src/jalview/xml/binding/jalview/JalviewUserColours.java

   1 //
   2 // This file was generated by the Eclipse Implementation of JAXB, v2.3.3
   3 // See https://eclipse-ee4j.github.io/jaxb-ri
   4 // Any modifications to this file will be lost upon recompilation of the source schema.
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   6 //
   7
   8 package jalview.xml.binding.jalview;
   9
  10 import java.util.ArrayList;
  11 import java.util.List;
  12 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessType;
  13 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessorType;
  14 import javax.xml.bind.annotation.XmlAttribute;
  15 import javax.xml.bind.annotation.XmlElement;
  16 import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
  17
  18 /**
  19  * &lt;p&gt;Java class for JalviewUserColours complex type.
  20  *
  21  * &lt;p&gt;The following schema fragment specifies the expected content
  22  * contained within this class.
  23  *
  24  * &lt;pre&gt; &amp;lt;complexType name="JalviewUserColours"&amp;gt;
  25  * &amp;lt;complexContent&amp;gt; &amp;lt;restriction
  26  * base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType"&amp;gt;
  27  * &amp;lt;sequence&amp;gt; &amp;lt;element name="Version"
  28  * type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" minOccurs="0"/&amp;gt;
  29  * &amp;lt;element name="colour" maxOccurs="unbounded" minOccurs="0"&amp;gt;
  30  * &amp;lt;complexType&amp;gt; &amp;lt;complexContent&amp;gt;
  31  * &amp;lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType"&amp;gt;
  32  * &amp;lt;sequence&amp;gt; &amp;lt;element name="attributeName"
  33  * type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" maxOccurs="2"
  34  * minOccurs="0"/&amp;gt; &amp;lt;/sequence&amp;gt; &amp;lt;attribute
  35  * name="Name" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" /&amp;gt;
  36  * &amp;lt;attribute name="RGB" use="required"
  37  * type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" /&amp;gt; &amp;lt;attribute
  38  * name="minRGB" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" /&amp;gt;
  39  * &amp;lt;attribute name="noValueColour"
  40  * type="{www.jalview.org/colours}NoValueColour" default="Min" /&amp;gt;
  41  * &amp;lt;attribute name="threshType"
  42  * type="{www.jalview.org/colours}ThresholdType" /&amp;gt; &amp;lt;attribute
  43  * name="threshold" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}float" /&amp;gt;
  44  * &amp;lt;attribute name="max" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}float"
  45  * /&amp;gt; &amp;lt;attribute name="min"
  46  * type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}float" /&amp;gt; &amp;lt;attribute
  47  * name="colourByLabel" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}boolean"
  48  * /&amp;gt; &amp;lt;attribute name="autoScale"
  49  * type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}boolean" /&amp;gt;
  50  * &amp;lt;/restriction&amp;gt; &amp;lt;/complexContent&amp;gt;
  51  * &amp;lt;/complexType&amp;gt; &amp;lt;/element&amp;gt; &amp;lt;element
  52  * name="filter" maxOccurs="unbounded" minOccurs="0"&amp;gt;
  53  * &amp;lt;complexType&amp;gt; &amp;lt;complexContent&amp;gt;
  54  * &amp;lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType"&amp;gt;
  55  * &amp;lt;sequence&amp;gt; &amp;lt;element name="matcherSet"
  56  * type="{www.jalview.org/colours}FeatureMatcherSet"/&amp;gt;
  57  * &amp;lt;/sequence&amp;gt; &amp;lt;attribute name="featureType" use="required"
  58  * type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" /&amp;gt;
  59  * &amp;lt;/restriction&amp;gt; &amp;lt;/complexContent&amp;gt;
  60  * &amp;lt;/complexType&amp;gt; &amp;lt;/element&amp;gt;
  61  * &amp;lt;/sequence&amp;gt; &amp;lt;attribute name="schemeName"
  62  * type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" /&amp;gt;
  63  * &amp;lt;/restriction&amp;gt; &amp;lt;/complexContent&amp;gt;
  64  * &amp;lt;/complexType&amp;gt; &lt;/pre&gt;
  65  *
  66  *
  67  */
  68 @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
  69 @XmlType(
  70   name = "JalviewUserColours",
  71   namespace = "www.jalview.org/colours",
  72   propOrder =
  73   { "version", "colour", "filter" })
  74 public class JalviewUserColours
  75 {
  76
  77   @XmlElement(name = "Version", namespace = "")
  78   protected String version;
  79
  80   @XmlElement(namespace = "")
  81   protected List<JalviewUserColours.Colour> colour;
  82
  83   @XmlElement(namespace = "")
  84   protected List<JalviewUserColours.Filter> filter;
  85
  86   @XmlAttribute(name = "schemeName")
  87   protected String schemeName;
  88
  89   /**
  90    * Gets the value of the version property.
