src2/fr/orsay/lri/varna/models/naView/Base.java

   1 /*
   2  VARNA is a tool for the automated drawing, visualization and annotation of the secondary structure of RNA, designed as a companion software for web servers and databases.
   3  Copyright (C) 2008  Kevin Darty, Alain Denise and Yann Ponty.
   4  electronic mail : Yann.Ponty@lri.fr
   5  paper mail : LRI, bat 490 Université Paris-Sud 91405 Orsay Cedex France
   6
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  10
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  13  See the GNU General Public License for more details.
  14
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  16  If not, see http://www.gnu.org/licenses.
  17  */
  18 package fr.orsay.lri.varna.models.naView;
  19
  20 public class Base {
  21         private int mate;
  22         private double x, y;
  23         private boolean extracted;
  24         private Region region = new Region();
  25
  26         public int getMate() {
  27                 return mate;
  28         }
  29
  30         public void setMate(int mate) {
  31                 this.mate = mate;
  32         }
  33
  34         public double getX() {
  35                 return x;
  36         }
  37
  38         public void setX(double x) {
  39                 //System.out.println("  Base.setX()");
  40                 this.x = x;
  41         }
  42
  43         public double getY() {
  44                 return y;
  45         }
  46
  47         public void setY(double y) {
  48                 this.y = y;
  49         }
  50
  51         public boolean isExtracted() {
  52                 return extracted;
  53         }
  54
  55         public void setExtracted(boolean extracted) {
  56                 this.extracted = extracted;
  57         }
  58
  59         public Region getRegion() {
  60                 return region;
  61         }
  62
  63         public void setRegion(Region region) {
  64                 this.region = region;
  65         }
  66 }