src/jalview/xml/binding/jalview/PcaDataType.java

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   7
   8 package jalview.xml.binding.jalview;
   9
  10 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessType;
  11 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessorType;
  12 import javax.xml.bind.annotation.XmlElement;
  13 import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
  14
  15 /**
  16  *
  17  * The results of a PCA calculation
  18  *
  19  *
  20  * &lt;p&gt;Java class for PcaDataType complex type.
  21  *
  22  * &lt;p&gt;The following schema fragment specifies the expected content
  23  * contained within this class.
  24  *
  25  * &lt;pre&gt; &amp;lt;complexType name="PcaDataType"&amp;gt;
  26  * &amp;lt;complexContent&amp;gt; &amp;lt;restriction
  27  * base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType"&amp;gt;
  28  * &amp;lt;sequence&amp;gt; &amp;lt;element name="pairwiseMatrix"
  29  * type="{www.jalview.org}DoubleMatrix"/&amp;gt; &amp;lt;element
  30  * name="tridiagonalMatrix" type="{www.jalview.org}DoubleMatrix"/&amp;gt;
  31  * &amp;lt;element name="eigenMatrix"
  32  * type="{www.jalview.org}DoubleMatrix"/&amp;gt; &amp;lt;/sequence&amp;gt;
  33  * &amp;lt;/restriction&amp;gt; &amp;lt;/complexContent&amp;gt;
  34  * &amp;lt;/complexType&amp;gt; &lt;/pre&gt;
  35  *
  36  *
  37  */
  38 @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
  39 @XmlType(
  40   name = "PcaDataType",
  41   namespace = "www.jalview.org",
  42   propOrder =
  43   { "pairwiseMatrix", "tridiagonalMatrix", "eigenMatrix" })
  44 public class PcaDataType
  45 {
  46
  47   @XmlElement(required = true)
  48   protected DoubleMatrix pairwiseMatrix;
  49
  50   @XmlElement(required = true)
  51   protected DoubleMatrix tridiagonalMatrix;
  52
  53   @XmlElement(required = true)
  54   protected DoubleMatrix eigenMatrix;
  55
  56   /**
  57    * Gets the value of the pairwiseMatrix property.
  58    *
  59    * @return possible object is {@link DoubleMatrix }
  60    *
  61    */
  62   public DoubleMatrix getPairwiseMatrix()
  63   {
  64     return pairwiseMatrix;
  65   }
  66
  67   /**
  68    * Sets the value of the pairwiseMatrix property.
  69    *
  70    * @param value
  71    *          allowed object is {@link DoubleMatrix }
  72    *
  73    */
  74   public void setPairwiseMatrix(DoubleMatrix value)
  75   {
  76     this.pairwiseMatrix = value;
  77   }
  78
  79   /**
  80    * Gets the value of the tridiagonalMatrix property.
  81    *
  82    * @return possible object is {@link DoubleMatrix }
  83    *
  84    */
  85   public DoubleMatrix getTridiagonalMatrix()
  86   {
  87     return tridiagonalMatrix;
  88   }
  89
  90   /**
  91    * Sets the value of the tridiagonalMatrix property.
  92    *
  93    * @param value
  94    *          allowed object is {@link DoubleMatrix }
  95    *
  96    */
  97   public void setTridiagonalMatrix(DoubleMatrix value)
  98   {
  99     this.tridiagonalMatrix = value;
 100   }
 101
 102   /**
 103    * Gets the value of the eigenMatrix property.
 104    *
 105    * @return possible object is {@link DoubleMatrix }
 106    *
 107    */
 108   public DoubleMatrix getEigenMatrix()
 109   {
 110     return eigenMatrix;
 111   }
 112
 113   /**
 114    * Sets the value of the eigenMatrix property.
 115    *
 116    * @param value
 117    *          allowed object is {@link DoubleMatrix }
 118    *
 119    */
 120   public void setEigenMatrix(DoubleMatrix value)
 121   {
 122     this.eigenMatrix = value;
 123   }
 124
 125 }