conf/log4j.properties.full

   1 \r
   2 ## CHANGE THIS (The root directory where to store all the log files)  \r
   3 #logDir = .\r
   4 \r
   5 ## Uncomment to enable JWS2 activity logging to standard out (to the console if available)\r
   6 ## for possible log levels please refer to Log4j documentation http://logging.apache.org/log4j/1.2/manual.html \r
   7 ## Valid log levels are:\r
   8 ## TRACE - log everything from below including very detailed messages (useful for debugging only)\r
   9 ## DEBUG - log everything from below including some minor events (useful for debugging only)\r
  10 ## INFO - log everything from below including some information messages\r
  11 ## WARN - log error and warnings\r
  12 ## ERROR - log errors and fatal events only \r
  13 ## FATAL - log fatal events only\r
  14 \r
  15 #log4j.rootLogger=ERROR, stdout\r
  16 #log4j.appender.stdout=org.apache.log4j.ConsoleAppender\r
  17 #log4j.appender.stdout.Target=System.out\r
  18 #log4j.appender.stdout.layout=org.apache.log4j.PatternLayout\r
  19 #log4j.appender.stdout.layout.ConversionPattern=%m%n\r
  20 \r
  21 ## Uncomment to enable JWS2 activity logging to the file\r
  22 #log4j.logger.compbio=ERROR, ACTIVITY\r
  23 #log4j.appender.ACTIVITY=org.apache.log4j.RollingFileAppender\r
  24 #log4j.appender.ACTIVITY.File=${logDir}/activity.log\r
  25 #log4j.appender.ACTIVITY.MaxFileSize=10MB\r
  26 #log4j.appender.ACTIVITY.MaxBackupIndex=10000\r
  27 #log4j.appender.ACTIVITY.layout=org.apache.log4j.PatternLayout\r
  28 #log4j.appender.ACTIVITY.layout.ConversionPattern=%d{MM-dd@HH:mm:ss} %-5p %3x - %m%n\r
  29 \r
  30 ## Uncomment for web access logging. Please do not change the log level!\r
  31 #log4j.logger.ClustalWS-stats=INFO, STAT\r
  32 #log4j.logger.MuscleWS-stats=INFO, STAT\r
  33 #log4j.logger.TcoffeeWS-stats=INFO, STAT\r
  34 #log4j.logger.MafftWS-stats=INFO, STAT\r
  35 #log4j.logger.ProbconsWS-stats=INFO, STAT\r
  36 #log4j.appender.STAT=org.apache.log4j.RollingFileAppender\r
  37 #log4j.appender.STAT.File=${logDir}/wsaccess.log\r
  38 #log4j.appender.STAT.MaxFileSize=10MB\r
  39 #log4j.appender.STAT.MaxBackupIndex=10000\r
  40 #log4j.appender.STAT.layout=org.apache.log4j.PatternLayout\r
  41 #log4j.appender.STAT.layout.ConversionPattern=%t %d %m%n\r
  42 \r
  43 ## Uncomment for separate local engine execution log (debugging only)\r
  44 #log4j.logger.compbio.engine.local.LocalExecutorService=INFO, C\r
  45 #log4j.appender.C=org.apache.log4j.FileAppender\r
  46 #log4j.appender.C.File=LocalExecutorService.log\r
  47 #log4j.appender.C.layout=org.apache.log4j.PatternLayout\r
  48 #log4j.appender.C.layout.ConversionPattern=%m%n\r
  49 \r
  50 ## Parameter combinator logger (testing only)\r
  51 #log4j.logger.RunnerLogger=ERROR, RUNNER\r
  52 #log4j.appender.RUNNER=org.apache.log4j.FileAppender\r
  53 #log4j.appender.RUNNER.File=RunnerParam.log \r
  54 #log4j.appender.RUNNER.layout=org.apache.log4j.PatternLayout\r
  55 #log4j.appender.RUNNER.layout.ConversionPattern=%r [%t] %p %c %x - %m%n\r
  56 \r
  57 \r
  58 ## NOT IN USE - collection of patterns choose the one that suits you\r
  59 # %d{ABSOLUTE} %5p %c{1}:%L -\r
  60 #log4j.appender.C.layout.ConversionPattern=%-4r [%t] %-5p %c %x - %m%n\r
  61 # %d{MM-dd@HH:mm:ss} %-5p (%13F:%L) %3x - \r
  62 #log4j.appender.ClustalWS-stats.layout.ConversionPattern=%p %d %t %C{4} %m%n\r