src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/AnnotationColoursDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.4.1)\r
   3  * Copyright (C) 2009 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  * \r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  * \r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;\r
  20 \r
  21   //---------------------------------/\r
  22  //- Imported classes and packages -/\r
  23 //---------------------------------/\r
  24 \r
  25 import jalview.schemabinding.version2.AnnotationColours;\r
  26 \r
  27 /**\r
  28  * Class AnnotationColoursDescriptor.\r
  29  * \r
  30  * @version $Revision$ $Date$\r
  31  */\r
  32 public class AnnotationColoursDescriptor extends org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl {\r
  33 \r
  34 \r
  35       //--------------------------/\r
  36      //- Class/Member Variables -/\r
  37     //--------------------------/\r
  38 \r
  39     /**\r
  40      * Field _elementDefinition.\r
  41      */\r
  42     private boolean _elementDefinition;\r
  43 \r
  44     /**\r
  45      * Field _nsPrefix.\r
  46      */\r
  47     private java.lang.String _nsPrefix;\r
  48 \r
  49     /**\r
  50      * Field _nsURI.\r
  51      */\r
  52     private java.lang.String _nsURI;\r
  53 \r
  54     /**\r
  55      * Field _xmlName.\r
  56      */\r
  57     private java.lang.String _xmlName;\r
  58 \r
  59 \r
  60       //----------------/\r
  61      //- Constructors -/\r
  62     //----------------/\r
  63 \r
  64     public AnnotationColoursDescriptor() {\r
  65         super();\r
  66         _nsURI = "www.jalview.org";\r
  67         _xmlName = "AnnotationColours";\r
  68         _elementDefinition = true;\r
  69         org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl  desc           = null;\r
  70         org.exolab.castor.mapping.FieldHandler             handler        = null;\r
  71         org.exolab.castor.xml.FieldValidator               fieldValidator = null;\r
  72         //-- initialize attribute descriptors\r
  73         \r
  74         //-- _aboveThreshold\r
  75         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_aboveThreshold", "aboveThreshold", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
  76         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
  77             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
  78                 throws IllegalStateException\r
  79             {\r
  80                 AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
  81                 if (!target.hasAboveThreshold()) { return null; }\r
  82                 return new java.lang.Integer(target.getAboveThreshold());\r
  83             }\r
  84             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
  85                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  86             {\r
  87                 try {\r
  88                     AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
  89                     // if null, use delete method for optional primitives \r
  90                     if (value == null) {\r
  91                         target.deleteAboveThreshold();\r
  92                         return;\r
  93                     }\r
  94                     target.setAboveThreshold( ((java.lang.Integer) value).intValue());\r
  95                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
  96                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
  97                 }\r
  98             }\r
  99             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 100                 return null;\r
 101             }\r
 102         };\r
 103         desc.setHandler(handler);\r
 104         desc.setMultivalued(false);\r
 105         addFieldDescriptor(desc);\r
 106         \r
 107         //-- validation code for: _aboveThreshold\r
 108         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 109         { //-- local scope\r
 110             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 111             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 112             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 113             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 114             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 115         }\r
 116         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 117         //-- _annotation\r
 118         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_annotation", "annotation", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 119         desc.setImmutable(true);\r
 120         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 121             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 122                 throws IllegalStateException\r
 123             {\r
 124                 AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 125                 return target.getAnnotation();\r
 126             }\r
 127             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 128                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 129             {\r
 130                 try {\r
 131                     AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 132                     target.setAnnotation( (java.lang.String) value);\r
 133                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 134                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 135                 }\r
 136             }\r
 137             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 138                 return null;\r
 139             }\r
 140         };\r
 141         desc.setHandler(handler);\r
 142         desc.setMultivalued(false);\r
 143         addFieldDescriptor(desc);\r
 144         \r
 145         //-- validation code for: _annotation\r
 146         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 147         { //-- local scope\r
 148             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 149             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 150             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 151             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 152         }\r
 153         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 154         //-- _minColour\r
 155         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_minColour", "minColour", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 156         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 157             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 158                 throws IllegalStateException\r
 159             {\r
 160                 AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 161                 if (!target.hasMinColour()) { return null; }\r
 162                 return new java.lang.Integer(target.getMinColour());\r
 163             }\r
 164             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 165                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 166             {\r
 167                 try {\r
 168                     AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 169                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 170                     if (value == null) {\r
 171                         target.deleteMinColour();\r
 172                         return;\r
 173                     }\r
 174                     target.setMinColour( ((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 175                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 176                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 177                 }\r
 178             }\r
 179             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 180                 return null;\r
 181             }\r
 182         };\r
 183         desc.setHandler(handler);\r
 184         desc.setMultivalued(false);\r
 185         addFieldDescriptor(desc);\r
 186         \r
 187         //-- validation code for: _minColour\r
 188         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 189         { //-- local scope\r
 190             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 191             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 192             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 193             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 194             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 195         }\r
 196         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 197         //-- _maxColour\r
 198         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_maxColour", "maxColour", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 199         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 200             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 201                 throws IllegalStateException\r
