src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/AnnotationElementDescriptor.java

   1 /*******************************************************************************
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.1)
   3  * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10  *
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15  *
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.
  17  * If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  18  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  19  ******************************************************************************/
  20 /*
  21  * This class was automatically generated with
  22  * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML
  23  * Schema.
  24  * $Id$
  25  */
  26
  27 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;
  28
  29 //---------------------------------/
  30 //- Imported classes and packages -/
  31 //---------------------------------/
  32
  33 import jalview.schemabinding.version2.AnnotationElement;
  34
  35 /**
  36  * Class AnnotationElementDescriptor.
  37  *
  38  * @version $Revision$ $Date$
  39  */
  40 public class AnnotationElementDescriptor extends
  41         org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl
  42 {
  43
  44   // --------------------------/
  45   // - Class/Member Variables -/
  46   // --------------------------/
  47
  48   /**
  49    * Field _elementDefinition.
  50    */
  51   private boolean _elementDefinition;
  52
  53   /**
  54    * Field _nsPrefix.
  55    */
  56   private java.lang.String _nsPrefix;
  57
  58   /**
  59    * Field _nsURI.
  60    */
  61   private java.lang.String _nsURI;
  62
  63   /**
  64    * Field _xmlName.
  65    */
  66   private java.lang.String _xmlName;
  67
  68   // ----------------/
  69   // - Constructors -/
  70   // ----------------/
  71
  72   public AnnotationElementDescriptor()
  73   {
  74     super();
  75     _nsURI = "www.vamsas.ac.uk/jalview/version2";
  76     _xmlName = "annotationElement";
  77     _elementDefinition = true;
  78
  79     // -- set grouping compositor
  80     setCompositorAsSequence();
  81     org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl desc = null;
  82     org.exolab.castor.mapping.FieldHandler handler = null;
  83     org.exolab.castor.xml.FieldValidator fieldValidator = null;
  84     // -- initialize attribute descriptors
  85
  86     // -- _position
  87     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
  88             java.lang.Integer.TYPE, "_position", "position",
  89             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
  90     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
  91     {
  92       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
  93               throws IllegalStateException
  94       {
  95         AnnotationElement target = (AnnotationElement) object;
  96         if (!target.hasPosition())
  97         {
  98           return null;
  99         }
 100         return new java.lang.Integer(target.getPosition());
 101       }
 102
 103       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 104               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 105       {
 106         try
 107         {
 108           AnnotationElement target = (AnnotationElement) object;
 109           // ignore null values for non optional primitives
 110           if (value == null)
 111           {
 112             return;
 113           }
 114
 115           target.setPosition(((java.lang.Integer) value).intValue());
 116         } catch (java.lang.Exception ex)
 117         {
 118           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 119         }
 120       }
 121
 122       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 123       {
 124         return null;
 125       }
 126     };
 127     desc.setHandler(handler);
 128     desc.setRequired(true);
 129     desc.setMultivalued(false);
 130     addFieldDescriptor(desc);
 131
 132     // -- validation code for: _position
 133     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 134     fieldValidator.setMinOccurs(1);
 135     { // -- local scope
 136       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 137       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 138       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 139       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 140       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 141     }
 142     desc.setValidator(fieldValidator);
 143     // -- _colour
 144     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 145             java.lang.Integer.TYPE, "_colour", "colour",
 146             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 147     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 148     {
 149       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 150               throws IllegalStateException
 151       {
 152         AnnotationElement target = (AnnotationElement) object;
 153         if (!target.hasColour())
 154         {
 155           return null;
 156         }
 157         return new java.lang.Integer(target.getColour());
 158       }
 159
 160       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 161               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 162       {
 163         try
 164         {
 165           AnnotationElement target = (AnnotationElement) object;
 166           // if null, use delete method for optional primitives
 167           if (value == null)
 168           {
 169             target.deleteColour();
 170             return;
 171           }
 172           target.setColour(((java.lang.Integer) value).intValue());
 173         } catch (java.lang.Exception ex)
 174         {
 175           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 176         }
 177       }
 178
 179       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 180       {
 181         return null;
 182       }
 183     };
 184     desc.setHandler(handler);
 185     desc.setMultivalued(false);
 186     addFieldDescriptor(desc);
 187
 188     // -- validation code for: _colour
 189     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 190     { // -- local scope
 191       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 192       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 193       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 194       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 195       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 196     }
 197     desc.setValidator(fieldValidator);
 198     // -- initialize element descriptors
 199
 200     // -- _displayCharacter
 201     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 202             java.lang.String.class, "_displayCharacter",
 203             "displayCharacter", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
 204     desc.setImmutable(true);
 205     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 206     {
 207       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 208               throws IllegalStateException
 209       {
 210         AnnotationElement target = (AnnotationElement) object;
 211         return target.getDisplayCharacter();
 212       }
 213
 214       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 215               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 216       {
 217         try
 218         {
 219           AnnotationElement target = (AnnotationElement) object;
 220           target.setDisplayCharacter((java.lang.String) value);
 221         } catch (java.lang.Exception ex)
 222         {
 223           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 224         }
 225       }
 226
 227       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 228       {
 229         return null;
 230       }
 231     };
 232     desc.setHandler(handler);
 233     desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");
 234     desc.setMultivalued(false);
 235     addFieldDescriptor(desc);
 236
 237     // -- validation code for: _displayCharacter
 238     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 239     { // -- local scope
