JAL-2835 spike updated with latest
[jalview.git] / resources / lang / Messages.properties
1 action.refresh_services = Refresh Services
2 action.reset_services = Reset Services
3 action.merge_results = Merge Results
4 action.load_scheme = Load scheme
5 action.save_scheme = Save scheme
6 label.scheme_changed = Changes to scheme ''{0}'' have not been saved.<br><br>Save changes, or continue without saving to make a new colour scheme.
7 label.save_changes = Save Changes
8 label.dont_save_changes = Don't Save
9 action.save_image = Save Image
10 action.paste = Paste
11 action.show_html_source = Show HTML Source
12 action.print = Print...
13 action.web_service = Web Service
14 action.cancel_job = Cancel Job
15 action.start_job = Start Job
16 action.revert = Revert
17 action.move_down = Move Down
18 action.move_up = Move Up
19 action.remove_return_datatype = Remove return datatype
20 action.add_return_datatype = Add return datatype
21 action.remove_input_parameter = Remove selected input parameter
22 action.add_input_parameter = Add input parameter
23 action.edit = Edit
24 action.new = New
25 action.open_file = Open file
26 action.show_unconserved = Show Unconserved
27 action.open_new_alignment = Open new alignment
28 action.raise_associated_windows = Raise Associated Windows
29 action.minimize_associated_windows = Minimize Associated Windows
30 action.close_all = Close all
31 action.load_project = Load Project
32 action.save_project = Save Project
33 action.quit = Quit
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35 action.gather_views = Gather Views
36 action.page_setup = Page Setup...
37 action.reload = Reload
38 action.load = Load
39 action.open = Open
40 action.cancel = Cancel
41 action.create = Create
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46 action.select_ddbb = --- Select Database ---
47 action.undo = Undo
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49 action.reset = Reset
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51 action.remove_right = Remove right
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64 action.remove = Remove
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66 action.pairwise_alignment = Pairwise Alignment
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68 action.by_conservation = By Conservation
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78 action.scale_above = Scale Above
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84 action.calculate_tree_pca = Calculate Tree or PCA...
85 action.help = Help
86 action.by_annotation = By Annotation...
87 action.invert_sequence_selection = Invert Sequence Selection
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89 action.show = Show
90 action.hide = Hide
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104 action.find_all = Find all
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110 action.apply = Apply
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112 action.apply_all_groups = Apply to all Groups
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114 action.by_sequence = By Sequence
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117 action.select = Select
118 action.new_view = New View
119 action.close = Close
120 action.add = Add
121 action.save_as_default = Save as default
122 action.save_as = Save as...
123 action.save = Save
124 action.cancel_fetch = Cancel Fetch
125 action.change_font = Change Font
126 action.change_font_tree_panel = Change Font (Tree Panel)
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131 tooltip.select_highlighted_columns = Press B to mark highlighted columns, Ctrl-(or Cmd)-B to toggle, and Alt-B to mark all but highlighted columns 
132 action.deselect_all = Deselect all
133 action.invert_selection = Invert selection
134 action.using_jmol = Using Jmol
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138 action.show_group = Show Group
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141 label.view_flanking_regions = Show sequence data either side of the subsequences involved in this alignment
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144 label.url = URL
145 label.url\: = URL:
146 label.input_file_url = Enter URL or Input File
147 label.select_feature = Select feature
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150 label.name_param = Name: {0}
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174 label.choose_calculation = Choose Calculation
175 label.treecalc_title = {0} Using {1}
176 label.tree_calc_av = Average Distance
177 label.tree_calc_nj = Neighbour Joining
178 label.select_score_model = Select score model
179 label.score_model_pid = % Identity
180 label.score_model_blosum62 = BLOSUM62
181 label.score_model_pam250 = PAM 250
182 label.score_model_smithwatermanscore = Score between two sequences aligned with Smith-Waterman with default Peptide/Nucleotide matrix
183 label.score_model_sequencefeaturesimilarity = Distance measure of average number of features not shared at sequence positions 
184 label.score_model_conservation = Physicochemical property conservation
185 label.score_model_enhconservation = Physicochemical property conservation
186 label.status_bar = Status bar
187 label.out_to_textbox = Output to Textbox
188 label.occupancy = Occupancy
189 # delete Clustal - use FileFormat name instead
190 label.clustal = Clustal
191 # label.colourScheme_<schemeName> as in JalviewColourScheme
192 label.colourScheme_clustal = Clustalx
193 label.colourScheme_blosum62 = BLOSUM62 Score
194 label.colourScheme_%_identity = Percentage Identity
195 label.colourScheme_zappo = Zappo
196 label.colourScheme_taylor = Taylor
197 label.colourScheme_hydrophobic = Hydrophobicity
198 label.colourScheme_helix_propensity = Helix Propensity
199 label.colourScheme_strand_propensity = Strand Propensity
200 label.colourScheme_turn_propensity = Turn Propensity
201 label.colourScheme_buried_index = Buried Index
202 label.colourScheme_purine/pyrimidine = Purine/Pyrimidine
203 label.colourScheme_nucleotide = Nucleotide
204 label.colourScheme_t-coffee_scores = T-Coffee Scores
205 label.colourScheme_rna_helices = By RNA Helices
206 label.blc = BLC
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210 label.pileup = Pileup
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212 label.average_distance_blosum62 = Average Distance Using BLOSUM62
213 label.neighbour_blosum62 = Neighbour Joining Using BLOSUM62
214 label.show_annotations = Show annotations
215 label.hide_annotations = Hide annotations
216 label.show_all_seq_annotations = Show sequence related
217 label.hide_all_seq_annotations = Hide sequence related
218 label.show_all_al_annotations = Show alignment related
219 label.hide_all_al_annotations = Hide alignment related
220 label.hide_all = Hide all
221 label.add_reference_annotations = Add reference annotations
222 label.find_tip = Search alignment, selection or sequence ids for a subsequence (ignoring gaps).<br>Accepts regular expressions - search Help for 'regex' for details.
223 label.colour_text = Colour Text
224 label.show_non_conserved = Show nonconserved
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263 label.show_first = Show first
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268 label.autoadd_temp = Add Temperature Factor annotation to alignment
269 label.structure_viewer = Default structure viewer
270 label.chimera_path = Path to Chimera program
271 label.chimera_path_tip = Jalview will first try any path entered here, else standard installation locations.<br>Double-click to browse for file.
272 label.invalid_chimera_path = Chimera path not found or not executable
273 label.chimera_missing = Chimera structure viewer not found.<br/>Please enter the path to Chimera (if installed),<br/>or download and install UCSF Chimera.
274 label.chimera_failed = Error opening Chimera - is it installed?\nCheck path in Preferences, Structure
275 label.min_colour = Minimum Colour
276 label.max_colour = Maximum Colour
277 label.no_colour = No Colour
278 label.use_original_colours = Use Original Colours
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281 label.selection = Selection
282 label.group_colour = Group Colour
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285 label.min_value = Min value:
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290 label.view_alignment_editor = View in alignment editor
291 label.labels = Labels
292 label.output_values = Output Values...
293 label.output_points = Output points...
294 label.output_transformed_points = Output transformed points
295 label.input_data = Input Data...
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298 label.show_bootstrap_values = Show Bootstrap Values
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304 label.colours = Colours
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311 label.successfully_added_features_alignment = Successfully added features to alignment
312 label.keyboard_editing_mode = Keyboard editing mode is {0}
313 label.paste_features_annotations_Tcoffee_here = Paste your features / annotations / T-coffee score file here.
314 label.removed_columns = Removed {0} columns.
315 label.removed_empty_columns = Removed {0} empty columns.
316 label.paste_newick_tree_file = Paste your Newick tree file here.
317 label.order_by_params = Order by {0}
318 label.html_content = <html>{0}</html>
319 label.paste_pdb_file= Paste your PDB file here.
320 label.paste_pdb_file_for_sequence = Paste PDB file for sequence {0}
321 label.could_not_parse_newick_file  = Could not parse Newick file\!\n {0}
322 label.successfully_pasted_tcoffee_scores_to_alignment= Successfully pasted T-Coffee scores to alignment.
323 label.failed_add_tcoffee_scores = Failed to add T-Coffee scores: 
324 label.successfully_pasted_annotation_to_alignment= Successfully pasted annotation to alignment.
325 label.couldnt_parse_pasted_text_as_valid_annotation_feature_GFF_tcoffee_file = Couldn't parse pasted text as a valid annotation, feature, GFF, or T-Coffee score file
326 label.successfully_pasted_alignment_file = Successfully pasted alignment file
327 label.paste_your_alignment_file = Paste your alignment file here
328 label.paste_your = Paste your
329 label.finished_searching = Finished searching
330 label.search_results= Search results {0} : {1}
331 label.found_match_for = Found match for {0}
332 label.font = Font:
333 label.size = Size:
334 label.style = Style:
335 label.calculating = Calculating....
336 label.modify_conservation_visibility = Modify conservation visibility
337 label.colour_residues_above_occurrence = Colour residues above % occurrence
338 label.set_this_label_text = set this label text
339 label.sequences_from = Sequences from {0}
340 label.successfully_loaded_file  = Successfully loaded file {0}
341 label.successfully_loaded_matrix  = Successfully loaded score matrix {0}
342 label.successfully_saved_to_file_in_format = Successfully saved to file: {0} in {1} format.
343 label.copied_sequences_to_clipboard = Copied {0} sequences to clipboard.
344 label.check_file_matches_sequence_ids_alignment = Check that the file matches sequence IDs in the alignment.
