src/jalview/binding/Feature.java

   1 /*
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  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.binding;
  22
  23 //---------------------------------/
  24 //- Imported classes and packages -/
  25 //---------------------------------/
  26
  27 import org.exolab.castor.xml.Marshaller;
  28 import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;
  29
  30 /**
  31  * Class Feature.
  32  *
  33  * @version $Revision$ $Date$
  34  */
  35 public class Feature implements java.io.Serializable
  36 {
  37
  38   // --------------------------/
  39   // - Class/Member Variables -/
  40   // --------------------------/
  41
  42   /**
  43    * Field _begin.
  44    */
  45   private int _begin;
  46
  47   /**
  48    * keeps track of state for field: _begin
  49    */
  50   private boolean _has_begin;
  51
  52   /**
  53    * Field _end.
  54    */
  55   private int _end;
  56
  57   /**
  58    * keeps track of state for field: _end
  59    */
  60   private boolean _has_end;
  61
  62   /**
  63    * Field _type.
  64    */
  65   private java.lang.String _type;
  66
  67   /**
  68    * Field _description.
  69    */
  70   private java.lang.String _description;
  71
  72   /**
  73    * Field _status.
  74    */
  75   private java.lang.String _status;
  76
  77   // ----------------/
  78   // - Constructors -/
  79   // ----------------/
  80
  81   public Feature()
  82   {
  83     super();
  84   }
  85
  86   // -----------/
  87   // - Methods -/
  88   // -----------/
  89
  90   /**
  91      */
  92   public void deleteBegin()
  93   {
  94     this._has_begin = false;
  95   }
  96
  97   /**
  98      */
  99   public void deleteEnd()
 100   {
 101     this._has_end = false;
 102   }
 103
 104   /**
 105    * Returns the value of field 'begin'.
 106    *
 107    * @return the value of field 'Begin'.
 108    */
 109   public int getBegin()
 110   {
 111     return this._begin;
 112   }
 113
 114   /**
 115    * Returns the value of field 'description'.
 116    *
 117    * @return the value of field 'Description'.
 118    */
 119   public java.lang.String getDescription()
 120   {
 121     return this._description;
 122   }
 123
 124   /**
 125    * Returns the value of field 'end'.
 126    *
 127    * @return the value of field 'End'.
 128    */
 129   public int getEnd()
 130   {
 131     return this._end;
 132   }
 133
 134   /**
 135    * Returns the value of field 'status'.
 136    *
 137    * @return the value of field 'Status'.
 138    */
 139   public java.lang.String getStatus()
 140   {
 141     return this._status;
 142   }
 143
 144   /**
 145    * Returns the value of field 'type'.
 146    *
 147    * @return the value of field 'Type'.
 148    */
 149   public java.lang.String getType()
 150   {
 151     return this._type;
 152   }
 153
 154   /**
 155    * Method hasBegin.
 156    *
 157    * @return true if at least one Begin has been added
 158    */
 159   public boolean hasBegin()
 160   {
 161     return this._has_begin;
 162   }
 163
 164   /**
 165    * Method hasEnd.
 166    *
 167    * @return true if at least one End has been added
 168    */
 169   public boolean hasEnd()
 170   {
 171     return this._has_end;
 172   }
 173
 174   /**
 175    * Method isValid.
 176    *
 177    * @return true if this object is valid according to the schema
 178    */
 179   public boolean isValid()
 180   {
 181     try
 182     {
 183       validate();
 184     } catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex)
 185     {
 186       return false;
 187     }
 188     return true;
 189   }
 190
 191   /**
 192    *
 193    *
 194    * @param out
 195    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException
 196    *           if object is null or if any SAXException is thrown during
 197    *           marshaling
 198    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 199    *           if this object is an invalid instance according to the schema
 200    */
 201   public void marshal(final java.io.Writer out)
 202           throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,
 203           org.exolab.castor.xml.ValidationException
 204   {
 205     Marshaller.marshal(this, out);
 206   }
 207
 208   /**
 209    *
 210    *
 211    * @param handler
 212    * @throws java.io.IOException
 213    *           if an IOException occurs during marshaling
 214    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 215    *           if this object is an invalid instance according to the schema
 216    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException
 217    *           if object is null or if any SAXException is thrown during
 218    *           marshaling
 219    */
 220   public void marshal(final org.xml.sax.ContentHandler handler)
 221           throws java.io.IOException,
 222           org.exolab.castor.xml.MarshalException,
 223           org.exolab.castor.xml.ValidationException
 224   {
 225     Marshaller.marshal(this, handler);
 226   }
 227
 228   /**
 229    * Sets the value of field 'begin'.
 230    *
 231    * @param begin
 232    *          the value of field 'begin'.
 233    */
 234   public void setBegin(final int begin)
 235   {
 236     this._begin = begin;
 237     this._has_begin = true;
 238   }
 239
 240   /**
 241    * Sets the value of field 'description'.
 242    *
 243    * @param description
 244    *          the value of field 'description'.
 245    */
 246   public void setDescription(final java.lang.String description)
 247   {
 248     this._description = description;
 249   }
 250
 251   /**
 252    * Sets the value of field 'end'.
 253    *
 254    * @param end
 255    *          the value of field 'end'.
 256    */
 257   public void setEnd(final int end)
 258   {
 259     this._end = end;
 260     this._has_end = true;
 261   }
 262
 263   /**
 264    * Sets the value of field 'status'.
 265    *
 266    * @param status
 267    *          the value of field 'status'.
 268    */
 269   public void setStatus(final java.lang.String status)
 270   {
 271     this._status = status;
 272   }
 273
 274   /**
 275    * Sets the value of field 'type'.
 276    *
 277    * @param type
 278    *          the value of field 'type'.
 279    */
 280   public void setType(final java.lang.String type)
 281   {
 282     this._type = type;
 283   }
 284
 285   /**
 286    * Method unmarshal.
 287    *
 288    * @param reader
 289    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException
 290    *           if object is null or if any SAXException is thrown during
 291    *           marshaling
 292    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 293    *           if this object is an invalid instance according to the schema
 294    * @return the unmarshaled jalview.binding.Feature
 295    */
 296   public static jalview.binding.Feature unmarshal(
 297           final java.io.Reader reader)
 298           throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,
 299           org.exolab.castor.xml.ValidationException
 300   {
 301     return (jalview.binding.Feature) Unmarshaller.unmarshal(
 302             jalview.binding.Feature.class, reader);
 303   }
 304
 305   /**
 306    *
 307    *
 308    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 309    *           if this object is an invalid instance according to the schema
 310    */
 311   public void validate() throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 312   {
 313     org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();
 314     validator.validate(this);
 315   }
 316
 317 }