src/org/biojava/dasobert/eventmodel/FeatureEvent.java

   1 /*
   2  *                  BioJava development code
   3  *
   4  * This code may be freely distributed and modified under the
   5  * terms of the GNU Lesser General Public Licence.  This should
   6  * be distributed with the code.  If you do not have a copy,
   7  * see:
   8  *
   9  *      http://www.gnu.org/copyleft/lesser.html
  10  *
  11  * Copyright for this code is held jointly by the individual
  12  * authors.  These should be listed in @author doc comments.
  13  *
  14  * For more information on the BioJava project and its aims,
  15  * or to join the biojava-l mailing list, visit the home page
  16  * at:
  17  *
  18  *      http://www.biojava.org/
  19  *
  20  * Created on Oct 28, 2005
  21  *
  22  */
  23 package org.biojava.dasobert.eventmodel;
  24
  25 import java.util.*;
  26
  27 import org.biojava.dasobert.dasregistry.*;
  28
  29 public class FeatureEvent extends AbstractDasEvent
  30 {
  31
  32   Map[] features;
  33   int comeBackLater;
  34     String version;
  35
  36   public FeatureEvent(Map[] features, Das1Source dasSource, String version)
  37   {
  38     super();
  39     this.features = features;
  40     this.dasSource = dasSource;
  41     comeBackLater = -1;
  42     this.version = version;
  43   }
  44
  45   public int getComeBackLater()
  46   {
  47     return comeBackLater;
  48   }
  49
  50   public void setComeBackLater(int comeBackLater)
  51   {
  52     this.comeBackLater = comeBackLater;
  53   }
  54
  55   /** get the features that have been found.
  56    *
  57    * do something like
  58    * Map[] features = event.getFeatures();
  59    * <pre>
  60    * for (int i = 0 ; i< features;i++) {
  61    *      Map f = features[i];
  62    *      String type = (String) f.get("TYPE") ;
  63    *      System.out.println(type);
  64    * }
  65    * </pre>
  66    * @return a Map containng the features
  67    */
  68   public Map[] getFeatures()
  69   {
  70     return features;
  71   }
  72
  73     /** Get the version of the reference object that has been annotated.
  74      * Compare the version string with the version string obtained from the reference server.
  75      * If they don;t match there is a version problem between the annotation and the reference!
  76      * @return the version string (e.g. an MD5 digest of the reference sequence)
  77      */
  78         public String getVersion() {
  79                 return version;
  80         }
  81
  82         public void setVersion(String version) {
  83                 this.version = version;
  84         }
  85
  86 }