345 label.problem_reading_tcoffee_score_file = Problem reading T-COFFEE score file
346 label.source_to_target = {0} ... {1}
347 label.per_sequence_only= Per-sequence only
348 label.to_file = to File
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350 label.jalview = Jalview
351 label.csv_spreadsheet = CSV (Spreadsheet)
352 label.status = Status
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354 label.channel_title_item_count = {0} ({1})
355 label.blog_item_published_on_date = {0} {1} 
356 label.select_das_service_from_table = Select a DAS service from the table to read a full description here.</font></html>
357 label.session_update = Session Update
358 label.new_vamsas_session = New Vamsas Session
359 action.load_vamsas_session = Load Vamsas Session...
360 action.save_vamsas_session = Save Vamsas Session
361 label.select_vamsas_session_opened_as_new_vamsas_session= Select a vamsas session to be opened as a new vamsas session.
362 label.open_saved_vamsas_session = Open a saved VAMSAS session
363 label.groovy_console = Groovy Console...
364 label.lineart = Lineart
365 label.dont_ask_me_again = Don't ask me again
366 label.select_eps_character_rendering_style = Select EPS character rendering style
367 label.invert_selection = Invert Selection
368 label.optimise_order = Optimise Order
369 label.seq_sort_by_score = Sequence sort by Score
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373 label.selected_database_to_fetch_from = Selected {0} database {1} to fetch from {2} 
374 label.database_param = Database: {0}
375 label.example = Example
376 label.example_param = Example: {0}
377 label.select_file_format_before_saving = You must select a file format before saving!
378 label.file_format_not_specified = File format not specified
379 label.couldnt_save_file = Couldn't save file: {0}
380 label.error_saving_file = Error Saving File
381 label.remove_from_default_list = Remove from default list?
382 label.remove_user_defined_colour = Remove user defined colour
383 label.you_must_select_least_two_sequences = You must select at least 2 sequences.
384 label.invalid_selection = Invalid Selection
385 label.sequence_selection_insufficient = Sequence selection insufficient
386 label.you_need_at_least_n_sequences = You need to select at least {0} sequences
387 label.not_enough_sequences = Not enough sequences
388 label.selected_region_to_tree_may_only_contain_residues_or_gaps =  The selected region to create a tree may\nonly contain residues or gaps.\nTry using the Pad function in the edit menu,\nor one of the multiple sequence alignment web services.
389 label.sequences_selection_not_aligned = Sequences in selection are not aligned
390 label.problem_reading_tree_file =  Problem reading tree file
391 label.possible_problem_with_tree_file = Possible problem with tree file
392 label.select_at_least_three_bases_in_at_least_one_sequence_to_cDNA_translation = Please select at least three bases in at least one sequence in order to perform a cDNA translation.
393 label.translation_failed = Translation Failed
394 label.error_when_translating_sequences_submit_bug_report = Unfortunately, something went wrong when translating your sequences.\nPlease take a look in the Jalview java console\nand submit a bug report including the stacktrace.
395 label.implementation_error  = Implementation error:
396 label.automatically_associate_structure_files_with_sequences_same_name = Do you want to automatically associate the {0} structure file(s) with sequences in the alignment that have the same name?
397 label.automatically_associate_structure_files_by_name = Automatically Associate Structure files by name
398 label.ignore_unmatched_dropped_files_info = <html>Do you want to <em>ignore</em> the {0} files whose names did not match any sequence IDs ?</html>
399 label.ignore_unmatched_dropped_files = Ignore unmatched dropped files?
400 label.view_name_original = Original
401 label.enter_view_name = Enter View Name
402 label.enter_label = Enter label
403 label.enter_label_for_the_structure = Enter a label for the structure
404 label.pdb_entry_is_already_displayed = {0} is already displayed.\nDo you want to re-use this viewer ?
405 label.map_sequences_to_visible_window = Map Sequences to Visible Window: {0}
406 label.add_pdbentry_to_view = Do you want to add {0} to the view called\n{1}\n
407 label.align_to_existing_structure_view = Align to existing structure view
408 label.pdb_entries_couldnt_be_retrieved = The following pdb entries could not be retrieved from the PDB\:\n{0}\nPlease retry, or try downloading them manually.
409 label.couldnt_load_file = Couldn't load file
410 label.couldnt_find_pdb_id_in_file = Couldn't find a PDB id in the file supplied. Please enter an Id to identify this structure.
411 label.no_pdb_id_in_file = No PDB Id in File
412 label.couldnt_read_pasted_text = Couldn't read the pasted text {0}
413 label.error_parsing_text = Error parsing text
414 label.enter_local_das_source = Enter Nickname & URL of Local DAS Source
415 label.you_can_only_edit_or_remove_local_das_sources = You can only edit or remove local DAS Sources!
416 label.public_das_source = Public DAS source - not editable
417 label.input_alignment_from_url = Input Alignment From URL
418 label.input_alignment = Input Alignment
419 label.couldnt_import_as_vamsas_session = Couldn't import {0} as a new vamsas session.
420 label.vamsas_document_import_failed = Vamsas Document Import Failed
421 label.couldnt_locate = Couldn't locate {0}
422 label.url_not_found = URL not found
423 label.new_sequence_url_link = New sequence URL link
424 label.cannot_edit_annotations_in_wrapped_view = Cannot edit annotations in wrapped view
425 label.wrapped_view_no_edit = Wrapped view - no edit
426 label.error_retrieving_data = Error Retrieving Data
427 label.user_colour_scheme_must_have_name = User colour scheme must have a name
428 label.no_name_colour_scheme = No name for colour scheme
429 label.invalid_url = Invalid URL !
430 label.error_loading_file = Error loading file
431 label.problems_opening_file = Encountered problems opening {0}!!
432 label.file_open_error = File open error
433 label.no_das_sources_selected_warn = No das sources were selected.\nPlease select some sources and\ntry again.
434 label.no_das_sources_selected_title = No DAS Sources Selected
435 label.colour_scheme_exists_overwrite = Colour scheme {0} exists.\nContinue saving colour scheme as {1}?"
436 label.duplicate_scheme_name = Duplicate scheme name
437 label.jalview_new_questionnaire = There is a new Questionnaire available. Would you like to complete it now ?\n
438 label.jalview_user_survey = Jalview User Survey
439 label.alignment_properties = Alignment Properties: {0}
440 label.alignment_props = Alignment Properties
441 label.input_cut_paste = Cut & Paste Input
442 label.input_cut_paste_params = Cut & Paste Input - {0}
443 label.alignment_output_command = Alignment output - {0}
444 label.annotations = Annotations
445 label.structure_options = Structure Options
446 label.features = Features
447 label.overview_params = Overview {0}
448 label.paste_newick_file = Paste Newick file
449 label.load_tree_from_file = From File - 
450 label.colour_by_annotation = Colour by Annotation
451 label.selection_output_command = Selection output - {0}
452 label.annotation_for_displayid = <p><h2>Annotation for {0} </h2></p><p>
453 label.pdb_sequence_mapping = PDB - Sequence Mapping
454 label.pca_details = PCA details
455 label.redundancy_threshold_selection = Redundancy threshold selection
456 label.user_defined_colours = User defined colours
457 label.jalviewLite_release = JalviewLite - Release {0}
458 label.jaview_build_date = Build date: {0}
459 label.jalview_authors_1 = Authors: Jim Procter, Andrew Waterhouse, Mungo Carstairs, Tochukwu Ofoegbu, Lauren Lui, Jan Engelhardt,
460 label.jalview_authors_2 = Natasha Sherstnev, Daniel Barton, Michele Clamp, James Cuff, Steve Searle, David Martin & Geoff Barton.
461 label.jalview_dev_managers = Development managed by The Barton Group, University of Dundee, Scotland, UK.
462 label.jalview_distribution_lists = For help, see the FAQ at www.jalview.org and/or join the jalview-discuss@jalview.org mailing list
463 label.jalview_please_cite = If  you use Jalview, please cite:
464 label.jalview_cite_1_authors = Waterhouse, A.M., Procter, J.B., Martin, D.M.A, Clamp, M. and Barton, G. J. (2009)
465 label.jalview_cite_1_title = Jalview Version 2 - a multiple sequence alignment editor and analysis workbench
466 label.jalview_cite_1_ref = Bioinformatics doi: 10.1093/bioinformatics/btp033
467 label.right_click = Right click
468 label.to_add_annotation = to add annotation
469 label.alignment_has_no_annotations = Alignment has no annotations
470 label.retrieving_pdb_data = Retrieving PDB data...
471 label.label = Label
472 label.no_features_added_to_this_alignment = No Features added to this alignment!!
473 label.features_can_be_added_from_searches_1 = (Features can be added from searches or
474 label.features_can_be_added_from_searches_2 = from Jalview / GFF features files)
475 label.calculating_pca= Calculating PCA
476 label.jalview_cannot_open_file = Jalview can't open file
477 label.jalview_applet = Jalview applet
478 label.loading_data = Loading data
479 label.memory_stats = Total Free Memory: {0} MB; Max Memory: {1} MB; {2} %
480 label.calculating_tree = Calculating tree
481 label.state_queueing = queuing
482 label.state_running = running
483 label.state_completed = finished
484 label.state_job_cancelled = job cancelled!!
485 label.state_job_error = job error!
486 label.server_error_try_later = Server Error! (try later)
487 label.error_loading_pdb_data = Error loading PDB data!!
488 label.fetching_pdb_data = Fetching PDB data...
489 label.structure_type = Structure type
490 label.settings_for_type = Settings for {0}
491 label.view_full_application = View in Full Application
492 label.load_associated_tree = Load Associated Tree...
493 label.load_features_annotations = Load Features/Annotations...
494 label.load_vcf = Load SNP variants from plain text or indexed VCF data
495 label.load_vcf_file = Load VCF File
496 label.searching_vcf = Loading VCF variants...
497 label.added_vcf = Added {0} VCF variants to {1} sequence(s)
498 label.export_features = Export Features...
