src/jalview/xml/binding/uniprot/GeneLocationType.java

   1 //
   2 // This file was generated by the JavaTM Architecture for XML Binding(JAXB) Reference Implementation, v2.2.8-b130911.1802
   3 // See <a href="http://java.sun.com/xml/jaxb">http://java.sun.com/xml/jaxb</a>
   4 // Any modifications to this file will be lost upon recompilation of the source schema.
   5 // Generated on: 2019.04.05 at 08:01:44 AM BST
   6 //
   7
   8 package jalview.xml.binding.uniprot;
   9
  10 import java.util.ArrayList;
  11 import java.util.List;
  12 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessType;
  13 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessorType;
  14 import javax.xml.bind.annotation.XmlAttribute;
  15 import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
  16
  17 /**
  18  * Describes non-nuclear gene locations (organelles and plasmids). Equivalent to
  19  * the flat file OG-line.
  20  *
  21  * <p>
  22  * Java class for geneLocationType complex type.
  23  *
  24  * <p>
  25  * The following schema fragment specifies the expected content contained within
  26  * this class.
  27  *
  28  * <pre>
  29  * &lt;complexType name="geneLocationType">
  30  *   &lt;complexContent>
  31  *     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
  32  *       &lt;sequence>
  33  *         &lt;element name="name" type="{http://uniprot.org/uniprot}statusType" maxOccurs="unbounded" minOccurs="0"/>
  34  *       &lt;/sequence>
  35  *       &lt;attribute name="type" use="required">
  36  *         &lt;simpleType>
  37  *           &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string">
  38  *             &lt;enumeration value="apicoplast"/>
  39  *             &lt;enumeration value="chloroplast"/>
  40  *             &lt;enumeration value="organellar chromatophore"/>
  41  *             &lt;enumeration value="cyanelle"/>
  42  *             &lt;enumeration value="hydrogenosome"/>
  43  *             &lt;enumeration value="mitochondrion"/>
  44  *             &lt;enumeration value="non-photosynthetic plastid"/>
  45  *             &lt;enumeration value="nucleomorph"/>
  46  *             &lt;enumeration value="plasmid"/>
  47  *             &lt;enumeration value="plastid"/>
  48  *           &lt;/restriction>
  49  *         &lt;/simpleType>
  50  *       &lt;/attribute>
  51  *       &lt;attribute name="evidence" type="{http://uniprot.org/uniprot}intListType" />
  52  *     &lt;/restriction>
  53  *   &lt;/complexContent>
  54  * &lt;/complexType>
  55  * </pre>
  56  *
  57  *
  58  */
  59 @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
  60 @XmlType(name = "geneLocationType", propOrder = { "name" })
  61 public class GeneLocationType
  62 {
  63
  64   protected List<StatusType> name;
  65
  66   @XmlAttribute(name = "type", required = true)
  67   protected String type;
  68
  69   @XmlAttribute(name = "evidence")
  70   protected List<Integer> evidence;
  71
  72   /**
  73    * Gets the value of the name property.
  74    *
  75    * <p>
  76    * This accessor method returns a reference to the live list, not a snapshot.
  77    * Therefore any modification you make to the returned list will be present
  78    * inside the JAXB object. This is why there is not a <CODE>set</CODE> method
  79    * for the name property.
  80    *
  81    * <p>
  82    * For example, to add a new item, do as follows:
  83    *
  84    * <pre>
  85    * getName().add(newItem);
  86    * </pre>
  87    *
  88    *
  89    * <p>
  90    * Objects of the following type(s) are allowed in the list {@link StatusType
  91    * }
  92    *
  93    *
  94    */
  95   public List<StatusType> getName()
  96   {
  97     if (name == null)
  98     {
  99       name = new ArrayList<StatusType>();
 100     }
 101     return this.name;
 102   }
 103
 104   /**
 105    * Gets the value of the type property.
 106    *
 107    * @return possible object is {@link String }
 108    *
 109    */
 110   public String getType()
 111   {
 112     return type;
 113   }
 114
 115   /**
 116    * Sets the value of the type property.
 117    *
 118    * @param value
 119    *          allowed object is {@link String }
 120    *
 121    */
 122   public void setType(String value)
 123   {
 124     this.type = value;
 125   }
 126
 127   /**
 128    * Gets the value of the evidence property.
 129    *
 130    * <p>
 131    * This accessor method returns a reference to the live list, not a snapshot.
 132    * Therefore any modification you make to the returned list will be present
 133    * inside the JAXB object. This is why there is not a <CODE>set</CODE> method
 134    * for the evidence property.
 135    *
 136    * <p>
 137    * For example, to add a new item, do as follows:
 138    *
 139    * <pre>
 140    * getEvidence().add(newItem);
 141    * </pre>
 142    *
 143    *
 144    * <p>
 145    * Objects of the following type(s) are allowed in the list {@link Integer }
 146    *
 147    *
 148    */
 149   public List<Integer> getEvidence()
 150   {
 151     if (evidence == null)
 152     {
 153       evidence = new ArrayList<Integer>();
 154     }
 155     return this.evidence;
 156   }
 157
 158 }