and number of contigs in view (contigs=0,blocks={0})
919 error.unknown_seq_cigar_operation = Unknown SeqCigar operation {0}
920 error.implementation_bug_parse_cigar_string = Implementation bug in parseCigarString
921 error.implementation_error_invalid_operation_string = Implementation error. Invalid operation string.
922 error.invalid_range_string = Invalid range string (must be zero or positive number)
923 error.implementation_error_delete_range_out_of_bounds = Implementation Error: deleteRange out of bounds: start must be non-negative and less than end.
924 error.implementation_error = Implementation error
925 error.implementation_error_unknown_operation = Implementation Error! Unknown operation {0}
926 error.implementation_error_unexpected_null_from_get_sequence_and_deletions = Implementation Error - unexpected null from getSequenceAndDeletions
927 error.implementation_error_set_seq_null = Implementation Error - _setSeq(null,...)
928 error.implementation_error_s = Implementation Error: _s= {0}
929 error.implementation_error_seqcigar_possible = SeqCigar: Possible implementation error: sequence is longer than dataset sequence
930 error.implmentation_bug_seq_null = Implementation Bug. Null seq
931 error.implementation_bug_cigar_operation_list_range_list = Implementation Bug. Cigar Operation list!= range list
932 error.not_yet_implemented_cigar_object_from_cigar_string = NOT YET Implemented: Constructing a Cigar object from a cigar string and a gapped sequence.
933 error.implementation_bug_cigar_operation = Implementation Bug. Cigar Operation {0} {1} not one of {2}, {3}, or {4}.
934 error.implementation_error_for_new_cigar = Implementation error for new Cigar(SequenceI)
935 error.implementation_error_cigar_seq_no_operations = Implementation error: {0}th sequence Cigar has no operations.
936 error.implementation_error_no_pdbentry_from_index = Implementation error - no corresponding pdbentry (for index {0}) to add sequences mappings to
937 error.jmol_version_not_compatible_with_jalview_version = Jmol version {0} is not compatible with this version of Jalview. Report this problem at issues.jalview.org
938 error.not_implemented_remove = Remove: Not implemented
939 error.not_implemented_clone = Clone: Not implemented
940 error.call_setprogressbar_before_registering_handler = call setProgressBar before registering the progress bar's handler.
941 label.cancelled_params = Cancelled {0}
942 error.implementation_error_cannot_show_view_alignment_frame = Implementation error: cannot show a view from another alignment in an AlignFrame.
943 error.implementation_error_dont_know_about_threshold_setting = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
944 error.eps_generation_not_implemented = EPS Generation not yet implemented
945 error.png_generation_not_implemented = PNG Generation not yet implemented
946 error.try_join_vamsas_session_another = Trying to join a vamsas session when another is already connected
947 error.invalid_vamsas_session_id = Invalid vamsas session id
948 label.groovy_support_failed = Jalview Groovy Support Failed
949 label.couldnt_create_groovy_shell = Couldn't create the groovy Shell. Check the error log for the details of what went wrong.
950 error.unsupported_version_calcIdparam = Unsupported Version for calcIdparam {0}
951 error.implementation_error_cant_reorder_tree = Implementation Error: Can't reorder this tree. Not DefaultMutableTreeNode.
952 error.invalid_value_for_option = Invalid value {0} for option {1}
953 error.implementation_error_cannot_import_vamsas_doc = Implementation Error - cannot import existing vamsas document into an existing session, Yet!
954 label.vamsas_doc_couldnt_be_opened_as_new_session = VAMSAS Document could not be opened as a new session - please choose another
955 error.implementation_error_vamsas_operation_not_init = Impementation error! Vamsas Operations when client not initialised and connected
956 error.jalview_no_connected_vamsas_session = Jalview not connected to Vamsas session
957 error.implementation_error_cannot_recover_vamsas_object_mappings = IMPLEMENTATION ERROR: Cannot recover vamsas object mappings - no backup was made
958 error.setstatus_called_non_existent_job_pane = setStatus called for non-existent job pane {0}
959 error.implementation_error_cannot_find_marshaller_for_param_set =Implementation error: Can't find a marshaller for the parameter set
960 error.implementation_error_old_jalview_object_not_bound =IMPLEMENTATION ERROR: old jalview object is not bound ! ({0})
961 error.implementation_error_vamsas_doc_class_should_bind_to_type = Implementation Error: Vamsas Document Class {0} should bind to a {1} (found a {2})
962 error.invalid_vamsas_rangetype_cannot_resolve_lists = Invalid vamsas RangeType - cannot resolve both lists of Pos and Seg from choice!