499 label.export_annotations = Export Annotations...
500 label.to_upper_case = To Upper Case
501 label.to_lower_case = To Lower Case
502 label.toggle_case = Toggle Case
503 label.edit_name_description = Edit Name/Description...
504 label.create_sequence_feature = Create Sequence Feature...
505 label.edit_sequence = Edit Sequence
506 label.edit_sequences = Edit Sequences
507 label.sequence_details = Sequence Details
508 label.jmol_help = Jmol Help
509 label.chimera_help = Chimera Help
510 label.close_viewer = Close Viewer
511 label.confirm_close_chimera = This will close Jalview''s connection to {0}.<br>Do you want to close the Chimera window as well?
512 label.all = All
513 label.sort_by = Sort alignment by
514 label.sort_by_score = Sort by Score
515 label.sort_by_density = Sort by Density
516 label.sequence_sort_by_density = Sequence sort by Density
517 label.sort_ann_by = Sort annotations by
518 label.sort_annotations_by_sequence = Sort by sequence
519 label.sort_annotations_by_label = Sort by label
520 label.reveal = Reveal
521 label.hide_columns = Hide Columns
522 label.load_jalview_annotations = Load Jalview Annotations or Features File
523 label.load_tree_file = Load a tree file
524 label.retrieve_parse_sequence_database_records_alignment_or_selected_sequences = Retrieve and parse sequence database records for the alignment or the currently selected sequences
525 label.standard_databases = Standard Databases
526 label.fetch_embl_uniprot = Fetch from EMBL/EMBLCDS or Uniprot/PDB and any selected DAS sources
527 label.reset_min_max_colours_to_defaults = Reset min and max colours to defaults from user preferences.
528 label.align_structures_using_linked_alignment_views = Superpose structures using {0} selected alignment view(s)
529 label.connect_to_session = Connect to session {0}
530 label.threshold_feature_display_by_score = Threshold the feature display by score.
531 label.threshold_feature_no_threshold = No Threshold
532 label.threshold_feature_above_threshold = Above Threshold
533 label.threshold_feature_below_threshold = Below Threshold
534 label.adjust_threshold = Adjust threshold
535 label.toggle_absolute_relative_display_threshold = Toggle between absolute and relative display threshold.
536 label.colour_by_label_tip = Display features of the same type with a different label using a different colour. (e.g. domain features)
537 label.select_colour_minimum_value = Select Colour for Minimum Value
538 label.select_colour_maximum_value = Select Colour for Maximum Value
539 label.open_url_param = Open URL {0}
540 label.open_url_seqs_param = Open URL ({0}..) ({1} seqs)
541 label.load_pdb_file_associate_with_sequence = Load a PDB file and associate it with sequence {0}
542 label.reveal_hidden_columns = Reveal Hidden Columns with Right Mouse Button
543 label.dark_colour = Dark Colour
544 label.light_colour = Light Colour
545 label.highlightnode = Left click to select leaves.<br>Double-click to invert leaves.<br>Right click to change colour.
546 label.load_colour_scheme = Load colour scheme
547 label.copy_format_from = Copy format from
548 label.toggle_enabled_views = When enabled, allows many views to be selected.
549 label.select_all_views = Select all views
550 label.select_many_views = Select many views
551 label.edit_notes_parameter_set = Click to edit the notes for this parameter set.
552 label.open_local_file = Open local file
553 label.enable_automatically_sort_alignment_when_open_new_tree = Enable this to automatically sort<br>the alignment when you open<br> a new tree.
554 label.listen_for_selections = Listen for selections
555 label.selections_mirror_selections_made_same_sequences_other_views = When selected, selections in this view will mirror<br>selections made on the same sequences in other views.
556 label.toggle_sequence_visibility = Shift+H toggles sequence visiblity
557 label.toggle_columns_visibility = Ctrl+H toggles column visiblity.
558 label.toggles_visibility_hidden_selected_regions = H toggles visibility of hidden or selected regions
559 label.rename_tab_eXpand_reGroup=  Right-click to rename tab <br> Press X to eXpand tabs, G to reGroup.
560 label.right_align_sequence_id = Right Align Sequence Id
561 label.sequence_id_tooltip = Sequence ID Tooltip
562 label.no_services = <No Services>
563 label.select_copy_raw_html = Select this if you want to copy raw html
564 label.share_data_vamsas_applications = Share data with other vamsas applications
565 label.connect_to = Connect to
566 label.join_existing_vamsas_session = Join an existing vamsas session
567 label.from_url = from URL
568 label.any_trees_calculated_or_loaded_alignment_automatically_sort = When selected, any trees calculated or loaded onto the alignment will automatically sort the alignment
569 label.sort_with_new_tree = Sort With New Tree
570 label.from_textbox = from Textbox
571 label.window = Window
572 label.preferences = Preferences
573 label.tools = Tools
574 label.fetch_sequences = Fetch Sequences
575 action.fetch_sequences = Fetch Sequences...
576 label.stop_vamsas_session = Stop Vamsas Session
577 label.collect_garbage = Collect Garbage
578 label.show_memory_usage = Show Memory Usage
579 label.show_java_console = Show Java Console
580 label.show_jalview_news = Show Jalview News
581 label.take_snapshot = Take snapshot
582 label.monospaced_fonts_faster_to_render = Monospaced fonts are faster to render
583 label.anti_alias_fonts = Anti-alias Fonts (Slower to render)
584 label.monospaced_font= Monospaced
585 label.quality = Quality
586 label.maximize_window = Maximize Window
587 label.conservation = Conservation
588 label.consensus = Consensus
589 label.histogram = Histogram
590 label.logo = Logo
591 label.non_positional_features = List Non-positional Features
592 label.database_references = List Database References
593 #label.share_selection_across_views = Share selection across views
594 #label.scroll_highlighted_regions = Scroll to highlighted regions
595 label.gap_symbol = Gap Symbol
596 label.prot_alignment_colour = Protein Alignment Colour
597 label.nuc_alignment_colour = Nucleotide Alignment Colour
598 label.address = Address
599 label.port = Port
600 label.default_browser_unix = Default Browser (Unix)
601 label.send_usage_statistics = Send usage statistics
602 label.check_for_questionnaires = Check for questionnaires
603 label.check_for_latest_version = Check for latest version
604 label.url_linkfrom_sequence_id = URL link from Sequence ID
605 label.use_proxy_server = Use a proxy server
606 label.eps_rendering_style = EPS rendering style
607 label.append_start_end = Append /start-end (/15-380)
608 label.full_sequence_id = Full Sequence Id
609 label.smooth_font = Smooth Font
610 label.autocalculate_consensus = AutoCalculate Consensus
611 label.pad_gaps = Pad Gaps
612 label.pad_gaps_when_editing = Pad Gaps When Editing
613 label.automatically_set_id_width = Automatically set ID width
614 label.figure_id_column_width = Figure ID column width
615 label.use_modeller_output = Use Modeller Output
616 label.wrap_alignment = Wrap Alignment
617 label.right_align_ids = Right Align Ids
618 label.sequence_name_italics = Italic Sequence Ids
619 label.open_overview = Open Overview
620 label.default_colour_scheme_for_alignment = Default Colour Scheme for alignment
621 label.annotation_shading_default = Annotation Shading Default
622 label.default_minimum_colour_annotation_shading = Default Minimum Colour for annotation shading
623 label.default_maximum_colour_annotation_shading = Default Maximum Colour for annotation shading
624 label.visual = Visual
625 label.connections = Connections
626 label.output = Output
627 label.editing = Editing
628 label.das_settings = DAS Settings
629 label.web_services = Web Services
630 label.right_click_to_edit_currently_selected_parameter = Right click to edit currently selected parameter.
631 label.let_jmol_manage_structure_colours = Let Jmol manage structure colours
632 label.let_chimera_manage_structure_colours = Let Chimera manage structure colours
633 label.fetch_chimera_attributes = Fetch Chimera attributes
634 label.fetch_chimera_attributes_tip = Copy Chimera attribute to Jalview feature
635 label.marks_leaves_tree_not_associated_with_sequence = Marks leaves of tree not associated with a sequence
636 label.index_web_services_menu_by_host_site = Index web services in menu by the host site
637 label.option_want_informed_web_service_URL_cannot_be_accessed_jalview_when_starts_up = Check this option if you want to be informed<br>when a web service URL cannot be accessed by Jalview<br>when it starts up
638 label.new_service_url = New Service URL
639 label.edit_service_url = Edit Service URL
640 label.delete_service_url = Delete Service URL
641 label.details = Details
642 label.options = Options
643 label.parameters = Parameters
644 label.available_das_sources = Available DAS Sources
645 label.full_details = Full Details
646 label.authority = Authority
647 label.type = Type
648 label.proxy_server = Proxy Server
649 label.file_output = File Output
650 label.select_input_type = Select input type
651 label.set_options_for_type = Set options for type
652 label.data_input_parameters = Data input parameters
653 label.data_returned_by_service = Data returned by service
654 label.rsbs_encoded_service = RSBS Encoded Service
655 label.parsing_errors = Parsing errors
656 label.simple_bioinformatics_rest_services = Simple Bioinformatics Rest Services
657 label.web_service_discovery_urls = Web Service Discovery URLS
658 label.input_parameter_name = Input Parameter name
659 label.short_descriptive_name_for_service = Short descriptive name for service
660 label.function_service_performs = What kind of function the service performs (e.g. alignment, analysis, search, etc).
661 label.brief_description_service = Brief description of service
662 label.url_post_data_service = URL to post data to service. Include any special parameters needed here
663 label.optional_suffix = Optional suffix added to URL when retrieving results from service
664 label.preferred_gap_character = Which gap character does this service prefer?
