src/ext/vamsas/SeqSearchServiceSoapBindingStub.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package ext.vamsas;
  22
  23 public class SeqSearchServiceSoapBindingStub
  24         extends org.apache.axis.client.Stub implements ext.vamsas.SeqSearchI
  25 {
  26   private java.util.Vector cachedSerClasses = new java.util.Vector();
  27
  28   private java.util.Vector cachedSerQNames = new java.util.Vector();
  29
  30   private java.util.Vector cachedSerFactories = new java.util.Vector();
  31
  32   private java.util.Vector cachedDeserFactories = new java.util.Vector();
  33
  34   static org.apache.axis.description.OperationDesc[] _operations;
  35
  36   static
  37   {
  38     _operations = new org.apache.axis.description.OperationDesc[5];
  39     _initOperationDesc1();
  40   }
  41
  42   private static void _initOperationDesc1()
  43   {
  44     org.apache.axis.description.OperationDesc oper;
  45     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  46     oper.setName("getDatabase");
  47     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  48             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"));
  49     oper.setReturnClass(java.lang.String.class);
  50     oper.setReturnQName(
  51             new javax.xml.namespace.QName("", "getDatabaseReturn"));
  52     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
  53     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
  54     _operations[0] = oper;
  55
  56     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  57     oper.setName("getResult");
  58     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "job_id"),
  59             new javax.xml.namespace.QName(
  60                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
  61             java.lang.String.class,
  62             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  63     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  64             "simple.objects.vamsas", "SeqSearchResult"));
  65     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.SeqSearchResult.class);
  66     oper.setReturnQName(
  67             new javax.xml.namespace.QName("", "getResultReturn"));
  68     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
  69     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
  70     _operations[1] = oper;
  71
  72     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  73     oper.setName("psearch");
  74     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "al"),
  75             new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
  76                     "Alignment"),
  77             vamsas.objects.simple.Alignment.class,
  78             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  79     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "database"),
  80             new javax.xml.namespace.QName(
  81                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
  82             java.lang.String.class,
  83             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  84     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  85             "simple.objects.vamsas", "WsJobId"));
  86     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
  87     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "psearchReturn"));
  88     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
  89     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
  90     _operations[2] = oper;
  91
  92     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  93     oper.setName("search");
  94     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "s"),
  95             new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
  96                     "Sequence"),
  97             vamsas.objects.simple.Sequence.class,
  98             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  99     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "database"),
 100             new javax.xml.namespace.QName(
 101                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
 102             java.lang.String.class,
 103             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
 104     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
 105             "simple.objects.vamsas", "WsJobId"));
 106     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
 107     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "searchReturn"));
 108     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
 109     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
 110     _operations[3] = oper;
 111
 112     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
 113     oper.setName("cancel");
 114     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "jobId"),
 115             new javax.xml.namespace.QName(
 116                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
 117             java.lang.String.class,
 118             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
 119     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
 120             "simple.objects.vamsas", "WsJobId"));
 121     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
 122     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "cancelReturn"));
 123     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
 124     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
 125     _operations[4] = oper;
 126
 127   }
 128
 129   public SeqSearchServiceSoapBindingStub() throws org.apache.axis.AxisFault
 130   {
 131     this(null);
 132   }
 133
 134   public SeqSearchServiceSoapBindingStub(java.net.URL endpointURL,
 135           javax.xml.rpc.Service service) throws org.apache.axis.AxisFault
 136   {
 137     this(service);
 138     super.cachedEndpoint = endpointURL;
 139   }
 140
