src/jalview/xml/binding/embl/EntryType.java

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   6 //
   7
   8 package jalview.xml.binding.embl;
   9
  10 import java.math.BigInteger;
  11 import java.util.ArrayList;
  12 import java.util.List;
  13 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessType;
  14 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessorType;
  15 import javax.xml.bind.annotation.XmlAttribute;
  16 import javax.xml.bind.annotation.XmlElement;
  17 import javax.xml.bind.annotation.XmlElements;
  18 import javax.xml.bind.annotation.XmlSchemaType;
  19 import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
  20 import javax.xml.datatype.XMLGregorianCalendar;
  21
  22 /**
  23  * <p>
  24  * Java class for EntryType complex type.
  25  *
  26  * <p>
  27  * The following schema fragment specifies the expected content contained within
  28  * this class.
  29  *
  30  * <pre>
  31  * &lt;complexType name="EntryType">
  32  *   &lt;complexContent>
  33  *     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
  34  *       &lt;sequence>
  35  *         &lt;element name="secondaryAccession" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" maxOccurs="unbounded" minOccurs="0"/>
  36  *         &lt;element name="projectAccession" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" maxOccurs="unbounded" minOccurs="0"/>
  37  *         &lt;element name="description" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string"/>
  38  *         &lt;element name="comment" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" minOccurs="0"/>
  39  *         &lt;element name="keyword" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" maxOccurs="unbounded" minOccurs="0"/>
  40  *         &lt;element name="reference" maxOccurs="unbounded" minOccurs="0">
  41  *           &lt;complexType>
  42  *             &lt;complexContent>
  43  *               &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
  44  *                 &lt;sequence>
  45  *                   &lt;element name="title" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" minOccurs="0"/>
  46  *                   &lt;element name="author" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" maxOccurs="unbounded" minOccurs="0"/>
  47  *                   &lt;element name="applicant" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" maxOccurs="unbounded" minOccurs="0"/>
  48  *                   &lt;element name="consortium" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" minOccurs="0"/>
  49  *                   &lt;element name="submissionDate" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}date" minOccurs="0"/>
  50  *                   &lt;element name="journal" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" minOccurs="0"/>
  51  *                   &lt;element name="year" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" minOccurs="0"/>
  52  *                   &lt;element name="volume" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" minOccurs="0"/>
  53  *                   &lt;element name="issue" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" minOccurs="0"/>
  54  *                   &lt;element name="firstPage" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" minOccurs="0"/>
  55  *                   &lt;element name="lastPage" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" minOccurs="0"/>
  56  *                   &lt;element name="comment" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" minOccurs="0"/>
  57  *                   &lt;element name="referenceLocation" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" minOccurs="0"/>
  58  *                   &lt;element name="xref" type="{}XrefType" maxOccurs="unbounded" minOccurs="0"/>
  59  *                 &lt;/sequence>
  60  *                 &lt;attribute name="type" use="required">
  61  *                   &lt;simpleType>
  62  *                     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string">
  63  *                       &lt;enumeration value="submission"/>
  64  *                       &lt;enumeration value="book"/>
  65  *                       &lt;enumeration value="article"/>
  66  *                       &lt;enumeration value="patent"/>
  67  *                       &lt;enumeration value="thesis"/>
  68  *                       &lt;enumeration value="unpublished"/>
  69  *                     &lt;/restriction>
  70  *                   &lt;/simpleType>
  71  *                 &lt;/attribute>
  72  *                 &lt;attribute name="number" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
  73  *                 &lt;attribute name="location" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
  74  *               &lt;/restriction>
  75  *             &lt;/complexContent>
  76  *           &lt;/complexType>
  77  *         &lt;/element>
  78  *         &lt;element name="xref" type="{}XrefType" maxOccurs="unbounded" minOccurs="0"/>
  79  *         &lt;element name="feature" maxOccurs="unbounded" minOccurs="0">
  80  *           &lt;complexType>
  81  *             &lt;complexContent>
  82  *               &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
  83  *                 &lt;sequence>
  84  *                   &lt;element name="taxon" minOccurs="0">
  85  *                     &lt;complexType>
  86  *                       &lt;complexContent>
  87  *                         &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
  88  *                           &lt;sequence>
  89  *                             &lt;element name="lineage" minOccurs="0">
  90  *                               &lt;complexType>
  91  *                                 &lt;complexContent>
  92  *                                   &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
  93  *                                     &lt;sequence>
  94  *                                       &lt;element name="taxon" maxOccurs="unbounded">
  95  *                                         &lt;complexType>
  96  *                                           &lt;complexContent>
  97  *                                             &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
  98  *                                               &lt;attribute name="scientificName" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
  99  *                                             &lt;/restriction>
 100  *                                           &lt;/complexContent>
 101  *                                         &lt;/complexType>
 102  *                                       &lt;/element>
 103  *                                     &lt;/sequence>
 104  *                                   &lt;/restriction>
 105  *                                 &lt;/complexContent>
 106  *                               &lt;/complexType>
 107  *                             &lt;/element>
 108  *                           &lt;/sequence>
 109  *                           &lt;attribute name="scientificName" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
 110  *                           &lt;attribute name="commonName" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
 111  *                           &lt;attribute name="taxId" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 112  *                         &lt;/restriction>
 113  *                       &lt;/complexContent>
 114  *                     &lt;/complexType>
 115  *                   &lt;/element>
 116  *                   &lt;element name="xref" type="{}XrefType" maxOccurs="unbounded" minOccurs="0"/>
 117  *                   &lt;element name="qualifier" maxOccurs="unbounded" minOccurs="0">
 118  *                     &lt;complexType>
 119  *                       &lt;complexContent>
 120  *                         &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
 121  *                           &lt;sequence>
 122  *                             &lt;element name="value" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" minOccurs="0"/>
 123  *                           &lt;/sequence>
 124  *                           &lt;attribute name="name" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
 125  *                         &lt;/restriction>
 126  *                       &lt;/complexContent>
 127  *                     &lt;/complexType>
 128  *                   &lt;/element>
 129  *                 &lt;/sequence>
 130  *                 &lt;attribute name="name" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
 131  *                 &lt;attribute name="location" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
 132  *               &lt;/restriction>
 133  *             &lt;/complexContent>
 134  *           &lt;/complexType>
 135  *         &lt;/element>
 136  *         &lt;element name="assembly" minOccurs="0">
 137  *           &lt;complexType>
 138  *             &lt;complexContent>
 139  *               &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
 140  *                 &lt;sequence>
 141  *                   &lt;element name="range" maxOccurs="unbounded">
 142  *                     &lt;complexType>
 143  *                       &lt;complexContent>
 144  *                         &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
 145  *                           &lt;attribute name="begin" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 146  *                           &lt;attribute name="end" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 147  *                           &lt;attribute name="primaryBegin" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 148  *                           &lt;attribute name="primaryEnd" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 149  *                           &lt;attribute name="accession" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
 150  *                           &lt;attribute name="version" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 151  *                           &lt;attribute name="complement" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}boolean" default="false" />
 152  *                         &lt;/restriction>
 153  *                       &lt;/complexContent>
 154  *                     &lt;/complexType>
 155  *                   &lt;/element>
 156  *                 &lt;/sequence>
 157  *               &lt;/restriction>
 158  *             &lt;/complexContent>
 159  *           &lt;/complexType>
 160  *         &lt;/element>
 161  *         &lt;element name="contig" minOccurs="0">
 162  *           &lt;complexType>
 163  *             &lt;complexContent>
 164  *               &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
 165  *                 &lt;sequence>
 166  *                   &lt;choice maxOccurs="unbounded" minOccurs="0">
 167  *                     &lt;element name="range">
 168  *                       &lt;complexType>
 169  *                         &lt;complexContent>
 170  *                           &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
 171  *                             &lt;attribute name="begin" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 172  *                             &lt;attribute name="end" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 173  *                             &lt;attribute name="primaryBegin" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 174  *                             &lt;attribute name="primaryEnd" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 175  *                             &lt;attribute name="accession" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
 176  *                             &lt;attribute name="version" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 177  *                             &lt;attribute name="complement" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}boolean" default="false" />