963 error.implementation_error_maplist_is_null = Implementation error. MapList is null for initMapType.
964 error.implementation_error_cannot_have_null_alignment = Implementation error: Cannot have null alignment property key
965 error.implementation_error_null_fileparse = Implementation error. Null FileParse in copy constructor
966 error.implementation_error_cannot_map_alignment_sequences = IMPLEMENTATION ERROR: Cannot map an alignment of sequences from different datasets into a single alignment in the vamsas document.
967 error.implementation_error_structure_selection_manager_null = Implementation error. Structure selection manager's context is 'null'
968 exception.ssm_context_is_null = SSM context is null
969 error.idstring_seqstrings_only_one_per_sequence = idstrings and seqstrings contain one string each per sequence
970 error.cannot_have_mixed_length_replacement_vectors = Cannot have mixed length replacement vectors. Replacement vector for {0} is {1} strings long, and have already seen a {2} length vector.
971 error.cannot_have_zero_length_vector_replacement_strings = Cannot have zero length vector of replacement strings - either 1 value or n values.
972 error.implementation_error_multiple_single_sequence_prediction_jobs_not_supported = Implementation Error! Multiple single sequence prediction jobs are not yet supported
973 error.implementation_error_invalid_msa_index_for_job =Implementation Error! Invalid msaIndex for JPredJob on parent MSA input object!
974 error.implementation_error_startjob_called = Implementation error - StartJob(JpredJob) called on {0}
975 error.multiple_jnet_subjob_merge_not_implemented = Multiple JPred subjob merging not yet implemented
976 label.job_never_ran = Job never ran - input returned to user.
977 error.implementation_error_minlen_must_be_greater_zero = Implementation error: minlen must be zero or more
978 error.implementation_error_msawbjob_called = Implementation error - StartJob(MsaWSJob) called on a WSJobInstance {0}
979 error.implementation_error_cannot_attach_ws_menu_entry = IMPLEMENTATION ERROR: cannot attach WS Menu Entry without service handle reference!
980 error.parameter_migration_not_implemented_yet = Parameter migration not implemented yet
981 error.implementation_error_cannot_set_jaba_option = Implementation error: cannot set Jaba Option to a value outside its allowed value range!
982 error.implementation_error_valuetype_doesnt_support_jabaws_type = IMPLEMENTATION ERROR: jalview.ws.params.ValueConstrainI.ValueType does not support the JABAWS type : {0}
983 error.cannot_create_jabaws_param_set = Cannot create a JabaWSParamSet from non-JabaWS parameters
984 error.cannot_set_arguments_to_jabaws_param_set = Cannot set arguments to a JabaWSParamSet that are not JabaWS arguments
985 error.implementation_error_runner_config_not_available = Implementation Error: Runner Config not available for a JABAWS service of type {0} ({1})
986 error.implementation_error_cannot_handle_jaba_param = Implementation Error: Cannot handle Jaba parameter object {0}
987 error.implementation_error_attempt_to_delete_service_preset = Implementation error: Attempt to delete a service preset!
988 error.implementation_error_cannot_locate_oldname_presetname = Implementation error: Can''t locate either oldname ({0}) or presetName ({1}in the datastore!"
989 error.implementation_error_jabaws_param_set_only_handled_by = Implementation error: JabaWsParamSets can only be handled by JabaParamStore
990 error.cannot_set_source_file_for = Cannot set source file for {0}
991 error.mismatch_service_instance_preset = Probable mismatch between service instance and preset!
992 error.cannot_set_params_for_ws_preset = Cannot set Parameters for a Jaba Web service's preset
993 error.implementation_error_can_only_instantiate_jaba_param_sets = Implementation error: Can only instantiate Jaba parameter sets
994 error.no_aacon_service_found = No AACon service found
995 error.implementation_error_couldnt_copy_value_constraint = Implementation error: could not copy ValueConstrain!
996 error.couldnt_encode_as_utf8 = Couldn''t encode {0} as UTF-8.
