src/jalview/ws/dbsources/EbiFileRetrievedProxy.java

   1 /*
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  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
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  20  */
  21 package jalview.ws.dbsources;
  22
  23 import java.io.BufferedReader;
  24 import java.io.File;
  25 import java.io.FileReader;
  26 import jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxyImpl;
  27
  28 public abstract class EbiFileRetrievedProxy extends DbSourceProxyImpl
  29 {
  30
  31   /**
  32    * temp path to retrieved file
  33    */
  34   protected String file = null;
  35
  36   public StringBuffer getRawRecords()
  37   {
  38     if (file == null)
  39       return null;
  40     StringBuffer bf = null;
  41     try
  42     {
  43       File f = new File(file);
  44       if (f.exists())
  45       {
  46         bf = new StringBuffer();
  47         BufferedReader breader = new BufferedReader(new FileReader(f));
  48         String line = null;
  49         while (breader.ready() && (line = breader.readLine()) != null)
  50         {
  51           bf.append(line);
  52         }
  53         breader.close();
  54       }
  55     } catch (Exception e)
  56     {
  57       System.err.println("Warning: problems reading temp file " + file);
  58       return null;
  59     }
  60     return bf;
  61   }
  62
  63 }