 178  *                           &lt;/restriction>
 179  *                         &lt;/complexContent>
 180  *                       &lt;/complexType>
 181  *                     &lt;/element>
 182  *                     &lt;element name="gap">
 183  *                       &lt;complexType>
 184  *                         &lt;complexContent>
 185  *                           &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
 186  *                             &lt;attribute name="begin" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 187  *                             &lt;attribute name="end" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 188  *                             &lt;attribute name="length" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 189  *                             &lt;attribute name="unknownLength" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}boolean" default="false" />
 190  *                           &lt;/restriction>
 191  *                         &lt;/complexContent>
 192  *                       &lt;/complexType>
 193  *                     &lt;/element>
 194  *                   &lt;/choice>
 195  *                 &lt;/sequence>
 196  *               &lt;/restriction>
 197  *             &lt;/complexContent>
 198  *           &lt;/complexType>
 199  *         &lt;/element>
 200  *         &lt;element name="sequence" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" minOccurs="0"/>
 201  *       &lt;/sequence>
 202  *       &lt;attribute name="accession" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
 203  *       &lt;attribute name="version" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 204  *       &lt;attribute name="entryVersion" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 205  *       &lt;attribute name="dataClass" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
 206  *       &lt;attribute name="taxonomicDivision" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
 207  *       &lt;attribute name="moleculeType" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
 208  *       &lt;attribute name="sequenceLength" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 209  *       &lt;attribute name="topology" use="required">
 210  *         &lt;simpleType>
 211  *           &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string">
 212  *             &lt;enumeration value="circular"/>
 213  *             &lt;enumeration value="linear"/>
 214  *           &lt;/restriction>
 215  *         &lt;/simpleType>
 216  *       &lt;/attribute>
 217  *       &lt;attribute name="firstPublic" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}date" />
 218  *       &lt;attribute name="firstPublicRelease" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 219  *       &lt;attribute name="lastUpdated" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}date" />
 220  *       &lt;attribute name="lastUpdatedRelease" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 221  *     &lt;/restriction>
 222  *   &lt;/complexContent>
 223  * &lt;/complexType>
 224  * </pre>
 225  *
 226  *
 227  */
 228 @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
 229 @XmlType(
 230   name = "EntryType",
 231   propOrder =
 232   { "secondaryAccession", "projectAccession", "description", "comment",
 233       "keyword", "reference", "xref", "feature", "assembly", "contig",
 234       "sequence" })
 235 public class EntryType
 236 {
 237
 238   protected List<String> secondaryAccession;
 239
 240   protected List<String> projectAccession;
 241
 242   @XmlElement(required = true)
 243   protected String description;
 244
 245   protected String comment;
 246
 247   protected List<String> keyword;
 248
 249   protected List<EntryType.Reference> reference;
 250
 251   protected List<XrefType> xref;
 252
 253   protected List<EntryType.Feature> feature;
 254
 255   protected EntryType.Assembly assembly;
 256
 257   protected EntryType.Contig contig;
 258
 259   protected String sequence;
 260
 261   @XmlAttribute(name = "accession", required = true)
 262   protected String accession;
 263
 264   @XmlAttribute(name = "version", required = true)
 265   protected BigInteger version;
 266
 267   @XmlAttribute(name = "entryVersion")
 268   protected BigInteger entryVersion;
 269
 270   @XmlAttribute(name = "dataClass", required = true)
 271   protected String dataClass;
 272
 273   @XmlAttribute(name = "taxonomicDivision", required = true)
 274   protected String taxonomicDivision;
 275
 276   @XmlAttribute(name = "moleculeType", required = true)
 277   protected String moleculeType;
 278
 279   @XmlAttribute(name = "sequenceLength", required = true)
 280   protected BigInteger sequenceLength;
 281
 282   @XmlAttribute(name = "topology", required = true)
 283   protected String topology;
 284
 285   @XmlAttribute(name = "firstPublic")
 286   @XmlSchemaType(name = "date")
 287   protected XMLGregorianCalendar firstPublic;
 288
 289   @XmlAttribute(name = "firstPublicRelease")
 290   protected BigInteger firstPublicRelease;
 291
 292   @XmlAttribute(name = "lastUpdated")
 293   @XmlSchemaType(name = "date")
 294   protected XMLGregorianCalendar lastUpdated;
 295
 296   @XmlAttribute(name = "lastUpdatedRelease")
 297   protected BigInteger lastUpdatedRelease;
 298
 299   /**
 300    * Gets the value of the secondaryAccession property.
 301    *
 302    * <p>
 303    * This accessor method returns a reference to the live list, not a snapshot.
 304    * Therefore any modification you make to the returned list will be present
 305    * inside the JAXB object. This is why there is not a <CODE>set</CODE> method
 306    * for the secondaryAccession property.
 307    *
 308    * <p>
 309    * For example, to add a new item, do as follows:
 310    *
 311    * <pre>
 312    * getSecondaryAccession().add(newItem);
 313    * </pre>
 314    *
 315    *
 316    * <p>
 317    * Objects of the following type(s) are allowed in the list {@link String }
 318    *
 319    *
 320    */
 321   public List<String> getSecondaryAccession()
 322   {
 323     if (secondaryAccession == null)
 324     {
 325       secondaryAccession = new ArrayList<String>();
 326     }
 327     return this.secondaryAccession;
 328   }
 329
 330   /**
 331    * Gets the value of the projectAccession property.
 332    *
 333    * <p>
 334    * This accessor method returns a reference to the live list, not a snapshot.
 335    * Therefore any modification you make to the returned list will be present
 336    * inside the JAXB object. This is why there is not a <CODE>set</CODE> method
 337    * for the projectAccession property.
 338    *
 339    * <p>
 340    * For example, to add a new item, do as follows:
 341    *
 342    * <pre>
 343    * getProjectAccession().add(newItem);
 344    * </pre>
 345    *
 346    *
 347    * <p>
 348    * Objects of the following type(s) are allowed in the list {@link String }
 349    *
 350    *
 351    */
 352   public List<String> getProjectAccession()
 353   {
 354     if (projectAccession == null)
 355     {
 356       projectAccession = new ArrayList<String>();
 357     }
 358     return this.projectAccession;
 359   }
 360
 361   /**
 362    * Gets the value of the description property.
 363    *
 364    * @return possible object is {@link String }
 365    *
 366    */
 367   public String getDescription()
 368   {
 369     return description;
 370   }
 371
 372   /**
 373    * Sets the value of the description property.
 374    *
 375    * @param value
 376    *          allowed object is {@link String }
 377    *
 378    */
 379   public void setDescription(String value)
 380   {
 381     this.description = value;
 382   }
 383
 384   /**
 385    * Gets the value of the comment property.
 386    *
 387    * @return possible object is {@link String }
 388    *
 389    */
 390   public String getComment()
 391   {
 392     return comment;
 393   }
 394
 395   /**
 396    * Sets the value of the comment property.
 397    *
 398    * @param value
 399    *          allowed object is {@link String }
 400    *
 401    */
 402   public void setComment(String value)
 403   {
 404     this.comment = value;
 405   }
 406
 407   /**
 408    * Gets the value of the keyword property.
 409    *
 410    * <p>
 411    * This accessor method returns a reference to the live list, not a snapshot.
 412    * Therefore any modification you make to the returned list will be present
 413    * inside the JAXB object. This is why there is not a <CODE>set</CODE> method
 414    * for the keyword property.
 415    *
 416    * <p>
 417    * For example, to add a new item, do as follows:
 418    *
 419    * <pre>
 420    * getKeyword().add(newItem);
 421    * </pre>
 422    *
 423    *
 424    * <p>
 425    * Objects of the following type(s) are allowed in the list {@link String }
 426    *
 427    *
 428    */
 429   public List<String> getKeyword()
 430   {
 431     if (keyword == null)
 432     {
 433       keyword = new ArrayList<String>();
 434     }
 435     return this.keyword;
 436   }
 437
 438   /**
 439    * Gets the value of the reference property.
 440    *
 441    * <p>
 442    * This accessor method returns a reference to the live list, not a snapshot.
 443    * Therefore any modification you make to the returned list will be present
 444    * inside the JAXB object. This is why there is not a <CODE>set</CODE> method
 445    * for the reference property.
 446    *
 447    * <p>
 448    * For example, to add a new item, do as follows:
 449    *
 450    * <pre>
 451    * getReference().add(newItem);
 452    * </pre>
 453    *
 454    *
 455    * <p>
 456    * Objects of the following type(s) are allowed in the list
 457    * {@link EntryType.Reference }
 458    *
 459    *
 460    */
 461   public List<EntryType.Reference> getReference()
 462   {
 463     if (reference == null)
 464     {
 465       reference = new ArrayList<EntryType.Reference>();
 466     }
 467     return this.reference;
 468   }
 469
 470   /**
 471    * Gets the value of the xref property.
 472    *
 473    * <p>
 474    * This accessor method returns a reference to the live list, not a snapshot.
 475    * Therefore any modification you make to the returned list will be present
 476    * inside the JAXB object. This is why there is not a <CODE>set</CODE> method
 477    * for the xref property.
 478    *
 479    * <p>
 480    * For example, to add a new item, do as follows:
 481    *
 482    * <pre>
 483    * getXref().add(newItem);
 484    * </pre>
 485    *
 486    *
 487    * <p>
 488    * Objects of the following type(s) are allowed in the list {@link XrefType }
 489    *
 490    *
 491    */
 492   public List<XrefType> getXref()
 493   {
 494     if (xref == null)
 495     {
 496       xref = new ArrayList<XrefType>();
 497     }
 498     return this.xref;
 499   }
 500
 501   /**
 502    * Gets the value of the feature property.
 503    *
 504    * <p>
 505    * This accessor method returns a reference to the live list, not a snapshot.
 506    * Therefore any modification you make to the returned list will be present
 507    * inside the JAXB object. This is why there is not a <CODE>set</CODE> method
 508    * for the feature property.
 509    *
 510    * <p>
 511    * For example, to add a new item, do as follows:
 512    *
 513    * <pre>
 514    * getFeature().add(newItem);
 515    * </pre>
 516    *
 517    *
 518    * <p>
 519    * Objects of the following type(s) are allowed in the list
 520    * {@link EntryType.Feature }
 521    *
 522    *
 523    */
 524   public List<EntryType.Feature> getFeature()
 525   {
 526     if (feature == null)
 527     {
 528       feature = new ArrayList<EntryType.Feature>();
 529     }
 530     return this.feature;
 531   }
 532
 533   /**
 534    * Gets the value of the assembly property.
