src/ext/vamsas/MuscleWSSoapBindingStub.java

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  20  */
  21 package ext.vamsas;
  22
  23 public class MuscleWSSoapBindingStub extends org.apache.axis.client.Stub
  24         implements ext.vamsas.MuscleWS
  25 {
  26   static org.apache.axis.description.OperationDesc[] _operations;
  27
  28   static
  29   {
  30     _operations = new org.apache.axis.description.OperationDesc[4];
  31     _initOperationDesc1();
  32   }
  33
  34   private java.util.Vector cachedSerClasses = new java.util.Vector();
  35
  36   private java.util.Vector cachedSerQNames = new java.util.Vector();
  37
  38   private java.util.Vector cachedSerFactories = new java.util.Vector();
  39
  40   private java.util.Vector cachedDeserFactories = new java.util.Vector();
  41
  42   public MuscleWSSoapBindingStub() throws org.apache.axis.AxisFault
  43   {
  44     this(null);
  45   }
  46
  47   public MuscleWSSoapBindingStub(java.net.URL endpointURL,
  48           javax.xml.rpc.Service service) throws org.apache.axis.AxisFault
  49   {
  50     this(service);
  51     super.cachedEndpoint = endpointURL;
  52   }
  53
  54   public MuscleWSSoapBindingStub(javax.xml.rpc.Service service)
  55           throws org.apache.axis.AxisFault
  56   {
  57     if (service == null)
  58     {
  59       super.service = new org.apache.axis.client.Service();
  60     }
  61     else
  62     {
  63       super.service = service;
  64     }
  65
  66     java.lang.Class cls;
  67     javax.xml.namespace.QName qName;
  68     java.lang.Class beansf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanSerializerFactory.class;
  69     java.lang.Class beandf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanDeserializerFactory.class;
  70     // java.lang.Class enumsf =
  71     // org.apache.axis.encoding.ser.EnumSerializerFactory.class;
  72     // java.lang.Class enumdf =
  73     // org.apache.axis.encoding.ser.EnumDeserializerFactory.class;
  74     java.lang.Class arraysf = org.apache.axis.encoding.ser.ArraySerializerFactory.class;
  75     java.lang.Class arraydf = org.apache.axis.encoding.ser.ArrayDeserializerFactory.class;
  76     // java.lang.Class simplesf =
  77     // org.apache.axis.encoding.ser.SimpleSerializerFactory.class;
  78     // java.lang.Class simpledf =
  79     // org.apache.axis.encoding.ser.SimpleDeserializerFactory.class;
  80     // java.lang.Class simplelistsf =
  81     // org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListSerializerFactory.class;
  82     // java.lang.Class simplelistdf =
  83     // org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListDeserializerFactory.class;
  84     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
  85             "Sequence");
  86     cachedSerQNames.add(qName);
  87     cls = vamsas.objects.simple.Sequence.class;
  88     cachedSerClasses.add(cls);
  89     cachedSerFactories.add(beansf);
  90     cachedDeserFactories.add(beandf);
  91
  92     qName = new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
  93             "ArrayOf_tns1_Sequence");
  94     cachedSerQNames.add(qName);
  95     cls = vamsas.objects.simple.Sequence[].class;
  96     cachedSerClasses.add(cls);
  97     cachedSerFactories.add(arraysf);
  98     cachedDeserFactories.add(arraydf);
  99
 100     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 101             "MsaResult");
 102     cachedSerQNames.add(qName);
 103     cls = vamsas.objects.simple.MsaResult.class;
 104     cachedSerClasses.add(cls);
 105     cachedSerFactories.add(beansf);
 106     cachedDeserFactories.add(beandf);
 107
 108     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 109             "SequenceSet");
 110     cachedSerQNames.add(qName);
 111     cls = vamsas.objects.simple.SequenceSet.class;
 112     cachedSerClasses.add(cls);
 113     cachedSerFactories.add(beansf);
 114     cachedDeserFactories.add(beandf);
 115
 116     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",
 117             "Object");
 118     cachedSerQNames.add(qName);
 119     cls = vamsas.objects.simple.Object.class;
 120     cachedSerClasses.add(cls);
 121     cachedSerFactories.add(beansf);
 122     cachedDeserFactories.add(beandf);
 123
 124     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 125             "Alignment");
 126     cachedSerQNames.add(qName);
 127     cls = vamsas.objects.simple.Alignment.class;
 128     cachedSerClasses.add(cls);
 129     cachedSerFactories.add(beansf);
 130     cachedDeserFactories.add(beandf);
 131
 132     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 133             "WsJobId");
 134     cachedSerQNames.add(qName);
 135     cls = vamsas.objects.simple.WsJobId.class;
 136     cachedSerClasses.add(cls);
 137     cachedSerFactories.add(beansf);
 138     cachedDeserFactories.add(beandf);
 139
 140     qName = new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "ArrayOf_xsd_string");
 141     cachedSerQNames.add(qName);
 142     cls = java.lang.String[].class;
 143     cachedSerClasses.add(cls);
 144     cachedSerFactories.add(arraysf);
 145     cachedDeserFactories.add(arraydf);
 146
 147     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 148             "Result");
 149     cachedSerQNames.add(qName);
 150     cls = vamsas.objects.simple.Result.class;