 141   public SeqSearchServiceSoapBindingStub(javax.xml.rpc.Service service)
 142           throws org.apache.axis.AxisFault
 143   {
 144     if (service == null)
 145     {
 146       super.service = new org.apache.axis.client.Service();
 147     }
 148     else
 149     {
 150       super.service = service;
 151     }
 152     java.lang.Class cls;
 153     javax.xml.namespace.QName qName;
 154     java.lang.Class beansf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanSerializerFactory.class;
 155     java.lang.Class beandf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanDeserializerFactory.class;
 156     java.lang.Class enumsf = org.apache.axis.encoding.ser.EnumSerializerFactory.class;
 157     java.lang.Class enumdf = org.apache.axis.encoding.ser.EnumDeserializerFactory.class;
 158     java.lang.Class arraysf = org.apache.axis.encoding.ser.ArraySerializerFactory.class;
 159     java.lang.Class arraydf = org.apache.axis.encoding.ser.ArrayDeserializerFactory.class;
 160     java.lang.Class simplesf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleSerializerFactory.class;
 161     java.lang.Class simpledf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleDeserializerFactory.class;
 162     java.lang.Class simplelistsf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListSerializerFactory.class;
 163     java.lang.Class simplelistdf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListDeserializerFactory.class;
 164     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 165             "Result");
 166     cachedSerQNames.add(qName);
 167     cls = vamsas.objects.simple.Result.class;
 168     cachedSerClasses.add(cls);
 169     cachedSerFactories.add(beansf);
 170     cachedDeserFactories.add(beandf);
 171
 172     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 173             "WsJobId");
 174     cachedSerQNames.add(qName);
 175     cls = vamsas.objects.simple.WsJobId.class;
 176     cachedSerClasses.add(cls);
 177     cachedSerFactories.add(beansf);
 178     cachedDeserFactories.add(beandf);
 179
 180     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",
 181             "Object");
 182     cachedSerQNames.add(qName);
 183     cls = vamsas.objects.simple.Object.class;
 184     cachedSerClasses.add(cls);
 185     cachedSerFactories.add(beansf);
 186     cachedDeserFactories.add(beandf);
 187
 188     qName = new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "ArrayOf_xsd_string");
 189     cachedSerQNames.add(qName);
 190     cls = java.lang.String[].class;
 191     cachedSerClasses.add(cls);
 192     cachedSerFactories.add(arraysf);
 193     cachedDeserFactories.add(arraydf);
 194
 195     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 196             "Alignment");
 197     cachedSerQNames.add(qName);
 198     cls = vamsas.objects.simple.Alignment.class;
 199     cachedSerClasses.add(cls);
 200     cachedSerFactories.add(beansf);
 201     cachedDeserFactories.add(beandf);
 202
 203     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 204             "Sequence");
 205     cachedSerQNames.add(qName);
 206     cls = vamsas.objects.simple.Sequence.class;
 207     cachedSerClasses.add(cls);
 208     cachedSerFactories.add(beansf);
 209     cachedDeserFactories.add(beandf);
 210
 211     qName = new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 212             "ArrayOf_tns1_Sequence");
 213     cachedSerQNames.add(qName);
 214     cls = vamsas.objects.simple.Sequence[].class;
 215     cachedSerClasses.add(cls);
 216     cachedSerFactories.add(arraysf);
 217     cachedDeserFactories.add(arraydf);
 218
 219     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 220             "SeqSearchResult");
 221     cachedSerQNames.add(qName);
 222     cls = vamsas.objects.simple.SeqSearchResult.class;
 223     cachedSerClasses.add(cls);
 224     cachedSerFactories.add(beansf);
 225     cachedDeserFactories.add(beandf);
 226
 227     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 228             "SequenceSet");
 229     cachedSerQNames.add(qName);
 230     cls = vamsas.objects.simple.SequenceSet.class;
 231     cachedSerClasses.add(cls);
 232     cachedSerFactories.add(beansf);
 233     cachedDeserFactories.add(beandf);
 234
 235   }
 236
 237   protected org.apache.axis.client.Call createCall()
 238           throws java.rmi.RemoteException
 239   {
 240     try
 241     {
 242       org.apache.axis.client.Call _call = (org.apache.axis.client.Call) super.service
 243               .createCall();
 244       if (super.maintainSessionSet)
 245       {
 246         _call.setMaintainSession(super.maintainSession);
 247       }
 248       if (super.cachedUsername != null)
 249       {
 250         _call.setUsername(super.cachedUsername);
 251       }
 252       if (super.cachedPassword != null)
 253       {
 254         _call.setPassword(super.cachedPassword);
 255       }
 256       if (super.cachedEndpoint != null)
 257       {
 258         _call.setTargetEndpointAddress(super.cachedEndpoint);
 259       }
 260       if (super.cachedTimeout != null)
 261       {
 262         _call.setTimeout(super.cachedTimeout);
 263       }
 264       if (super.cachedPortName != null)
 265       {
 266         _call.setPortName(super.cachedPortName);
 267       }
 268       java.util.Enumeration keys = super.cachedProperties.keys();
 269       while (keys.hasMoreElements())
 270       {
 271         java.lang.String key = (java.lang.String) keys.nextElement();
 272         _call.setProperty(key, super.cachedProperties.get(key));
 273       }
 274       // All the type mapping information is registered
 275       // when the first call is made.
 276       // The type mapping information is actually registered in
 277       // the TypeMappingRegistry of the service, which
 278       // is the reason why registration is only needed for the first call.