 535    *
 536    * @return possible object is {@link EntryType.Assembly }
 537    *
 538    */
 539   public EntryType.Assembly getAssembly()
 540   {
 541     return assembly;
 542   }
 543
 544   /**
 545    * Sets the value of the assembly property.
 546    *
 547    * @param value
 548    *          allowed object is {@link EntryType.Assembly }
 549    *
 550    */
 551   public void setAssembly(EntryType.Assembly value)
 552   {
 553     this.assembly = value;
 554   }
 555
 556   /**
 557    * Gets the value of the contig property.
 558    *
 559    * @return possible object is {@link EntryType.Contig }
 560    *
 561    */
 562   public EntryType.Contig getContig()
 563   {
 564     return contig;
 565   }
 566
 567   /**
 568    * Sets the value of the contig property.
 569    *
 570    * @param value
 571    *          allowed object is {@link EntryType.Contig }
 572    *
 573    */
 574   public void setContig(EntryType.Contig value)
 575   {
 576     this.contig = value;
 577   }
 578
 579   /**
 580    * Gets the value of the sequence property.
 581    *
 582    * @return possible object is {@link String }
 583    *
 584    */
 585   public String getSequence()
 586   {
 587     return sequence;
 588   }
 589
 590   /**
 591    * Sets the value of the sequence property.
 592    *
 593    * @param value
 594    *          allowed object is {@link String }
 595    *
 596    */
 597   public void setSequence(String value)
 598   {
 599     this.sequence = value;
 600   }
 601
 602   /**
 603    * Gets the value of the accession property.
 604    *
 605    * @return possible object is {@link String }
 606    *
 607    */
 608   public String getAccession()
 609   {
 610     return accession;
 611   }
 612
 613   /**
 614    * Sets the value of the accession property.
 615    *
 616    * @param value
 617    *          allowed object is {@link String }
 618    *
 619    */
 620   public void setAccession(String value)
 621   {
 622     this.accession = value;
 623   }
 624
 625   /**
 626    * Gets the value of the version property.
 627    *
 628    * @return possible object is {@link BigInteger }
 629    *
 630    */
 631   public BigInteger getVersion()
 632   {
 633     return version;
 634   }
 635
 636   /**
 637    * Sets the value of the version property.
 638    *
 639    * @param value
 640    *          allowed object is {@link BigInteger }
 641    *
 642    */
 643   public void setVersion(BigInteger value)
 644   {
 645     this.version = value;
 646   }
 647
 648   /**
 649    * Gets the value of the entryVersion property.
 650    *
 651    * @return possible object is {@link BigInteger }
 652    *
 653    */
 654   public BigInteger getEntryVersion()
 655   {
 656     return entryVersion;
 657   }
 658
 659   /**
 660    * Sets the value of the entryVersion property.
 661    *
 662    * @param value
 663    *          allowed object is {@link BigInteger }
 664    *
 665    */
 666   public void setEntryVersion(BigInteger value)
 667   {
 668     this.entryVersion = value;
 669   }
 670
 671   /**
 672    * Gets the value of the dataClass property.
 673    *
 674    * @return possible object is {@link String }
 675    *
 676    */
 677   public String getDataClass()
 678   {
 679     return dataClass;
 680   }
 681
 682   /**
 683    * Sets the value of the dataClass property.
 684    *
 685    * @param value
 686    *          allowed object is {@link String }
 687    *
 688    */
 689   public void setDataClass(String value)
 690   {
 691     this.dataClass = value;
 692   }
 693
 694   /**
 695    * Gets the value of the taxonomicDivision property.
 696    *
 697    * @return possible object is {@link String }
 698    *
 699    */
 700   public String getTaxonomicDivision()
 701   {
 702     return taxonomicDivision;
 703   }
 704
 705   /**
 706    * Sets the value of the taxonomicDivision property.
 707    *
 708    * @param value
 709    *          allowed object is {@link String }
 710    *
 711    */
 712   public void setTaxonomicDivision(String value)
 713   {
 714     this.taxonomicDivision = value;
 715   }
 716
 717   /**
 718    * Gets the value of the moleculeType property.
 719    *
 720    * @return possible object is {@link String }
 721    *
 722    */
 723   public String getMoleculeType()
 724   {
 725     return moleculeType;
 726   }
 727
 728   /**
 729    * Sets the value of the moleculeType property.
 730    *
 731    * @param value
 732    *          allowed object is {@link String }
 733    *
 734    */
 735   public void setMoleculeType(String value)
 736   {
 737     this.moleculeType = value;
 738   }
 739
 740   /**
 741    * Gets the value of the sequenceLength property.
 742    *
 743    * @return possible object is {@link BigInteger }
 744    *
 745    */
 746   public BigInteger getSequenceLength()
 747   {
 748     return sequenceLength;
 749   }
 750
 751   /**
 752    * Sets the value of the sequenceLength property.
 753    *
 754    * @param value
 755    *          allowed object is {@link BigInteger }
 756    *
 757    */
 758   public void setSequenceLength(BigInteger value)
 759   {
 760     this.sequenceLength = value;
 761   }
 762
 763   /**
 764    * Gets the value of the topology property.
 765    *
 766    * @return possible object is {@link String }
 767    *
 768    */
 769   public String getTopology()
 770   {
 771     return topology;
 772   }
 773
 774   /**
 775    * Sets the value of the topology property.
 776    *
 777    * @param value
 778    *          allowed object is {@link String }
 779    *
 780    */
 781   public void setTopology(String value)
 782   {
 783     this.topology = value;
 784   }
 785
 786   /**
 787    * Gets the value of the firstPublic property.
 788    *
 789    * @return possible object is {@link XMLGregorianCalendar }
 790    *
 791    */
 792   public XMLGregorianCalendar getFirstPublic()
 793   {
 794     return firstPublic;
 795   }
 796
 797   /**
 798    * Sets the value of the firstPublic property.
 799    *
 800    * @param value
 801    *          allowed object is {@link XMLGregorianCalendar }
 802    *
 803    */
 804   public void setFirstPublic(XMLGregorianCalendar value)
 805   {
 806     this.firstPublic = value;
 807   }
 808
 809   /**
 810    * Gets the value of the firstPublicRelease property.
 811    *
 812    * @return possible object is {@link BigInteger }
 813    *
 814    */
 815   public BigInteger getFirstPublicRelease()
 816   {
 817     return firstPublicRelease;
 818   }
 819
 820   /**
 821    * Sets the value of the firstPublicRelease property.
 822    *
 823    * @param value
 824    *          allowed object is {@link BigInteger }
 825    *
 826    */
 827   public void setFirstPublicRelease(BigInteger value)
 828   {
 829     this.firstPublicRelease = value;
 830   }
 831
 832   /**
 833    * Gets the value of the lastUpdated property.
 834    *
 835    * @return possible object is {@link XMLGregorianCalendar }
 836    *
 837    */
 838   public XMLGregorianCalendar getLastUpdated()
 839   {
 840     return lastUpdated;
 841   }
 842
 843   /**
 844    * Sets the value of the lastUpdated property.
 845    *
 846    * @param value
 847    *          allowed object is {@link XMLGregorianCalendar }
 848    *
 849    */
 850   public void setLastUpdated(XMLGregorianCalendar value)
 851   {
 852     this.lastUpdated = value;
 853   }
 854
 855   /**
 856    * Gets the value of the lastUpdatedRelease property.
 857    *
 858    * @return possible object is {@link BigInteger }
 859    *
 860    */
 861   public BigInteger getLastUpdatedRelease()
 862   {
 863     return lastUpdatedRelease;
 864   }
 865
 866   /**
 867    * Sets the value of the lastUpdatedRelease property.
 868    *
 869    * @param value
 870    *          allowed object is {@link BigInteger }
 871    *
 872    */
 873   public void setLastUpdatedRelease(BigInteger value)
 874   {
 875     this.lastUpdatedRelease = value;
 876   }
 877
 878   /**
 879    * <p>
 880    * Java class for anonymous complex type.
 881    *
 882    * <p>
 883    * The following schema fragment specifies the expected content contained
 884    * within this class.
 885    *
 886    * <pre>
 887    * &lt;complexType>
 888    *   &lt;complexContent>
 889    *     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
 890    *       &lt;sequence>
 891    *         &lt;element name="range" maxOccurs="unbounded">
 892    *           &lt;complexType>
 893    *             &lt;complexContent>
 894    *               &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
 895    *                 &lt;attribute name="begin" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 896    *                 &lt;attribute name="end" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 897    *                 &lt;attribute name="primaryBegin" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 898    *                 &lt;attribute name="primaryEnd" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 899    *                 &lt;attribute name="accession" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
 900    *                 &lt;attribute name="version" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 901    *                 &lt;attribute name="complement" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}boolean" default="false" />
 902    *               &lt;/restriction>
 903    *             &lt;/complexContent>
 904    *           &lt;/complexType>
 905    *         &lt;/element>
 906    *       &lt;/sequence>
 907    *     &lt;/restriction>
 908    *   &lt;/complexContent>
 909    * &lt;/complexType>
 910    * </pre>
 911    *
 912    *
 913    */
 914   @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
 915   @XmlType(name = "", propOrder = { "range" })
 916   public static class Assembly
 917   {
 918
 919     @XmlElement(required = true)
 920     protected List<EntryType.Assembly.Range> range;
 921
 922     /**
 923      * Gets the value of the range property.
