src/jalview/xml/binding/uniprot/PositionType.java

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   7
   8 package jalview.xml.binding.uniprot;
   9
  10 import java.math.BigInteger;
  11 import java.util.ArrayList;
  12 import java.util.List;
  13 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessType;
  14 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessorType;
  15 import javax.xml.bind.annotation.XmlAttribute;
  16 import javax.xml.bind.annotation.XmlSchemaType;
  17 import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
  18
  19 /**
  20  * <p>
  21  * Java class for positionType complex type.
  22  *
  23  * <p>
  24  * The following schema fragment specifies the expected content contained within
  25  * this class.
  26  *
  27  * <pre>
  28  * &lt;complexType name="positionType">
  29  *   &lt;complexContent>
  30  *     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
  31  *       &lt;attribute name="position" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}unsignedLong" />
  32  *       &lt;attribute name="status" default="certain">
  33  *         &lt;simpleType>
  34  *           &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string">
  35  *             &lt;enumeration value="certain"/>
  36  *             &lt;enumeration value="uncertain"/>
  37  *             &lt;enumeration value="less than"/>
  38  *             &lt;enumeration value="greater than"/>
  39  *             &lt;enumeration value="unknown"/>
  40  *           &lt;/restriction>
  41  *         &lt;/simpleType>
  42  *       &lt;/attribute>
  43  *       &lt;attribute name="evidence" type="{http://uniprot.org/uniprot}intListType" />
  44  *     &lt;/restriction>
  45  *   &lt;/complexContent>
  46  * &lt;/complexType>
  47  * </pre>
  48  *
  49  *
  50  */
  51 @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
  52 @XmlType(name = "positionType")
  53 public class PositionType
  54 {
  55
  56   @XmlAttribute(name = "position")
  57   @XmlSchemaType(name = "unsignedLong")
  58   protected BigInteger position;
  59
  60   @XmlAttribute(name = "status")
  61   protected String status;
  62
  63   @XmlAttribute(name = "evidence")
  64   protected List<Integer> evidence;
  65
  66   /**
  67    * Gets the value of the position property.
  68    *
  69    * @return possible object is {@link BigInteger }
  70    *
  71    */
  72   public BigInteger getPosition()
  73   {
  74     return position;
  75   }
  76
  77   /**
  78    * Sets the value of the position property.
  79    *
  80    * @param value
  81    *          allowed object is {@link BigInteger }
  82    *
  83    */
  84   public void setPosition(BigInteger value)
  85   {
  86     this.position = value;
  87   }
  88
  89   /**
  90    * Gets the value of the status property.
  91    *
  92    * @return possible object is {@link String }
  93    *
  94    */
  95   public String getStatus()
  96   {
  97     if (status == null)
  98     {
  99       return "certain";
 100     }
 101     else
 102     {
 103       return status;
 104     }
 105   }
 106
 107   /**
 108    * Sets the value of the status property.
 109    *
 110    * @param value
 111    *          allowed object is {@link String }
 112    *
 113    */
 114   public void setStatus(String value)
 115   {
 116     this.status = value;
 117   }
 118
 119   /**
 120    * Gets the value of the evidence property.
 121    *
 122    * <p>
 123    * This accessor method returns a reference to the live list, not a snapshot.
 124    * Therefore any modification you make to the returned list will be present
 125    * inside the JAXB object. This is why there is not a <CODE>set</CODE> method
 126    * for the evidence property.
 127    *
 128    * <p>
 129    * For example, to add a new item, do as follows:
 130    *
 131    * <pre>
 132    * getEvidence().add(newItem);
 133    * </pre>
 134    *
 135    *
 136    * <p>
 137    * Objects of the following type(s) are allowed in the list {@link Integer }
 138    *
 139    *
 140    */
 141   public List<Integer> getEvidence()
 142   {
 143     if (evidence == null)
 144     {
 145       evidence = new ArrayList<Integer>();
 146     }
 147     return this.evidence;
 148   }
 149
 150 }