src/ext/vamsas/JpredSoapBindingStub.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.1)
   3  * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10  *
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15  *
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  18  */
  19 package ext.vamsas;
  20
  21 public class JpredSoapBindingStub extends org.apache.axis.client.Stub
  22         implements ext.vamsas.Jpred
  23 {
  24   private java.util.Vector cachedSerClasses = new java.util.Vector();
  25
  26   private java.util.Vector cachedSerQNames = new java.util.Vector();
  27
  28   private java.util.Vector cachedSerFactories = new java.util.Vector();
  29
  30   private java.util.Vector cachedDeserFactories = new java.util.Vector();
  31
  32   static org.apache.axis.description.OperationDesc[] _operations;
  33
  34   static
  35   {
  36     _operations = new org.apache.axis.description.OperationDesc[4];
  37     _initOperationDesc1();
  38   }
  39
  40   private static void _initOperationDesc1()
  41   {
  42     org.apache.axis.description.OperationDesc oper;
  43     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  44     oper.setName("predict");
  45     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "seq"),
  46             new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
  47                     "Sequence"), vamsas.objects.simple.Sequence.class,
  48             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  49     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  50             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"));
  51     oper.setReturnClass(java.lang.String.class);
  52     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "predictReturn"));
  53     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
  54     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
  55     _operations[0] = oper;
  56
  57     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  58     oper.setName("predictOnMsa");
  59     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "msf"),
  60             new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",
  61                     "Msfalignment"),
  62             vamsas.objects.simple.Msfalignment.class,
  63             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  64     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  65             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"));
  66     oper.setReturnClass(java.lang.String.class);
  67     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("",
  68             "predictOnMsaReturn"));
  69     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
  70     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
  71     _operations[1] = oper;
  72
  73     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  74     oper.setName("getpredict");
  75     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "job_id"),
  76             new javax.xml.namespace.QName(
  77                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
  78             java.lang.String.class,
  79             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  80     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  81             "http://simple.objects.vamsas", "Secstructpred"));
  82     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.Secstructpred.class);
  83     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("",
  84             "getpredictReturn"));
  85     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
  86     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
  87     _operations[2] = oper;
  88
  89     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  90     oper.setName("getresult");
  91     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "job_id"),
  92             new javax.xml.namespace.QName(
  93                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
  94             java.lang.String.class,
  95             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  96     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  97             "http://simple.objects.vamsas", "JpredResult"));
  98     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.JpredResult.class);
  99     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "getresultReturn"));
 100     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
 101     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
 102     _operations[3] = oper;
 103
 104   }
 105
 106   public JpredSoapBindingStub() throws org.apache.axis.AxisFault
 107   {
 108     this(null);
 109   }
 110
 111   public JpredSoapBindingStub(java.net.URL endpointURL,
 112           javax.xml.rpc.Service service) throws org.apache.axis.AxisFault
 113   {