 924      *
 925      * <p>
 926      * This accessor method returns a reference to the live list, not a
 927      * snapshot. Therefore any modification you make to the returned list will
 928      * be present inside the JAXB object. This is why there is not a
 929      * <CODE>set</CODE> method for the range property.
 930      *
 931      * <p>
 932      * For example, to add a new item, do as follows:
 933      *
 934      * <pre>
 935      * getRange().add(newItem);
 936      * </pre>
 937      *
 938      *
 939      * <p>
 940      * Objects of the following type(s) are allowed in the list
 941      * {@link EntryType.Assembly.Range }
 942      *
 943      *
 944      */
 945     public List<EntryType.Assembly.Range> getRange()
 946     {
 947       if (range == null)
 948       {
 949         range = new ArrayList<EntryType.Assembly.Range>();
 950       }
 951       return this.range;
 952     }
 953
 954     /**
 955      * <p>
 956      * Java class for anonymous complex type.
 957      *
 958      * <p>
 959      * The following schema fragment specifies the expected content contained
 960      * within this class.
 961      *
 962      * <pre>
 963      * &lt;complexType>
 964      *   &lt;complexContent>
 965      *     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
 966      *       &lt;attribute name="begin" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 967      *       &lt;attribute name="end" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 968      *       &lt;attribute name="primaryBegin" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 969      *       &lt;attribute name="primaryEnd" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 970      *       &lt;attribute name="accession" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
 971      *       &lt;attribute name="version" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
 972      *       &lt;attribute name="complement" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}boolean" default="false" />
 973      *     &lt;/restriction>
 974      *   &lt;/complexContent>
 975      * &lt;/complexType>
 976      * </pre>
 977      *
 978      *
 979      */
 980     @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
 981     @XmlType(name = "")
 982     public static class Range
 983     {
 984
 985       @XmlAttribute(name = "begin", required = true)
 986       protected BigInteger begin;
 987
 988       @XmlAttribute(name = "end", required = true)
 989       protected BigInteger end;
 990
 991       @XmlAttribute(name = "primaryBegin")
 992       protected BigInteger primaryBegin;
 993
 994       @XmlAttribute(name = "primaryEnd")
 995       protected BigInteger primaryEnd;
 996
 997       @XmlAttribute(name = "accession", required = true)
 998       protected String accession;
 999
1000       @XmlAttribute(name = "version", required = true)
1001       protected BigInteger version;
1002
1003       @XmlAttribute(name = "complement")
1004       protected Boolean complement;
1005
1006       /**
1007        * Gets the value of the begin property.
1008        *
1009        * @return possible object is {@link BigInteger }
1010        *
1011        */
1012       public BigInteger getBegin()
1013       {
1014         return begin;
1015       }
1016
1017       /**
1018        * Sets the value of the begin property.
1019        *
1020        * @param value
1021        *          allowed object is {@link BigInteger }
1022        *
1023        */
1024       public void setBegin(BigInteger value)
1025       {
1026         this.begin = value;
1027       }
1028
1029       /**
1030        * Gets the value of the end property.
1031        *
1032        * @return possible object is {@link BigInteger }
1033        *
1034        */
1035       public BigInteger getEnd()
1036       {
1037         return end;
1038       }
1039
1040       /**
1041        * Sets the value of the end property.
1042        *
1043        * @param value
1044        *          allowed object is {@link BigInteger }
1045        *
1046        */
1047       public void setEnd(BigInteger value)
1048       {
1049         this.end = value;
1050       }
1051
1052       /**
1053        * Gets the value of the primaryBegin property.
1054        *
1055        * @return possible object is {@link BigInteger }
1056        *
1057        */
1058       public BigInteger getPrimaryBegin()
1059       {
1060         return primaryBegin;
1061       }
1062
1063       /**
1064        * Sets the value of the primaryBegin property.
1065        *
1066        * @param value
1067        *          allowed object is {@link BigInteger }
1068        *
1069        */
1070       public void setPrimaryBegin(BigInteger value)
1071       {
1072         this.primaryBegin = value;
1073       }
1074
1075       /**
1076        * Gets the value of the primaryEnd property.
1077        *
1078        * @return possible object is {@link BigInteger }
1079        *
1080        */
1081       public BigInteger getPrimaryEnd()
1082       {
1083         return primaryEnd;
1084       }
1085
1086       /**
1087        * Sets the value of the primaryEnd property.
1088        *
1089        * @param value
1090        *          allowed object is {@link BigInteger }
1091        *
1092        */
1093       public void setPrimaryEnd(BigInteger value)
1094       {
1095         this.primaryEnd = value;
1096       }
1097
1098       /**
1099        * Gets the value of the accession property.
1100        *
1101        * @return possible object is {@link String }
1102        *
1103        */
1104       public String getAccession()
1105       {
1106         return accession;
1107       }
1108
1109       /**
1110        * Sets the value of the accession property.
1111        *
1112        * @param value
1113        *          allowed object is {@link String }
1114        *
1115        */
1116       public void setAccession(String value)
1117       {
1118         this.accession = value;
1119       }
1120
1121       /**
1122        * Gets the value of the version property.
1123        *
1124        * @return possible object is {@link BigInteger }
1125        *
1126        */
1127       public BigInteger getVersion()
1128       {
1129         return version;
1130       }
1131
1132       /**
1133        * Sets the value of the version property.
1134        *
1135        * @param value
1136        *          allowed object is {@link BigInteger }
1137        *
1138        */
1139       public void setVersion(BigInteger value)
1140       {
1141         this.version = value;
1142       }
1143
1144       /**
1145        * Gets the value of the complement property.
1146        *
1147        * @return possible object is {@link Boolean }
1148        *
1149        */
1150       public boolean isComplement()
1151       {
1152         if (complement == null)
1153         {
1154           return false;
1155         }
1156         else
1157         {
1158           return complement;
1159         }
1160       }
1161
1162       /**
1163        * Sets the value of the complement property.
1164        *
1165        * @param value
1166        *          allowed object is {@link Boolean }
1167        *
1168        */
1169       public void setComplement(Boolean value)
1170       {
1171         this.complement = value;
1172       }
1173
1174     }
1175
1176   }
1177
1178   /**
1179    * <p>
1180    * Java class for anonymous complex type.
1181    *
1182    * <p>
1183    * The following schema fragment specifies the expected content contained
1184    * within this class.
1185    *
1186    * <pre>
1187    * &lt;complexType>
1188    *   &lt;complexContent>
1189    *     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
1190    *       &lt;sequence>
1191    *         &lt;choice maxOccurs="unbounded" minOccurs="0">
1192    *           &lt;element name="range">
1193    *             &lt;complexType>
1194    *               &lt;complexContent>
1195    *                 &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
1196    *                   &lt;attribute name="begin" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
1197    *                   &lt;attribute name="end" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
1198    *                   &lt;attribute name="primaryBegin" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
1199    *                   &lt;attribute name="primaryEnd" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
1200    *                   &lt;attribute name="accession" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
1201    *                   &lt;attribute name="version" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
1202    *                   &lt;attribute name="complement" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}boolean" default="false" />
1203    *                 &lt;/restriction>
1204    *               &lt;/complexContent>
1205    *             &lt;/complexType>
1206    *           &lt;/element>
1207    *           &lt;element name="gap">
1208    *             &lt;complexType>
1209    *               &lt;complexContent>
1210    *                 &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
1211    *                   &lt;attribute name="begin" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
1212    *                   &lt;attribute name="end" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
1213    *                   &lt;attribute name="length" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
1214    *                   &lt;attribute name="unknownLength" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}boolean" default="false" />
1215    *                 &lt;/restriction>
1216    *               &lt;/complexContent>
1217    *             &lt;/complexType>
1218    *           &lt;/element>
1219    *         &lt;/choice>
1220    *       &lt;/sequence>
1221    *     &lt;/restriction>
1222    *   &lt;/complexContent>
1223    * &lt;/complexType>
1224    * </pre>
1225    *
1226    *
1227    */
1228   @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
1229   @XmlType(name = "", propOrder = { "rangeOrGap" })
1230   public static class Contig
1231   {
1232
1233     @XmlElements({
1234         @XmlElement(name = "range", type = EntryType.Contig.Range.class),
1235         @XmlElement(name = "gap", type = EntryType.Contig.Gap.class) })
1236     protected List<Object> rangeOrGap;
1237
1238     /**
1239      * Gets the value of the rangeOrGap property.
1240      *
1241      * <p>
1242      * This accessor method returns a reference to the live list, not a
1243      * snapshot. Therefore any modification you make to the returned list will
1244      * be present inside the JAXB object. This is why there is not a
1245      * <CODE>set</CODE> method for the rangeOrGap property.
1246      *
1247      * <p>
1248      * For example, to add a new item, do as follows:
1249      *
1250      * <pre>
1251      * getRangeOrGap().add(newItem);
1252      * </pre>
1253      *
1254      *
1255      * <p>
1256      * Objects of the following type(s) are allowed in the list
1257      * {@link EntryType.Contig.Range } {@link EntryType.Contig.Gap }
1258      *
1259      *
1260      */
1261     public List<Object> getRangeOrGap()
1262     {
1263       if (rangeOrGap == null)
1264       {
1265         rangeOrGap = new ArrayList<Object>();
1266       }
1267       return this.rangeOrGap;
1268     }
1269
1270     /**
1271      * <p>
1272      * Java class for anonymous complex type.