665 label.gap_character = Gap character
666 label.move_return_type_up_order= Move return type up order
667 label.move_return_type_down_order= Move return type down order
668 label.update_user_parameter_set = Update this existing user parameter set
669 label.delete_user_parameter_set = Delete the currently selected user parameter set
670 label.create_user_parameter_set = Create a new parameter set with the current settings.
671 label.revert_changes_user_parameter_set = Undo all changes to the current parameter set
672 label.start_job_current_settings = Start Job with current settings
673 label.cancel_job_close_dialog = Close this dialog and cancel job
674 label.input_output = Input/Output
675 label.cut_paste = Cut'n'Paste
676 label.adjusting_parameters_for_calculation = Adjusting parameters for existing Calculation
677 label.2d_rna_structure_line = 2D RNA {0} (alignment)
678 label.2d_rna_sequence_name = 2D RNA - {0}
679 label.edit_name_and_description_current_group = Edit name and description of current group
680 label.from_file = From File
681 label.enter_pdb_id = Enter PDB Id (or pdbid:chaincode)
682 label.text_colour = Text Colour...
683 label.structure = Structure
684 label.show_pdbstruct_dialog = 3D Structure Data...
685 label.view_rna_structure = VARNA 2D Structure
686 label.create_sequence_details_report_annotation_for = Annotation for {0}
687 label.sequence_details_for = Sequence Details for {0}
688 label.sequence_name = Sequence Name
689 label.sequence_description = Sequence Description
690 label.edit_sequence_name_description = Edit Sequence Name/Description
691 label.spaces_converted_to_backslashes = Spaces have been converted to _
692 label.no_spaces_allowed_sequence_name = No spaces allowed in Sequence Name
693 label.select_outline_colour = Select Outline Colour
694 label.web_browser_not_found_unix = Unixers\: Couldn't find default web browser.\nAdd the full path to your browser in Preferences."
695 label.web_browser_not_found = Web browser not found
696 label.select_pdb_file_for = Select a PDB file for {0}
697 label.html = HTML
698 label.wrap = Wrap
699 label.show_database_refs = Show Database Refs
700 label.show_non_positional_features = Show Non-Positional Features
701 label.save_png_image = Save As PNG Image
702 label.load_tree_for_sequence_set = Load a tree for this sequence set
703 label.export_image = Export Image
704 label.vamsas_store = VAMSAS store
705 label.translate_cDNA = Translate as cDNA
706 label.reverse = Reverse
707 label.reverse_complement = Reverse Complement
708 label.linked_view_title = Linked CDS and protein view
709 label.extract_scores = Extract Scores
710 label.get_cross_refs = Get Cross-References
711 label.sort_alignment_new_tree = Sort Alignment With New Tree
712 label.add_sequences = Add Sequences
713 label.new_window = New Window
714 label.split_window = Split Window
715 label.refresh_available_sources = Refresh Available Sources
716 label.use_registry = Use Registry
717 label.add_local_source = Add Local Source
718 label.set_as_default = Set as Default
719 label.show_labels = Show labels
720 action.background_colour = Background Colour...
721 label.associate_nodes_with = Associate Nodes With
722 label.link_name = Link Name
723 label.pdb_file = PDB file
724 label.colour_with_jmol = Colour with Jmol
725 label.colour_with_chimera = Colour with Chimera
726 label.superpose_structures = Superpose Structures
727 error.superposition_failed = Superposition failed: {0}
728 label.insufficient_residues = Not enough aligned residues ({0}) to perform superposition
729 label.jmol = Jmol
730 label.chimera = Chimera
731 label.create_chimera_attributes = Write Jalview features
732 label.create_chimera_attributes_tip = Set Chimera residue attributes for visible features
733 label.attributes_set = {0} attribute values set on Chimera
734 label.sort_alignment_by_tree = Sort Alignment By Tree
735 label.mark_unlinked_leaves = Mark Unlinked Leaves
736 label.associate_leaves_with = Associate Leaves With
737 label.save_colour_scheme_with_unique_name_added_to_colour_menu = Save your colour scheme with a unique name and it will be added to the Colour menu
738 label.case_sensitive = Case Sensitive
739 label.lower_case_colour = Colour All Lower Case
740 label.lower_case_tip = Chosen colour applies to all lower case symbols
741 label.index_by_host = Index by Host
742 label.index_by_type = Index by Type
743 label.enable_jabaws_services = Enable JABAWS Services
744 label.display_warnings = Display Warnings
745 label.move_url_up = Move URL Up
746 label.move_url_down = Move URL Down
747 label.add_sbrs_definition = Add a SBRS Definition
748 label.edit_sbrs_definition = Edit SBRS Definition
749 label.delete_sbrs_definition = Delete SBRS Definition
750 label.your_sequences_have_been_verified = Your sequences have been verified against known sequence databases.\n(Use Calculate | Show flanking regions to show enclosing sequence.)\nTo preserve data changes, save your alignment.\n\n
751 label.sequences_updated = Sequences updated
752 label.dbref_search_completed = DBRef search completed
753 label.fetch_all_param = Fetch all {0}
754 label.paste_new_window = Paste To New Window
755 label.settings_for_param = Settings for {0}
756 label.view_params = View {0}
757 label.aacon_calculations = AACon Calculations
758 label.aacon_settings = Change AACon Settings...
759 tooltip.aacon_calculations = When checked, AACon calculations are updated automatically.
760 tooltip.aacon_settings = Modify settings for AACon calculations.
761 label.rnalifold_calculations = RNAAliFold Prediction
762 label.rnalifold_settings = Change RNAAliFold settings...
763 tooltip.rnalifold_calculations = When checked, RNA secondary structure predictions will be calculated for the alignment, and updated when edits are made.
764 tooltip.rnalifold_settings = Modify settings for the RNAAliFold prediction. Use this to hide or show different results of the RNA calculation, and change RNA folding parameters.
765 label.all_views = All Views
766 label.align_sequences_to_existing_alignment = Align sequences to an existing alignment
767 label.realign_with_params = Realign with {0}
768 label.calcname_with_default_settings = {0} with Defaults
769 label.action_with_default_settings = {0} with default settings
770 label.edit_settings_and_run = Edit settings and run...
771 label.view_and_change_parameters_before_alignment = View and change the parameters before alignment
772 label.run_with_preset_params = Run {0} with preset
773 label.view_and_change_parameters_before_running_calculation = View and change parameters before running calculation
774 label.view_documentation = View documentation
775 label.select_return_type = Select return type
776 label.translation_of_params = Translation of {0}
777 label.features_for_params = Features for - {0}
778 label.annotations_for_params = Annotations for - {0}
779 label.generating_features_for_params = Generating features for - {0}
780 label.generating_annotations_for_params = Generating annotations for - {0}
781 label.varna_params = VARNA - {0}
782 label.sequence_feature_settings = Sequence Feature Settings
783 label.pairwise_aligned_sequences = Pairwise Aligned Sequences
784 label.original_data_for_params = Original Data for {0}
785 label.points_for_params = Points for {0}
786 label.transformed_points_for_params = Transformed points for {0}
787 label.variable_color_for = Variable Feature Colour for {0}
788 label.select_background_colour = Select Background Colour
789 label.invalid_font = Invalid Font
790 label.separate_multiple_accession_ids = Enter one or more accession IDs separated by a semi-colon ";"
791 label.separate_multiple_query_values = Enter one or more {0}s separated by a semi-colon ";"
792 label.search_all = Enter one or more search values separated by a semi-colon ";" (Note: This searches the entire database)
793 label.replace_commas_semicolons = Replace commas with semi-colons
794 label.parsing_failed_syntax_errors_shown_below_param = Parsing failed. Syntax errors shown below {0}
795 label.parsing_failed_unrecoverable_exception_thrown_param = \nParsing failed. An unrecoverable exception was thrown\:\n {0}
796 label.example_query_param = Example query: {0}
797 label.enter_value_increase_conservation_visibility = Enter value to increase conservation visibility
798 label.enter_percentage_identity_above_which_colour_residues = Enter % identity above which to colour residues
799 label.wswublast_client_credits = To display sequence features an exact Uniprot id with 100% sequence identity match must be entered.\nIn order to display these features, try changing the names of your sequences to the ids suggested below.\n\nRunning WSWUBlast at EBI.\nPlease quote Pillai S., Silventoinen V., Kallio K., Senger M., Sobhany S., Tate J., Velankar S., Golovin A., Henrick K., Rice P., Stoehr P., Lopez R.\nSOAP-based services provided by the European Bioinformatics Institute.\nNucleic Acids Res. 33(1)\:W25-W28 (2005));
800 label.blasting_for_unidentified_sequence = BLASTing for unidentified sequences
801 label.select_columns_containing = Select columns containing
802 label.select_columns_not_containing = Select columns that do not contain
803 label.hide_columns_containing = Hide columns containing
804 label.hide_columns_not_containing = Hide columns that do not contain
805 option.trim_retrieved_seqs = Trim retrieved sequences
806 label.trim_retrieved_sequences = When the reference sequence is longer than the sequence that you are working with, only keep the relevant subsequences.
807 label.use_sequence_id_1 = Use $DB_ACCESSION$ or $DB_ACCESSION=/<regex>/=$
808 label.use_sequence_id_2 = to embed accession id in URL
809 label.use_sequence_id_3 = Use $SEQUENCE_ID$ similarly to embed sequence id
810 label.use_sequence_id_4 = 
811 label.ws_parameters_for = Parameters for {0}
812 label.switch_server = Switch server
813 label.choose_jabaws_server = Choose a server for running this service
814 label.services_at = Services at {0}
815 label.rest_client_submit = {0} using {1}
816 label.fetch_retrieve_from =Retrieve from {0}</html>
817 label.fetch_retrieve_from_all_sources = Retrieve from all {0} sources in {1}<br>First is :{2}<html> 
818 label.feature_settings_click_drag = Drag up or down to change render order.<br/>Double click to select columns containing feature.