997 error.tree_inputtype_not_yet_implemented = Tree InputType not yet implemented
998 error.implementation_error_need_to_have_httpresponse = Implementation Error: need to have an HttpResponse to process
999 error.dbrefsource_implementation_exception =DBRefSource Implementation Exception
1000 error.implementation_error_dbinstance_must_implement_interface = Implmentation Error - getDbInstances must be given a class that implements jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy (was given{0})
1001 error.implementation_error_must_init_dbsources =Implementation error. Must initialise dbSources
1002 label.view_controller_toggled_marked = {0} {1} columns {2} features of type {3}  across {4} sequence(s)
1003 label.toggled = Toggled
1004 label.marked = Marked
1005 label.containing = containing
1006 label.not_containing = not containing
1007 label.no_feature_of_type_found = No features of type {0} found
1008 label.no_feature_found_selection = No features of type {0} found in selection
1009 label.submission_params = Submission {0}
1010 label.empty_alignment_job = Empty Alignment Job
1011 label.add_new_sbrs_service = Add a new Simple Bioinformatics Rest Service
1012 label.edit_sbrs_entry = Edit Simple Bioinformatics Rest Service entry
1013 label.pca_recalculating = Recalculating PCA
1014 label.pca_calculating = Calculating PCA
1015 label.select_foreground_colour = Choose foreground colour
1016 label.select_colour_for_text = Select Colour for Text
1017 label.adjunst_foreground_text_colour_threshold = Adjust Foreground Text Colour Threshold
1018 label.select_subtree_colour = Select Sub-Tree Colour
1019 label.create_new_sequence_features = Create New Sequence Feature(s)
1020 label.amend_delete_features = Amend/Delete Features for {0}
1021 exception.out_of_bounds_for_file = Out of bounds for file: i={0}, Final Buffer: i0={1} iend={2}
1022 exception.null_string_given_to_regex_search = Null String Given to Regex.search
1023 exception.null_string_like_given_to_regex_search = Null StringLike Given to Regex.search
1024 exception.null_string_given_to_regex_reverse_search = Null String Given to Regex.reverseSearch
1025 exception.null_string_like_given_to_regex_reverse_search = Null StringLike Given to Regex.reverseSearch
1026 exception.null_string_like_given_to_regex_search_from = Null String Given to Regex.searchFrom
1027 exception.null_string_like_given_to_regex_search_region = Null String Given to Regex.searchRegion
1028 exception.replace_null_regex_pointer = Replacer has null Regex pointer
1029 exception.bad_pattern_to_regex_perl_code = bad pattern to Regex.perlCode: {0}
1030 exception.no_stub_implementation_for_interface = There is no stub implementation for the interface: {0}
1031 exception.cannot_set_endpoint_address_unknown_port = Cannot set Endpoint Address for Unknown Port {0}
1032 exception.mismatched_unseen_closing_char = Mismatched (unseen) closing character {0}
1033 exception.mismatched_closing_char = Mismatched closing character {0}
1034 exception.mismatched_opening_char = Mismatched opening character {0} at {1}
1035 exception.invalid_datasource_couldnt_obtain_reader = Invalid datasource. Could not obtain Reader
1036 exception.unterminated_cigar_string = Unterminated cigar string
1037 exception.unexpected_operation_cigar_string_pos = Unexpected operation {0} in cigar string (position {1} in {2}
1038 exception.couldnt_parse_responde_from_annotated3d_server = Couldn't parse response from Annotate3d server
1039 exception.application_test_npe = Application test: throwing an NullPointerException It should arrive at the console
1040 exception.overwriting_vamsas_id_binding = Overwriting vamsas id binding
1041 exception.overwriting_jalview_id_binding = Overwriting jalview id binding
1042 exception.failed_to_resolve_gzip_stream = Failed to resolve GZIP stream
1043 exception.problem_opening_file_also_tried = Problem opening {0} (also tried {1}) : {2}
1044 exception.problem_opening_file = Problem opening {0} : {1}
1045 exception.failed_to_read_data_from_source = Failed to read data from source: {0}
1046 exception.no_init_source_stream = Unitialised Source Stream
1047 exception.invalid_source_stream = Invalid Source Stream: {0}
1048 error.implementation_error_reset_called_for_invalid_source = Implementation Error: Reset called for invalid source.
