src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/AlcodonFrameDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.4.0.b2)\r
   3  * Copyright (C) 2009 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  * \r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  * \r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;\r
  20 \r
  21 // ---------------------------------/\r
  22 // - Imported classes and packages -/\r
  23 // ---------------------------------/\r
  24 \r
  25 import jalview.schemabinding.version2.AlcodonFrame;\r
  26 \r
  27 /**\r
  28  * Class AlcodonFrameDescriptor.\r
  29  * \r
  30  * @version $Revision$ $Date$\r
  31  */\r
  32 public class AlcodonFrameDescriptor extends\r
  33         org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl\r
  34 {\r
  35 \r
  36   // --------------------------/\r
  37   // - Class/Member Variables -/\r
  38   // --------------------------/\r
  39 \r
  40   /**\r
  41    * Field _elementDefinition.\r
  42    */\r
  43   private boolean _elementDefinition;\r
  44 \r
  45   /**\r
  46    * Field _nsPrefix.\r
  47    */\r
  48   private java.lang.String _nsPrefix;\r
  49 \r
  50   /**\r
  51    * Field _nsURI.\r
  52    */\r
  53   private java.lang.String _nsURI;\r
  54 \r
  55   /**\r
  56    * Field _xmlName.\r
  57    */\r
  58   private java.lang.String _xmlName;\r
  59 \r
  60   // ----------------/\r
  61   // - Constructors -/\r
  62   // ----------------/\r
  63 \r
  64   public AlcodonFrameDescriptor()\r
  65   {\r
  66     super();\r
  67     _nsURI = "www.vamsas.ac.uk/jalview/version2";\r
  68     _xmlName = "AlcodonFrame";\r
  69     _elementDefinition = true;\r
  70 \r
  71     // -- set grouping compositor\r
  72     setCompositorAsSequence();\r
  73     org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl desc = null;\r
  74     org.exolab.castor.mapping.FieldHandler handler = null;\r
  75     org.exolab.castor.xml.FieldValidator fieldValidator = null;\r
  76     // -- initialize attribute descriptors\r
  77 \r
  78     // -- initialize element descriptors\r
  79 \r
  80     // -- _alcodonList\r
  81     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
  82             jalview.schemabinding.version2.Alcodon.class, "_alcodonList",\r
  83             "alcodon", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
  84     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
  85     {\r
  86       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
  87               throws IllegalStateException\r
  88       {\r
  89         AlcodonFrame target = (AlcodonFrame) object;\r
  90         return target.getAlcodon();\r
  91       }\r
  92 \r
  93       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
  94               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  95       {\r
  96         try\r
  97         {\r
  98           AlcodonFrame target = (AlcodonFrame) object;\r
  99           target.addAlcodon((jalview.schemabinding.version2.Alcodon) value);\r
 100         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 101         {\r
 102           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 103         }\r
 104       }\r
 105 \r
 106       public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException,\r
 107               IllegalArgumentException\r
 108       {\r
 109         try\r
 110         {\r
 111           AlcodonFrame target = (AlcodonFrame) object;\r
 112           target.removeAllAlcodon();\r
 113         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 114         {\r
 115           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 116         }\r
 117       }\r
 118 \r
 119       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 120       {\r
 121         return new jalview.schemabinding.version2.Alcodon();\r
 122       }\r
 123     };\r
 124     desc.setHandler(handler);\r
 125     desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");\r
 126     desc.setMultivalued(true);\r
 127     addFieldDescriptor(desc);\r
 128 \r
 129     // -- validation code for: _alcodonList\r
 130     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 131     fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
 132     { // -- local scope\r
 133     }\r
 134     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 135     // -- _alcodMapList\r
 136     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 137             jalview.schemabinding.version2.AlcodMap.class, "_alcodMapList",\r
 138             "alcodMap", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 139     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 140     {\r
 141       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 142               throws IllegalStateException\r
 143       {\r
 144         AlcodonFrame target = (AlcodonFrame) object;\r
 145         return target.getAlcodMap();\r
 146       }\r
 147 \r
 148       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 149               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 150       {\r
 151         try\r
 152         {\r
 153           AlcodonFrame target = (AlcodonFrame) object;\r
 154           target\r
 155                   .addAlcodMap((jalview.schemabinding.version2.AlcodMap) value);\r
 156         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 157         {\r
 158           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 159         }\r
 160       }\r
 161 \r
 162       public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException,\r
 163               IllegalArgumentException\r
 164       {\r
 165         try\r
 166         {\r
 167           AlcodonFrame target = (AlcodonFrame) object;\r
 168           target.removeAllAlcodMap();\r
 169         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 170         {\r
 171           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 172         }\r
 173       }\r
 174 \r
 175       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 176       {\r
 177         return new jalview.schemabinding.version2.AlcodMap();\r
 178       }\r
 179     };\r
 180     desc.setHandler(handler);\r
 181     desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");\r
 182     desc.setMultivalued(true);\r
 183     addFieldDescriptor(desc);\r
 184 \r
 185     // -- validation code for: _alcodMapList\r
 186     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 187     fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
 188     { // -- local scope\r
 189     }\r
 190     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 191   }\r
 192 \r
 193   // -----------/\r
 194   // - Methods -/\r
 195   // -----------/\r
 196 \r
 197   /**\r
 198    * Method getAccessMode.\r
 199    * \r
 200    * @return the access mode specified for this class.\r
 201    */\r
 202   public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()\r
 203   {\r
 204     return null;\r
 205   }\r
 206 \r
 207   /**\r
 208    * Method getIdentity.\r
 209    * \r
 210    * @return the identity field, null if this class has no identity.\r
 211    */\r
 212   public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()\r
 213   {\r
 214     return super.getIdentity();\r
 215   }\r
 216 \r
 217   /**\r
 218    * Method getJavaClass.\r
 219    * \r
 220    * @return the Java class represented by this descriptor.\r
 221    */\r
 222   public java.lang.Class getJavaClass()\r
 223   {\r
 224     return jalview.schemabinding.version2.AlcodonFrame.class;\r
 225   }\r
 226 \r
 227   /**\r
 228    * Method getNameSpacePrefix.\r
 229    * \r
 230    * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.\r
 231    */\r
 232   public java.lang.String getNameSpacePrefix()\r
 233   {\r
 234     return _nsPrefix;\r
 235   }\r
 236 \r
 237   /**\r
 238    * Method getNameSpaceURI.\r
 239    * \r
 240    * @return the namespace URI used when marshaling and unmarshaling as XML.\r
 241    */\r
 242   public java.lang.String getNameSpaceURI()\r
 243   {\r
 244     return _nsURI;\r
 245   }\r
 246 \r
 247   /**\r
 248    * Method getValidator.\r
 249    * \r
 250    * @return a specific validator for the class described by this\r
 251    *         ClassDescriptor.\r
 252    */\r
 253   public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()\r
 254   {\r
 255     return this;\r
 256   }\r
 257 \r
 258   /**\r
 259    * Method getXMLName.\r
 260    * \r
 261    * @return the XML Name for the Class being described.\r
 262    */\r
 263   public java.lang.String getXMLName()\r
 264   {\r
 265     return _xmlName;\r
 266   }\r
 267 \r
 268   /**\r
 269    * Method isElementDefinition.\r
 270    * \r
 271    * @return true if XML schema definition of this Class is that of a global\r
 272    *         element or element with anonymous type definition.\r
 273    */\r
 274   public boolean isElementDefinition()\r
 275   {\r
 276     return _elementDefinition;\r
 277   }\r
 278 \r
 279 }\r