 151     cachedSerClasses.add(cls);
 152     cachedSerFactories.add(beansf);
 153     cachedDeserFactories.add(beandf);
 154   }
 155
 156   private static void _initOperationDesc1()
 157   {
 158     org.apache.axis.description.OperationDesc oper;
 159     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
 160     oper.setName("align");
 161     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "seqSet"),
 162             new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 163                     "SequenceSet"),
 164             vamsas.objects.simple.SequenceSet.class,
 165             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
 166     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
 167             "simple.objects.vamsas", "WsJobId"));
 168     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
 169     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "alignReturn"));
 170     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
 171     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
 172     _operations[0] = oper;
 173
 174     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
 175     oper.setName("getalign");
 176     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "job_id"),
 177             new javax.xml.namespace.QName(
 178                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
 179             java.lang.String.class,
 180             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
 181     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
 182             "simple.objects.vamsas", "Alignment"));
 183     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.Alignment.class);
 184     oper.setReturnQName(
 185             new javax.xml.namespace.QName("", "getalignReturn"));
 186     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
 187     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
 188     _operations[1] = oper;
 189
 190     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
 191     oper.setName("getResult");
 192     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "job_id"),
 193             new javax.xml.namespace.QName(
 194                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
 195             java.lang.String.class,
 196             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
 197     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
 198             "simple.objects.vamsas", "MsaResult"));
 199     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.MsaResult.class);
 200     oper.setReturnQName(
 201             new javax.xml.namespace.QName("", "getResultReturn"));
 202     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
 203     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
 204     _operations[2] = oper;
 205
 206     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
 207     oper.setName("cancel");
 208     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "jobId"),
 209             new javax.xml.namespace.QName(
 210                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
 211             java.lang.String.class,
 212             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
 213     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
 214             "simple.objects.vamsas", "WsJobId"));
 215     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
 216     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "cancelReturn"));
 217     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
 218     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
 219     _operations[3] = oper;
 220   }
 221
 222   protected org.apache.axis.client.Call createCall()
 223           throws java.rmi.RemoteException
 224   {
 225     try
 226     {
 227       org.apache.axis.client.Call _call = (org.apache.axis.client.Call) super.service
 228               .createCall();
 229
 230       if (super.maintainSessionSet)
 231       {
 232         _call.setMaintainSession(super.maintainSession);
 233       }
 234
 235       if (super.cachedUsername != null)
 236       {
 237         _call.setUsername(super.cachedUsername);
 238       }
 239
 240       if (super.cachedPassword != null)
 241       {
 242         _call.setPassword(super.cachedPassword);
 243       }
 244
 245       if (super.cachedEndpoint != null)
 246       {
 247         _call.setTargetEndpointAddress(super.cachedEndpoint);
 248       }
 249
 250       if (super.cachedTimeout != null)
 251       {
 252         _call.setTimeout(super.cachedTimeout);
 253       }
 254
 255       if (super.cachedPortName != null)
 256       {
 257         _call.setPortName(super.cachedPortName);
 258       }
 259
 260       java.util.Enumeration keys = super.cachedProperties.keys();
 261
 262       while (keys.hasMoreElements())
 263       {
 264         java.lang.String key = (java.lang.String) keys.nextElement();
 265         _call.setProperty(key, super.cachedProperties.get(key));
 266       }
 267
 268       // All the type mapping information is registered
 269       // when the first call is made.
 270       // The type mapping information is actually registered in
 271       // the TypeMappingRegistry of the service, which
 272       // is the reason why registration is only needed for the first call.
