src/jalview/ws/rest/AlignmentProcessor.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.1)
   3  * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
   4  *
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  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15  *
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  17  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  18  */
  19 package jalview.ws.rest;
  20
  21 import jalview.datamodel.AlignmentI;
  22
  23 public interface AlignmentProcessor
  24 {
  25   /**
  26    * prepare the context alignment for this input
  27    *
  28    * @param al
  29    *          - alignment to be processed
  30    * @return al or a new alignment with appropriate attributes/order for input
  31    */
  32   public AlignmentI prepareAlignment(AlignmentI al);
  33 }