 279       synchronized (this)
 280       {
 281         if (firstCall())
 282         {
 283           // must set encoding style before registering serializers
 284           _call.setSOAPVersion(
 285                   org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 286           _call.setEncodingStyle(org.apache.axis.Constants.URI_SOAP11_ENC);
 287           for (int i = 0; i < cachedSerFactories.size(); ++i)
 288           {
 289             java.lang.Class cls = (java.lang.Class) cachedSerClasses.get(i);
 290             javax.xml.namespace.QName qName = (javax.xml.namespace.QName) cachedSerQNames
 291                     .get(i);
 292             java.lang.Class sf = (java.lang.Class) cachedSerFactories
 293                     .get(i);
 294             java.lang.Class df = (java.lang.Class) cachedDeserFactories
 295                     .get(i);
 296             _call.registerTypeMapping(cls, qName, sf, df, false);
 297           }
 298         }
 299       }
 300       return _call;
 301     } catch (java.lang.Throwable _t)
 302     {
 303       throw new org.apache.axis.AxisFault(
 304               "Failure trying to get the Call object", _t);
 305     }
 306   }
 307
 308   public java.lang.String getDatabase() throws java.rmi.RemoteException
 309   {
 310     if (super.cachedEndpoint == null)
 311     {
 312       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 313     }
 314     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 315     _call.setOperation(_operations[0]);
 316     _call.setUseSOAPAction(true);
 317     _call.setSOAPActionURI("");
 318     _call.setSOAPVersion(
 319             org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 320     _call.setOperationName(
 321             new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "getDatabase"));
 322
 323     setRequestHeaders(_call);
 324     setAttachments(_call);
 325     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[] {});
 326
 327     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 328     {
 329       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 330     }
 331     else
 332     {
 333       extractAttachments(_call);
 334       try
 335       {
 336         return (java.lang.String) _resp;
 337       } catch (java.lang.Exception _exception)
 338       {
 339         return (java.lang.String) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 340                 .convert(_resp, java.lang.String.class);
 341       }
 342     }
 343   }
 344
 345   public vamsas.objects.simple.SeqSearchResult getResult(
 346           java.lang.String job_id) throws java.rmi.RemoteException
 347   {
 348     if (super.cachedEndpoint == null)
 349     {
 350       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 351     }
 352     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 353     _call.setOperation(_operations[1]);
 354     _call.setUseSOAPAction(true);
 355     _call.setSOAPActionURI("");
 356     _call.setSOAPVersion(
 357             org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 358     _call.setOperationName(
 359             new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "getResult"));
 360
 361     setRequestHeaders(_call);
 362     setAttachments(_call);
 363     java.lang.Object _resp = _call
 364             .invoke(new java.lang.Object[]
 365             { job_id });
 366
 367     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 368     {
 369       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 370     }
 371     else
 372     {
 373       extractAttachments(_call);
 374       try
 375       {
 376         return (vamsas.objects.simple.SeqSearchResult) _resp;
 377       } catch (java.lang.Exception _exception)
 378       {
 379         return (vamsas.objects.simple.SeqSearchResult) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 380                 .convert(_resp,
 381                         vamsas.objects.simple.SeqSearchResult.class);
 382       }
 383     }
 384   }
 385
 386   public vamsas.objects.simple.WsJobId psearch(
 387           vamsas.objects.simple.Alignment al, java.lang.String database)
 388           throws java.rmi.RemoteException
 389   {
 390     if (super.cachedEndpoint == null)
 391     {
 392       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 393     }
 394     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 395     _call.setOperation(_operations[2]);
 396     _call.setUseSOAPAction(true);
 397     _call.setSOAPActionURI("");
 398     _call.setSOAPVersion(
 399             org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 400     _call.setOperationName(
 401             new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "psearch"));
 402
 403     setRequestHeaders(_call);
 404     setAttachments(_call);
 405     java.lang.Object _resp = _call
 406             .invoke(new java.lang.Object[]
 407             { al, database });
 408
 409     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 410     {
 411       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 412     }
 413     else
 414     {
 415       extractAttachments(_call);
 416       try
 417       {
 418         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) _resp;
 419       } catch (java.lang.Exception _exception)
 420       {
 421         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 422                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
 423       }
 424     }
 425   }
 426
 427   public vamsas.objects.simple.WsJobId search(
 428           vamsas.objects.simple.Sequence s, java.lang.String database)
 429           throws java.rmi.RemoteException
 430   {
 431     if (super.cachedEndpoint == null)
 432     {
 433       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 434     }
 435     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 436     _call.setOperation(_operations[3]);
 437     _call.setUseSOAPAction(true);
 438     _call.setSOAPActionURI("");
 439     _call.setSOAPVersion(
 440             org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 441     _call.setOperationName(
 442             new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "search"));
 443
 444     setRequestHeaders(_call);
 445     setAttachments(_call);
 446     java.lang.Object _resp = _call
 447             .invoke(new java.lang.Object[]
 448             { s, database });
 449
 450     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 451     {
 452       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 453     }
 454     else
 455     {
 456       extractAttachments(_call);
 457       try
 458       {
 459         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) _resp;
 460       } catch (java.lang.Exception _exception)
 461       {
 462         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 463                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
 464       }
 465     }
 466   }
 467
 468   public vamsas.objects.simple.WsJobId cancel(java.lang.String jobId)
 469           throws java.rmi.RemoteException
 470   {
 471     if (super.cachedEndpoint == null)
 472     {
 473       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 474     }
 475     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 476     _call.setOperation(_operations[4]);
 477     _call.setUseSOAPAction(true);
 478     _call.setSOAPActionURI("");
 479     _call.setSOAPVersion(
 480             org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 481     _call.setOperationName(
 482             new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "cancel"));
 483
 484     setRequestHeaders(_call);
 485     setAttachments(_call);
 486     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[] { jobId });
 487
 488     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 489     {
 490       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 491     }
 492     else
 493     {
 494       extractAttachments(_call);
 495       try
 496       {
 497         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) _resp;
 498       } catch (java.lang.Exception _exception)
 499       {
 500         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 501                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
 502       }
 503     }
 504   }
 505
 506 }