1049 exception.number_of_residues_in_query_sequence_differ_from_prediction = Number of residues in {0} supposed query sequence ({1}\n{2})\ndiffer from number of prediction sites in prediction ({3})
1050 label.mapped = mapped
1051 exception.jpredconcide_entry_has_unexpected_number_of_columns = JPredConcise: Entry ({0}) has an unexpected number of columns
1052 exception.couldnt_parse_concise_annotation_for_prediction = Couldn''t parse concise annotation for prediction profile.\n{0}
1053 exception.newfile = NewickFile\: {0}\n
1054 label.no_tree_read_in = No Tree read in
1055 exception.rnaml_couldnt_access_datasource = Couldn''t access datasource ({0})
1056 exception.ranml_couldnt_process_data = Couldn''t process data as RNAML file ({0})
1057 exception.ranml_invalid_file = Invalid RNAML file ({0})
1058 exception.ranml_problem_parsing_data = Problem parsing data as RNAML ({0})
1059 exception.pfam_no_sequences_found = No sequences found (PFAM input)
1060 exception.stockholm_invalid_format = This file is not in valid STOCKHOLM format: First line does not contain '# STOCKHOLM'
1061 exception.couldnt_parse_sequence_line = Could not parse sequence line: {0}
1062 exception.unknown_annotation_detected = Unknown annotation detected: {0} {1}
1063 exception.couldnt_store_sequence_mappings = Couldn''t store sequence mappings for {0}
1064 exception.matrix_too_many_iteration = Too many iterations in {0} (max is {1})
1065 exception.browser_not_found = Exception in finding browser: {0}
1066 exception.browser_unable_to_locate = Unable to locate browser: {0}
1067 exception.invocation_target_exception_creating_aedesc = InvocationTargetException while creating AEDesc: {0}
1068 exception.illegal_access_building_apple_evt= IllegalAccessException while building AppleEvent: {0}
1069 exception.unable_to_launch_url = Unable to launch URL: {0}
1070 exception.unable_to_create_internet_config = Unable to create an Internet Config instance: {0}
1071 exception.invocation_target_calling_url = InvocationTargetException while calling openURL: {0}
1072 exception.illegal_access_calling_url = IllegalAccessException while calling openURL: {0}
1073 exception.interrupted_launching_browser = InterruptedException while launching browser: {0}
1074 exception.no_pdb_records_for_chain = No PDB Records for {0} chain {1}
1075 exception.unexpected_handling_rnaml_translation_for_pdb = Unexpected exception when handling RNAML translation of PDB data
1076 exception.couldnt_recover_sequence_properties_for_alignment = Couldn't recover sequence properties for alignment
1077 exception.unknown_format_for_file = Unknown format {0} for file \: \n{1}
1078 label.remove_gaps = Remove Gaps
1079 exception.couldnt_recover_sequence_props_for_jnet_query = Couldn't recover sequence properties for JPred Query sequence!
1080 exception.server_timeout_try_later = Server timed out - try again later\n
1081 exception.web_service_returned_null_try_later= Server at {0} returned null object, it probably cannot be contacted. Try again later.
1082 exception.cannot_contact_service_endpoint_at = Cannot contact service endpoint at {0}
1083 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set = Implementation error: Cannot find service url in the given url set!
1084 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set_param_store = Implementation error: Cannot find service url in the given url set for this service parameter store ({0}}
1085 exception.jobsubmission_invalid_params_set = Invalid parameter set. Check Jalview implementation
1086 exception.notvaliddata_group_contains_less_than_min_seqs = Group contains less than {0} sequences.
1087 exception.outofmemory_loading_pdb_file = Out of memory loading PDB File
1088 exception.eps_coudnt_write_output_file = Could not write to the output file: {0}
1089 exception.eps_method_not_supported = Method not currently supported by EpsGraphics2D version {0}
1090 exception.eps_unable_to_get_inverse_matrix = Unable to get inverse of matrix: {0}
1091 warn.job_cannot_be_cancelled_close_window = This job cannot be cancelled.\nJust close the window.
1092 warn.service_not_supported = Service not supported!
1093 warn.input_is_too_big = Input is too big!
1094 warn.invalid_job_param_set = Invalid job parameter set!
1095 warn.oneseq_msainput_selection = The current selection only contains a single sequence. Do you want to submit all sequences for alignment instead ?   
1096 info.job_couldnt_be_run_server_doesnt_support_program = Job could not be run because the server doesn''t support this program.\n{0}
1097 info.job_couldnt_be_run_exceeded_hard_limit = Job could not be run because it exceeded a hard limit on the server.\n{0}
1098 info.job_couldnt_be_run_incorrect_param_setting = Job could not be run because some of the parameter settings are not supported by the server.\n{0}\nPlease check to make sure you have used the correct parameter set for this service\!\n
1099 info.no_jobs_ran = No jobs ran
1100 info.failed_to_submit_prediction = Failed to submit the prediction\:\n{0} {1}
1101 info.invalid_jnet_job_result_data ={0}\n{1}\nInvalid JPred job result data\!\n{2}
1102 info.failed_to_submit_sequences_for_alignment = Failed to submit sequences for alignment.\nIt is most likely that there is a problem with the server.\nJust close the window\n
1103 info.alignment_object_method_notes = \nAlignment Object Method Notes\n
1104 info.server_exception = \n{0} Server exception\!\n{1}
1105 info.invalid_msa_input_mininfo = Need at least two sequences with at least 3 residues each, with no hidden regions between them.  
1106 info.invalid_msa_notenough = Not enough sequence data to align
1107 status.processing_commandline_args = Processing commandline arguments...