1273      *
1274      * <p>
1275      * The following schema fragment specifies the expected content contained
1276      * within this class.
1277      *
1278      * <pre>
1279      * &lt;complexType>
1280      *   &lt;complexContent>
1281      *     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
1282      *       &lt;attribute name="begin" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
1283      *       &lt;attribute name="end" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
1284      *       &lt;attribute name="length" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
1285      *       &lt;attribute name="unknownLength" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}boolean" default="false" />
1286      *     &lt;/restriction>
1287      *   &lt;/complexContent>
1288      * &lt;/complexType>
1289      * </pre>
1290      *
1291      *
1292      */
1293     @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
1294     @XmlType(name = "")
1295     public static class Gap
1296     {
1297
1298       @XmlAttribute(name = "begin", required = true)
1299       protected BigInteger begin;
1300
1301       @XmlAttribute(name = "end", required = true)
1302       protected BigInteger end;
1303
1304       @XmlAttribute(name = "length", required = true)
1305       protected BigInteger length;
1306
1307       @XmlAttribute(name = "unknownLength")
1308       protected Boolean unknownLength;
1309
1310       /**
1311        * Gets the value of the begin property.
1312        *
1313        * @return possible object is {@link BigInteger }
1314        *
1315        */
1316       public BigInteger getBegin()
1317       {
1318         return begin;
1319       }
1320
1321       /**
1322        * Sets the value of the begin property.
1323        *
1324        * @param value
1325        *          allowed object is {@link BigInteger }
1326        *
1327        */
1328       public void setBegin(BigInteger value)
1329       {
1330         this.begin = value;
1331       }
1332
1333       /**
1334        * Gets the value of the end property.
1335        *
1336        * @return possible object is {@link BigInteger }
1337        *
1338        */
1339       public BigInteger getEnd()
1340       {
1341         return end;
1342       }
1343
1344       /**
1345        * Sets the value of the end property.
1346        *
1347        * @param value
1348        *          allowed object is {@link BigInteger }
1349        *
1350        */
1351       public void setEnd(BigInteger value)
1352       {
1353         this.end = value;
1354       }
1355
1356       /**
1357        * Gets the value of the length property.
1358        *
1359        * @return possible object is {@link BigInteger }
1360        *
1361        */
1362       public BigInteger getLength()
1363       {
1364         return length;
1365       }
1366
1367       /**
1368        * Sets the value of the length property.
1369        *
1370        * @param value
1371        *          allowed object is {@link BigInteger }
1372        *
1373        */
1374       public void setLength(BigInteger value)
1375       {
1376         this.length = value;
1377       }
1378
1379       /**
1380        * Gets the value of the unknownLength property.
1381        *
1382        * @return possible object is {@link Boolean }
1383        *
1384        */
1385       public boolean isUnknownLength()
1386       {
1387         if (unknownLength == null)
1388         {
1389           return false;
1390         }
1391         else
1392         {
1393           return unknownLength;
1394         }
1395       }
1396
1397       /**
1398        * Sets the value of the unknownLength property.
1399        *
1400        * @param value
1401        *          allowed object is {@link Boolean }
1402        *
1403        */
1404       public void setUnknownLength(Boolean value)
1405       {
1406         this.unknownLength = value;
1407       }
1408
1409     }
1410
1411     /**
1412      * <p>
1413      * Java class for anonymous complex type.
1414      *
1415      * <p>
1416      * The following schema fragment specifies the expected content contained
1417      * within this class.
1418      *
1419      * <pre>
1420      * &lt;complexType>
1421      *   &lt;complexContent>
1422      *     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
1423      *       &lt;attribute name="begin" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
1424      *       &lt;attribute name="end" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
1425      *       &lt;attribute name="primaryBegin" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
1426      *       &lt;attribute name="primaryEnd" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
1427      *       &lt;attribute name="accession" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
1428      *       &lt;attribute name="version" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
1429      *       &lt;attribute name="complement" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}boolean" default="false" />
1430      *     &lt;/restriction>
1431      *   &lt;/complexContent>
1432      * &lt;/complexType>
1433      * </pre>
1434      *
1435      *
1436      */
1437     @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
1438     @XmlType(name = "")
1439     public static class Range
1440     {
1441
1442       @XmlAttribute(name = "begin", required = true)
1443       protected BigInteger begin;
1444
1445       @XmlAttribute(name = "end", required = true)
1446       protected BigInteger end;
1447
1448       @XmlAttribute(name = "primaryBegin")
1449       protected BigInteger primaryBegin;
1450
1451       @XmlAttribute(name = "primaryEnd")
1452       protected BigInteger primaryEnd;
1453
1454       @XmlAttribute(name = "accession", required = true)
1455       protected String accession;
1456
1457       @XmlAttribute(name = "version", required = true)
1458       protected BigInteger version;
1459
1460       @XmlAttribute(name = "complement")
1461       protected Boolean complement;
1462
1463       /**
1464        * Gets the value of the begin property.
1465        *
1466        * @return possible object is {@link BigInteger }
1467        *
1468        */
1469       public BigInteger getBegin()
1470       {
1471         return begin;
1472       }
1473
1474       /**
1475        * Sets the value of the begin property.
1476        *
1477        * @param value
1478        *          allowed object is {@link BigInteger }
1479        *
1480        */
1481       public void setBegin(BigInteger value)
1482       {
1483         this.begin = value;
1484       }
1485
1486       /**
1487        * Gets the value of the end property.
1488        *
1489        * @return possible object is {@link BigInteger }
1490        *
1491        */
1492       public BigInteger getEnd()
1493       {
1494         return end;
1495       }
1496
1497       /**
1498        * Sets the value of the end property.
1499        *
1500        * @param value
1501        *          allowed object is {@link BigInteger }
1502        *
1503        */
1504       public void setEnd(BigInteger value)
1505       {
1506         this.end = value;
1507       }
1508
1509       /**
1510        * Gets the value of the primaryBegin property.
1511        *
1512        * @return possible object is {@link BigInteger }
1513        *
1514        */
1515       public BigInteger getPrimaryBegin()
1516       {
1517         return primaryBegin;
1518       }
1519
1520       /**
1521        * Sets the value of the primaryBegin property.
1522        *
1523        * @param value
1524        *          allowed object is {@link BigInteger }
1525        *
1526        */
1527       public void setPrimaryBegin(BigInteger value)
1528       {
1529         this.primaryBegin = value;
1530       }
1531
1532       /**
1533        * Gets the value of the primaryEnd property.
1534        *
1535        * @return possible object is {@link BigInteger }
1536        *
1537        */
1538       public BigInteger getPrimaryEnd()
1539       {
1540         return primaryEnd;
1541       }
1542
1543       /**
1544        * Sets the value of the primaryEnd property.
1545        *
1546        * @param value
1547        *          allowed object is {@link BigInteger }
1548        *
1549        */
1550       public void setPrimaryEnd(BigInteger value)
1551       {
1552         this.primaryEnd = value;
1553       }
1554
1555       /**
1556        * Gets the value of the accession property.
1557        *
1558        * @return possible object is {@link String }
1559        *
1560        */
1561       public String getAccession()
1562       {
1563         return accession;
1564       }
1565
1566       /**
1567        * Sets the value of the accession property.
1568        *
1569        * @param value
1570        *          allowed object is {@link String }
1571        *
1572        */
1573       public void setAccession(String value)
1574       {
1575         this.accession = value;
1576       }
1577
1578       /**
1579        * Gets the value of the version property.
1580        *
1581        * @return possible object is {@link BigInteger }
1582        *
1583        */
1584       public BigInteger getVersion()
1585       {
1586         return version;
1587       }
1588
1589       /**
1590        * Sets the value of the version property.
1591        *
1592        * @param value
1593        *          allowed object is {@link BigInteger }
1594        *
1595        */
1596       public void setVersion(BigInteger value)
1597       {
1598         this.version = value;
1599       }
1600
1601       /**
1602        * Gets the value of the complement property.
1603        *
1604        * @return possible object is {@link Boolean }
1605        *
1606        */
1607       public boolean isComplement()
1608       {
1609         if (complement == null)
1610         {
1611           return false;
1612         }
1613         else
1614         {
1615           return complement;
1616         }
1617       }
1618
1619       /**
1620        * Sets the value of the complement property.
1621        *
1622        * @param value
1623        *          allowed object is {@link Boolean }
1624        *
1625        */
1626       public void setComplement(Boolean value)
1627       {
1628         this.complement = value;
1629       }
1630
1631     }
1632
1633   }
1634
1635   /**
1636    * <p>
1637    * Java class for anonymous complex type.
1638    *
1639    * <p>
1640    * The following schema fragment specifies the expected content contained
1641    * within this class.
