src/jalview/schemabinding/version2/Alcodon.java

   1 /*******************************************************************************
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  19  ******************************************************************************/
  20 /*
  21  * This class was automatically generated with
  22  * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML
  23  * Schema.
  24  * $Id$
  25  */
  26
  27 package jalview.schemabinding.version2;
  28
  29 //---------------------------------/
  30 //- Imported classes and packages -/
  31 //---------------------------------/
  32
  33 import org.exolab.castor.xml.Marshaller;
  34 import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;
  35
  36 /**
  37  * Class Alcodon.
  38  *
  39  * @version $Revision$ $Date$
  40  */
  41 public class Alcodon implements java.io.Serializable
  42 {
  43
  44   // --------------------------/
  45   // - Class/Member Variables -/
  46   // --------------------------/
  47
  48   /**
  49    * Field _pos1.
  50    */
  51   private long _pos1;
  52
  53   /**
  54    * keeps track of state for field: _pos1
  55    */
  56   private boolean _has_pos1;
  57
  58   /**
  59    * Field _pos2.
  60    */
  61   private long _pos2;
  62
  63   /**
  64    * keeps track of state for field: _pos2
  65    */
  66   private boolean _has_pos2;
  67
  68   /**
  69    * Field _pos3.
  70    */
  71   private long _pos3;
  72
  73   /**
  74    * keeps track of state for field: _pos3
  75    */
  76   private boolean _has_pos3;
  77
  78   // ----------------/
  79   // - Constructors -/
  80   // ----------------/
  81
  82   public Alcodon()
  83   {
  84     super();
  85   }
  86
  87   // -----------/
  88   // - Methods -/
  89   // -----------/
  90
  91   /**
  92      */
  93   public void deletePos1()
  94   {
  95     this._has_pos1 = false;
  96   }
  97
  98   /**
  99      */
 100   public void deletePos2()
 101   {
 102     this._has_pos2 = false;
 103   }
 104
 105   /**
 106      */
 107   public void deletePos3()
 108   {
 109     this._has_pos3 = false;
 110   }
 111
 112   /**
 113    * Returns the value of field 'pos1'.
 114    *
 115    * @return the value of field 'Pos1'.
 116    */
 117   public long getPos1()
 118   {
 119     return this._pos1;
 120   }
 121
 122   /**
 123    * Returns the value of field 'pos2'.
 124    *
 125    * @return the value of field 'Pos2'.
 126    */
 127   public long getPos2()
 128   {
 129     return this._pos2;
 130   }
 131
 132   /**
 133    * Returns the value of field 'pos3'.
 134    *
 135    * @return the value of field 'Pos3'.
 136    */
 137   public long getPos3()
 138   {
 139     return this._pos3;
 140   }
 141
 142   /**
 143    * Method hasPos1.
 144    *
 145    * @return true if at least one Pos1 has been added
 146    */
 147   public boolean hasPos1()
 148   {
 149     return this._has_pos1;
 150   }
 151
 152   /**
 153    * Method hasPos2.
 154    *
 155    * @return true if at least one Pos2 has been added
 156    */
 157   public boolean hasPos2()
 158   {
 159     return this._has_pos2;
 160   }
 161
 162   /**
 163    * Method hasPos3.
 164    *
 165    * @return true if at least one Pos3 has been added
 166    */
 167   public boolean hasPos3()
 168   {
 169     return this._has_pos3;
 170   }
 171
 172   /**
 173    * Method isValid.
 174    *
 175    * @return true if this object is valid according to the schema
 176    */
 177   public boolean isValid()
 178   {
 179     try
 180     {
 181       validate();
 182     } catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex)
 183     {
 184       return false;
 185     }
 186     return true;
 187   }
 188
 189   /**
 190    *
 191    *
 192    * @param out
 193    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException
 194    *           if object is null or if any SAXException is thrown during
 195    *           marshaling
 196    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 197    *           if this object is an invalid instance according to the schema
 198    */
 199   public void marshal(final java.io.Writer out)
 200           throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,
 201           org.exolab.castor.xml.ValidationException
 202   {
 203     Marshaller.marshal(this, out);
 204   }
 205
 206   /**
 207    *
 208    *
 209    * @param handler
 210    * @throws java.io.IOException
 211    *           if an IOException occurs during marshaling
 212    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 213    *           if this object is an invalid instance according to the schema
 214    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException
 215    *           if object is null or if any SAXException is thrown during
 216    *           marshaling
 217    */
 218   public void marshal(final org.xml.sax.ContentHandler handler)
 219           throws java.io.IOException,
 220           org.exolab.castor.xml.MarshalException,
 221           org.exolab.castor.xml.ValidationException
 222   {
 223     Marshaller.marshal(this, handler);
 224   }
 225
 226   /**
 227    * Sets the value of field 'pos1'.
 228    *
 229    * @param pos1
 230    *          the value of field 'pos1'.
 231    */
 232   public void setPos1(final long pos1)
 233   {
 234     this._pos1 = pos1;
 235     this._has_pos1 = true;
 236   }
 237
 238   /**
 239    * Sets the value of field 'pos2'.
 240    *
 241    * @param pos2
 242    *          the value of field 'pos2'.
 243    */
 244   public void setPos2(final long pos2)
 245   {
 246     this._pos2 = pos2;
 247     this._has_pos2 = true;
 248   }
 249
 250   /**
 251    * Sets the value of field 'pos3'.
 252    *
 253    * @param pos3
 254    *          the value of field 'pos3'.
 255    */
 256   public void setPos3(final long pos3)
 257   {
 258     this._pos3 = pos3;
 259     this._has_pos3 = true;
 260   }
 261
 262   /**
 263    * Method unmarshal.
 264    *
 265    * @param reader
 266    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException
 267    *           if object is null or if any SAXException is thrown during
 268    *           marshaling
 269    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 270    *           if this object is an invalid instance according to the schema
 271    * @return the unmarshaled jalview.schemabinding.version2.Alcodo
 272    */
 273   public static jalview.schemabinding.version2.Alcodon unmarshal(
 274           final java.io.Reader reader)
 275           throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,
 276           org.exolab.castor.xml.ValidationException
 277   {
 278     return (jalview.schemabinding.version2.Alcodon) Unmarshaller.unmarshal(
 279             jalview.schemabinding.version2.Alcodon.class, reader);
 280   }
 281
 282   /**
 283    *
 284    *
 285    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 286    *           if this object is an invalid instance according to the schema
 287    */
 288   public void validate() throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 289   {
 290     org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();
 291     validator.validate(this);
 292   }
 293
 294 }