 114     this(service);
 115     super.cachedEndpoint = endpointURL;
 116   }
 117
 118   public JpredSoapBindingStub(javax.xml.rpc.Service service)
 119           throws org.apache.axis.AxisFault
 120   {
 121     if (service == null)
 122     {
 123       super.service = new org.apache.axis.client.Service();
 124     }
 125     else
 126     {
 127       super.service = service;
 128     }
 129     java.lang.Class cls;
 130     javax.xml.namespace.QName qName;
 131     java.lang.Class beansf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanSerializerFactory.class;
 132     java.lang.Class beandf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanDeserializerFactory.class;
 133     /*
 134      * java.lang.Class enumsf =
 135      * org.apache.axis.encoding.ser.EnumSerializerFactory.class; java.lang.Class
 136      * enumdf = org.apache.axis.encoding.ser.EnumDeserializerFactory.class;
 137      * java.lang.Class arraysf =
 138      * org.apache.axis.encoding.ser.ArraySerializerFactory.class;
 139      * java.lang.Class arraydf =
 140      * org.apache.axis.encoding.ser.ArrayDeserializerFactory.class;
 141      * java.lang.Class simplesf =
 142      * org.apache.axis.encoding.ser.SimpleSerializerFactory.class;
 143      * java.lang.Class simpledf =
 144      * org.apache.axis.encoding.ser.SimpleDeserializerFactory.class;
 145      * java.lang.Class simplelistsf =
 146      * org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListSerializerFactory.class;
 147      * java.lang.Class simplelistdf =
 148      * org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListDeserializerFactory.class;
 149      */
 150     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",
 151             "JpredResult");
 152     cachedSerQNames.add(qName);
 153     cls = vamsas.objects.simple.JpredResult.class;
 154     cachedSerClasses.add(cls);
 155     cachedSerFactories.add(beansf);
 156     cachedDeserFactories.add(beandf);
 157
 158     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas", "Result");
 159     cachedSerQNames.add(qName);
 160     cls = vamsas.objects.simple.Result.class;
 161     cachedSerClasses.add(cls);
 162     cachedSerFactories.add(beansf);
 163     cachedDeserFactories.add(beandf);
 164
 165     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",
 166             "Secstructpred");
 167     cachedSerQNames.add(qName);
 168     cls = vamsas.objects.simple.Secstructpred.class;
 169     cachedSerClasses.add(cls);
 170     cachedSerFactories.add(beansf);
 171     cachedDeserFactories.add(beandf);
 172
 173     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",
 174             "Msfalignment");
 175     cachedSerQNames.add(qName);
 176     cls = vamsas.objects.simple.Msfalignment.class;
 177     cachedSerClasses.add(cls);
 178     cachedSerFactories.add(beansf);
 179     cachedDeserFactories.add(beandf);
 180
 181     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 182             "Sequence");
 183     cachedSerQNames.add(qName);
 184     cls = vamsas.objects.simple.Sequence.class;
 185     cachedSerClasses.add(cls);
 186     cachedSerFactories.add(beansf);
 187     cachedDeserFactories.add(beandf);
 188
 189   }
 190
 191   protected org.apache.axis.client.Call createCall()
 192           throws java.rmi.RemoteException
 193   {
 194     try
 195     {
 196       org.apache.axis.client.Call _call = (org.apache.axis.client.Call) super.service
 197               .createCall();
 198       if (super.maintainSessionSet)
 199       {
 200         _call.setMaintainSession(super.maintainSession);
 201       }
 202       if (super.cachedUsername != null)
 203       {
 204         _call.setUsername(super.cachedUsername);
 205       }
 206       if (super.cachedPassword != null)
 207       {
 208         _call.setPassword(super.cachedPassword);
 209       }
 210       if (super.cachedEndpoint != null)
 211       {
 212         _call.setTargetEndpointAddress(super.cachedEndpoint);
 213       }
 214       if (super.cachedTimeout != null)
 215       {
 216         _call.setTimeout(super.cachedTimeout);
 217       }
 218       if (super.cachedPortName != null)
 219       {
 220         _call.setPortName(super.cachedPortName);
 221       }
 222       java.util.Enumeration keys = super.cachedProperties.keys();
 223       while (keys.hasMoreElements())
 224       {
 225         java.lang.String key = (java.lang.String) keys.nextElement();
 226         _call.setProperty(key, super.cachedProperties.get(key));
 227       }
 228       // All the type mapping information is registered
 229       // when the first call is made.
 230       // The type mapping information is actually registered in
 231       // the TypeMappingRegistry of the service, which
 232       // is the reason why registration is only needed for the first call.