1108 status.das_features_being_retrived = DAS features being retrieved...
1109 status.searching_for_sequences_from = Searching for sequences from {0}
1110 status.finished_searching_for_sequences_from = Finished searching for sequences from {0}
1111 label.eps_file = EPS file
1112 label.png_image = PNG image
1113 status.saving_file = Saving {0}
1114 status.export_complete = {0} Export completed.
1115 status.fetching_pdb = Fetching PDB {0}
1116 status.refreshing_news = Refreshing news
1117 status.importing_vamsas_session_from = Importing VAMSAS session from {0}
1118 status.opening_params = Opening {0}
1119 status.waiting_sequence_database_fetchers_init = Waiting for Sequence Database Fetchers to initialise
1120 status.init_sequence_database_fetchers = Initialising Sequence Database Fetchers
1121 status.fetching_sequence_queries_from = Fetching {0} sequence queries from {1}
1122 status.finshed_querying = Finished querying
1123 status.parsing_results = Parsing results.
1124 status.processing = Processing...
1125 status.refreshing_web_service_menus = Refreshing Web Service Menus
1126 status.collecting_job_results = Collecting job results.
1127 status.fetching_db_refs = Fetching db refs
1128 status.loading_cached_pdb_entries = Loading Cached PDB Entries
1129 status.searching_for_pdb_structures = Searching for PDB Structures
1130 status.opening_file_for = opening file for
1131 status.colouring_chimera = Colouring Chimera
1132 label.font_doesnt_have_letters_defined = Font doesn't have letters defined\nso cannot be used\nwith alignment data
1133 label.font_too_small = Font size is too small
1134 label.error_loading_file_params = Error loading file {0}
1135 label.error_loading_jalview_file = Error loading Jalview file
1136 warn.out_of_memory_when_action = Out of memory when {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1137 warn.out_of_memory_loading_file = Out of memory loading file {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1138 label.out_of_memory = Out of memory
1139 label.invalid_id_column_width = Invalid ID Column width
1140 warn.user_defined_width_requirements = The user defined width for the\nannotation and sequence ID columns\nin exported figures must be\nat least 12 pixels wide.
1141 label.couldnt_create_sequence_fetcher = Couldn't create SequenceFetcher
1142 warn.couldnt_create_sequence_fetcher_client = Could not create the sequence fetcher client. Check error logs for details.
1143 warn.server_didnt_pass_validation = Service did not pass validation.\nCheck the Jalview Console for more details.
1144 warn.url_must_contain = Sequence URL must contain $SEQUENCE_ID$, $DB_ACCESSION$, or a regex
1145 warn.urls_not_contacted = URLs that could not be contacted
1146 warn.urls_no_jaba = URLs without any JABA Services
1147 info.validate_jabaws_server = Validate JabaWS Server ?\n(Look in console output for results)
1148 label.test_server = Test Server?
1149 label.new_sequence_fetcher = New Sequence Fetcher
1150 label.additional_sequence_fetcher = Additional Sequence Fetcher
1151 label.select_database_retrieval_source = Select Database Retrieval Source
1152 label.overwrite_existing_file = Overwrite existing file?
1153 label.file_already_exists = File exists
1154 label.edit_jabaws_url = Edit JABAWS URL
1155 label.add_jabaws_url = Add new JABAWS URL
1156 label.news_from_jalview = News from http://www.jalview.org
1157 label.cut_paste_alignmen_file = Cut & Paste Alignment File
1158 label.enter_redundancy_threshold = Enter the redundancy threshold
1159 label.select_dark_light_set_threshold = <html><i>Select a dark and light text colour, then set the threshold to<br>switch between colours, based on background colour</i></html>
1160 label.select_feature_colour = Select Feature Colour
1161 label.delete_all = Delete all sequences
1162 warn.delete_all = <html>Deleting all sequences will close the alignment window.<br>Confirm deletion or Cancel.
1163 label.add_annotations_for = Add annotations for
1164 action.choose_annotations = Choose Annotations...
1165 label.choose_annotations = Choose Annotations
1166 label.find = Find
1167 label.invalid_search = Search string invalid
1168 error.invalid_regex = Invalid regular expression
1169 label.ignore_gaps_consensus = Ignore Gaps In Consensus
1170 label.show_group_histogram = Show Group Histogram
1171 label.show_group_logo = Show Group Logo
1172 label.normalise_group_logo = Normalise Group Logo
1173 label.show_histogram = Show Histogram
1174 label.show_logo = Show Logo
1175 label.normalise_logo = Normalise Logo
1176 label.no_colour_selection_in_scheme = Please make a colour selection before applying colour scheme
1177 label.no_colour_selection_warn = Error saving colour scheme
1178 label.open_split_window? = Would you like to open as a split window, with cDNA and protein linked?
