JAL-2110 unused method removed
authorgmungoc <g.m.carstairs@dundee.ac.uk>
Mon, 4 Jul 2016 14:20:27 +0000 (15:20 +0100)
committergmungoc <g.m.carstairs@dundee.ac.uk>
Mon, 4 Jul 2016 14:20:27 +0000 (15:20 +0100)
src/jalview/datamodel/Alignment.java
src/jalview/datamodel/AlignmentI.java

index c9ec77b..2b194cc 100755 (executable)
@@ -1296,22 +1296,6 @@ public class Alignment implements AlignmentI
     }
   }
 
-  /**
-   * adds a set of mappings (while ignoring any duplicates)
-   */
-  @Override
-  public void addCodonFrames(Iterable<AlignedCodonFrame> codons)
-  {
-    if (codons != null)
-    {
-      Iterator<AlignedCodonFrame> it = codons.iterator();
-      while (it.hasNext())
-      {
-        addCodonFrame(it.next());
-      }
-    }
-  }
-
   /*
    * (non-Javadoc)
    * 
index f1238ff..c15bb99 100755 (executable)
@@ -363,14 +363,6 @@ public interface AlignmentI extends AnnotatedCollectionI
   void addCodonFrame(AlignedCodonFrame codons);
 
   /**
-   * add a set of aligned codons mappings for this alignment, apart from any
-   * duplicates which are ignored
-   * 
-   * @param codons
-   */
-  void addCodonFrames(Iterable<AlignedCodonFrame> codons);
-
-  /**
    * remove a particular codon frame reference from this alignment
    * 
    * @param codons