src/jalview/xml/binding/uniprot/DbReferenceType.java

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   7
   8 package jalview.xml.binding.uniprot;
   9
  10 import java.util.ArrayList;
  11 import java.util.List;
  12 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessType;
  13 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessorType;
  14 import javax.xml.bind.annotation.XmlAttribute;
  15 import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
  16
  17 /**
  18  * Describes a database cross-reference. Equivalent to the flat file DR-line.
  19  *
  20  *
  21  * <p>
  22  * Java class for dbReferenceType complex type.
  23  *
  24  * <p>
  25  * The following schema fragment specifies the expected content contained within
  26  * this class.
  27  *
  28  * <pre>
  29  * &lt;complexType name="dbReferenceType">
  30  *   &lt;complexContent>
  31  *     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
  32  *       &lt;sequence>
  33  *         &lt;element name="molecule" type="{http://uniprot.org/uniprot}moleculeType" minOccurs="0"/>
  34  *         &lt;element name="property" type="{http://uniprot.org/uniprot}propertyType" maxOccurs="unbounded" minOccurs="0"/>
  35  *       &lt;/sequence>
  36  *       &lt;attribute name="type" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
  37  *       &lt;attribute name="id" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
  38  *       &lt;attribute name="evidence" type="{http://uniprot.org/uniprot}intListType" />
  39  *     &lt;/restriction>
  40  *   &lt;/complexContent>
  41  * &lt;/complexType>
  42  * </pre>
  43  *
  44  *
  45  */
  46 @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
  47 @XmlType(name = "dbReferenceType", propOrder = { "molecule", "property" })
  48 public class DbReferenceType
  49 {
  50
  51   protected MoleculeType molecule;
  52
  53   protected List<PropertyType> property;
  54
  55   @XmlAttribute(name = "type", required = true)
  56   protected String type;
  57
  58   @XmlAttribute(name = "id", required = true)
  59   protected String id;
  60
  61   @XmlAttribute(name = "evidence")
  62   protected List<Integer> evidence;
  63
  64   /**
  65    * Gets the value of the molecule property.
  66    *
  67    * @return possible object is {@link MoleculeType }
  68    *
  69    */
  70   public MoleculeType getMolecule()
  71   {
  72     return molecule;
  73   }
  74
  75   /**
  76    * Sets the value of the molecule property.
  77    *
  78    * @param value
  79    *          allowed object is {@link MoleculeType }
  80    *
  81    */
  82   public void setMolecule(MoleculeType value)
  83   {
  84     this.molecule = value;
  85   }
  86
  87   /**
  88    * Gets the value of the property property.
  89    *
  90    * <p>
  91    * This accessor method returns a reference to the live list, not a snapshot.
  92    * Therefore any modification you make to the returned list will be present
  93    * inside the JAXB object. This is why there is not a <CODE>set</CODE> method
  94    * for the property property.
  95    *
  96    * <p>
  97    * For example, to add a new item, do as follows:
  98    *
  99    * <pre>
 100    * getProperty().add(newItem);
 101    * </pre>
 102    *
 103    *
 104    * <p>
 105    * Objects of the following type(s) are allowed in the list
 106    * {@link PropertyType }
 107    *
 108    *
 109    */
 110   public List<PropertyType> getProperty()
 111   {
 112     if (property == null)
 113     {
 114       property = new ArrayList<PropertyType>();
 115     }
 116     return this.property;
 117   }
 118
 119   /**
 120    * Gets the value of the type property.
 121    *
 122    * @return possible object is {@link String }
 123    *
 124    */
 125   public String getType()
 126   {
 127     return type;
 128   }
 129
 130   /**
 131    * Sets the value of the type property.
 132    *
 133    * @param value
 134    *          allowed object is {@link String }
 135    *
 136    */
 137   public void setType(String value)
 138   {
 139     this.type = value;
 140   }
 141
 142   /**
 143    * Gets the value of the id property.
 144    *
 145    * @return possible object is {@link String }
 146    *
 147    */
 148   public String getId()
 149   {
 150     return id;
 151   }
 152
 153   /**
 154    * Sets the value of the id property.
 155    *
 156    * @param value
 157    *          allowed object is {@link String }
 158    *
 159    */
 160   public void setId(String value)
 161   {
 162     this.id = value;
 163   }
 164
 165   /**
 166    * Gets the value of the evidence property.
 167    *
 168    * <p>
 169    * This accessor method returns a reference to the live list, not a snapshot.
 170    * Therefore any modification you make to the returned list will be present
 171    * inside the JAXB object. This is why there is not a <CODE>set</CODE> method
 172    * for the evidence property.
 173    *
 174    * <p>
 175    * For example, to add a new item, do as follows:
 176    *
 177    * <pre>
 178    * getEvidence().add(newItem);
 179    * </pre>
 180    *
 181    *
 182    * <p>
 183    * Objects of the following type(s) are allowed in the list {@link Integer }
 184    *
 185    *
 186    */
 187   public List<Integer> getEvidence()
 188   {
 189     if (evidence == null)
 190     {
 191       evidence = new ArrayList<Integer>();
 192     }
 193     return this.evidence;
 194   }
 195
 196 }