1179 label.open_split_window = Open split window
1180 action.no = No
1181 action.yes = Yes
1182 label.for = for
1183 label.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation
1184 action.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation...
1185 label.threshold_filter =  Threshold Filter
1186 label.alpha_helix = Alpha Helix
1187 label.beta_strand = Beta Strand
1188 label.turn = Turn
1189 label.select_all = Select All
1190 label.structures_filter = Structures Filter
1191 label.search_filter = Search Filter
1192 label.include_description= Include Description
1193 action.back = Back
1194 label.hide_insertions = Hide Insertions
1195 label.mark_as_representative = Mark as representative
1196 label.open_jabaws_web_page = Open JABAWS web page
1197 label.pdb_sequence_fetcher = PDB Sequence Fetcher
1198 label.result = result
1199 label.results = results
1200 label.structure_chooser = Structure Chooser
1201 label.invert = Invert 
1202 label.select_pdb_file = Select PDB File
1203 info.select_filter_option = Select Filter Option/Manual Entry
1204 info.associate_wit_sequence = Associate with Sequence
1205 label.search_result = Search Result
1206 label.found_structures_summary = Found Structures Summary
1207 label.configure_displayed_columns = Customise Displayed Options
1208 label.start_jalview = Start Jalview
1209 label.biojs_html_export = BioJS
1210 label.scale_as_cdna = Scale protein residues to codons
1211 label.font_as_cdna = Use same font for cDNA and peptide
1212 label.scale_protein_to_cdna = Scale Protein to cDNA
1213 label.scale_protein_to_cdna_tip = Make protein residues same width as codons in split frame views
1214 info.select_annotation_row = Select Annotation Row
1215 info.enter_search_text_here = Enter Search Text Here
1216 info.enter_search_text_to_enable = Enter Search Text to Enable
1217 info.search_in_annotation_label = Search in {0} Label
1218 info.search_in_annotation_description = Search in {0} Description
1219 info.change_threshold_mode_to_enable = Change Threshold Mode to Enable
1220 label.couldnt_read_data = Couldn't read data
1221 label.embbed_biojson = Embed BioJSON to HTML export
1222 action.export_groups = Export Groups
1223 action.export_annotations = Export Annotations
1224 action.export_hidden_columns = Export Hidden Columns
1225 action.export_hidden_sequences = Export Hidden Sequences
1226 action.export_features = Export Features
1227 label.export_settings = Export Settings
1228 label.pdb_web-service_error = PDB Web-service Error
1229 label.structure_chooser_manual_association = Structure Chooser - Manual association
1230 label.structure_chooser_filter_time = Structure Chooser - Filter time ({0})
1231 label.structure_chooser_no_of_structures = Structure Chooser - {0} Found ({1})
1232 info.no_pdb_entry_found_for = No PDB entry found for {0}
1233 exception.unable_to_detect_internet_connection = Jalview is unable to detect an internet connection
1234 exception.fts_server_unreachable = Jalview is unable to reach the {0} server. \nPlease ensure that you are connected to the internet and try again.
1235 label.nw_mapping = Needleman & Wunsch Alignment
1236 label.sifts_mapping = SIFTs Mapping
1237 label.mapping_method = Sequence \u27f7 Structure mapping method
1238 status.waiting_for_user_to_select_output_file = Waiting for user to select {0} file
1239 status.cancelled_image_export_operation = Cancelled {0} export operation
1240 info.error_creating_file = Error creating {0} file
1241 exception.outofmemory_loading_mmcif_file = Out of memory loading mmCIF File
1242 label.run_groovy = Run Groovy console script
1243 label.run_groovy_tip = Run the script in the Groovy console over this alignment
1244 label.couldnt_run_groovy_script = Failed to run Groovy script
1245 label.uniprot_sequence_fetcher = UniProt Sequence Fetcher
1246 action.next_page= >> 
1247 action.prev_page= << 
1248 label.next_page_tooltip=Next Page
1249 label.prev_page_tooltip=Previous Page
1250 status.launching_3d_structure_viewer = Launching 3D Structure viewer...
1251 status.fetching_3d_structures_for_selected_entries = Fetching 3D Structures for selected entries...
