binaries/src/ViennaRNA/RNAforester/src/part_func.h

   1 extern "C"
   2 {
   3
   4 /* functions from part_func.c */
   5 float  pf_fold(char *sequence, char *structure);
   6 /* calculate partition function and base pair probabilities */
   7 void   init_pf_fold(int length);    /* allocate space for pf_fold() */
   8 void   free_pf_arrays(void);        /* free arrays from pf_fold() */
   9 void   update_pf_params(int length); /*recalculate energy parameters */
  10 char   bppm_symbol(float *x);   /* string representation of structure */
  11 double mean_bp_dist(int length); /* mean pair distance of ensemble */
  12
  13 }