src/jalview/xml/binding/uniprot/LocationType.java

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   7
   8 package jalview.xml.binding.uniprot;
   9
  10 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessType;
  11 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessorType;
  12 import javax.xml.bind.annotation.XmlAttribute;
  13 import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
  14
  15 /**
  16  * Describes a sequence location as either a range with a begin and end or as a
  17  * position. The 'sequence' attribute is only used when the location is not on
  18  * the canonical sequence displayed in the current entry.
  19  *
  20  * <p>
  21  * Java class for locationType complex type.
  22  *
  23  * <p>
  24  * The following schema fragment specifies the expected content contained within
  25  * this class.
  26  *
  27  * <pre>
  28  * &lt;complexType name="locationType">
  29  *   &lt;complexContent>
  30  *     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
  31  *       &lt;choice>
  32  *         &lt;sequence>
  33  *           &lt;element name="begin" type="{http://uniprot.org/uniprot}positionType"/>
  34  *           &lt;element name="end" type="{http://uniprot.org/uniprot}positionType"/>
  35  *         &lt;/sequence>
  36  *         &lt;element name="position" type="{http://uniprot.org/uniprot}positionType"/>
  37  *       &lt;/choice>
  38  *       &lt;attribute name="sequence" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
  39  *     &lt;/restriction>
  40  *   &lt;/complexContent>
  41  * &lt;/complexType>
  42  * </pre>
  43  *
  44  *
  45  */
  46 @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
  47 @XmlType(name = "locationType", propOrder = { "begin", "end", "position" })
  48 public class LocationType
  49 {
  50
  51   protected PositionType begin;
  52
  53   protected PositionType end;
  54
  55   protected PositionType position;
  56
  57   @XmlAttribute(name = "sequence")
  58   protected String sequence;
  59
  60   /**
  61    * Gets the value of the begin property.
  62    *
  63    * @return possible object is {@link PositionType }
  64    *
  65    */
  66   public PositionType getBegin()
  67   {
  68     return begin;
  69   }
  70
  71   /**
  72    * Sets the value of the begin property.
  73    *
  74    * @param value
  75    *          allowed object is {@link PositionType }
  76    *
  77    */
  78   public void setBegin(PositionType value)
  79   {
  80     this.begin = value;
  81   }
  82
  83   /**
  84    * Gets the value of the end property.
  85    *
  86    * @return possible object is {@link PositionType }
  87    *
  88    */
  89   public PositionType getEnd()
  90   {
  91     return end;
  92   }
  93
  94   /**
  95    * Sets the value of the end property.
  96    *
  97    * @param value
  98    *          allowed object is {@link PositionType }
  99    *
 100    */
 101   public void setEnd(PositionType value)
 102   {
 103     this.end = value;
 104   }
 105
 106   /**
 107    * Gets the value of the position property.
 108    *
 109    * @return possible object is {@link PositionType }
 110    *
 111    */
 112   public PositionType getPosition()
 113   {
 114     return position;
 115   }
 116
 117   /**
 118    * Sets the value of the position property.
 119    *
 120    * @param value
 121    *          allowed object is {@link PositionType }
 122    *
 123    */
 124   public void setPosition(PositionType value)
 125   {
 126     this.position = value;
 127   }
 128
 129   /**
 130    * Gets the value of the sequence property.
 131    *
 132    * @return possible object is {@link String }
 133    *
 134    */
 135   public String getSequence()
 136   {
 137     return sequence;
 138   }
 139
 140   /**
 141    * Sets the value of the sequence property.
 142    *
 143    * @param value
 144    *          allowed object is {@link String }
 145    *
 146    */
 147   public void setSequence(String value)
 148   {
 149     this.sequence = value;
 150   }
 151
 152 }