1252 status.fetching_dbrefs_for_sequences_without_valid_refs = Fetching db refs for {0} sequence(s) without valid db ref required for SIFTS mapping
1253 status.fetching_3d_structures_for = Fetching 3D Structure for {0}
1254 status.obtaining_mapping_with_sifts = Obtaining mapping with SIFTS
1255 status.obtaining_mapping_with_nw_alignment = Obtaining mapping with NW alignment
1256 status.exporting_alignment_as_x_file = Exporting alignment as {0} file
1257 label.column = Column
1258 label.cant_map_cds = Unable to map CDS to protein\nCDS missing or incomplete
1259 label.operation_failed = Operation failed
1260 label.SEQUENCE_ID_no_longer_used = $SEQUENCE_ID$ is no longer used for DB accessions
1261 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION1 = Please review your URL links in the 'Connections' tab of the Preferences window:
1262 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION2 = URL links using '$SEQUENCE_ID$' for DB accessions now use '$DB_ACCESSION$'.
1263 label.do_not_display_again = Do not display this message again
1264 exception.url_cannot_have_duplicate_id = {0} cannot be used as a label for more than one line
1265 action.customfilter = Custom only
1266 action.showall = Show All
1267 label.insert = Insert:
1268 action.seq_id = $SEQUENCE_ID$
1269 action.db_acc = $DB_ACCESSION$
1270 label.primary = Double Click
1271 label.inmenu = In Menu
1272 label.id = ID
1273 label.database = Database
1274 label.urltooltip = Only one url, which must use a sequence id, can be selected for the 'On Click' option
1275 label.edit_sequence_url_link = Edit sequence URL link
1276 warn.name_cannot_be_duplicate = User-defined URL names must be unique and cannot be MIRIAM ids
1277 label.output_seq_details = Output Sequence Details to list all database references
1278 label.urllinks = Links
1279 action.clear_cached_items = Clear Cached Items
1280 label.togglehidden = Show hidden regions
1281 label.quality_descr = Alignment Quality based on Blosum62 scores
1282 label.conservation_descr = Conservation of total alignment less than {0}% gaps
1283 label.consensus_descr = PID
1284 label.complement_consensus_descr = PID for cDNA
1285 label.strucconsensus_descr = PID for base pairs
1286 label.occupancy_descr = Number of aligned positions 
1287 label.show_experimental = Enable experimental features
1288 label.show_experimental_tip = Enable any new and currently 'experimental' features (see Latest Release Notes for details)
1289 label.warning_hidden = Warning: {0} {1} is currently hidden
1290 label.overview_settings = Overview settings
1291 label.ov_legacy_gap = Use legacy gap colouring (gaps are white)
1292 label.gap_colour = Gap colour:
1293 label.ov_show_hide_default = Show hidden regions when opening overview
1294 label.hidden_colour = Hidden colour:
1295 label.select_gap_colour = Select gap colour
1296 label.select_hidden_colour = Select hidden colour
1297 label.overview = Overview
1298 label.reset_to_defaults = Reset to defaults
1299 label.oview_calc = Recalculating overview...
1300 label.feature_details = Feature details
1301 label.matchCondition_contains = Contains
1302 label.matchCondition_notcontains = Does not contain
1303 label.matchCondition_matches = Matches
1304 label.matchCondition_notmatches = Does not match
1305 label.matchCondition_present = Is present
1306 label.matchCondition_notpresent = Is not present
1307 label.matchCondition_eq = =
1308 label.matchCondition_ne = not =
1309 label.matchCondition_lt = <
1310 label.matchCondition_le = <=
1311 label.matchCondition_gt = >
1312 label.matchCondition_ge = >=
1313 label.numeric_required = The value should be numeric
1314 label.filter = Filter
1315 label.filters = Filters
1316 label.join_conditions = Join conditions with
1317 label.delete_condition = Delete this condition
1318 label.score = Score
1319 label.colour_by_label = Colour by label
1320 label.variable_colour = Variable colour...
1321 label.select_colour = Select colour
1322 option.enable_disable_autosearch = When ticked, search is performed automatically
1323 option.autosearch = Autosearch
1324 label.retrieve_ids = Retrieve IDs
1325 label.display_settings_for = Display settings for {0} features
1326 label.simple = Simple
1327 label.simple_colour = Simple Colour
1328 label.colour_by_text = Colour by text
1329 label.graduated_colour = Graduated Colour
1330 label.by_text_of = By text of
1331 label.by_range_of = By range of
1332 label.or = Or
1333 label.and = And
1334 label.sequence_feature_colours = Sequence Feature Colours
1335 label.best_quality = Best Quality
1336 label.best_resolution = Best Resolution
1337 label.most_protein_chain = Most Protein Chain
1338 label.most_bound_molecules = Most Bound Molecules
1339 label.most_polymer_residues = Most Polymer Residues
1340 label.cached_structures = Cached Structures
1341 label.free_text_search = Free Text Search
1342 label.backupfiles_confirm_delete = Confirm delete
1343 label.backupfiles_confirm_delete_old_files = Delete the following older backup files? (see the Backups tab in Preferences for more options)
1344 label.backupfiles_confirm_save_file = Confirm save file
1345 label.backupfiles_confirm_save_file_backupfiles_roll_wrong = Something possibly went wrong with the backups of this file.