819 label.transparency_tip = Adjust transparency to 'see through' feature colours.
820 label.opt_and_params_further_details = see further details by right-clicking
821 label.opt_and_params_show_brief_desc_image_link = <html>Click to show brief description<br><img src="{0}"/> Right click for further information.</html> 
822 label.opt_and_params_show_brief_desc = <html>Click to show brief description<br></html>
823 label.adjusts_width_generated_eps_png = <html>Adjusts the width of the generated EPS or PNG file to ensure even the longest sequence ID or annotation label is displayed</html>
824 label.manually_specify_width_left_column = <html>Manually specify the width of the left hand column where sequence IDs and annotation labels will be rendered in exported alignment figures. This setting will be ignored if 'Automatically set ID width' is set</html>
825 label.job_created_when_checked = <html>When checked, a job is created for every sequence in the current selection.</html>
826 label.when_checked_job_visible_region_and_results = <html>When checked, a single job is created for the visible region and results mapped back onto their location in the alignment. Otherwise, a job would be created for every contiguous region visible in the alignment or current selection (e.g. a multiple alignment).</html>
827 label.flat_file_representation = <html>Flat file representation of this rest service using the Really Simple Bioinformatics Service formalism</html>
828 label.result_of_parsing_rsbs = <html>Results of parsing the RSBS representation</html>
829 label.user_preset = User Preset
830 label.service_preset = Service Preset
831 label.run_with_preset = Run {0} with preset
832 label.view_service_doc_url = <html>View <a href="{0}">{1}</a></html>
833 action.by_title_param = By {0}
834 label.source_from_db_source = Sources from {0}
835 label.from_msname = from {0}
836 label.superpose_with = Superpose with
837 label.scale_label_to_column = Scale Label to Column
838 label.add_new_row = Add New Row
839 label.edit_label_description = Edit Label/Description
840 label.hide_row = Hide This Row
841 label.delete_row = Delete This Row
842 label.show_all_hidden_rows = Show All Hidden Rows
843 label.export_annotation = Export Annotation
844 label.copy_consensus_sequence = Copy Consensus Sequence
845 label.helix = Helix
846 label.sheet = Sheet
847 label.rna_helix = RNA Helix
848 label.remove_annotation = Remove Annotation
849 label.colour_by = Colour by...
850 label.muscle_multiple_protein_sequence_alignment = Muscle Multiple Protein Sequence Alignment
851 label.mafft_multiple_sequence_alignment = MAFFT Multiple Sequence Alignment
852 label.clustalw_multiple_sequence_alignment = ClustalW Multiple Sequence Alignment
853 label.jnet_secondary_structure_prediction = JPred Secondary Structure Prediction
854 label.multiharmony = Multi-Harmony
855 label.unable_start_web_service_analysis = Unable to start web service analysis
856 label.job_couldnt_be_started_check_input = The Job couldn't be started. Please check your input, and the Jalview console for any warning messages.
857 label.prompt_each_time = Prompt each time
858 label.use_source = Use Source
859 label.couldnt_save_project = Couldn't save project
860 label.error_whilst_saving_current_state_to = Error whilst saving current state to {0}
861 label.error_whilst_loading_project_from = Error whilst loading project from {0}
862 label.couldnt_load_project = Couldn't load project
863 label.invalid_name_preset_exists = Invalid name - preset already exists.
864 label.invalid_name = Invalid name
865 label.set_proxy_settings = Please set up your proxy settings in the 'Connections' tab of the Preferences window
866 label.proxy_authorization_failed = Proxy Authorization Failed
867 label.internal_jalview_error = Internal Jalview Error
868 label.secondary_structure_prediction_service_couldnt_be_located = The Secondary Structure Prediction Service named {0} at {1} couldn't be located.
869 label.service_called_is_not_msa_service = The Service called \n{0}\nis not a \nMultiple Sequence Alignment Service\!
870 label.msa_service_is_unknown = The Multiple Sequence Alignment Service named {0} is unknown
871 label.service_called_is_not_seq_search_service = The Service called \n{0}\nis not a \nSequence Search Service\!
872 label.seq_search_service_is_unknown = The Sequence Search Service named {0} is unknown
873 label.feature_type = Feature Type
874 label.display = Display
875 label.service_url = Service URL
876 label.copied_sequences = Copied sequences
877 label.cut_sequences = Cut Sequences
878 label.conservation_colour_increment = Conservation Colour Increment ({0})
879 label.percentage_identity_threshold = Percentage Identity Threshold ({0})
880 label.error_unsupported_owwner_user_colour_scheme = Unsupported owner for User Colour scheme dialog
881 label.save_alignment_to_file = Save Alignment to file
882 label.save_features_to_file = Save Features to File
883 label.save_annotation_to_file = Save Annotation to File
884 label.no_features_on_alignment = No features found on alignment
885 label.save_pdb_file = Save PDB File
886 label.save_text_to_file = Save Text to File
887 label.save_state = Save State
888 label.restore_state = Restore State
889 label.saving_jalview_project = Saving jalview project {0}
890 label.loading_jalview_project = Loading jalview project {0}
891 label.save_vamsas_document_archive = Save Vamsas Document Archive
892 label.saving_vamsas_doc = Saving VAMSAS Document to {0}
893 label.load_feature_colours = Load Feature Colours
894 label.save_feature_colours = Save Feature Colour Scheme
895 label.select_startup_file = Select startup file
896 label.select_default_browser = Select default web browser
897 label.save_tree_as_newick = Save tree as newick file
898 label.create_eps_from_tree = Create EPS file from tree
899 label.create_png_from_tree = Create PNG image from tree
900 label.save_colour_scheme = Save colour scheme
901 label.edit_params_for = Edit parameters for {0}
902 label.choose_filename_for_param_file = Choose a filename for this parameter file
903 label.save_as_html = Save as HTML
904 label.recently_opened = Recently Opened
905 label.blasting_for_unidentified_sequence_jobs_running = BLASTing for unidentified sequences - {0}  jobs running.
906 label.tree = Tree
907 label.tree_from = Tree from {0}
908 label.webservice_job_title = {0} using {1}
909 label.select_visible_region_of = selected {0} region of {1}
910 label.visible = Visible
911 label.select_unselect_visible_regions_from = select and unselected {0} regions from {1}
912 label.visible_region_of = visible region of
913 label.webservice_job_title_on = {0} using {1} on {2}
914 label.updating_vamsas_session = Updating vamsas session
915 label.loading_file = Loading File: {0}
916 label.edit_params = Edit {0}
917 label.as_percentage = As Percentage
918 error.not_implemented = Not implemented
919 error.no_such_method_as_clone1_for = No such method as clone1 for {0}
920 error.null_from_clone1 = Null from clone1!
921 error.not_yet_implemented = Not yet implemented
922 error.unknown_type_dna_or_pep = Unknown Type {0} - dna or pep are the only allowed values.
923 error.implementation_error_dont_know_threshold_annotationcolourgradient = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
924 error.invalid_separator_parameter = Invalid separator parameter - must be non-zero length
925 error.alignment_cigararray_not_implemented = Alignment(CigarArray) not yet implemented
926 error.empty_view_cannot_be_updated = empty view cannot be updated.
927 error.mismatch_between_number_of_sequences_in_block = Mismatch between number of sequences in block {0} ({1}) and the original view ({2})
928 error.padding_not_yet_implemented = Padding not yet implemented
929 error.mismatch_between_visible_blocks_to_update_and_number_of_contigs_in_view = Mismatch between visible blocks to update and number of contigs in view (contigs=0,blocks={0})
930 error.unknown_seq_cigar_operation = Unknown SeqCigar operation {0}
931 error.implementation_bug_parse_cigar_string = Implementation bug in parseCigarString
932 error.implementation_error_invalid_operation_string = Implementation error. Invalid operation string.
933 error.invalid_range_string = Invalid range string (must be zero or positive number)
934 error.implementation_error_delete_range_out_of_bounds = Implementation Error: deleteRange out of bounds: start must be non-negative and less than end.
935 error.implementation_error = Implementation error
936 error.implementation_error_unknown_operation = Implementation Error! Unknown operation {0}
937 error.implementation_error_unexpected_null_from_get_sequence_and_deletions = Implementation Error - unexpected null from getSequenceAndDeletions
938 error.implementation_error_set_seq_null = Implementation Error - _setSeq(null,...)
939 error.implementation_error_s = Implementation Error: _s= {0}
940 error.implementation_error_seqcigar_possible = SeqCigar: Possible implementation error: sequence is longer than dataset sequence
941 error.implmentation_bug_seq_null = Implementation Bug. Null seq
942 error.implementation_bug_cigar_operation_list_range_list = Implementation Bug. Cigar Operation list!= range list
943 error.not_yet_implemented_cigar_object_from_cigar_string = NOT YET Implemented: Constructing a Cigar object from a cigar string and a gapped sequence.
944 error.implementation_bug_cigar_operation = Implementation Bug. Cigar Operation {0} {1} not one of {2}, {3}, or {4}.
945 error.implementation_error_for_new_cigar = Implementation error for new Cigar(SequenceI)
946 error.implementation_error_cigar_seq_no_operations = Implementation error: {0}th sequence Cigar has no operations.
947 error.implementation_error_no_pdbentry_from_index = Implementation error - no corresponding pdbentry (for index {0}) to add sequences mappings to
948 error.jmol_version_not_compatible_with_jalview_version = Jmol version {0} is not compatible with this version of Jalview. Report this problem at issues.jalview.org
949 error.not_implemented_remove = Remove: Not implemented
950 error.not_implemented_clone = Clone: Not implemented
951 error.call_setprogressbar_before_registering_handler = call setProgressBar before registering the progress bar's handler.