  91    *
  92    * @return possible object is {@link String }
  93    *
  94    */
  95   public String getVersion()
  96   {
  97     return version;
  98   }
  99
 100   /**
 101    * Sets the value of the version property.
 102    *
 103    * @param value
 104    *          allowed object is {@link String }
 105    *
 106    */
 107   public void setVersion(String value)
 108   {
 109     this.version = value;
 110   }
 111
 112   /**
 113    * Gets the value of the colour property.
 114    *
 115    * &lt;p&gt; This accessor method returns a reference to the live list, not a
 116    * snapshot. Therefore any modification you make to the returned list will be
 117    * present inside the JAXB object. This is why there is not a
 118    * &lt;CODE&gt;set&lt;/CODE&gt; method for the colour property.
 119    *
 120    * &lt;p&gt; For example, to add a new item, do as follows: &lt;pre&gt;
 121    * getColour().add(newItem); &lt;/pre&gt;
 122    *
 123    *
 124    * &lt;p&gt; Objects of the following type(s) are allowed in the list
 125    * {@link JalviewUserColours.Colour }
 126    *
 127    *
 128    */
 129   public List<JalviewUserColours.Colour> getColour()
 130   {
 131     if (colour == null)
 132     {
 133       colour = new ArrayList<JalviewUserColours.Colour>();
 134     }
 135     return this.colour;
 136   }
 137
 138   /**
 139    * Gets the value of the filter property.
 140    *
 141    * &lt;p&gt; This accessor method returns a reference to the live list, not a
 142    * snapshot. Therefore any modification you make to the returned list will be
 143    * present inside the JAXB object. This is why there is not a
 144    * &lt;CODE&gt;set&lt;/CODE&gt; method for the filter property.
 145    *
 146    * &lt;p&gt; For example, to add a new item, do as follows: &lt;pre&gt;
 147    * getFilter().add(newItem); &lt;/pre&gt;
 148    *
 149    *
 150    * &lt;p&gt; Objects of the following type(s) are allowed in the list
 151    * {@link JalviewUserColours.Filter }
 152    *
 153    *
 154    */
 155   public List<JalviewUserColours.Filter> getFilter()
 156   {
 157     if (filter == null)
 158     {
 159       filter = new ArrayList<JalviewUserColours.Filter>();
 160     }
 161     return this.filter;
 162   }
 163
 164   /**
 165    * Gets the value of the schemeName property.
 166    *
 167    * @return possible object is {@link String }
 168    *
 169    */
 170   public String getSchemeName()
 171   {
 172     return schemeName;
 173   }
 174
 175   /**
 176    * Sets the value of the schemeName property.
 177    *
 178    * @param value
 179    *          allowed object is {@link String }
 180    *
 181    */
 182   public void setSchemeName(String value)
 183   {
 184     this.schemeName = value;
 185   }
 186
 187   /**
 188    * &lt;p&gt;Java class for anonymous complex type.
 189    *
 190    * &lt;p&gt;The following schema fragment specifies the expected content
 191    * contained within this class.
 192    *
 193    * &lt;pre&gt; &amp;lt;complexType&amp;gt; &amp;lt;complexContent&amp;gt;
 194    * &amp;lt;restriction
 195    * base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType"&amp;gt;
 196    * &amp;lt;sequence&amp;gt; &amp;lt;element name="attributeName"
 197    * type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" maxOccurs="2"
 198    * minOccurs="0"/&amp;gt; &amp;lt;/sequence&amp;gt; &amp;lt;attribute
 199    * name="Name" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" /&amp;gt;
 200    * &amp;lt;attribute name="RGB" use="required"
 201    * type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" /&amp;gt; &amp;lt;attribute
 202    * name="minRGB" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" /&amp;gt;
 203    * &amp;lt;attribute name="noValueColour"
 204    * type="{www.jalview.org/colours}NoValueColour" default="Min" /&amp;gt;
 205    * &amp;lt;attribute name="threshType"
 206    * type="{www.jalview.org/colours}ThresholdType" /&amp;gt; &amp;lt;attribute
 207    * name="threshold" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}float" /&amp;gt;
 208    * &amp;lt;attribute name="max" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}float"
 209    * /&amp;gt; &amp;lt;attribute name="min"
 210    * type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}float" /&amp;gt; &amp;lt;attribute
 211    * name="colourByLabel" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}boolean"
 212    * /&amp;gt; &amp;lt;attribute name="autoScale"
 213    * type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}boolean" /&amp;gt;
 214    * &amp;lt;/restriction&amp;gt; &amp;lt;/complexContent&amp;gt;
 215    * &amp;lt;/complexType&amp;gt; &lt;/pre&gt;
 216    *
 217    *
 218    */
 219   @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
 220   @XmlType(name = "", propOrder = { "attributeName" })
 221   public static class Colour
 222   {
 223
 224     @XmlElement(namespace = "")
 225     protected List<String> attributeName;
 226
 227     @XmlAttribute(name = "Name")
 228     protected String name;
 229
 230     @XmlAttribute(name = "RGB", required = true)
 231     protected String rgb;
 232
 233     @XmlAttribute(name = "minRGB")
 234     protected String minRGB;
 235
 236     @XmlAttribute(name = "noValueColour")
 237     protected NoValueColour noValueColour;
 238
 239     @XmlAttribute(name = "threshType")
 240     protected ThresholdType threshType;
 241
 242     @XmlAttribute(name = "threshold")
 243     protected Float threshold;
 244
 245     @XmlAttribute(name = "max")
 246     protected Float max;
 247
 248     @XmlAttribute(name = "min")
 249     protected Float min;
 250
 251     @XmlAttribute(name = "colourByLabel")
 252     protected Boolean colourByLabel;
 253
 254     @XmlAttribute(name = "autoScale")
 255     protected Boolean autoScale;
 256
 257     /**
 258      * Gets the value of the attributeName property.