 273       synchronized (this)
 274       {
 275         if (firstCall())
 276         {
 277           // must set encoding style before registering serializers
 278           _call.setSOAPVersion(
 279                   org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 280           _call.setEncodingStyle(org.apache.axis.Constants.URI_SOAP11_ENC);
 281
 282           for (int i = 0; i < cachedSerFactories.size(); ++i)
 283           {
 284             java.lang.Class cls = (java.lang.Class) cachedSerClasses.get(i);
 285             javax.xml.namespace.QName qName = (javax.xml.namespace.QName) cachedSerQNames
 286                     .get(i);
 287             java.lang.Class sf = (java.lang.Class) cachedSerFactories
 288                     .get(i);
 289             java.lang.Class df = (java.lang.Class) cachedDeserFactories
 290                     .get(i);
 291             _call.registerTypeMapping(cls, qName, sf, df, false);
 292           }
 293         }
 294       }
 295
 296       return _call;
 297     } catch (java.lang.Throwable _t)
 298     {
 299       throw new org.apache.axis.AxisFault(
 300               "Failure trying to get the Call object", _t);
 301     }
 302   }
 303
 304   public vamsas.objects.simple.WsJobId align(
 305           vamsas.objects.simple.SequenceSet seqSet)
 306           throws java.rmi.RemoteException
 307   {
 308     if (super.cachedEndpoint == null)
 309     {
 310       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 311     }
 312
 313     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 314     _call.setOperation(_operations[0]);
 315     _call.setUseSOAPAction(true);
 316     _call.setSOAPActionURI("");
 317     _call.setSOAPVersion(
 318             org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 319     _call.setOperationName(
 320             new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "align"));
 321
 322     setRequestHeaders(_call);
 323     setAttachments(_call);
 324
 325     java.lang.Object _resp = _call
 326             .invoke(new java.lang.Object[]
 327             { seqSet });
 328
 329     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 330     {
 331       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 332     }
 333     else
 334     {
 335       extractAttachments(_call);
 336
 337       try
 338       {
 339         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) _resp;
 340       } catch (java.lang.Exception _exception)
 341       {
 342         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 343                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
 344       }
 345     }
 346   }
 347
 348   public vamsas.objects.simple.Alignment getalign(java.lang.String job_id)
 349           throws java.rmi.RemoteException
 350   {
 351     if (super.cachedEndpoint == null)
 352     {
 353       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 354     }
 355
 356     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 357     _call.setOperation(_operations[1]);
 358     _call.setUseSOAPAction(true);
 359     _call.setSOAPActionURI("");
 360     _call.setSOAPVersion(
 361             org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 362     _call.setOperationName(
 363             new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "getalign"));
 364
 365     setRequestHeaders(_call);
 366     setAttachments(_call);
 367
 368     java.lang.Object _resp = _call
 369             .invoke(new java.lang.Object[]
 370             { job_id });
 371
 372     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 373     {
 374       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 375     }
 376     else
 377     {
 378       extractAttachments(_call);
 379
 380       try
 381       {
 382         return (vamsas.objects.simple.Alignment) _resp;
 383       } catch (java.lang.Exception _exception)
 384       {
 385         return (vamsas.objects.simple.Alignment) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 386                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.Alignment.class);
 387       }
 388     }
 389   }
 390
 391   public vamsas.objects.simple.MsaResult getResult(java.lang.String job_id)
 392           throws java.rmi.RemoteException
 393   {
 394     if (super.cachedEndpoint == null)
 395     {
 396       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 397     }
 398
 399     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 400     _call.setOperation(_operations[2]);
 401     _call.setUseSOAPAction(true);
 402     _call.setSOAPActionURI("");
 403     _call.setSOAPVersion(
 404             org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 405     _call.setOperationName(
 406             new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "getResult"));
 407
 408     setRequestHeaders(_call);
 409     setAttachments(_call);
 410
 411     java.lang.Object _resp = _call
 412             .invoke(new java.lang.Object[]
 413             { job_id });
 414
 415     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 416     {
 417       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 418     }
 419     else
 420     {
 421       extractAttachments(_call);
 422
 423       try
 424       {
 425         return (vamsas.objects.simple.MsaResult) _resp;
 426       } catch (java.lang.Exception _exception)
 427       {
 428         return (vamsas.objects.simple.MsaResult) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 429                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.MsaResult.class);
 430       }
 431     }
 432   }
 433
 434   public vamsas.objects.simple.WsJobId cancel(java.lang.String jobId)
 435           throws java.rmi.RemoteException
 436   {
 437     if (super.cachedEndpoint == null)
 438     {
 439       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 440     }
 441
 442     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 443     _call.setOperation(_operations[3]);
 444     _call.setUseSOAPAction(true);
 445     _call.setSOAPActionURI("");
 446     _call.setSOAPVersion(
 447             org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 448     _call.setOperationName(
 449             new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "cancel"));
 450
 451     setRequestHeaders(_call);
 452     setAttachments(_call);
 453
 454     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[] { jobId });
 455
 456     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 457     {
 458       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 459     }
 460     else
 461     {
 462       extractAttachments(_call);
 463
 464       try
 465       {
 466         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) _resp;
 467       } catch (java.lang.Exception _exception)
 468       {
 469         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 470                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
 471       }
 472     }
 473   }
 474 }