952 label.cancelled_params = Cancelled {0}
953 error.implementation_error_cannot_show_view_alignment_frame = Implementation error: cannot show a view from another alignment in an AlignFrame.
954 error.implementation_error_dont_know_about_threshold_setting = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
955 error.eps_generation_not_implemented = EPS Generation not yet implemented
956 error.png_generation_not_implemented = PNG Generation not yet implemented
957 error.try_join_vamsas_session_another = Trying to join a vamsas session when another is already connected
958 error.invalid_vamsas_session_id = Invalid vamsas session id
959 label.groovy_support_failed = Jalview Groovy Support Failed
960 label.couldnt_create_groovy_shell = Couldn't create the groovy Shell. Check the error log for the details of what went wrong.
961 error.unsupported_version_calcIdparam = Unsupported Version for calcIdparam {0}
962 error.implementation_error_cant_reorder_tree = Implementation Error: Can't reorder this tree. Not DefaultMutableTreeNode.
963 error.invalid_value_for_option = Invalid value {0} for option {1}
964 error.implementation_error_cannot_import_vamsas_doc = Implementation Error - cannot import existing vamsas document into an existing session, Yet!
965 label.vamsas_doc_couldnt_be_opened_as_new_session = VAMSAS Document could not be opened as a new session - please choose another
966 error.implementation_error_vamsas_operation_not_init = Impementation error! Vamsas Operations when client not initialised and connected
967 error.jalview_no_connected_vamsas_session = Jalview not connected to Vamsas session
968 error.implementation_error_cannot_recover_vamsas_object_mappings = IMPLEMENTATION ERROR: Cannot recover vamsas object mappings - no backup was made
969 error.setstatus_called_non_existent_job_pane = setStatus called for non-existent job pane {0}
970 error.implementation_error_cannot_find_marshaller_for_param_set =Implementation error: Can't find a marshaller for the parameter set
971 error.implementation_error_old_jalview_object_not_bound =IMPLEMENTATION ERROR: old jalview object is not bound ! ({0})
972 error.implementation_error_vamsas_doc_class_should_bind_to_type = Implementation Error: Vamsas Document Class {0} should bind to a {1} (found a {2})
973 error.invalid_vamsas_rangetype_cannot_resolve_lists = Invalid vamsas RangeType - cannot resolve both lists of Pos and Seg from choice!
974 error.implementation_error_maplist_is_null = Implementation error. MapList is null for initMapType.
975 error.implementation_error_cannot_have_null_alignment = Implementation error: Cannot have null alignment property key
976 error.implementation_error_null_fileparse = Implementation error. Null FileParse in copy constructor
977 error.implementation_error_cannot_map_alignment_sequences = IMPLEMENTATION ERROR: Cannot map an alignment of sequences from different datasets into a single alignment in the vamsas document.
978 error.implementation_error_structure_selection_manager_null = Implementation error. Structure selection manager's context is 'null'
979 exception.ssm_context_is_null = SSM context is null
980 error.idstring_seqstrings_only_one_per_sequence = idstrings and seqstrings contain one string each per sequence
981 error.cannot_have_mixed_length_replacement_vectors = Cannot have mixed length replacement vectors. Replacement vector for {0} is {1} strings long, and have already seen a {2} length vector.
982 error.cannot_have_zero_length_vector_replacement_strings = Cannot have zero length vector of replacement strings - either 1 value or n values.
983 error.implementation_error_multiple_single_sequence_prediction_jobs_not_supported = Implementation Error! Multiple single sequence prediction jobs are not yet supported
984 error.implementation_error_invalid_msa_index_for_job =Implementation Error! Invalid msaIndex for JPredJob on parent MSA input object!
985 error.implementation_error_startjob_called = Implementation error - StartJob(JpredJob) called on {0}
986 error.multiple_jnet_subjob_merge_not_implemented = Multiple JPred subjob merging not yet implemented
987 label.job_never_ran = Job never ran - input returned to user.
988 error.implementation_error_minlen_must_be_greater_zero = Implementation error: minlen must be zero or more
989 error.implementation_error_msawbjob_called = Implementation error - StartJob(MsaWSJob) called on a WSJobInstance {0}
990 error.implementation_error_cannot_attach_ws_menu_entry = IMPLEMENTATION ERROR: cannot attach WS Menu Entry without service handle reference!
991 error.parameter_migration_not_implemented_yet = Parameter migration not implemented yet
992 error.implementation_error_cannot_set_jaba_option = Implementation error: cannot set Jaba Option to a value outside its allowed value range!
993 error.implementation_error_valuetype_doesnt_support_jabaws_type = IMPLEMENTATION ERROR: jalview.ws.params.ValueConstrainI.ValueType does not support the JABAWS type : {0}
994 error.cannot_create_jabaws_param_set = Cannot create a JabaWSParamSet from non-JabaWS parameters
995 error.cannot_set_arguments_to_jabaws_param_set = Cannot set arguments to a JabaWSParamSet that are not JabaWS arguments
996 error.implementation_error_runner_config_not_available = Implementation Error: Runner Config not available for a JABAWS service of type {0} ({1})
997 error.implementation_error_cannot_handle_jaba_param = Implementation Error: Cannot handle Jaba parameter object {0}
998 error.implementation_error_attempt_to_delete_service_preset = Implementation error: Attempt to delete a service preset!
999 error.implementation_error_cannot_locate_oldname_presetname = Implementation error: Can't locate either oldname ({0}) or presetName ({1}in the datastore!"
1000 error.implementation_error_jabaws_param_set_only_handled_by = Implementation error: JabaWsParamSets can only be handled by JabaParamStore
1001 error.cannot_set_source_file_for = Cannot set source file for {0}
1002 error.mismatch_service_instance_preset = Probable mismatch between service instance and preset!
1003 error.cannot_set_params_for_ws_preset = Cannot set Parameters for a Jaba Web service's preset
1004 error.implementation_error_can_only_instantiate_jaba_param_sets = Implementation error: Can only instantiate Jaba parameter sets
1005 error.no_aacon_service_found = No AACon service found
1006 error.implementation_error_couldnt_copy_value_constraint = Implementation error: could not copy ValueConstrain!
1007 error.couldnt_encode_as_utf8 = Couldn't encode {0} as UTF-8.
1008 error.tree_inputtype_not_yet_implemented = Tree InputType not yet implemented
1009 error.implementation_error_need_to_have_httpresponse = Implementation Error: need to have an HttpResponse to process
1010 error.dbrefsource_implementation_exception =DBRefSource Implementation Exception
1011 error.implementation_error_dbinstance_must_implement_interface = Implmentation Error - getDbInstances must be given a class that implements jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy (was given{0})
1012 error.implementation_error_must_init_dbsources =Implementation error. Must initialise dbSources
1013 label.view_controller_toggled_marked = {0} {1} columns {2} features of type {3}  across {4} sequence(s)
1014 label.toggled = Toggled
1015 label.marked = Marked
1016 label.containing = containing
1017 label.not_containing = not containing
1018 label.no_feature_of_type_found = No features of type {0} found.
1019 label.submission_params = Submission {0}
1020 label.empty_alignment_job = Empty Alignment Job
1021 label.add_new_sbrs_service = Add a new Simple Bioinformatics Rest Service
1022 label.edit_sbrs_entry = Edit Simple Bioinformatics Rest Service entry
1023 label.pca_recalculating = Recalculating PCA
1024 label.pca_calculating = Calculating PCA
1025 label.select_foreground_colour = Choose foreground colour
1026 label.select_colour_for_text = Select Colour for Text
1027 label.adjunst_foreground_text_colour_threshold = Adjust Foreground Text Colour Threshold
1028 label.select_subtree_colour = Select Sub-Tree Colour
1029 label.create_new_sequence_features = Create New Sequence Feature(s)
1030 label.amend_delete_features = Amend/Delete Features for {0}
1031 exception.out_of_bounds_for_file = Out of bounds for file: i={0}, Final Buffer: i0={1} iend={2}
1032 exception.null_string_given_to_regex_search = Null String Given to Regex.search
1033 exception.null_string_like_given_to_regex_search = Null StringLike Given to Regex.search
1034 exception.null_string_given_to_regex_reverse_search = Null String Given to Regex.reverseSearch
1035 exception.null_string_like_given_to_regex_reverse_search = Null StringLike Given to Regex.reverseSearch
1036 exception.null_string_like_given_to_regex_search_from = Null String Given to Regex.searchFrom
1037 exception.null_string_like_given_to_regex_search_region = Null String Given to Regex.searchRegion
1038 exception.replace_null_regex_pointer = Replacer has null Regex pointer
1039 exception.bad_pattern_to_regex_perl_code = bad pattern to Regex.perlCode: {0}
1040 exception.no_stub_implementation_for_interface = There is no stub implementation for the interface: {0}
1041 exception.cannot_set_endpoint_address_unknown_port = Cannot set Endpoint Address for Unknown Port {0}
1042 exception.mismatched_unseen_closing_char = Mismatched (unseen) closing character {0}
1043 exception.mismatched_closing_char = Mismatched closing character {0}
1044 exception.mismatched_opening_char = Mismatched opening character {0} at {1}
1045 exception.invalid_datasource_couldnt_obtain_reader = Invalid datasource. Could not obtain Reader
1046 exception.unterminated_cigar_string = Unterminated cigar string
1047 exception.unexpected_operation_cigar_string_pos = Unexpected operation {0} in cigar string (position {1} in {2}
1048 exception.couldnt_parse_responde_from_annotated3d_server = Couldn't parse response from Annotate3d server
1049 exception.application_test_npe = Application test: throwing an NullPointerException It should arrive at the console
1050 exception.overwriting_vamsas_id_binding = Overwriting vamsas id binding
1051 exception.overwriting_jalview_id_binding = Overwriting jalview id binding
1052 exception.failed_to_resolve_gzip_stream = Failed to resolve GZIP stream
1053 exception.problem_opening_file_also_tried = Problem opening {0} (also tried {1}) : {2}
1054 exception.problem_opening_file = Problem opening {0} : {1}
1055 exception.failed_to_read_data_from_source = Failed to read data from source: {0}
1056 exception.no_init_source_stream = Unitialised Source Stream
1057 exception.invalid_source_stream = Invalid Source Stream: {0}
1058 error.implementation_error_reset_called_for_invalid_source = Implementation Error: Reset called for invalid source.