 259      *
 260      * &lt;p&gt; This accessor method returns a reference to the live list, not
 261      * a snapshot. Therefore any modification you make to the returned list will
 262      * be present inside the JAXB object. This is why there is not a
 263      * &lt;CODE&gt;set&lt;/CODE&gt; method for the attributeName property.
 264      *
 265      * &lt;p&gt; For example, to add a new item, do as follows: &lt;pre&gt;
 266      * getAttributeName().add(newItem); &lt;/pre&gt;
 267      *
 268      *
 269      * &lt;p&gt; Objects of the following type(s) are allowed in the list
 270      * {@link String }
 271      *
 272      *
 273      */
 274     public List<String> getAttributeName()
 275     {
 276       if (attributeName == null)
 277       {
 278         attributeName = new ArrayList<String>();
 279       }
 280       return this.attributeName;
 281     }
 282
 283     /**
 284      * Gets the value of the name property.
 285      *
 286      * @return possible object is {@link String }
 287      *
 288      */
 289     public String getName()
 290     {
 291       return name;
 292     }
 293
 294     /**
 295      * Sets the value of the name property.
 296      *
 297      * @param value
 298      *          allowed object is {@link String }
 299      *
 300      */
 301     public void setName(String value)
 302     {
 303       this.name = value;
 304     }
 305
 306     /**
 307      * Gets the value of the rgb property.
 308      *
 309      * @return possible object is {@link String }
 310      *
 311      */
 312     public String getRGB()
 313     {
 314       return rgb;
 315     }
 316
 317     /**
 318      * Sets the value of the rgb property.
 319      *
 320      * @param value
 321      *          allowed object is {@link String }
 322      *
 323      */
 324     public void setRGB(String value)
 325     {
 326       this.rgb = value;
 327     }
 328
 329     /**
 330      * Gets the value of the minRGB property.
 331      *
 332      * @return possible object is {@link String }
 333      *
 334      */
 335     public String getMinRGB()
 336     {
 337       return minRGB;
 338     }
 339
 340     /**
 341      * Sets the value of the minRGB property.
 342      *
 343      * @param value
 344      *          allowed object is {@link String }
 345      *
 346      */
 347     public void setMinRGB(String value)
 348     {
 349       this.minRGB = value;
 350     }
 351
 352     /**
 353      * Gets the value of the noValueColour property.
 354      *
 355      * @return possible object is {@link NoValueColour }
 356      *
 357      */
 358     public NoValueColour getNoValueColour()
 359     {
 360       if (noValueColour == null)
 361       {
 362         return NoValueColour.MIN;
 363       }
 364       else
 365       {
 366         return noValueColour;
 367       }
 368     }
 369
 370     /**
 371      * Sets the value of the noValueColour property.
 372      *
 373      * @param value
 374      *          allowed object is {@link NoValueColour }
 375      *
 376      */
 377     public void setNoValueColour(NoValueColour value)
 378     {
 379       this.noValueColour = value;
 380     }
 381
 382     /**
 383      * Gets the value of the threshType property.
 384      *
 385      * @return possible object is {@link ThresholdType }
 386      *
 387      */
 388     public ThresholdType getThreshType()
 389     {
 390       return threshType;
 391     }
 392
 393     /**
 394      * Sets the value of the threshType property.
 395      *
 396      * @param value
 397      *          allowed object is {@link ThresholdType }
 398      *
 399      */
 400     public void setThreshType(ThresholdType value)
 401     {
 402       this.threshType = value;
 403     }
 404
 405     /**
 406      * Gets the value of the threshold property.