 233       synchronized (this)
 234       {
 235         if (firstCall())
 236         {
 237           // must set encoding style before registering serializers
 238           _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 239           _call.setEncodingStyle(org.apache.axis.Constants.URI_SOAP11_ENC);
 240           for (int i = 0; i < cachedSerFactories.size(); ++i)
 241           {
 242             java.lang.Class cls = (java.lang.Class) cachedSerClasses.get(i);
 243             javax.xml.namespace.QName qName = (javax.xml.namespace.QName) cachedSerQNames
 244                     .get(i);
 245             java.lang.Class sf = (java.lang.Class) cachedSerFactories
 246                     .get(i);
 247             java.lang.Class df = (java.lang.Class) cachedDeserFactories
 248                     .get(i);
 249             _call.registerTypeMapping(cls, qName, sf, df, false);
 250           }
 251         }
 252       }
 253       return _call;
 254     } catch (java.lang.Throwable _t)
 255     {
 256       throw new org.apache.axis.AxisFault(
 257               "Failure trying to get the Call object", _t);
 258     }
 259   }
 260
 261   public java.lang.String predict(vamsas.objects.simple.Sequence seq)
 262           throws java.rmi.RemoteException
 263   {
 264     if (super.cachedEndpoint == null)
 265     {
 266       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 267     }
 268     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 269     _call.setOperation(_operations[0]);
 270     _call.setUseSOAPAction(true);
 271     _call.setSOAPActionURI("");
 272     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 273     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 274             "predict"));
 275
 276     setRequestHeaders(_call);
 277     setAttachments(_call);
 278     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 279     { seq });
 280
 281     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 282     {
 283       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 284     }
 285     else
 286     {
 287       extractAttachments(_call);
 288       try
 289       {
 290         return (java.lang.String) _resp;
 291       } catch (java.lang.Exception _exception)
 292       {
 293         return (java.lang.String) org.apache.axis.utils.JavaUtils.convert(
 294                 _resp, java.lang.String.class);
 295       }
 296     }
 297   }
 298
 299   public java.lang.String predictOnMsa(
 300           vamsas.objects.simple.Msfalignment msf)
 301           throws java.rmi.RemoteException
 302   {
 303     if (super.cachedEndpoint == null)
 304     {
 305       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 306     }
 307     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 308     _call.setOperation(_operations[1]);
 309     _call.setUseSOAPAction(true);
 310     _call.setSOAPActionURI("");
 311     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 312     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 313             "predictOnMsa"));
 314
 315     setRequestHeaders(_call);
 316     setAttachments(_call);
 317     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 318     { msf });
 319
 320     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 321     {
 322       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 323     }
 324     else
 325     {
 326       extractAttachments(_call);
 327       try
 328       {
 329         return (java.lang.String) _resp;
 330       } catch (java.lang.Exception _exception)
 331       {
 332         return (java.lang.String) org.apache.axis.utils.JavaUtils.convert(
 333                 _resp, java.lang.String.class);
 334       }
 335     }
 336   }
 337
 338   public vamsas.objects.simple.Secstructpred getpredict(
 339           java.lang.String job_id) throws java.rmi.RemoteException
 340   {
 341     if (super.cachedEndpoint == null)
 342     {
 343       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 344     }
 345     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 346     _call.setOperation(_operations[2]);
 347     _call.setUseSOAPAction(true);
 348     _call.setSOAPActionURI("");
 349     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 350     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 351             "getpredict"));
 352
 353     setRequestHeaders(_call);
 354     setAttachments(_call);
 355     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 356     { job_id });
 357
 358     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 359     {
 360       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 361     }
 362     else
 363     {
 364       extractAttachments(_call);
 365       try
 366       {
 367         return (vamsas.objects.simple.Secstructpred) _resp;
 368       } catch (java.lang.Exception _exception)
 369       {
 370         return (vamsas.objects.simple.Secstructpred) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 371                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.Secstructpred.class);
 372       }
 373     }
 374   }
 375
 376   public vamsas.objects.simple.JpredResult getresult(java.lang.String job_id)
 377           throws java.rmi.RemoteException
 378   {
 379     if (super.cachedEndpoint == null)
 380     {
 381       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 382     }
 383     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 384     _call.setOperation(_operations[3]);
 385     _call.setUseSOAPAction(true);
 386     _call.setSOAPActionURI("");
 387     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 388     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 389             "getresult"));
 390
 391     setRequestHeaders(_call);
 392     setAttachments(_call);
 393     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 394     { job_id });
 395
 396     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 397     {
 398       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 399     }
 400     else
 401     {
 402       extractAttachments(_call);
 403       try
 404       {
 405         return (vamsas.objects.simple.JpredResult) _resp;
 406       } catch (java.lang.Exception _exception)
 407       {
 408         return (vamsas.objects.simple.JpredResult) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 409                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.JpredResult.class);
 410       }
 411     }
 412   }
 413
 414 }