1642    *
1643    * <pre>
1644    * &lt;complexType>
1645    *   &lt;complexContent>
1646    *     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
1647    *       &lt;sequence>
1648    *         &lt;element name="taxon" minOccurs="0">
1649    *           &lt;complexType>
1650    *             &lt;complexContent>
1651    *               &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
1652    *                 &lt;sequence>
1653    *                   &lt;element name="lineage" minOccurs="0">
1654    *                     &lt;complexType>
1655    *                       &lt;complexContent>
1656    *                         &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
1657    *                           &lt;sequence>
1658    *                             &lt;element name="taxon" maxOccurs="unbounded">
1659    *                               &lt;complexType>
1660    *                                 &lt;complexContent>
1661    *                                   &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
1662    *                                     &lt;attribute name="scientificName" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
1663    *                                   &lt;/restriction>
1664    *                                 &lt;/complexContent>
1665    *                               &lt;/complexType>
1666    *                             &lt;/element>
1667    *                           &lt;/sequence>
1668    *                         &lt;/restriction>
1669    *                       &lt;/complexContent>
1670    *                     &lt;/complexType>
1671    *                   &lt;/element>
1672    *                 &lt;/sequence>
1673    *                 &lt;attribute name="scientificName" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
1674    *                 &lt;attribute name="commonName" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
1675    *                 &lt;attribute name="taxId" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
1676    *               &lt;/restriction>
1677    *             &lt;/complexContent>
1678    *           &lt;/complexType>
1679    *         &lt;/element>
1680    *         &lt;element name="xref" type="{}XrefType" maxOccurs="unbounded" minOccurs="0"/>
1681    *         &lt;element name="qualifier" maxOccurs="unbounded" minOccurs="0">
1682    *           &lt;complexType>
1683    *             &lt;complexContent>
1684    *               &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
1685    *                 &lt;sequence>
1686    *                   &lt;element name="value" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" minOccurs="0"/>
1687    *                 &lt;/sequence>
1688    *                 &lt;attribute name="name" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
1689    *               &lt;/restriction>
1690    *             &lt;/complexContent>
1691    *           &lt;/complexType>
1692    *         &lt;/element>
1693    *       &lt;/sequence>
1694    *       &lt;attribute name="name" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
1695    *       &lt;attribute name="location" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
1696    *     &lt;/restriction>
1697    *   &lt;/complexContent>
1698    * &lt;/complexType>
1699    * </pre>
1700    *
1701    *
1702    */
1703   @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
1704   @XmlType(name = "", propOrder = { "taxon", "xref", "qualifier" })
1705   public static class Feature
1706   {
1707
1708     protected EntryType.Feature.FeatureTaxon taxon;
1709
1710     protected List<XrefType> xref;
1711
1712     protected List<EntryType.Feature.Qualifier> qualifier;
1713
1714     @XmlAttribute(name = "name", required = true)
1715     protected String name;
1716
1717     @XmlAttribute(name = "location", required = true)
1718     protected String location;
1719
1720     /**
1721      * Gets the value of the taxon property.
1722      *
1723      * @return possible object is {@link EntryType.Feature.FeatureTaxon }
1724      *
1725      */
1726     public EntryType.Feature.FeatureTaxon getTaxon()
1727     {
1728       return taxon;
1729     }
1730
1731     /**
1732      * Sets the value of the taxon property.
1733      *
1734      * @param value
1735      *          allowed object is {@link EntryType.Feature.FeatureTaxon }
1736      *
1737      */
1738     public void setTaxon(EntryType.Feature.FeatureTaxon value)
1739     {
1740       this.taxon = value;
1741     }
1742
1743     /**
1744      * Gets the value of the xref property.
1745      *
1746      * <p>
1747      * This accessor method returns a reference to the live list, not a
1748      * snapshot. Therefore any modification you make to the returned list will
1749      * be present inside the JAXB object. This is why there is not a
1750      * <CODE>set</CODE> method for the xref property.
1751      *
1752      * <p>
1753      * For example, to add a new item, do as follows:
1754      *
1755      * <pre>
1756      * getXref().add(newItem);
1757      * </pre>
1758      *
1759      *
1760      * <p>
1761      * Objects of the following type(s) are allowed in the list {@link XrefType
1762      * }
1763      *
1764      *
1765      */
1766     public List<XrefType> getXref()
1767     {
1768       if (xref == null)
1769       {
1770         xref = new ArrayList<XrefType>();
1771       }
1772       return this.xref;
1773     }
1774
1775     /**
1776      * Gets the value of the qualifier property.
1777      *
1778      * <p>
1779      * This accessor method returns a reference to the live list, not a
1780      * snapshot. Therefore any modification you make to the returned list will
1781      * be present inside the JAXB object. This is why there is not a
1782      * <CODE>set</CODE> method for the qualifier property.
1783      *
1784      * <p>
1785      * For example, to add a new item, do as follows:
1786      *
1787      * <pre>
1788      * getQualifier().add(newItem);
1789      * </pre>
1790      *
1791      *
1792      * <p>
1793      * Objects of the following type(s) are allowed in the list
1794      * {@link EntryType.Feature.Qualifier }
1795      *
1796      *
1797      */
1798     public List<EntryType.Feature.Qualifier> getQualifier()
1799     {
1800       if (qualifier == null)
1801       {
1802         qualifier = new ArrayList<EntryType.Feature.Qualifier>();
1803       }
1804       return this.qualifier;
1805     }
1806
1807     /**
1808      * Gets the value of the name property.
1809      *
1810      * @return possible object is {@link String }
1811      *
1812      */
1813     public String getName()
1814     {
1815       return name;
1816     }
1817
1818     /**
1819      * Sets the value of the name property.
1820      *
1821      * @param value
1822      *          allowed object is {@link String }
1823      *
1824      */
1825     public void setName(String value)
1826     {
1827       this.name = value;
1828     }
1829
1830     /**
1831      * Gets the value of the location property.
1832      *
1833      * @return possible object is {@link String }
1834      *
1835      */
1836     public String getLocation()
1837     {
1838       return location;
1839     }
1840
1841     /**
1842      * Sets the value of the location property.
1843      *
1844      * @param value
1845      *          allowed object is {@link String }
1846      *
1847      */
1848     public void setLocation(String value)
1849     {
1850       this.location = value;
1851     }
1852
1853     /**
1854      * <p>
1855      * Java class for anonymous complex type.
1856      *
1857      * <p>
1858      * The following schema fragment specifies the expected content contained
1859      * within this class.
1860      *
1861      * <pre>
1862      * &lt;complexType>
1863      *   &lt;complexContent>
1864      *     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
1865      *       &lt;sequence>
1866      *         &lt;element name="lineage" minOccurs="0">
1867      *           &lt;complexType>
1868      *             &lt;complexContent>
1869      *               &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
1870      *                 &lt;sequence>
1871      *                   &lt;element name="taxon" maxOccurs="unbounded">
1872      *                     &lt;complexType>
1873      *                       &lt;complexContent>
1874      *                         &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
1875      *                           &lt;attribute name="scientificName" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
1876      *                         &lt;/restriction>
1877      *                       &lt;/complexContent>
1878      *                     &lt;/complexType>
1879      *                   &lt;/element>
1880      *                 &lt;/sequence>
1881      *               &lt;/restriction>
1882      *             &lt;/complexContent>
1883      *           &lt;/complexType>
1884      *         &lt;/element>
1885      *       &lt;/sequence>
1886      *       &lt;attribute name="scientificName" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
1887      *       &lt;attribute name="commonName" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
1888      *       &lt;attribute name="taxId" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
1889      *     &lt;/restriction>
1890      *   &lt;/complexContent>
1891      * &lt;/complexType>
1892      * </pre>
1893      *
1894      *
1895      */
1896     @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
1897     @XmlType(name = "", propOrder = { "lineage" })
1898     public static class FeatureTaxon
1899     {
1900
1901       protected EntryType.Feature.FeatureTaxon.Lineage lineage;
1902
1903       @XmlAttribute(name = "scientificName", required = true)
1904       protected String scientificName;
1905
1906       @XmlAttribute(name = "commonName")
1907       protected String commonName;
1908
1909       @XmlAttribute(name = "taxId")
1910       protected BigInteger taxId;
1911
1912       /**
1913        * Gets the value of the lineage property.
1914        *
1915        * @return possible object is
1916        *         {@link EntryType.Feature.FeatureTaxon.Lineage }
1917        *
1918        */
1919       public EntryType.Feature.FeatureTaxon.Lineage getLineage()
1920       {
1921         return lineage;
1922       }
1923
1924       /**
1925        * Sets the value of the lineage property.
1926        *
1927        * @param value
1928        *          allowed object is
1929        *          {@link EntryType.Feature.FeatureTaxon.Lineage }
1930        *
1931        */
1932       public void setLineage(EntryType.Feature.FeatureTaxon.Lineage value)
1933       {
1934         this.lineage = value;
1935       }
1936
1937       /**
1938        * Gets the value of the scientificName property.
1939        *
1940        * @return possible object is {@link String }
1941        *
1942        */
1943       public String getScientificName()
1944       {
1945         return scientificName;
1946       }
1947
1948       /**
1949        * Sets the value of the scientificName property.
1950        *
1951        * @param value
1952        *          allowed object is {@link String }
1953        *
1954        */
1955       public void setScientificName(String value)
1956       {
1957         this.scientificName = value;
1958       }
1959
1960       /**
1961        * Gets the value of the commonName property.
1962        *
1963        * @return possible object is {@link String }
1964        *
1965        */
1966       public String getCommonName()
1967       {
1968         return commonName;
1969       }
1970
1971       /**
1972        * Sets the value of the commonName property.