 202             {\r
 203                 AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 204                 if (!target.hasMaxColour()) { return null; }\r
 205                 return new java.lang.Integer(target.getMaxColour());\r
 206             }\r
 207             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 208                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 209             {\r
 210                 try {\r
 211                     AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 212                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 213                     if (value == null) {\r
 214                         target.deleteMaxColour();\r
 215                         return;\r
 216                     }\r
 217                     target.setMaxColour( ((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 218                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 219                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 220                 }\r
 221             }\r
 222             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 223                 return null;\r
 224             }\r
 225         };\r
 226         desc.setHandler(handler);\r
 227         desc.setMultivalued(false);\r
 228         addFieldDescriptor(desc);\r
 229         \r
 230         //-- validation code for: _maxColour\r
 231         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 232         { //-- local scope\r
 233             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 234             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 235             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 236             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 237             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 238         }\r
 239         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 240         //-- _colourScheme\r
 241         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_colourScheme", "colourScheme", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 242         desc.setImmutable(true);\r
 243         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 244             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 245                 throws IllegalStateException\r
 246             {\r
 247                 AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 248                 return target.getColourScheme();\r
 249             }\r
 250             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 251                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 252             {\r
 253                 try {\r
 254                     AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 255                     target.setColourScheme( (java.lang.String) value);\r
 256                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 257                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 258                 }\r
 259             }\r
 260             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 261                 return null;\r
 262             }\r
 263         };\r
 264         desc.setHandler(handler);\r
 265         desc.setMultivalued(false);\r
 266         addFieldDescriptor(desc);\r
 267         \r
 268         //-- validation code for: _colourScheme\r
 269         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 270         { //-- local scope\r
 271             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 272             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 273             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 274             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 275         }\r
 276         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 277         //-- _threshold\r
 278         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Float.TYPE, "_threshold", "threshold", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 279         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 280             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 281                 throws IllegalStateException\r
 282             {\r
 283                 AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 284                 if (!target.hasThreshold()) { return null; }\r
 285                 return new java.lang.Float(target.getThreshold());\r
 286             }\r
 287             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 288                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 289             {\r
 290                 try {\r
 291                     AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 292                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 293                     if (value == null) {\r
 294                         target.deleteThreshold();\r
 295                         return;\r
 296                     }\r
 297                     target.setThreshold( ((java.lang.Float) value).floatValue());\r
 298                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 299                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 300                 }\r
 301             }\r
 302             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 303                 return null;\r
 304             }\r
 305         };\r
 306         desc.setHandler(handler);\r
 307         desc.setMultivalued(false);\r
 308         addFieldDescriptor(desc);\r
 309         \r
 310         //-- validation code for: _threshold\r
 311         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 312         { //-- local scope\r
 313             org.exolab.castor.xml.validators.FloatValidator typeValidator;\r
 314             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.FloatValidator();\r
 315             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 316             typeValidator.setMinInclusive((float) -3.4028235E38);\r
 317             typeValidator.setMaxInclusive((float) 3.4028235E38);\r
 318         }\r
 319         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 320         //-- initialize element descriptors\r
 321         \r
 322     }\r
 323 \r
 324 \r
 325       //-----------/\r
 326      //- Methods -/\r
 327     //-----------/\r
 328 \r
 329     /**\r
 330      * Method getAccessMode.\r
 331      * \r
 332      * @return the access mode specified for this class.\r
 333      */\r
 334     public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode(\r
 335     ) {\r
 336         return null;\r
 337     }\r
 338 \r
 339     /**\r
 340      * Method getIdentity.\r
 341      * \r
 342      * @return the identity field, null if this class has no\r
 343      * identity.\r
 344      */\r
 345     public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity(\r
 346     ) {\r
 347         return super.getIdentity();\r
 348     }\r
 349 \r
 350     /**\r
 351      * Method getJavaClass.\r
 352      * \r
 353      * @return the Java class represented by this descriptor.\r
 354      */\r
 355     public java.lang.Class getJavaClass(\r
 356     ) {\r
 357         return jalview.schemabinding.version2.AnnotationColours.class;\r
 358     }\r
 359 \r
 360     /**\r
 361      * Method getNameSpacePrefix.\r
 362      * \r
 363      * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.\r
 364      */\r
 365     public java.lang.String getNameSpacePrefix(\r
 366     ) {\r
 367         return _nsPrefix;\r
 368     }\r
 369 \r
 370     /**\r
 371      * Method getNameSpaceURI.\r
 372      * \r
 373      * @return the namespace URI used when marshaling and\r
 374      * unmarshaling as XML.\r
 375      */\r
 376     public java.lang.String getNameSpaceURI(\r
 377     ) {\r
 378         return _nsURI;\r
 379     }\r
 380 \r
 381     /**\r
 382      * Method getValidator.\r
 383      * \r
 384      * @return a specific validator for the class described by this\r
 385      * ClassDescriptor.\r
 386      */\r
 387     public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator(\r
 388     ) {\r
 389         return this;\r
 390     }\r
 391 \r
 392     /**\r
 393      * Method getXMLName.\r
 394      * \r
 395      * @return the XML Name for the Class being described.\r
 396      */\r
 397     public java.lang.String getXMLName(\r
 398     ) {\r
 399         return _xmlName;\r
 400     }\r
 401 \r
 402     /**\r
 403      * Method isElementDefinition.\r
 404      * \r
 405      * @return true if XML schema definition of this Class is that\r
 406      * of a global\r
 407      * element or element with anonymous type definition.\r
 408      */\r
 409     public boolean isElementDefinition(\r
 410     ) {\r
 411         return _elementDefinition;\r
 412     }\r
 413 \r
 414 }\r