1059 exception.number_of_residues_in_query_sequence_differ_from_prediction = Number of residues in {0} supposed query sequence ({1}\n{2})\ndiffer from number of prediction sites in prediction ({3})
1060 label.mapped = mapped
1061 exception.jpredconcide_entry_has_unexpected_number_of_columns = JPredConcise: Entry ({0}) has an unexpected number of columns
1062 exception.couldnt_parse_concise_annotation_for_prediction = Couldn't parse concise annotation for prediction profile.\n{0}
1063 exception.newfile = NewickFile\: {0}\n
1064 label.no_tree_read_in = No Tree read in
1065 exception.rnaml_couldnt_access_datasource = Couldn't access datasource ({0})
1066 exception.ranml_couldnt_process_data = Couldn't process data as RNAML file ({0})
1067 exception.ranml_invalid_file = Invalid RNAML file ({0})
1068 exception.ranml_problem_parsing_data = Problem parsing data as RNAML ({0})
1069 exception.pfam_no_sequences_found = No sequences found (PFAM input)
1070 exception.stockholm_invalid_format = This file is not in valid STOCKHOLM format: First line does not contain '# STOCKHOLM'
1071 exception.couldnt_parse_sequence_line = Could not parse sequence line: {0}
1072 exception.unknown_annotation_detected = Unknown annotation detected: {0} {1}
1073 exception.couldnt_store_sequence_mappings = Couldn't store sequence mappings for {0}
1074 exception.matrix_too_many_iteration = Too many iterations in {0} (max is {1})
1075 exception.browser_not_found = Exception in finding browser: {0}
1076 exception.browser_unable_to_locate = Unable to locate browser: {0}
1077 exception.invocation_target_exception_creating_aedesc = InvocationTargetException while creating AEDesc: {0}
1078 exception.illegal_access_building_apple_evt= IllegalAccessException while building AppleEvent: {0}
1079 exception.unable_to_launch_url = Unable to launch URL: {0}
1080 exception.unable_to_create_internet_config = Unable to create an Internet Config instance: {0}
1081 exception.invocation_target_calling_url = InvocationTargetException while calling openURL: {0}
1082 exception.illegal_access_calling_url = IllegalAccessException while calling openURL: {0}
1083 exception.interrupted_launching_browser = InterruptedException while launching browser: {0}
1084 exception.das_source_doesnt_support_sequence_command = Source {0} does not support the sequence command.
1085 exception.invalid_das_source = Invalid das source: {0}
1086 exception.ebiembl_retrieval_failed_on = EBI EMBL XML retrieval failed on {0}:{1}
1087 exception.no_pdb_records_for_chain = No PDB Records for {0} chain {1}
1088 exception.unexpected_handling_rnaml_translation_for_pdb = Unexpected exception when handling RNAML translation of PDB data
1089 exception.couldnt_recover_sequence_properties_for_alignment = Couldn't recover sequence properties for alignment
1090 exception.unknown_format_for_file = Unknown format {0} for file \: \n{1}
1091 label.remove_gaps = Remove Gaps
1092 exception.couldnt_recover_sequence_props_for_jnet_query = Couldn't recover sequence properties for JPred Query sequence!
1093 exception.server_timeout_try_later = Server timed out - try again later\n
1094 exception.web_service_returned_null_try_later= Server at {0} returned null object, it probably cannot be contacted. Try again later.
1095 exception.cannot_contact_service_endpoint_at = Cannot contact service endpoint at {0}
1096 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set = Implementation error: Cannot find service url in the given url set!
1097 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set_param_store = Implementation error: Cannot find service url in the given url set for this service parameter store ({0}}
1098 exception.jobsubmission_invalid_params_set = Invalid parameter set. Check Jalview implementation
1099 exception.notvaliddata_group_contains_less_than_min_seqs = Group contains less than {0} sequences.
1100 exception.outofmemory_loading_pdb_file = Out of memory loading PDB File
1101 exception.eps_coudnt_write_output_file = Could not write to the output file: {0}
1102 exception.eps_method_not_supported = Method not currently supported by EpsGraphics2D version {0}
1103 exception.eps_unable_to_get_inverse_matrix = Unable to get inverse of matrix: {0}
1104 warn.job_cannot_be_cancelled_close_window = This job cannot be cancelled.\nJust close the window.
1105 warn.service_not_supported = Service not supported!
1106 warn.input_is_too_big = Input is too big!
1107 warn.invalid_job_param_set = Invalid job parameter set!
1108 warn.oneseq_msainput_selection = The current selection only contains a single sequence. Do you want to submit all sequences for alignment instead ?   
1109 info.job_couldnt_be_run_server_doesnt_support_program = Job could not be run because the server doesn't support this program.\n{0}
1110 info.job_couldnt_be_run_exceeded_hard_limit = Job could not be run because it exceeded a hard limit on the server.\n{0}
1111 info.job_couldnt_be_run_incorrect_param_setting = Job could not be run because some of the parameter settings are not supported by the server.\n{0}\nPlease check to make sure you have used the correct parameter set for this service\!\n
1112 info.no_jobs_ran = No jobs ran
1113 info.failed_to_submit_prediction = Failed to submit the prediction\:\n{0} {1}
1114 info.invalid_jnet_job_result_data ={0}\n{1}\nInvalid JPred job result data\!\n{2}
1115 info.failed_to_submit_sequences_for_alignment = Failed to submit sequences for alignment.\nIt is most likely that there is a problem with the server.\nJust close the window\n
1116 info.alignment_object_method_notes = \nAlignment Object Method Notes\n
1117 info.server_exception = \n{0} Server exception\!\n{1}
1118 info.invalid_msa_input_mininfo = Need at least two sequences with at least 3 residues each, with no hidden regions between them.  
1119 info.invalid_msa_notenough = Not enough sequence data to align
1120 status.processing_commandline_args = Processing commandline arguments...
1121 status.das_features_being_retrived = DAS features being retrieved...
1122 status.searching_for_sequences_from = Searching for sequences from {0}
1123 status.finished_searching_for_sequences_from = Finished searching for sequences from {0}
1124 label.eps_file = EPS file
1125 label.png_image = PNG image
1126 status.saving_file = Saving {0}
1127 status.export_complete = {0} Export completed.
1128 status.fetching_pdb = Fetching PDB {0}
1129 status.refreshing_news = Refreshing news
1130 status.importing_vamsas_session_from = Importing VAMSAS session from {0}
1131 status.opening_params = Opening {0}
1132 status.waiting_sequence_database_fetchers_init = Waiting for Sequence Database Fetchers to initialise
1133 status.init_sequence_database_fetchers = Initialising Sequence Database Fetchers
1134 status.fetching_sequence_queries_from = Fetching {0} sequence queries from {1}
1135 status.finshed_querying = Finished querying
1136 status.parsing_results = Parsing results.
1137 status.processing = Processing...
1138 status.refreshing_web_service_menus = Refreshing Web Service Menus
1139 status.collecting_job_results = Collecting job results.
1140 status.fetching_das_sequence_features = Fetching DAS Sequence Features
1141 status.no_das_sources_active = No DAS Sources Active
1142 status.das_feature_fetching_cancelled = DAS Feature Fetching Cancelled
1143 status.das_feature_fetching_complete = DAS Feature Fetching Complete
1144 status.fetching_db_refs = Fetching db refs
1145 status.loading_cached_pdb_entries = Loading Cached PDB Entries
1146 status.searching_for_pdb_structures = Searching for PDB Structures
1147 status.opening_file_for = opening file for
1148 status.colouring_chimera = Colouring Chimera
1149 label.font_doesnt_have_letters_defined = Font doesn't have letters defined\nso cannot be used\nwith alignment data
1150 label.font_too_small = Font size is too small
1151 label.error_loading_file_params = Error loading file {0}
1152 label.error_loading_jalview_file = Error loading Jalview file
1153 warn.out_of_memory_when_action = Out of memory when {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1154 warn.out_of_memory_loading_file = Out of memory loading file {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1155 label.out_of_memory = Out of memory
1156 label.invalid_id_column_width = Invalid ID Column width
1157 warn.user_defined_width_requirements = The user defined width for the\nannotation and sequence ID columns\nin exported figures must be\nat least 12 pixels wide.
1158 label.couldnt_create_sequence_fetcher = Couldn't create SequenceFetcher
1159 warn.couldnt_create_sequence_fetcher_client = Could not create the sequence fetcher client. Check error logs for details.
1160 warn.server_didnt_pass_validation = Service did not pass validation.\nCheck the Jalview Console for more details.
1161 warn.url_must_contain = Sequence URL must contain $SEQUENCE_ID$, $DB_ACCESSION$, or a regex
1162 warn.urls_not_contacted = URLs that could not be contacted
1163 warn.urls_no_jaba = URLs without any JABA Services
1164 info.validate_jabaws_server = Validate JabaWS Server ?\n(Look in console output for results)
1165 label.test_server = Test Server?
1166 info.you_want_jalview_to_find_uniprot_accessions = Do you want Jalview to find\nUniprot Accession ids for given sequence names?