 240       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 241       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 242       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 243       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 244     }
 245     desc.setValidator(fieldValidator);
 246     // -- _description
 247     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 248             java.lang.String.class, "_description", "description",
 249             org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
 250     desc.setImmutable(true);
 251     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 252     {
 253       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 254               throws IllegalStateException
 255       {
 256         AnnotationElement target = (AnnotationElement) object;
 257         return target.getDescription();
 258       }
 259
 260       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 261               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 262       {
 263         try
 264         {
 265           AnnotationElement target = (AnnotationElement) object;
 266           target.setDescription((java.lang.String) value);
 267         } catch (java.lang.Exception ex)
 268         {
 269           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 270         }
 271       }
 272
 273       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 274       {
 275         return null;
 276       }
 277     };
 278     desc.setHandler(handler);
 279     desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");
 280     desc.setMultivalued(false);
 281     addFieldDescriptor(desc);
 282
 283     // -- validation code for: _description
 284     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 285     { // -- local scope
 286       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 287       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 288       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 289       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 290     }
 291     desc.setValidator(fieldValidator);
 292     // -- _secondaryStructure
 293     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 294             java.lang.String.class, "_secondaryStructure",
 295             "secondaryStructure", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
 296     desc.setImmutable(true);
 297     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 298     {
 299       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 300               throws IllegalStateException
 301       {
 302         AnnotationElement target = (AnnotationElement) object;
 303         return target.getSecondaryStructure();
 304       }
 305
 306       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 307               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 308       {
 309         try
 310         {
 311           AnnotationElement target = (AnnotationElement) object;
 312           target.setSecondaryStructure((java.lang.String) value);
 313         } catch (java.lang.Exception ex)
 314         {
 315           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 316         }
 317       }
 318
 319       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 320       {
 321         return null;
 322       }
 323     };
 324     desc.setHandler(handler);
 325     desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");
 326     desc.setMultivalued(false);
 327     addFieldDescriptor(desc);
 328
 329     // -- validation code for: _secondaryStructure
 330     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 331     { // -- local scope
 332       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 333       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 334       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 335       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 336       typeValidator.setLength(1);
 337     }
 338     desc.setValidator(fieldValidator);
 339     // -- _value
 340     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 341             java.lang.Float.TYPE, "_value", "value",
 342             org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
 343     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 344     {
 345       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 346               throws IllegalStateException
 347       {
 348         AnnotationElement target = (AnnotationElement) object;
 349         if (!target.hasValue())
 350         {
 351           return null;
 352         }
 353         return new java.lang.Float(target.getValue());
 354       }
 355
 356       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 357               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 358       {
 359         try
 360         {
 361           AnnotationElement target = (AnnotationElement) object;
 362           // if null, use delete method for optional primitives
 363           if (value == null)
 364           {
 365             target.deleteValue();
 366             return;
 367           }
 368           target.setValue(((java.lang.Float) value).floatValue());
 369         } catch (java.lang.Exception ex)
 370         {
 371           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 372         }
 373       }
 374
 375       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 376       {
 377         return null;
 378       }
 379     };
 380     desc.setHandler(handler);
 381     desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");
 382     desc.setMultivalued(false);
 383     addFieldDescriptor(desc);
 384
 385     // -- validation code for: _value
 386     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 387     { // -- local scope
 388       org.exolab.castor.xml.validators.FloatValidator typeValidator;
 389       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.FloatValidator();
 390       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 391       typeValidator.setMinInclusive((float) -3.4028235E38);
 392       typeValidator.setMaxInclusive((float) 3.4028235E38);
 393     }
 394     desc.setValidator(fieldValidator);
 395   }
 396
 397   // -----------/
 398   // - Methods -/
 399   // -----------/
 400
 401   /**
 402    * Method getAccessMode.
 403    *
 404    * @return the access mode specified for this class.
 405    */
 406   public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()
 407   {
 408     return null;
 409   }
 410
 411   /**
 412    * Method getIdentity.
 413    *
 414    * @return the identity field, null if this class has no identity.
 415    */
 416   public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()
 417   {
 418     return super.getIdentity();
 419   }
 420
 421   /**
 422    * Method getJavaClass.
 423    *
 424    * @return the Java class represented by this descriptor.
 425    */
 426   public java.lang.Class getJavaClass()
 427   {
 428     return jalview.schemabinding.version2.AnnotationElement.class;
 429   }
 430
 431   /**
 432    * Method getNameSpacePrefix.
 433    *
 434    * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.
 435    */
 436   public java.lang.String getNameSpacePrefix()
 437   {
 438     return _nsPrefix;
 439   }
 440
 441   /**
 442    * Method getNameSpaceURI.
 443    *
 444    * @return the namespace URI used when marshaling and unmarshaling as XML.
 445    */
 446   public java.lang.String getNameSpaceURI()
 447   {
 448     return _nsURI;
 449   }
 450
 451   /**
 452    * Method getValidator.
 453    *
 454    * @return a specific validator for the class described by this
 455    *         ClassDescriptor.
 456    */
 457   public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()
 458   {
 459     return this;
 460   }
 461
 462   /**
 463    * Method getXMLName.
 464    *
 465    * @return the XML Name for the Class being described.
 466    */
 467   public java.lang.String getXMLName()
 468   {
 469     return _xmlName;
 470   }
 471
 472   /**
 473    * Method isElementDefinition.
 474    *
 475    * @return true if XML schema definition of this Class is that of a global
 476    *         element or element with anonymous type definition.
 477    */
 478   public boolean isElementDefinition()
 479   {
 480     return _elementDefinition;
 481   }
 482
 483 }