1346 label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_ok = The new saved file seems okay.
1347 label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_not_ok = The new saved file might not be okay.
1348 label.continue_operation = Continue operation?
1349 label.backups = Backups
1350 label.backup = Backup
1351 label.backup_files = Backup Files
1352 label.enable_backupfiles = Enable backup files
1353 label.backup_filename_strategy = Backup filename strategy
1354 label.append_to_filename = Append to filename (%n is replaced by the backup number)
1355 label.append_to_filename_tooltip = %n in the text will be replaced by the backup number. The text will appear after the filename. See the summary box above.
1356 label.index_digits = Number of digits to use for the backup number (%n)
1357 label.summary_of_backups_scheme = Summary of backup scheme
1358 label.scheme_examples = Scheme examples
1359 label.increment_index = Increase appended text numbers - newest file has largest number.
1360 label.reverse_roll = "Roll" appended text numbers - newest backup file is always number 1.
1361 label.keep_files = Deleting old backup files
1362 label.keep_all_backup_files = Do not delete old backup files
1363 label.keep_only_this_number_of_backup_files = Keep only this number of most recent backup files
1364 label.autodelete_old_backup_files = Auto-delete old backup files:
1365 label.always_ask = Always ask
1366 label.auto_delete = Automatically delete
1367 label.filename = filename
1368 label.braced_oldest = (oldest)
1369 label.braced_newest = (most recent)
1370 label.configuration = Configuration
1371 label.configure_feature_tooltip = Click to configure variable colour or filters
1372 label.schemes = Schemes
1373 label.customise = Customise
1374 label.custom = Custom
1375 label.default = Default
1376 label.single_file = Single backup
1377 label.keep_all_versions = Keep all versions
1378 label.rolled_backups = Rolled backup files
1379 label.customise_description = Select Customise, make changes, and click on OK to save your own custom scheme
1380 label.custom_description = Your own saved scheme
1381 label.default_description = Keep the last three versions of the file
1382 label.single_file_description = Keep the last version of the file
1383 label.keep_all_versions_description = Keep all previous versions of the file
1384 label.rolled_backups_description = Keep the last nine versions of the file from _bak.1 (newest) to _bak.9 (oldest)
1385 label.cancel_changes_description = Cancel changes made to your last saved Custom scheme
1386 label.previously_saved_scheme = Previously saved scheme
1387 label.no_backup_files = NO BACKUP FILES
1388 label.include_backup_files = Include backup files
1389 label.cancel_changes = Cancel changes
1390 label.warning_confirm_change_reverse = Warning!\nIf you change the increment/decrement of the backup filename number, without changing the suffix or number of digits,\nthis may cause loss of backup files created with the previous backup filename scheme.\nAre you sure you wish to do this?
1391 label.change_increment_decrement = Change increment/decrement?
1392 label.was_previous = was {0}
1393 label.newerdelete_replacement_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted and replaced by apparently older file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
1394 label.confirm_deletion_or_rename = Confirm deletion of ''{0}'' or rename to ''{1}''?
1395 label.newerdelete_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted but is newer than the oldest remaining backup file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
1396 label.confirm_deletion = Confirm deletion of ''{0}''?
1397 label.delete = Delete
1398 label.rename = Rename
1399 label.keep = Keep
1400 label.file_info = (modified {0}, size {1})
1401 label.annotation_name = Annotation Name
1402 label.annotation_description = Annotation Description 
1403 label.edit_annotation_name_description = Edit Annotation Name/Description
1404 label.alignment = alignment
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1408 label.by_annotation_tooltip = Annotation Colour is configured from the main Colour menu
1409 label.show_linked_features = Show {0} features
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1415 label.log_level = Log level
1416 label.log_level_tooltip = Temporarily set the log level for this console. The log level will revert to {0} when this Java console is closed.
1417 label.copy_to_clipboard = Copy to clipboard
1418 label.copy_to_clipboard_tooltip = Copy all of the log text in this console to the system clipboard
1419 label.ignore_hidden = Ignore hidden columns
1420 label.ignore_hidden_tooltip = Ignore any characters in hidden columns when matching