1167 label.find_uniprot_accession_ids = Find Uniprot Accession Ids
1168 label.new_sequence_fetcher = New Sequence Fetcher
1169 label.additional_sequence_fetcher = Additional Sequence Fetcher
1170 label.select_database_retrieval_source = Select Database Retrieval Source
1171 label.overwrite_existing_file = Overwrite existing file?
1172 label.file_already_exists = File exists
1173 label.edit_jabaws_url = Edit JABAWS URL
1174 label.add_jabaws_url = Add new JABAWS URL
1175 label.news_from_jalview = News from http://www.jalview.org
1176 label.cut_paste_alignmen_file = Cut & Paste Alignment File
1177 label.enter_redundancy_threshold = Enter the redundancy threshold
1178 label.select_dark_light_set_threshold = <html><i>Select a dark and light text colour, then set the threshold to<br>switch between colours, based on background colour</i></html>
1179 label.select_feature_colour = Select Feature Colour
1180 label.delete_all = Delete all sequences
1181 warn.delete_all = <html>Deleting all sequences will close the alignment window.<br>Confirm deletion or Cancel.
1182 label.add_annotations_for = Add annotations for
1183 action.choose_annotations = Choose Annotations...
1184 label.choose_annotations = Choose Annotations
1185 label.find = Find
1186 label.invalid_search = Search string invalid
1187 error.invalid_regex = Invalid regular expression
1188 label.ignore_gaps_consensus = Ignore Gaps In Consensus
1189 label.show_group_histogram = Show Group Histogram
1190 label.show_group_logo = Show Group Logo
1191 label.normalise_group_logo = Normalise Group Logo
1192 label.show_histogram = Show Histogram
1193 label.show_logo = Show Logo
1194 label.normalise_logo = Normalise Logo
1195 label.no_colour_selection_in_scheme = Please make a colour selection before applying colour scheme
1196 label.no_colour_selection_warn = Error saving colour scheme
1197 label.open_split_window? = Would you like to open as a split window, with cDNA and protein linked?
1198 label.open_split_window = Open split window
1199 action.no = No
1200 action.yes = Yes
1201 label.for = for
1202 label.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation
1203 action.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation...
1204 label.threshold_filter =  Threshold Filter
1205 label.alpha_helix = Alpha Helix
1206 label.beta_strand = Beta Strand
1207 label.turn = Turn
1208 label.select_all = Select All
1209 label.structures_filter = Structures Filter
1210 label.search_filter = Search Filter
1211 label.include_description= Include Description
1212 action.back = Back
1213 label.hide_insertions = Hide Insertions
1214 label.mark_as_representative = Mark as representative
1215 label.open_jabaws_web_page = Open JABAWS web page
1216 label.pdb_sequence_fetcher = PDB Sequence Fetcher
1217 label.result = result
1218 label.results = results
1219 label.structure_chooser = Structure Chooser
1220 label.select = Select : 
1221 label.invert = Invert 
1222 label.select_pdb_file = Select PDB File
1223 info.select_filter_option = Select Filter Option/Manual Entry
1224 info.associate_wit_sequence = Associate with Sequence
1225 label.search_result = Search Result
1226 label.found_structures_summary = Found Structures Summary
1227 label.configure_displayed_columns = Customise Displayed Options
1228 label.start_jalview = Start Jalview
1229 label.biojs_html_export = BioJS
1230 label.scale_as_cdna = Scale protein residues to codons
1231 label.font_as_cdna = Use same font for cDNA and peptide
1232 label.scale_protein_to_cdna = Scale Protein to cDNA
1233 label.scale_protein_to_cdna_tip = Make protein residues same width as codons in split frame views
1234 info.select_annotation_row = Select Annotation Row
1235 info.enter_search_text_here = Enter Search Text Here
1236 info.enter_search_text_to_enable = Enter Search Text to Enable
1237 info.search_in_annotation_label = Search in {0} Label
1238 info.search_in_annotation_description = Search in {0} Description
1239 info.change_threshold_mode_to_enable = Change Threshold Mode to Enable
1240 label.couldnt_read_data = Couldn't read data
1241 label.embbed_biojson = Embed BioJSON to HTML export
1242 action.export_groups = Export Groups
1243 action.export_annotations = Export Annotations
1244 action.export_hidden_columns = Export Hidden Columns
1245 action.export_hidden_sequences = Export Hidden Sequences
1246 action.export_features = Export Features
1247 label.export_settings = Export Settings
1248 label.pdb_web-service_error = PDB Web-service Error
1249 label.structure_chooser_manual_association = Structure Chooser - Manual association
1250 label.structure_chooser_filter_time = Structure Chooser - Filter time ({0})
1251 label.structure_chooser_no_of_structures = Structure Chooser - {0} Found ({1})
1252 info.no_pdb_entry_found_for = No PDB entry found for {0}
1253 exception.unable_to_detect_internet_connection = Jalview is unable to detect an internet connection
1254 exception.fts_rest_service_no_longer_available = {0} rest services no longer available!
1255 exception.resource_not_be_found = The requested resource could not be found
1256 exception.fts_server_error = There seems to be an error from the {0} server
1257 exception.fts_server_unreachable = Jalview is unable to reach the {0} server. \nPlease ensure that you are connected to the internet and try again.
1258 label.nw_mapping = Needleman & Wunsch Alignment
1259 label.sifts_mapping = SIFTs Mapping
1260 label.mapping_method = Sequence \u27f7 Structure mapping method
1261 status.waiting_for_user_to_select_output_file = Waiting for user to select {0} file
1262 status.cancelled_image_export_operation = Cancelled {0} export operation
1263 info.error_creating_file = Error creating {0} file
1264 exception.outofmemory_loading_mmcif_file = Out of memory loading mmCIF File
1265 label.run_groovy = Run Groovy console script
1266 label.run_groovy_tip = Run the script in the Groovy console over this alignment
1267 label.couldnt_run_groovy_script = Failed to run Groovy script
1268 label.uniprot_sequence_fetcher = UniProt Sequence Fetcher
1269 action.next_page= >> 
1270 action.prev_page= << 
1271 label.next_page_tooltip=Next Page
1272 label.prev_page_tooltip=Previous Page
1273 exception.bad_request=Bad request. There is a problem with your input.
1274 exception.service_not_available=Service not available. The server is being updated, try again later.
1275 status.launching_3d_structure_viewer = Launching 3D Structure viewer...
1276 status.fetching_3d_structures_for_selected_entries = Fetching 3D Structures for selected entries...
1277 status.fetching_dbrefs_for_sequences_without_valid_refs = Fetching db refs for {0} sequence(s) without valid db ref required for SIFTS mapping
1278 status.fetching_3d_structures_for = Fetching 3D Structure for {0}
1279 status.obtaining_mapping_with_sifts = Obtaining mapping with SIFTS
1280 status.obtaining_mapping_with_nw_alignment = Obtaining mapping with NW alignment
1281 status.exporting_alignment_as_x_file = Exporting alignment as {0} file
1282 label.column = Column
1283 label.cant_map_cds = Unable to map CDS to protein\nCDS missing or incomplete
1284 label.operation_failed = Operation failed
1285 label.SEQUENCE_ID_no_longer_used = $SEQUENCE_ID$ is no longer used for DB accessions
1286 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION1 = Please review your URL links in the 'Connections' tab of the Preferences window:
1287 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION2 = URL links using '$SEQUENCE_ID$' for DB accessions now use '$DB_ACCESSION$'.
1288 label.do_not_display_again = Do not display this message again
1289 exception.url_cannot_have_duplicate_id = {0} cannot be used as a label for more than one line
1290 label.filter = Filter text:
1291 action.customfilter = Custom only
1292 action.showall = Show All
1293 label.insert = Insert:
1294 action.seq_id = $SEQUENCE_ID$
1295 action.db_acc = $DB_ACCESSION$
1296 label.primary = Double Click
1297 label.inmenu = In Menu
1298 label.id = ID
1299 label.database = Database
1300 label.urltooltip = Only one url, which must use a sequence id, can be selected for the 'On Click' option
1301 label.edit_sequence_url_link = Edit sequence URL link
1302 warn.name_cannot_be_duplicate = User-defined URL names must be unique and cannot be MIRIAM ids
1303 label.output_seq_details = Output Sequence Details to list all database references
1304 label.urllinks = Links
1305 label.default_cache_size = Default Cache Size
1306 action.clear_cached_items = Clear Cached Items
1307 label.togglehidden = Show hidden regions
1308 label.quality_descr = Alignment Quality based on Blosum62 scores
1309 label.conservation_descr = Conservation of total alignment less than {0}% gaps
1310 label.consensus_descr = PID
1311 label.complement_consensus_descr = PID for cDNA
1312 label.strucconsensus_descr = PID for base pairs
1313 label.occupancy_descr = Number of aligned positions 
1314 label.show_experimental = Enable experimental features
1315 label.show_experimental_tip = Enable any new and currently 'experimental' features (see Latest Release Notes for details)
1316 label.warning_hidden = Warning: {0} {1} is currently hidden
1317 label.overview_settings = Overview settings
1318 label.ov_legacy_gap = Use legacy gap colouring (gaps are white)
1319 label.gap_colour = Gap colour:
1320 label.ov_show_hide_default = Show hidden regions when opening overview
1321 label.hidden_colour = Hidden colour:
1322 label.select_gap_colour = Select gap colour
1323 label.select_hidden_colour = Select hidden colour
1324 label.overview = Overview
1325 label.reset_to_defaults = Reset to defaults
1326 label.oview_calc = Recalculating overview...
1327 label.feature_details = Feature details
1328 label.matchCondition_contains = Contains
1329 label.matchCondition_notcontains = Does not contain
1330 label.matchCondition_matches = Matches
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1338 label.numeric_required = The value should be numeric
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1340 label.no_numeric_attributes = No numeric attributes known
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