1973        *
1974        * @param value
1975        *          allowed object is {@link String }
1976        *
1977        */
1978       public void setCommonName(String value)
1979       {
1980         this.commonName = value;
1981       }
1982
1983       /**
1984        * Gets the value of the taxId property.
1985        *
1986        * @return possible object is {@link BigInteger }
1987        *
1988        */
1989       public BigInteger getTaxId()
1990       {
1991         return taxId;
1992       }
1993
1994       /**
1995        * Sets the value of the taxId property.
1996        *
1997        * @param value
1998        *          allowed object is {@link BigInteger }
1999        *
2000        */
2001       public void setTaxId(BigInteger value)
2002       {
2003         this.taxId = value;
2004       }
2005
2006       /**
2007        * <p>
2008        * Java class for anonymous complex type.
2009        *
2010        * <p>
2011        * The following schema fragment specifies the expected content contained
2012        * within this class.
2013        *
2014        * <pre>
2015        * &lt;complexType>
2016        *   &lt;complexContent>
2017        *     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
2018        *       &lt;sequence>
2019        *         &lt;element name="taxon" maxOccurs="unbounded">
2020        *           &lt;complexType>
2021        *             &lt;complexContent>
2022        *               &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
2023        *                 &lt;attribute name="scientificName" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
2024        *               &lt;/restriction>
2025        *             &lt;/complexContent>
2026        *           &lt;/complexType>
2027        *         &lt;/element>
2028        *       &lt;/sequence>
2029        *     &lt;/restriction>
2030        *   &lt;/complexContent>
2031        * &lt;/complexType>
2032        * </pre>
2033        *
2034        *
2035        */
2036       @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
2037       @XmlType(name = "", propOrder = { "taxon" })
2038       public static class Lineage
2039       {
2040
2041         @XmlElement(required = true)
2042         protected List<EntryType.Feature.FeatureTaxon.Lineage.Taxon> taxon;
2043
2044         /**
2045          * Gets the value of the taxon property.
2046          *
2047          * <p>
2048          * This accessor method returns a reference to the live list, not a
2049          * snapshot. Therefore any modification you make to the returned list
2050          * will be present inside the JAXB object. This is why there is not a
2051          * <CODE>set</CODE> method for the taxon property.
2052          *
2053          * <p>
2054          * For example, to add a new item, do as follows:
2055          *
2056          * <pre>
2057          * getTaxon().add(newItem);
2058          * </pre>
2059          *
2060          *
2061          * <p>
2062          * Objects of the following type(s) are allowed in the list
2063          * {@link EntryType.Feature.FeatureTaxon.Lineage.Taxon }
2064          *
2065          *
2066          */
2067         public List<EntryType.Feature.FeatureTaxon.Lineage.Taxon> getTaxon()
2068         {
2069           if (taxon == null)
2070           {
2071             taxon = new ArrayList<EntryType.Feature.FeatureTaxon.Lineage.Taxon>();
2072           }
2073           return this.taxon;
2074         }
2075
2076         /**
2077          * <p>
2078          * Java class for anonymous complex type.
2079          *
2080          * <p>
2081          * The following schema fragment specifies the expected content
2082          * contained within this class.
2083          *
2084          * <pre>
2085          * &lt;complexType>
2086          *   &lt;complexContent>
2087          *     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
2088          *       &lt;attribute name="scientificName" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
2089          *     &lt;/restriction>
2090          *   &lt;/complexContent>
2091          * &lt;/complexType>
2092          * </pre>
2093          *
2094          *
2095          */
2096         @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
2097         @XmlType(name = "")
2098         public static class Taxon
2099         {
2100
2101           @XmlAttribute(name = "scientificName", required = true)
2102           protected String scientificName;
2103
2104           /**
2105            * Gets the value of the scientificName property.
2106            *
2107            * @return possible object is {@link String }
2108            *
2109            */
2110           public String getScientificName()
2111           {
2112             return scientificName;
2113           }
2114
2115           /**
2116            * Sets the value of the scientificName property.
2117            *
2118            * @param value
2119            *          allowed object is {@link String }
2120            *
2121            */
2122           public void setScientificName(String value)
2123           {
2124             this.scientificName = value;
2125           }
2126
2127         }
2128
2129       }
2130
2131     }
2132
2133     /**
2134      * <p>
2135      * Java class for anonymous complex type.
2136      *
2137      * <p>
2138      * The following schema fragment specifies the expected content contained
2139      * within this class.
2140      *
2141      * <pre>
2142      * &lt;complexType>
2143      *   &lt;complexContent>
2144      *     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
2145      *       &lt;sequence>
2146      *         &lt;element name="value" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" minOccurs="0"/>
2147      *       &lt;/sequence>
2148      *       &lt;attribute name="name" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
2149      *     &lt;/restriction>
2150      *   &lt;/complexContent>
2151      * &lt;/complexType>
2152      * </pre>
2153      *
2154      *
2155      */
2156     @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
2157     @XmlType(name = "", propOrder = { "value" })
2158     public static class Qualifier
2159     {
2160
2161       protected String value;
2162
2163       @XmlAttribute(name = "name", required = true)
2164       protected String name;
2165
2166       /**
2167        * Gets the value of the value property.
2168        *
2169        * @return possible object is {@link String }
2170        *
2171        */
2172       public String getValue()
2173       {
2174         return value;
2175       }
2176
2177       /**
2178        * Sets the value of the value property.
2179        *
2180        * @param value
2181        *          allowed object is {@link String }
2182        *
2183        */
2184       public void setValue(String value)
2185       {
2186         this.value = value;
2187       }
2188
2189       /**
2190        * Gets the value of the name property.
2191        *
2192        * @return possible object is {@link String }
2193        *
2194        */
2195       public String getName()
2196       {
2197         return name;
2198       }
2199
2200       /**
2201        * Sets the value of the name property.
2202        *
2203        * @param value
2204        *          allowed object is {@link String }
2205        *
2206        */
2207       public void setName(String value)
2208       {
2209         this.name = value;
2210       }
2211
2212     }
2213
2214   }
2215
2216   /**
2217    * <p>
2218    * Java class for anonymous complex type.
2219    *
2220    * <p>
2221    * The following schema fragment specifies the expected content contained
2222    * within this class.
2223    *
2224    * <pre>
2225    * &lt;complexType>
2226    *   &lt;complexContent>
2227    *     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
2228    *       &lt;sequence>
2229    *         &lt;element name="title" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" minOccurs="0"/>
2230    *         &lt;element name="author" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" maxOccurs="unbounded" minOccurs="0"/>
2231    *         &lt;element name="applicant" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" maxOccurs="unbounded" minOccurs="0"/>
2232    *         &lt;element name="consortium" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" minOccurs="0"/>
2233    *         &lt;element name="submissionDate" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}date" minOccurs="0"/>
2234    *         &lt;element name="journal" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" minOccurs="0"/>
2235    *         &lt;element name="year" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" minOccurs="0"/>
2236    *         &lt;element name="volume" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" minOccurs="0"/>
2237    *         &lt;element name="issue" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" minOccurs="0"/>
2238    *         &lt;element name="firstPage" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" minOccurs="0"/>
2239    *         &lt;element name="lastPage" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" minOccurs="0"/>
2240    *         &lt;element name="comment" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" minOccurs="0"/>
2241    *         &lt;element name="referenceLocation" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" minOccurs="0"/>
2242    *         &lt;element name="xref" type="{}XrefType" maxOccurs="unbounded" minOccurs="0"/>
2243    *       &lt;/sequence>
2244    *       &lt;attribute name="type" use="required">
2245    *         &lt;simpleType>
2246    *           &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string">
2247    *             &lt;enumeration value="submission"/>
2248    *             &lt;enumeration value="book"/>
2249    *             &lt;enumeration value="article"/>
2250    *             &lt;enumeration value="patent"/>
2251    *             &lt;enumeration value="thesis"/>
2252    *             &lt;enumeration value="unpublished"/>
2253    *           &lt;/restriction>
2254    *         &lt;/simpleType>
2255    *       &lt;/attribute>
2256    *       &lt;attribute name="number" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}integer" />
2257    *       &lt;attribute name="location" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
2258    *     &lt;/restriction>
2259    *   &lt;/complexContent>
2260    * &lt;/complexType>
2261    * </pre>
2262    *
2263    *
2264    */
2265   @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
2266   @XmlType(
2267     name = "",
2268     propOrder =
2269     { "title", "author", "applicant", "consortium", "submissionDate",
2270         "journal", "year", "volume", "issue", "firstPage", "lastPage",
2271         "comment", "referenceLocation", "xref" })
2272   public static class Reference
2273   {
2274
2275     protected String title;
2276
2277     protected List<String> author;
2278
2279     protected List<String> applicant;
2280
2281     protected String consortium;
2282
2283     @XmlSchemaType(name = "date")
2284     protected XMLGregorianCalendar submissionDate;
2285
2286     protected String journal;
2287
2288     protected String year;
2289
2290     protected String volume;
2291
2292     protected String issue;
2293
2294     protected String firstPage;
2295
2296     protected String lastPage;
2297
2298     protected String comment;
2299
2300     protected String referenceLocation;
2301
2302     protected List<XrefType> xref;
2303
2304     @XmlAttribute(name = "type", required = true)
2305     protected String type;
2306
2307     @XmlAttribute(name = "number", required = true)
2308     protected BigInteger number;
2309
2310     @XmlAttribute(name = "location")
2311     protected String location;
2312
2313     /**
2314      * Gets the value of the title property.