 407      *
 408      * @return possible object is {@link Float }
 409      *
 410      */
 411     public Float getThreshold()
 412     {
 413       return threshold;
 414     }
 415
 416     /**
 417      * Sets the value of the threshold property.
 418      *
 419      * @param value
 420      *          allowed object is {@link Float }
 421      *
 422      */
 423     public void setThreshold(Float value)
 424     {
 425       this.threshold = value;
 426     }
 427
 428     /**
 429      * Gets the value of the max property.
 430      *
 431      * @return possible object is {@link Float }
 432      *
 433      */
 434     public Float getMax()
 435     {
 436       return max;
 437     }
 438
 439     /**
 440      * Sets the value of the max property.
 441      *
 442      * @param value
 443      *          allowed object is {@link Float }
 444      *
 445      */
 446     public void setMax(Float value)
 447     {
 448       this.max = value;
 449     }
 450
 451     /**
 452      * Gets the value of the min property.
 453      *
 454      * @return possible object is {@link Float }
 455      *
 456      */
 457     public Float getMin()
 458     {
 459       return min;
 460     }
 461
 462     /**
 463      * Sets the value of the min property.
 464      *
 465      * @param value
 466      *          allowed object is {@link Float }
 467      *
 468      */
 469     public void setMin(Float value)
 470     {
 471       this.min = value;
 472     }
 473
 474     /**
 475      * Gets the value of the colourByLabel property.
 476      *
 477      * @return possible object is {@link Boolean }
 478      *
 479      */
 480     public Boolean isColourByLabel()
 481     {
 482       return colourByLabel;
 483     }
 484
 485     /**
 486      * Sets the value of the colourByLabel property.
 487      *
 488      * @param value
 489      *          allowed object is {@link Boolean }
 490      *
 491      */
 492     public void setColourByLabel(Boolean value)
 493     {
 494       this.colourByLabel = value;
 495     }
 496
 497     /**
 498      * Gets the value of the autoScale property.
 499      *
 500      * @return possible object is {@link Boolean }
 501      *
 502      */
 503     public Boolean isAutoScale()
 504     {
 505       return autoScale;
 506     }
 507
 508     /**
 509      * Sets the value of the autoScale property.
 510      *
 511      * @param value
 512      *          allowed object is {@link Boolean }
 513      *
 514      */
 515     public void setAutoScale(Boolean value)
 516     {
 517       this.autoScale = value;
 518     }
 519
 520   }
 521
 522   /**
 523    * &lt;p&gt;Java class for anonymous complex type.
 524    *
 525    * &lt;p&gt;The following schema fragment specifies the expected content
 526    * contained within this class.
 527    *
 528    * &lt;pre&gt; &amp;lt;complexType&amp;gt; &amp;lt;complexContent&amp;gt;
 529    * &amp;lt;restriction
 530    * base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType"&amp;gt;
 531    * &amp;lt;sequence&amp;gt; &amp;lt;element name="matcherSet"
 532    * type="{www.jalview.org/colours}FeatureMatcherSet"/&amp;gt;
 533    * &amp;lt;/sequence&amp;gt; &amp;lt;attribute name="featureType"
 534    * use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" /&amp;gt;
 535    * &amp;lt;/restriction&amp;gt; &amp;lt;/complexContent&amp;gt;
 536    * &amp;lt;/complexType&amp;gt; &lt;/pre&gt;
 537    *
 538    *
 539    */
 540   @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
 541   @XmlType(name = "", propOrder = { "matcherSet" })
 542   public static class Filter
 543   {
 544
 545     @XmlElement(namespace = "", required = true)
 546     protected FeatureMatcherSet matcherSet;
 547
 548     @XmlAttribute(name = "featureType", required = true)
 549     protected String featureType;
 550
 551     /**
 552      * Gets the value of the matcherSet property.
 553      *
 554      * @return possible object is {@link FeatureMatcherSet }
 555      *
 556      */
 557     public FeatureMatcherSet getMatcherSet()
 558     {
 559       return matcherSet;
 560     }
 561
 562     /**
 563      * Sets the value of the matcherSet property.
 564      *
 565      * @param value
 566      *          allowed object is {@link FeatureMatcherSet }
 567      *
 568      */
 569     public void setMatcherSet(FeatureMatcherSet value)
 570     {
 571       this.matcherSet = value;
 572     }
 573
 574     /**
 575      * Gets the value of the featureType property.
 576      *
 577      * @return possible object is {@link String }
 578      *
 579      */
 580     public String getFeatureType()
 581     {
 582       return featureType;
 583     }
 584
 585     /**
 586      * Sets the value of the featureType property.
 587      *
 588      * @param value
 589      *          allowed object is {@link String }
 590      *
 591      */
 592     public void setFeatureType(String value)
 593     {
 594       this.featureType = value;
 595     }
 596
 597   }
 598
 599 }