src/jalview/xml/binding/uniprot/ReactionType.java

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   8 package jalview.xml.binding.uniprot;
   9
  10 import java.util.ArrayList;
  11 import java.util.List;
  12 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessType;
  13 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessorType;
  14 import javax.xml.bind.annotation.XmlAttribute;
  15 import javax.xml.bind.annotation.XmlElement;
  16 import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
  17
  18 /**
  19  * Describes a chemical reaction.
  20  *
  21  * <p>
  22  * Java class for reactionType complex type.
  23  *
  24  * <p>
  25  * The following schema fragment specifies the expected content contained within
  26  * this class.
  27  *
  28  * <pre>
  29  * &lt;complexType name="reactionType">
  30  *   &lt;complexContent>
  31  *     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
  32  *       &lt;sequence>
  33  *         &lt;element name="text" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string"/>
  34  *         &lt;element name="dbReference" type="{http://uniprot.org/uniprot}dbReferenceType" maxOccurs="unbounded"/>
  35  *       &lt;/sequence>
  36  *       &lt;attribute name="evidence" type="{http://uniprot.org/uniprot}intListType" />
  37  *     &lt;/restriction>
  38  *   &lt;/complexContent>
  39  * &lt;/complexType>
  40  * </pre>
  41  *
  42  *
  43  */
  44 @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
  45 @XmlType(name = "reactionType", propOrder = { "text", "dbReference" })
  46 public class ReactionType
  47 {
  48
  49   @XmlElement(required = true)
  50   protected String text;
  51
  52   @XmlElement(required = true)
  53   protected List<DbReferenceType> dbReference;
  54
  55   @XmlAttribute(name = "evidence")
  56   protected List<Integer> evidence;
  57
  58   /**
  59    * Gets the value of the text property.
  60    *
  61    * @return possible object is {@link String }
  62    *
  63    */
  64   public String getText()
  65   {
  66     return text;
  67   }
  68
  69   /**
  70    * Sets the value of the text property.
  71    *
  72    * @param value
  73    *          allowed object is {@link String }
  74    *
  75    */
  76   public void setText(String value)
  77   {
  78     this.text = value;
  79   }
  80
  81   /**
  82    * Gets the value of the dbReference property.
  83    *
  84    * <p>
  85    * This accessor method returns a reference to the live list, not a snapshot.
  86    * Therefore any modification you make to the returned list will be present
  87    * inside the JAXB object. This is why there is not a <CODE>set</CODE> method
  88    * for the dbReference property.
  89    *
  90    * <p>
  91    * For example, to add a new item, do as follows:
  92    *
  93    * <pre>
  94    * getDbReference().add(newItem);
  95    * </pre>
  96    *
  97    *
  98    * <p>
  99    * Objects of the following type(s) are allowed in the list
 100    * {@link DbReferenceType }
 101    *
 102    *
 103    */
 104   public List<DbReferenceType> getDbReference()
 105   {
 106     if (dbReference == null)
 107     {
 108       dbReference = new ArrayList<DbReferenceType>();
 109     }
 110     return this.dbReference;
 111   }
 112
 113   /**
 114    * Gets the value of the evidence property.
 115    *
 116    * <p>
 117    * This accessor method returns a reference to the live list, not a snapshot.
 118    * Therefore any modification you make to the returned list will be present
 119    * inside the JAXB object. This is why there is not a <CODE>set</CODE> method
 120    * for the evidence property.
 121    *
 122    * <p>
 123    * For example, to add a new item, do as follows:
 124    *
 125    * <pre>
 126    * getEvidence().add(newItem);
 127    * </pre>
 128    *
 129    *
 130    * <p>
 131    * Objects of the following type(s) are allowed in the list {@link Integer }
 132    *
 133    *
 134    */
 135   public List<Integer> getEvidence()
 136   {
 137     if (evidence == null)
 138     {
 139       evidence = new ArrayList<Integer>();
 140     }
 141     return this.evidence;
 142   }
 143
 144 }