2315      *
2316      * @return possible object is {@link String }
2317      *
2318      */
2319     public String getTitle()
2320     {
2321       return title;
2322     }
2323
2324     /**
2325      * Sets the value of the title property.
2326      *
2327      * @param value
2328      *          allowed object is {@link String }
2329      *
2330      */
2331     public void setTitle(String value)
2332     {
2333       this.title = value;
2334     }
2335
2336     /**
2337      * Gets the value of the author property.
2338      *
2339      * <p>
2340      * This accessor method returns a reference to the live list, not a
2341      * snapshot. Therefore any modification you make to the returned list will
2342      * be present inside the JAXB object. This is why there is not a
2343      * <CODE>set</CODE> method for the author property.
2344      *
2345      * <p>
2346      * For example, to add a new item, do as follows:
2347      *
2348      * <pre>
2349      * getAuthor().add(newItem);
2350      * </pre>
2351      *
2352      *
2353      * <p>
2354      * Objects of the following type(s) are allowed in the list {@link String }
2355      *
2356      *
2357      */
2358     public List<String> getAuthor()
2359     {
2360       if (author == null)
2361       {
2362         author = new ArrayList<String>();
2363       }
2364       return this.author;
2365     }
2366
2367     /**
2368      * Gets the value of the applicant property.
2369      *
2370      * <p>
2371      * This accessor method returns a reference to the live list, not a
2372      * snapshot. Therefore any modification you make to the returned list will
2373      * be present inside the JAXB object. This is why there is not a
2374      * <CODE>set</CODE> method for the applicant property.
2375      *
2376      * <p>
2377      * For example, to add a new item, do as follows:
2378      *
2379      * <pre>
2380      * getApplicant().add(newItem);
2381      * </pre>
2382      *
2383      *
2384      * <p>
2385      * Objects of the following type(s) are allowed in the list {@link String }
2386      *
2387      *
2388      */
2389     public List<String> getApplicant()
2390     {
2391       if (applicant == null)
2392       {
2393         applicant = new ArrayList<String>();
2394       }
2395       return this.applicant;
2396     }
2397
2398     /**
2399      * Gets the value of the consortium property.
2400      *
2401      * @return possible object is {@link String }
2402      *
2403      */
2404     public String getConsortium()
2405     {
2406       return consortium;
2407     }
2408
2409     /**
2410      * Sets the value of the consortium property.
2411      *
2412      * @param value
2413      *          allowed object is {@link String }
2414      *
2415      */
2416     public void setConsortium(String value)
2417     {
2418       this.consortium = value;
2419     }
2420
2421     /**
2422      * Gets the value of the submissionDate property.
2423      *
2424      * @return possible object is {@link XMLGregorianCalendar }
2425      *
2426      */
2427     public XMLGregorianCalendar getSubmissionDate()
2428     {
2429       return submissionDate;
2430     }
2431
2432     /**
2433      * Sets the value of the submissionDate property.
2434      *
2435      * @param value
2436      *          allowed object is {@link XMLGregorianCalendar }
2437      *
2438      */
2439     public void setSubmissionDate(XMLGregorianCalendar value)
2440     {
2441       this.submissionDate = value;
2442     }
2443
2444     /**
2445      * Gets the value of the journal property.
2446      *
2447      * @return possible object is {@link String }
2448      *
2449      */
2450     public String getJournal()
2451     {
2452       return journal;
2453     }
2454
2455     /**
2456      * Sets the value of the journal property.
2457      *
2458      * @param value
2459      *          allowed object is {@link String }
2460      *
2461      */
2462     public void setJournal(String value)
2463     {
2464       this.journal = value;
2465     }
2466
2467     /**
2468      * Gets the value of the year property.
2469      *
2470      * @return possible object is {@link String }
2471      *
2472      */
2473     public String getYear()
2474     {
2475       return year;
2476     }
2477
2478     /**
2479      * Sets the value of the year property.
2480      *
2481      * @param value
2482      *          allowed object is {@link String }
2483      *
2484      */
2485     public void setYear(String value)
2486     {
2487       this.year = value;
2488     }
2489
2490     /**
2491      * Gets the value of the volume property.
2492      *
2493      * @return possible object is {@link String }
2494      *
2495      */
2496     public String getVolume()
2497     {
2498       return volume;
2499     }
2500
2501     /**
2502      * Sets the value of the volume property.
2503      *
2504      * @param value
2505      *          allowed object is {@link String }
2506      *
2507      */
2508     public void setVolume(String value)
2509     {
2510       this.volume = value;
2511     }
2512
2513     /**
2514      * Gets the value of the issue property.
2515      *
2516      * @return possible object is {@link String }
2517      *
2518      */
2519     public String getIssue()
2520     {
2521       return issue;
2522     }
2523
2524     /**
2525      * Sets the value of the issue property.
2526      *
2527      * @param value
2528      *          allowed object is {@link String }
2529      *
2530      */
2531     public void setIssue(String value)
2532     {
2533       this.issue = value;
2534     }
2535
2536     /**
2537      * Gets the value of the firstPage property.
2538      *
2539      * @return possible object is {@link String }
2540      *
2541      */
2542     public String getFirstPage()
2543     {
2544       return firstPage;
2545     }
2546
2547     /**
2548      * Sets the value of the firstPage property.
2549      *
2550      * @param value
2551      *          allowed object is {@link String }
2552      *
2553      */
2554     public void setFirstPage(String value)
2555     {
2556       this.firstPage = value;
2557     }
2558
2559     /**
2560      * Gets the value of the lastPage property.
2561      *
2562      * @return possible object is {@link String }
2563      *
2564      */
2565     public String getLastPage()
2566     {
2567       return lastPage;
2568     }
2569
2570     /**
2571      * Sets the value of the lastPage property.
2572      *
2573      * @param value
2574      *          allowed object is {@link String }
2575      *
2576      */
2577     public void setLastPage(String value)
2578     {
2579       this.lastPage = value;
2580     }
2581
2582     /**
2583      * Gets the value of the comment property.
2584      *
2585      * @return possible object is {@link String }
2586      *
2587      */
2588     public String getComment()
2589     {
2590       return comment;
2591     }
2592
2593     /**
2594      * Sets the value of the comment property.
2595      *
2596      * @param value
2597      *          allowed object is {@link String }
2598      *
2599      */
2600     public void setComment(String value)
2601     {
2602       this.comment = value;
2603     }
2604
2605     /**
2606      * Gets the value of the referenceLocation property.
2607      *
2608      * @return possible object is {@link String }
2609      *
2610      */
2611     public String getReferenceLocation()
2612     {
2613       return referenceLocation;
2614     }
2615
2616     /**
2617      * Sets the value of the referenceLocation property.
2618      *
2619      * @param value
2620      *          allowed object is {@link String }
2621      *
2622      */
2623     public void setReferenceLocation(String value)
2624     {
2625       this.referenceLocation = value;
2626     }
2627
2628     /**
2629      * Gets the value of the xref property.
2630      *
2631      * <p>
2632      * This accessor method returns a reference to the live list, not a
2633      * snapshot. Therefore any modification you make to the returned list will
2634      * be present inside the JAXB object. This is why there is not a
2635      * <CODE>set</CODE> method for the xref property.
2636      *
2637      * <p>
2638      * For example, to add a new item, do as follows:
2639      *
2640      * <pre>
2641      * getXref().add(newItem);
2642      * </pre>
2643      *
2644      *
2645      * <p>
2646      * Objects of the following type(s) are allowed in the list {@link XrefType
2647      * }
2648      *
2649      *
2650      */
2651     public List<XrefType> getXref()
2652     {
2653       if (xref == null)
2654       {
2655         xref = new ArrayList<XrefType>();
2656       }
2657       return this.xref;
2658     }
2659
2660     /**
2661      * Gets the value of the type property.
2662      *
2663      * @return possible object is {@link String }
2664      *
2665      */
2666     public String getType()
2667     {
2668       return type;
2669     }
2670
2671     /**
2672      * Sets the value of the type property.
2673      *
2674      * @param value
2675      *          allowed object is {@link String }
2676      *
2677      */
2678     public void setType(String value)
2679     {
2680       this.type = value;
2681     }
2682
2683     /**
2684      * Gets the value of the number property.
2685      *
2686      * @return possible object is {@link BigInteger }
2687      *
2688      */
2689     public BigInteger getNumber()
2690     {
2691       return number;
2692     }
2693
2694     /**
2695      * Sets the value of the number property.
2696      *
2697      * @param value
2698      *          allowed object is {@link BigInteger }
2699      *
2700      */
2701     public void setNumber(BigInteger value)
2702     {
2703       this.number = value;
2704     }
2705
2706     /**
2707      * Gets the value of the location property.
2708      *
2709      * @return possible object is {@link String }
2710      *
2711      */
2712     public String getLocation()
2713     {
2714       return location;
2715     }
2716
2717     /**
2718      * Sets the value of the location property.
2719      *
2720      * @param value
2721      *          allowed object is {@link String }
2722      *
2723      */
2724     public void setLocation(String value)
2725     {
2726       this.location = value;
2727     }
2728
2729   }
2730
2731 }