src/jalview/xml/binding/uniprot/PhysiologicalReactionType.java

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   7
   8 package jalview.xml.binding.uniprot;
   9
  10 import java.util.ArrayList;
  11 import java.util.List;
  12 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessType;
  13 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessorType;
  14 import javax.xml.bind.annotation.XmlAttribute;
  15 import javax.xml.bind.annotation.XmlElement;
  16 import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
  17
  18 /**
  19  * Describes a physiological reaction.
  20  *
  21  * <p>
  22  * Java class for physiologicalReactionType complex type.
  23  *
  24  * <p>
  25  * The following schema fragment specifies the expected content contained within
  26  * this class.
  27  *
  28  * <pre>
  29  * &lt;complexType name="physiologicalReactionType">
  30  *   &lt;complexContent>
  31  *     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
  32  *       &lt;sequence>
  33  *         &lt;element name="dbReference" type="{http://uniprot.org/uniprot}dbReferenceType"/>
  34  *       &lt;/sequence>
  35  *       &lt;attribute name="direction" use="required">
  36  *         &lt;simpleType>
  37  *           &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string">
  38  *             &lt;enumeration value="left-to-right"/>
  39  *             &lt;enumeration value="right-to-left"/>
  40  *           &lt;/restriction>
  41  *         &lt;/simpleType>
  42  *       &lt;/attribute>
  43  *       &lt;attribute name="evidence" type="{http://uniprot.org/uniprot}intListType" />
  44  *     &lt;/restriction>
  45  *   &lt;/complexContent>
  46  * &lt;/complexType>
  47  * </pre>
  48  *
  49  *
  50  */
  51 @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
  52 @XmlType(name = "physiologicalReactionType", propOrder = { "dbReference" })
  53 public class PhysiologicalReactionType
  54 {
  55
  56   @XmlElement(required = true)
  57   protected DbReferenceType dbReference;
  58
  59   @XmlAttribute(name = "direction", required = true)
  60   protected String direction;
  61
  62   @XmlAttribute(name = "evidence")
  63   protected List<Integer> evidence;
  64
  65   /**
  66    * Gets the value of the dbReference property.
  67    *
  68    * @return possible object is {@link DbReferenceType }
  69    *
  70    */
  71   public DbReferenceType getDbReference()
  72   {
  73     return dbReference;
  74   }
  75
  76   /**
  77    * Sets the value of the dbReference property.
  78    *
  79    * @param value
  80    *          allowed object is {@link DbReferenceType }
  81    *
  82    */
  83   public void setDbReference(DbReferenceType value)
  84   {
  85     this.dbReference = value;
  86   }
  87
  88   /**
  89    * Gets the value of the direction property.
  90    *
  91    * @return possible object is {@link String }
  92    *
  93    */
  94   public String getDirection()
  95   {
  96     return direction;
  97   }
  98
  99   /**
 100    * Sets the value of the direction property.
 101    *
 102    * @param value
 103    *          allowed object is {@link String }
 104    *
 105    */
 106   public void setDirection(String value)
 107   {
 108     this.direction = value;
 109   }
 110
 111   /**
 112    * Gets the value of the evidence property.
 113    *
 114    * <p>
 115    * This accessor method returns a reference to the live list, not a snapshot.
 116    * Therefore any modification you make to the returned list will be present
 117    * inside the JAXB object. This is why there is not a <CODE>set</CODE> method
 118    * for the evidence property.
 119    *
 120    * <p>
 121    * For example, to add a new item, do as follows:
 122    *
 123    * <pre>
 124    * getEvidence().add(newItem);
 125    * </pre>
 126    *
 127    *
 128    * <p>
 129    * Objects of the following type(s) are allowed in the list {@link Integer }
 130    *
 131    *
 132    */
 133   public List<Integer> getEvidence()
 134   {
 135     if (evidence == null)
 136     {
 137       evidence = new ArrayList<Integer>();
 138     }
 139     return this.evidence;
 140   }
 141
 142 }